BioLiP

>protein
LEPPPSTFQPLCHPLVEEVSKEVDGYFLQHWNFPNEKARKKFVAAGFSRVTCLYFPKALDDRIHFACRLLTVLFLIDDLL
EYMSFEEGSAYNEKLIPISRGDVLPDRSIPVEYIIYDLWESMRAHDREMADEILEPVFLFMRAQTDRTRARPMGLGGYLE
YRERDVGKELLAALMRFSMGLKLSPSELQRVREIDANCSKHLSVVNDIYSYEKELYTSKTAHSEGGILCTSVQILAQEAD
VTAEAAKRVLFVMCREWELRHQLLVARLSAEGLETPGLAAYVEGLEYQMSGNELWSQTTLRYSV

The query sequence (length=304) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5imi:A	306	304	0.9967	0.9902	0.9967	0.0	3bnx:A, 3bnx:B, 3bnx:C, 3bnx:D, 3bny:A, 3bny:B, 3bny:C, 3bny:D, 3cke:A, 3cke:B, 3cke:C, 5imi:B, 5imi:C, 5imi:D, 5imn:A, 5imn:B, 5imn:C, 5imn:D, 5imp:A, 5imp:B, 5imp:C, 5imp:D, 5in8:A, 5in8:B, 5in8:C, 5in8:D, 5ivg:A, 5ivg:B, 5ivg:C, 5ivg:D, 4kux:A, 4kux:B, 4kux:C, 4kux:D, 4kvd:A, 4kvd:B, 4kvd:C, 4kvd:D, 4kvi:A, 4kvi:B, 4kvi:C, 4kvi:D, 4kvw:A, 4kvw:B, 4kvw:C, 4kvw:D, 4kvy:A, 4kvy:B, 4kvy:C, 4kvy:D, 4kwd:A, 4kwd:B, 4kwd:C, 4kwd:D, 2oa6:D
2	3cke:D	284	304	0.9309	0.9965	0.9309	0.0
3	1dgp:A	290	298	0.6086	0.6379	0.6208	1.11e-133	1dgp:B
4	5erm:B	314	182	0.1579	0.1529	0.2637	3.55e-12	5er8:B, 5erm:A
5	5er8:A	294	155	0.1382	0.1429	0.2710	3.83e-12
6	6vyd:A	304	147	0.1349	0.1349	0.2789	1.89e-11	6vyd:B, 6w26:I, 6w26:A
7	6lcd:A	373	262	0.2138	0.1743	0.2481	2.08e-10	6lcd:B
8	5nx7:A	308	270	0.2039	0.2013	0.2296	2.19e-06	5nx6:A, 5nx6:B, 5nx7:B
9	8h6u:A	338	325	0.2500	0.2249	0.2338	4.45e-06	8h6u:B, 8h6u:C, 8h6u:D
10	8yl9:A	346	255	0.1776	0.1561	0.2118	3.96e-04	8yl9:B, 8yl9:I
11	8yla:A	328	148	0.1118	0.1037	0.2297	4.74e-04	8yla:B
12	7ofl:A	335	171	0.1349	0.1224	0.2398	7.58e-04	7ofl:B
13	8h72:A	328	276	0.1809	0.1677	0.1993	0.007	8h72:B
14	4okm:A	346	157	0.1316	0.1156	0.2548	0.008	4okm:B, 4okm:C, 4okz:A, 4okz:B, 4okz:C, 4okz:D
15	4mc3:A	287	296	0.1974	0.2091	0.2027	0.008
16	7y88:A	354	100	0.0987	0.0847	0.3000	0.011
17	7zrn:A	301	315	0.2336	0.2359	0.2254	0.015	7zrn:B
18	5dz2:A	322	248	0.1974	0.1863	0.2419	0.024	5dz2:B
19	6wkj:A	251	85	0.0559	0.0677	0.2000	0.032
20	4la6:A	325	120	0.1217	0.1138	0.3083	0.082	3v1v:A, 3v1x:A
21	6wkd:A	280	87	0.0592	0.0643	0.2069	0.17	6wkf:A, 6wkh:A
22	5vn5:C	334	40	0.0395	0.0359	0.3000	0.32	6e6i:A, 6e6i:B, 6e6i:C, 6e6i:D, 6e6i:E, 6e6i:F, 6e6i:G, 6e6i:H, 6e6i:I, 5vn5:A, 5vn5:B
23	8gr7:A	326	296	0.1776	0.1656	0.1824	0.39	8gr7:B
24	4ayb:B	1103	58	0.0625	0.0172	0.3276	0.42	3hkz:B, 3hkz:J, 2pmz:B, 2pmz:R, 4v8s:AR, 4v8s:BB, 2waq:B, 2wb1:B, 2wb1:R, 2y0s:B, 2y0s:R
25	1sdd:A	268	56	0.0493	0.0560	0.2679	0.64
26	7ok0:B	1109	108	0.0822	0.0225	0.2315	0.75	7oq4:B, 7oqy:B
27	6oh6:A	311	70	0.0658	0.0643	0.2857	1.9	6oh7:A
28	5nx5:A	287	189	0.1283	0.1359	0.2063	2.1
29	6itd:A	328	32	0.0461	0.0427	0.4375	2.9	6k36:A, 6k37:A, 6k38:A
30	8fgw:C	1342	56	0.0592	0.0134	0.3214	3.4	8fh3:C
31	6yk9:A	341	126	0.1184	0.1056	0.2857	3.9	6yk9:B, 6yk9:C, 6yk9:E, 6yka:B, 6ykb:A, 6ykb:C
32	6rmg:A	1026	132	0.1053	0.0312	0.2424	4.1	6dmb:A, 6dmy:A, 7k65:A, 6mg8:A, 6n7g:A, 6n7g:B, 6n7g:D, 6n7g:E, 6n7h:A, 6n7h:B, 6n7k:A, 6n7k:B, 6n7k:D, 6n7k:E, 6rtw:A, 6rvd:A, 6rvd:B, 7v6y:A, 7v6z:A
33	5gky:A	3660	81	0.0888	0.0074	0.3333	4.5	5gky:C, 5gky:E, 5gky:G, 5gkz:A, 5gkz:C, 5gkz:E, 5gkz:G, 5gl0:A, 5gl0:C, 5gl0:E, 5gl0:G, 5gl1:A, 5gl1:C, 5gl1:E, 5gl1:G
34	8gju:F	332	126	0.0987	0.0904	0.2381	5.3	8gju:D, 8gju:A, 8gju:B
35	3q85:B	151	37	0.0428	0.0861	0.3514	7.7	4aii:A, 4aii:B, 3q85:A
36	6q63:A	751	73	0.0724	0.0293	0.3014	8.1	6q63:B, 6q63:C

[Back]