Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LEPTLSNIIEQRSLKWIFVGGKGGVGKTTCSCSLAVQLSKGRESVLIISTDPAHNISDAFDQKFSKVPTKVKGYDNLFAM
EIDPSLGVAELPDEFFEEDNMLSMGKKMMQEAMSAFPGIDEAMSYAEVMRLVKGMNFSVVVFDTAPTGHTLRLLNFPTIV
ERGLGRLMQIKNQISPFISQMCNADQLASKLEETLPVIRSVSEQFKDPEQTTFICVCIAEFLSLYETERLIQELAKCKID
THNIIVNQLVFPDPEKPCKMCEARHKIQAKYLDQMEDLYEDFHIVKLPLLPHEVRGADKVNTFSALLLEPYKP

The query sequence (length=313) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6so5:A 313 313 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7ru9:A, 7ru9:B, 7rua:A, 7rua:B, 7ruc:A, 7ruc:B
2 2woo:A 303 310 0.5559 0.5743 0.5613 2.29e-115 2woo:B, 2woo:C, 2woo:D, 2woo:E, 2woo:F
3 3ibg:A 300 318 0.5495 0.5733 0.5409 1.26e-110 3ibg:B, 3ibg:C, 3ibg:D, 3ibg:E, 3ibg:F
4 8odu:A 291 314 0.5399 0.5808 0.5382 2.88e-108
5 8hac:B 327 341 0.5272 0.5046 0.4839 6.17e-99 8hac:A
6 3iqx:A 261 314 0.5144 0.6169 0.5127 8.37e-99 3iqw:A, 3iqw:B, 3iqx:B
7 3sja:A 338 325 0.5016 0.4645 0.4831 2.77e-93 3a36:B, 3a37:B, 3b2e:B, 3b2e:C, 3sja:E
8 3a36:A 314 325 0.4984 0.4968 0.4800 3.85e-90 3a37:A, 5bwk:N
9 4xtr:B 311 321 0.4856 0.4887 0.4735 8.74e-89 3b2e:A, 3b2e:D, 5bw8:B, 4pwx:A, 4pwx:B, 3vlc:A, 2woj:A, 2woj:B, 2woj:D, 4xtr:A, 4xvu:H, 4xvu:A, 4xvu:B, 4xvu:G, 4xwo:A, 4xwo:G, 4xwo:M, 4xwo:N, 4xwo:S, 4xwo:B, 4xwo:H, 4xwo:T, 3zs8:B, 3zs9:A, 3zs9:B
10 3sjd:C 292 323 0.4824 0.5171 0.4675 8.27e-85 3sjd:A, 3sjd:B, 2woj:C, 3zs8:A
11 7spz:A 328 321 0.4281 0.4085 0.4174 4.59e-78 7spy:A
12 3idq:A 272 318 0.4441 0.5110 0.4371 6.88e-72
13 7sq0:A 306 325 0.4217 0.4314 0.4062 1.44e-71 7sq0:B
14 3io3:A 230 315 0.4377 0.5957 0.4349 2.34e-67
15 3zq6:D 307 302 0.3514 0.3583 0.3642 5.11e-56 3zq6:A
16 3zq6:B 288 295 0.3514 0.3819 0.3729 6.86e-55 3zq6:C
17 3ug7:A 317 301 0.3546 0.3502 0.3688 8.88e-53 3ug6:A, 3ug6:B, 3ug6:C, 3ug6:D, 3ug7:B, 3ug7:C, 3ug7:D
18 5zme:A 638 319 0.3355 0.1646 0.3292 2.72e-37 5zmf:A
19 5zme:A 638 302 0.3035 0.1489 0.3146 6.69e-35 5zmf:A
20 1ii0:B 553 247 0.2109 0.1193 0.2672 5.74e-22 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
21 1ii0:B 553 152 0.1310 0.0741 0.2697 1.89e-07 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
22 1ii0:B 553 104 0.0831 0.0470 0.2500 0.66 1f48:A, 1ihu:A, 1ii0:A, 1ii9:A, 1ii9:B
23 6bs3:A 330 265 0.1885 0.1788 0.2226 1.43e-07 6bs4:A, 6bs5:A
24 8elf:B 384 161 0.1374 0.1120 0.2671 4.52e-06 8elf:A
25 6iub:A 264 114 0.0927 0.1098 0.2544 7.49e-04 6iub:B, 6iuc:A, 6iuc:B, 6iuc:C, 6iuc:D, 6iud:B, 6iud:C, 6iud:D, 6iud:A, 8jmj:A, 8jmj:B, 8jmj:C, 8jmj:D, 8jmk:A, 8jmk:B, 8jmk:C, 8jmk:D, 8jml:A, 8jml:B
26 6g2g:B 273 76 0.0767 0.0879 0.3158 0.001 6g2g:A
27 2ynm:B 268 55 0.0735 0.0858 0.4182 0.002 2ynm:A
28 6bs3:B 355 159 0.1182 0.1042 0.2327 0.005 6bs4:B
29 2bej:A 245 45 0.0511 0.0653 0.3556 0.008 2bek:A, 2bek:B, 2bek:C, 2bek:D
30 3q9l:A 257 133 0.1150 0.1401 0.2707 0.012 3q9l:B, 3r9i:A, 3r9i:B, 3r9i:C, 3r9i:D, 3r9j:A, 3r9j:B
31 5tvk:B 242 46 0.0639 0.0826 0.4348 0.014 3k9g:A, 5tvk:A
32 7dut:A 220 66 0.0767 0.1091 0.3636 0.017 7dv3:A, 7dv3:B, 7dwr:A, 7dwr:D, 7dwr:B, 7dwr:C
33 3fwy:A 268 57 0.0735 0.0858 0.4035 0.023 3fwy:B, 6uyk:A, 6uyk:B, 6uyk:C, 6uyk:D
34 5if9:A 251 190 0.1374 0.1713 0.2263 0.029 5if9:B, 5ihp:A, 5ihp:B
35 5u1g:D 211 41 0.0447 0.0664 0.3415 0.077 4dzz:A, 4dzz:B, 4e03:A, 4e03:B, 4e07:A, 4e07:B, 4e09:A, 5u1g:B, 5u1g:C, 5u1g:A
36 6nzj:A 273 39 0.0447 0.0513 0.3590 0.17 6nzj:B
37 4v02:A 244 34 0.0447 0.0574 0.4118 0.18 4v02:B, 4v03:A, 4v03:B
38 1g3q:A 237 34 0.0479 0.0633 0.4412 0.25 1g3r:A
39 1ion:A 243 34 0.0479 0.0617 0.4412 0.26
40 5k5t:A 578 162 0.1118 0.0606 0.2160 0.30
41 2afh:E 289 40 0.0415 0.0450 0.3250 0.31 2afh:F, 2afi:E, 2afi:F, 2afi:G, 2afi:H, 2afi:M, 2afi:N, 2afi:O, 2afi:P, 2c8v:A, 1de0:A, 1de0:B, 8dfc:E, 8dfc:F, 8dfd:E, 8dfd:F, 8dfd:G, 8dfd:H, 1fp6:A, 1fp6:B, 1fp6:C, 1fp6:D, 1g1m:A, 1g1m:B, 1g20:E, 1g20:F, 1g20:G, 1g20:H, 1g21:E, 1g21:F, 1g21:G, 1g21:H, 1g5p:A, 1g5p:B, 1m1y:E, 1m1y:F, 1m1y:G, 1m1y:H, 1m1y:M, 1m1y:N, 1m1y:O, 1m1y:P, 1m34:E, 1m34:F, 1m34:G, 1m34:H, 1m34:M, 1m34:N, 1m34:O, 1m34:P, 1n2c:E, 1n2c:F, 1n2c:G, 1n2c:H, 6n4j:A, 6n4j:B, 6n4k:A, 6n4k:B, 6n4l:A, 6n4m:A, 1nip:B, 1nip:A, 2nip:A, 2nip:B, 6o0b:A, 6o0b:B, 6q93:A, 6q93:B, 6q93:C, 6q93:D, 6q93:E, 6q93:F, 6q93:G, 6q93:H, 1rw4:A, 7t4h:A, 8tc3:A, 8tc3:B, 7tne:A, 7tpn:A, 7tpo:A, 7tpv:A, 7tpw:A, 7tpx:A, 7tpy:A, 7tpz:A, 7tq0:A, 7tq9:A, 7tqc:A, 7tqe:A, 7tqf:A, 7tqh:A, 7tqi:A, 7tqj:A, 7tqk:A, 7ut8:E, 7ut8:F, 7ut9:E, 7ut9:F, 7uta:E, 7uta:F, 7uta:G, 7uta:H, 4wza:E, 4wza:F, 4wza:G, 4wza:H, 4wzb:E, 4wzb:F, 4wzb:G, 4wzb:H, 1xcp:A, 1xcp:B, 1xcp:C, 1xcp:D, 1xd8:A, 1xd8:B, 1xd9:A, 1xd9:B, 1xdb:A, 1xdb:B
42 3kb1:A 243 31 0.0479 0.0617 0.4839 0.35 3kb1:B, 6oby:A, 6oby:B
43 6yb5:A 243 46 0.0511 0.0658 0.3478 0.42 6yar:A, 6yar:B, 6yay:A, 6yay:B, 6yb3:A, 6yb3:B, 6yb5:B, 6ybb:A, 6ybb:B, 6ybu:A, 6ybu:B, 6ybu:G, 6ybu:H
44 5k5z:D 314 39 0.0479 0.0478 0.3846 0.46 5k5z:A, 5u1j:B, 5u1j:A, 5u1j:C, 5u1j:D
45 8szi:B 802 294 0.1853 0.0723 0.1973 0.69 9avg:Q, 9axf:Q, 9ayf:Q, 7dd6:A, 7dd6:B, 7dd7:A, 7dd7:B, 7m3j:A, 7m3j:B, 7sil:A, 7sil:B, 7sim:A, 7sim:B, 7sin:A, 7sin:B, 8szf:A, 8szf:B, 8szg:B
46 8szh:A 835 169 0.1118 0.0419 0.2071 0.75 9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
47 7dtv:A 779 169 0.1118 0.0449 0.2071 0.76 7dtu:A, 7dtu:B, 7dtv:B
48 8egk:B 355 153 0.0927 0.0817 0.1895 0.88
49 5aup:I 241 40 0.0543 0.0705 0.4250 1.0 5aun:B, 5auo:B, 5aup:B, 3vx3:A, 3vx3:B
50 3add:A 251 35 0.0479 0.0598 0.4286 1.3 3a4l:A, 3a4l:B, 3a4m:A, 3a4m:B, 3adb:A, 3adb:B, 3adc:A, 3adc:B, 3add:B, 3am1:A
51 6riq:C 254 33 0.0415 0.0512 0.3939 1.3 6riq:D, 6riq:G, 6riq:J, 6riq:K, 6riq:M, 6riq:N, 6riq:Q, 6riq:R, 6riq:U, 6riq:V
52 3kjg:A 254 34 0.0415 0.0512 0.3824 1.5 3kjg:B, 3kjh:A, 3kji:A, 3kji:B
53 1cp2:A 269 39 0.0351 0.0409 0.2821 1.6 1cp2:B
54 2w58:A 188 37 0.0415 0.0691 0.3514 2.8
55 3cwq:A 206 50 0.0671 0.1019 0.4200 3.3 3cwq:B
56 7zhf:A 250 38 0.0511 0.0640 0.4211 3.3 7zhk:A, 7zhk:B, 7zhk:C
57 8iu7:B 323 41 0.0415 0.0402 0.3171 3.9 8iu7:A, 8iu7:C, 8iu7:D
58 4prl:A 330 56 0.0511 0.0485 0.2857 4.4 4prl:B
59 2x65:A 334 62 0.0639 0.0599 0.3226 5.2 2x5z:A, 2x5z:B, 2x60:A, 2x60:B, 2x65:B
60 7seh:B 443 110 0.0895 0.0632 0.2545 5.2 7seh:A, 7sei:A, 6va0:A, 6va7:A, 6va8:A, 6va9:A, 6vaq:A
61 6opc:B 741 63 0.0607 0.0256 0.3016 5.3 8dar:A, 8dar:B, 8dar:C, 8dar:D, 8dar:E, 8dar:F, 8das:A, 8das:B, 8das:C, 8das:D, 8das:E, 8das:F, 8dat:A, 8dat:B, 8dat:C, 8dat:D, 8dat:E, 8dat:F, 8dau:A, 8dau:B, 8dau:C, 8dau:D, 8dau:E, 8dau:F, 8dav:A, 8dav:B, 8dav:C, 8dav:D, 8dav:E, 8dav:F, 8daw:A, 8daw:B, 8daw:C, 8daw:D, 8daw:E, 8daw:F, 6oa9:A, 6oa9:B, 6oa9:C, 6oa9:E, 6oa9:F, 6oaa:B, 6oaa:C, 6oaa:D, 6oab:D, 6oab:B, 6oab:C, 6oab:A, 6omb:A, 6omb:B, 6omb:C, 6omb:D, 6omb:E, 6opc:A, 6opc:C, 6opc:D, 6opc:E
62 7q3e:D 226 30 0.0511 0.0708 0.5333 5.3
63 6oa9:D 489 63 0.0607 0.0389 0.3016 5.7 6oaa:E, 6oab:E
64 5ep3:A 253 32 0.0415 0.0514 0.4062 5.9 5ep2:A, 5ep4:A
65 8r9r:A 255 70 0.0703 0.0863 0.3143 7.6
66 4rz3:A 244 28 0.0415 0.0533 0.4643 7.6 4rz3:B
67 7s0t:A 1231 112 0.0767 0.0195 0.2143 9.3

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218