BioLiP

>protein
LEIPTAIKPRDGRFGSGPSKVRLEQLQTLTTTAAALFGTSHRQAPVKNLVGRVRSGLAELFSLPDGYEVILGNGGATAFW
DAAAFGLIDKRSLHLTYGEFSAKFASAVSKNPFVGEPIIITSDPGSAPEPQTDPSVDVIAWAHNETSTGVAVAVRRPEGS
DDALVVIDATSGAGGLPVDIAETDAYYFAPQKNFASDGGLWLAIMSPAALSRIEAIAATGRWVPDFLSLPIAVENSLKNQ
TYNTPAIATLALLAEQIDWLVGNGGLDWAVKRTADSSQRLYSWAQERPYTTPFVTDPGLRSQVVGTIDFVDDVDAGTVAK
ILRANGIVDTEPYRKLGRNQLRVAMFPAVEPDDVSALTECVDWVVERL

The query sequence (length=368) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2fyf:A	368	368	0.9973	0.9973	0.9973	0.0	2fyf:B, 3vom:A, 3vom:B
2	3ffr:A	361	357	0.2473	0.2521	0.2549	4.60e-23
3	5yb0:B	349	362	0.2120	0.2235	0.2155	2.93e-18	5yb0:A, 5yb0:C, 5yb0:D, 5yb0:E, 5yb0:F, 5yb0:G, 5yb0:H, 5yb0:I, 5yb0:J, 5yb0:K, 5yd2:A, 5yd2:B
4	8a5v:E	366	378	0.2527	0.2541	0.2460	1.63e-16	8a5v:C, 8a5v:F, 8a5v:B, 8a5v:A, 8a5v:G, 8a5v:H, 8a5w:D, 8a5w:C, 8a5w:E, 8a5w:F, 8a5w:B, 8a5w:A, 8a5w:H, 3e77:A, 3e77:B
5	3qbo:B	359	284	0.1957	0.2006	0.2535	8.48e-10	3qbo:A
6	2dr1:A	381	384	0.2174	0.2100	0.2083	8.65e-10	2dr1:B
7	4azj:A	360	366	0.2147	0.2194	0.2158	2.44e-09	4azj:B, 4azk:A, 4azk:B, 2bhx:A, 2bhx:B, 2bi1:A, 2bi1:B, 2bi2:A, 2bi2:B, 2bi3:A, 2bi3:B, 2bi5:A, 2bi5:B, 2bi9:A, 2bi9:B, 2bia:A, 2bia:B, 2bie:A, 2bie:B, 2big:A, 2big:B, 1w23:A, 1w23:B
8	1bt4:A	361	369	0.2147	0.2188	0.2141	2.73e-09	2c0r:A, 2c0r:B, 1w3u:A
9	6czy:A	362	262	0.1739	0.1768	0.2443	1.75e-08	6czy:B, 6czy:C, 6czy:D, 6czz:A, 6czz:B, 6czz:C, 6czz:D
10	1bjo:A	360	369	0.2255	0.2306	0.2249	5.03e-07	1bjo:B
11	7t7j:B	360	284	0.1793	0.1833	0.2324	6.70e-07	7t7j:A
12	2yri:A	352	291	0.1957	0.2045	0.2474	0.003	2yri:B, 2yrr:A, 2yrr:B
13	1m32:B	362	281	0.1739	0.1768	0.2278	0.005	1m32:A, 1m32:C, 1m32:D, 1m32:E, 1m32:F
14	1iug:A	348	207	0.1386	0.1466	0.2464	0.005	1iug:B
15	6xdk:D	359	288	0.1766	0.1811	0.2257	0.015	6xdk:B, 6xdk:A, 6xdk:C
16	3zrq:A	382	231	0.1603	0.1545	0.2554	0.019	3zrp:A, 3zrp:B, 3zrq:B, 3zrr:A, 3zrr:B
17	3qm2:B	331	163	0.1168	0.1299	0.2638	0.053	3qm2:A
18	7cep:A	414	171	0.1250	0.1111	0.2690	0.51	7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
19	1n31:A	386	53	0.0462	0.0440	0.3208	0.52	1elq:A, 1elq:B, 1elu:A, 1elu:B, 1n2t:A, 1n2t:B, 1n31:B
20	3isl:A	387	72	0.0625	0.0594	0.3194	0.55	3isl:B
21	7d4i:3B	242	74	0.0571	0.0868	0.2838	1.9	7aju:CB, 7d4i:3C, 7d5s:3C, 7d5t:3B, 7d5t:3C, 7d63:3C, 6ke6:3C, 6lqp:3C, 6lqq:3C, 6lqr:3C, 6lqs:3C, 6lqt:3C, 6lqu:3C, 6lqv:3C, 7suk:SD, 5wlc:SD, 6zqd:CA, 6zqd:CB
22	6pk3:B	400	85	0.0679	0.0625	0.2941	2.1	6pk1:A, 6pk1:B, 6pk3:A
23	2wym:A	303	68	0.0543	0.0660	0.2941	2.6	2wym:B, 2wym:C, 2wym:D, 2wym:E, 2wym:F
24	6pd2:C	616	79	0.0543	0.0325	0.2532	2.8	6pd1:A, 6pd1:B, 6pd1:D, 6pd2:A, 6pd2:B, 6pd2:D
25	1fcv:A	324	65	0.0516	0.0586	0.2923	3.3
26	3afg:B	507	83	0.0598	0.0434	0.2651	4.2	3afg:A
27	8wm6:e	169	72	0.0435	0.0947	0.2222	4.3	8wmv:e, 8wmw:e
28	7x6v:A	1381	109	0.0842	0.0224	0.2844	6.2
29	7x6s:A	1453	109	0.0842	0.0213	0.2844	6.2	5ltf:A, 5ltn:A, 5ltn:B, 5t2t:A
30	4ifd:H	295	57	0.0489	0.0610	0.3158	8.0	5c0x:H, 6fsz:HH, 5jea:H, 5k36:H, 8qcf:I
31	7vwt:A	326	39	0.0408	0.0460	0.3846	8.7	7vwt:B
32	8odq:D	410	72	0.0652	0.0585	0.3333	9.9	8odq:B

[Back]