Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LEEAPWPPPEGAFVGFVLSRKEPMWADLLALAAARGGRVHRAPEPYKALRDLKEARGLLAKDLSVLALREGLGLPPGDDP
MLLAYLLDPSNTTPEGVARRYGGEWTEEAGERAALSERLFANLWGRLEGEERLLWLYREVERPLSAVLAHMEATGVRLDV
AYLRALSLEVAEEIARLEAEVFRLAGHPFNLNSRDQLERVLFDELGLPAIGKTEKTGKRSTSAAVLEALREAHPIVEKIL
QYRELTKLKSTYIDPLPDLIHPRTGRLHTRFNQTATATGRLSSSDPNLQNIPVRTPLGQRIRRAFIAEEGWLLVALDYSQ
IELRVLAHLSGDENLIRVFQEGRDIHTETASWMFRRAAKTINFGVLYGMSAHRLSQELAIPYEEAQAFIERYFQSFPKVR
AWIEKTLEEGRRRGYVETLFGRRRYVPDLEARVKSVREAAERMAFNMPVQGTAADLMKLAMVKLFPRLEEMGARMLLQVH
DELVLEAPKERAEAVARLAKEVMEGVYPLAVPLEVEVGIGEDWLSAKE

The query sequence (length=528) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1taq:A 807 539 0.9924 0.6493 0.9722 0.0 4bwj:A, 4bwm:A, 4c8k:A, 4c8l:A, 4c8m:A, 4c8n:A, 4c8o:A, 4cch:A, 4df4:A, 4df8:A, 4dfj:A, 4dfk:A, 4dfm:A, 4dfp:A, 4dle:A, 4dlg:A, 5e41:A, 4elt:A, 4elu:A, 4elv:A, 6fbc:A, 6fbd:A, 6fbe:A, 6fbf:A, 6fbg:A, 6fbh:A, 6fbi:A, 2ktq:A, 3ktq:A, 4ktq:A, 5ktq:A, 3lwl:A, 3lwm:A, 3m8r:A, 3m8s:A, 4n5s:A, 5nkl:A, 5o7t:A, 3ojs:A, 3oju:A, 7owf:A, 5oxj:A, 3po4:A, 3po5:A, 3py8:A, 6q4u:A, 6q4v:A, 1qss:A, 1qsy:A, 1qtm:A, 3rr7:A, 3rr8:A, 3rrg:A, 3rrh:A, 3rtv:A, 3sv3:A, 3sv4:A, 3syz:A, 3sz2:A, 5szt:A, 3t3f:A, 1tau:A, 5w6k:A, 5w6q:C, 5w6q:G, 4xiu:A, 5ytc:A, 5ytd:A, 5yte:A, 5ytf:A, 5ytg:A, 5yth:A, 5z3n:A
2 5w6q:A 515 525 0.9697 0.9942 0.9752 0.0
3 4n56:A 494 528 0.9337 0.9980 0.9337 0.0
4 4dqq:D 584 425 0.4034 0.3647 0.5012 5.92e-130 4b9l:A, 4b9m:A, 4b9n:A, 4b9s:A, 4b9t:A, 4b9u:A, 4b9v:A, 2bdp:A, 3bdp:A, 4bdp:A, 4dqi:A, 4dqi:D, 4dqp:A, 4dqp:D, 4dqq:A, 4dqr:A, 4dqr:D, 4dqs:A, 4ds4:A, 4ds5:A, 4dse:D, 4dsf:D, 4dsi:A, 4dsj:A, 4dsj:B, 4dsk:A, 4dsl:A, 6dsu:A, 6dsv:A, 6dsw:A, 6dsx:A, 6dsy:A, 4dwi:A, 4e0d:A, 3eyz:A, 3ez5:A, 3ez5:D, 4ez6:D, 4ez9:A, 4ez9:D, 4f2r:A, 4f2r:D, 4f2s:A, 4f2s:D, 4f3o:A, 4f3o:D, 4f4k:A, 4f4k:D, 4f8r:A, 2hhq:A, 2hhs:A, 2hht:A, 2hhu:A, 2hhv:A, 2hhw:D, 2hhw:A, 2hhx:A, 3hp6:A, 3hp6:D, 3hpo:A, 3ht3:A, 3ht3:D, 2hvh:A, 2hvh:D, 2hvi:A, 2hvi:D, 2hw3:A, 7k5o:A, 7k5p:A, 7k5q:A, 7k5r:A, 7k5s:A, 7k5t:A, 7k5u:A, 1l3s:A, 1l3t:A, 1l3u:A, 1l3v:A, 1l5u:A, 1lv5:A, 1lv5:B, 6mu4:A, 6mu5:A, 1njw:A, 1njx:A, 1njy:A, 1njz:A, 1nk0:A, 1nk4:A, 1nk5:A, 1nk6:A, 1nk7:A, 1nk8:A, 1nk9:A, 1nkb:A, 1nkc:A, 1nke:A, 4o0i:A, 6p5c:A, 3pv8:A, 3pv8:D, 3px0:D, 3px4:D, 3px6:A, 3px6:D, 8scg:A, 8scg:D, 8sci:A, 8sci:D, 8scj:A, 8scj:D, 8sck:A, 8sck:D, 8scl:A, 8scl:D, 8scm:A, 8scm:D, 8scn:A, 8scn:D, 8sco:A, 8sco:D, 8scp:A, 8scp:D, 8scq:A, 8scq:D, 8scr:A, 8scr:D, 8scs:A, 8scs:D, 8sct:A, 8sct:D, 8scu:A, 8scu:D, 3tan:A, 3tap:A, 3taq:A, 3tar:A, 3thv:A, 3thv:D, 3ti0:A, 3ti0:D, 1u45:A, 1u47:A, 1u48:A, 1u49:A, 1u4b:A, 1ua0:A, 1ua1:A, 6ueu:A, 6ueu:D, 4uqg:A, 6ur2:A, 6ur4:A, 6ur9:A, 6ur9:D, 6us5:A, 6us5:D, 1xc9:A, 2xo7:A, 2xy5:A, 2xy6:A, 2xy7:A, 2y1i:A, 2y1j:A, 4yfu:A, 4yfu:D
5 4ds4:D 561 414 0.3958 0.3725 0.5048 2.02e-128 4ds5:D, 4dse:A, 4dsf:A, 4ez6:A, 4f8r:D, 3px0:A, 3px4:A
6 8oo6:A 604 431 0.3807 0.3328 0.4664 1.51e-118 1d8y:A, 1d9d:A, 1d9f:A, 1kfs:A, 2kfn:A, 2kfz:A, 1kln:A, 1krp:A, 1ksp:A, 2kzm:A, 2kzz:A, 8ooy:A, 1qsl:A
7 1kfd:A 560 431 0.3466 0.3268 0.4246 1.15e-100
8 6vdd:A 567 409 0.3314 0.3086 0.4279 5.46e-100 6vdd:D
9 6vde:A 860 409 0.3314 0.2035 0.4279 1.04e-96 6vde:B
10 4xvi:A 647 501 0.3144 0.2566 0.3313 1.24e-76 4xvk:A, 4xvl:A, 4xvm:A
11 8ef9:A 599 508 0.3144 0.2771 0.3268 6.90e-76 8efc:A, 8efk:A
12 6vdc:A 497 312 0.2538 0.2696 0.4295 8.81e-76
13 7zus:CCC 650 528 0.3087 0.2508 0.3087 7.89e-71 8e23:A, 8e24:A, 8e24:D, 8gd7:A, 4x0p:A, 4x0p:B, 4x0p:C, 4x0p:D, 4x0q:A, 4x0q:B, 7zus:AAA, 7zus:BBB, 7zx0:AAA, 7zx0:BBB, 7zx0:CCC, 7zx0:DDD, 7zx0:EEE, 7zx0:FFF, 7zx1:AAA, 7zx1:BBB, 7zx1:CCC, 7zx1:DDD, 7zx1:EEE, 7zx1:FFF
14 8e23:D 603 524 0.3068 0.2687 0.3092 1.04e-62
15 6xbu:A 605 526 0.2936 0.2562 0.2947 2.30e-61
16 6n9u:H 645 441 0.2178 0.1783 0.2608 2.66e-22 6n9v:H, 6n9w:H, 6n9x:H, 6p7e:D
17 1sks:A 681 376 0.1894 0.1468 0.2660 3.30e-21 1skr:A, 1skw:A, 1sl1:A, 1sl2:A, 1t7p:A, 1tk5:A, 1x9m:A, 1x9s:A, 1x9w:A, 1zyq:A
18 6p7e:C 672 376 0.1894 0.1488 0.2660 5.84e-21 1sl0:A, 1sl0:C
19 2ajq:A 704 377 0.1894 0.1420 0.2653 1.06e-20 2ajq:F, 6n7w:H, 6p7e:A, 6p7e:B, 1t8e:A, 1tk0:A, 1tk8:A, 1tkd:A
20 8g5j:A 941 250 0.1136 0.0638 0.2400 0.047
21 8g5k:A 905 233 0.1136 0.0663 0.2575 0.13
22 8d33:A 974 233 0.1098 0.0595 0.2489 0.20 8d37:A, 8d3r:A, 8d42:A, 8udl:A, 8v54:A
23 8v5r:A 944 234 0.1098 0.0614 0.2479 0.38 8g5i:A, 8g5l:A, 8g5m:A, 8g5n:A, 8g5o:A, 8g5p:A, 8t7e:A
24 8v55:A 902 239 0.1061 0.0621 0.2343 0.39
25 8udk:A 1012 264 0.1212 0.0632 0.2424 1.2 5c51:A, 5c52:A, 5c53:A, 4ztu:A, 4ztz:A
26 3ogd:A 288 32 0.0265 0.0486 0.4375 2.1 3cvs:A, 3cvs:B, 3cvs:C, 3cvs:D, 3cvt:A, 3cvt:B, 3cvt:C, 3cvt:D, 3cw7:A, 3cw7:B, 3cw7:C, 3cw7:D, 3cwa:A, 3cwa:B, 3cwa:C, 3cwa:D, 3cws:A, 3cws:B, 3cws:C, 3cws:D, 3cwt:A, 3cwt:B, 3cwt:C, 3cwt:D, 3cwu:A, 3cwu:B, 3cwu:C, 3cwu:D, 3d4v:A, 3d4v:B, 3d4v:C, 3d4v:D, 1diz:B, 1diz:A, 3oh6:A, 3oh9:A, 1pvs:A, 1pvs:B
27 5k16:B 328 45 0.0284 0.0457 0.3333 2.2 5cvm:A, 5k16:A, 5k1c:A, 5l8h:A, 5l8w:A
28 4kdx:A 207 140 0.0720 0.1836 0.2714 2.4 4kdx:B
29 1qd1:B 325 102 0.0587 0.0954 0.3039 3.5 1qd1:A
30 8y9c:B 1609 36 0.0284 0.0093 0.4167 3.5
31 6oq5:A 2346 36 0.0284 0.0064 0.4167 3.6 6oq7:A, 7s0z:B, 7s0z:A
32 7ml7:A 1216 49 0.0303 0.0132 0.3265 4.0
33 8xon:O 593 148 0.0758 0.0675 0.2703 7.4 8xon:S, 8xon:R, 8xon:Q, 8xon:P, 8xon:T, 8xoo:R, 8xoo:Q, 8xoo:P, 8xoo:T, 8xoo:S
34 1ued:A 391 146 0.0682 0.0921 0.2466 7.7 1ued:B
35 2yfb:B 238 59 0.0436 0.0966 0.3898 7.9 2yfa:A, 2yfa:B, 2yfb:A
36 6o8w:S 102 46 0.0265 0.1373 0.3043 9.9 7nhk:U, 6o8x:S, 6o8y:S, 6o8z:S, 6o90:S, 7p7q:U, 7p7r:U, 7p7s:U, 7p7t:U, 7p7u:U, 6w6p:S, 6wu9:S

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218