BioLiP

>protein
LEAKKEENLADWYSQVITKSEMIEYHDISGCYILRPWAYAIWEAIKDFFDAEIKKLGVENCYFPMFVSQSALEKEKTHVA
DFAPEVAWVTRSGKTELAEPIAIRPTSETVMYPAYAKWVQSHRDLPIKLNQWCNVVRWEFKHPQPFLRTREFLWQEGHSA
FATMEEAAEEVLQILDLYAQVYEELLAIPVVKGRKTEKEKFAGGDYTTTIEAFISASGRAIQGGTSHHLGQNFSKMFEIV
FEDPKIPGEKQFAYQNSWGLTTRTIGVMTMVHGDNMGLVLPPRVACVQVVIIPCGITNALSEEDKEALIAKCNDYRRRLL
SVNIRVRADLRDNYSPGWKFNHWELKGVPIRLEVGPRDMKSCQFVAVRRDTGEKLTVAENEAETKLQAILEDIQVTLFTR
ASEDLKTHMVVANTMEDFQKILDSGKIVQIPFCGEIDCEDWIKKTTARDQSMGAKSLCIPFKPLCELQPGAKCVCGKNPA
KYYTLFGRSY

The query sequence (length=490) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7f9a:A	499	497	1.0000	0.9820	0.9859	0.0	7bbu:A, 7f98:A, 7f98:B, 7f99:A, 7f99:B, 7f9a:B, 7f9b:A, 7f9b:B, 7f9c:A, 7f9c:B, 7f9d:A, 7f9d:B, 4hvc:A, 4hvc:B, 4k86:A, 4k87:A, 4k88:A, 7osy:A, 7osy:B, 7osz:A, 7osz:B, 7ot0:A, 7ot0:B, 7ot1:A, 7ot1:B, 7ot2:A, 7ot2:B, 7ot3:A, 7ot3:B, 5v58:A, 5vad:A, 5vad:B, 7x09:A, 7x09:B, 7x1o:A, 7x1o:B, 7y1h:A, 7y1h:B, 7y1w:A, 7y1w:B, 7y28:A, 7y28:B, 7y3s:A, 7y3s:B
2	5xip:B	475	490	0.5755	0.5937	0.5755	0.0	5xip:A, 5xip:C, 5xip:D
3	6nab:B	497	507	0.5673	0.5594	0.5483	0.0	6nab:A, 6uyh:A, 6uyh:B
4	6mn8:A	399	408	0.5265	0.6466	0.6324	0.0
5	7evv:A	489	502	0.5673	0.5685	0.5538	0.0	6a88:A, 6a88:B, 6a88:C, 6a88:D, 7evu:A, 7evu:B, 7f9p:A, 7f9q:A, 7f9q:B, 7f9r:A, 7f9s:A, 7f9t:A, 7f9t:B, 7f9u:A, 7f9u:B, 7f9u:C, 7f9u:D, 7f9v:A, 7f9v:B, 7fak:A, 7fal:A, 7fal:B, 7fam:A, 7fan:A, 7v8j:A, 7v8j:B, 7v8k:A, 7v8k:B, 7vc1:A, 7vc2:A, 7vc2:B, 7vc3:A, 7vc5:A, 5xig:A, 5xig:B, 5xig:C, 5xig:D, 5xih:A, 5xih:B, 5xih:C, 5xih:D, 5xii:A, 5xii:B, 5xii:C, 5xii:D, 5xij:A, 5xij:B, 5xij:C, 5xij:D, 5xik:A, 5xik:B, 5xik:C, 5xik:D, 5xiq:A, 5xiq:B, 5xiq:C, 5xiq:D
6	5f9z:A	493	491	0.5531	0.5497	0.5519	0.0	5f9y:A, 5f9y:B, 5f9z:B, 5xio:A, 5xio:B
7	6t7k:A	494	497	0.5265	0.5223	0.5191	0.0	7f96:A, 7f97:A, 7f97:B, 7f97:C, 7f97:D, 4olf:A, 4q15:A, 4q15:B, 7qb7:A, 7qc1:A, 7qc1:D, 7qc1:I, 7qc2:A, 7v9d:A, 4ydq:A, 4ydq:B
8	5xil:A	445	496	0.4980	0.5483	0.4919	1.99e-172
9	5ifu:B	445	491	0.4776	0.5258	0.4766	1.74e-154	5ifu:A, 4wi1:A, 4wi1:B
10	1h4s:A	473	488	0.4327	0.4482	0.4344	1.07e-130	1h4q:A, 1h4q:B, 1h4s:B, 1h4t:A, 1h4t:B, 1h4t:C, 1h4t:D, 1hc7:A, 1hc7:B, 1hc7:C, 1hc7:D
11	1nj1:A	463	434	0.3245	0.3434	0.3664	4.09e-93	1nj2:A, 1nj5:A, 1nj6:A
12	3ial:B	505	512	0.3184	0.3089	0.3047	8.78e-79	3ial:A
13	1qf6:A	641	386	0.1918	0.1466	0.2435	6.29e-08	7cbg:A, 7cbg:B, 7cbh:A, 7cbh:B, 7cbi:A, 7cbi:B, 1evk:A, 1evk:B, 1evl:A, 1evl:B, 1evl:C, 1evl:D, 1fyf:A, 1fyf:B, 8h98:B, 8h98:A, 8h99:A, 8h99:B, 8h9a:A, 8h9b:A, 8h9c:A, 4hwo:A, 4hwo:B, 4hwp:A, 4hwp:B, 4hwr:A, 4hwr:B, 4hws:A, 4hws:B, 1kog:A, 1kog:B, 1kog:C, 1kog:D, 1kog:E, 1kog:F, 1kog:G, 1kog:H, 6l2p:A, 6l2p:B, 6l2q:A, 6l2q:B, 8ou8:D, 8ou8:A, 4p3o:A, 4p3o:B, 4p3p:A, 4p3p:B, 8qic:A, 8qic:D, 1tke:A, 1tkg:A, 1tky:A, 8wia:A, 8wia:B, 8wig:A, 8wig:B, 8wih:A, 8wih:B, 8wii:A, 8wii:B, 8wij:B, 8wij:A, 7wm7:A, 7wm7:B, 7wmf:A, 7wmf:B, 7wmi:A, 7wmi:B
14	2i4n:B	442	169	0.0837	0.0928	0.2426	1.76e-05	2i4m:B, 2i4m:C, 2i4n:A, 2i4n:C, 2i4o:A, 2i4o:B, 2i4o:C
15	2i4n:B	442	149	0.0633	0.0701	0.2081	0.001	2i4m:B, 2i4m:C, 2i4n:A, 2i4n:C, 2i4o:A, 2i4o:B, 2i4o:C
16	6vu9:A	631	397	0.1776	0.1379	0.2191	2.58e-05
17	5znj:A	563	183	0.0878	0.0764	0.2350	6.73e-04	5znk:A
18	5znj:A	563	176	0.0918	0.0799	0.2557	0.007	5znk:A
19	2j3l:B	570	155	0.0694	0.0596	0.2194	0.002	2j3l:A, 2j3m:A, 2j3m:B
20	2j3l:B	570	177	0.0857	0.0737	0.2373	0.029	2j3l:A, 2j3m:A, 2j3m:B
21	4ttv:A	403	194	0.0959	0.1166	0.2423	0.010	4hwt:A, 4hwt:B, 4p3n:A, 4p3n:B, 4p3n:C, 4p3n:D, 4ttv:B, 4ttv:C, 4ttv:D
22	8w8j:A	572	171	0.0694	0.0594	0.1988	0.022	8w8j:B, 8w8l:A, 8w8l:B, 8w9i:A, 8w9i:B
23	8w8j:A	572	165	0.0735	0.0629	0.2182	0.031	8w8j:B, 8w8l:A, 8w8l:B, 8w9i:A, 8w9i:B
24	5ijl:A	943	62	0.0367	0.0191	0.2903	0.11
25	1nyq:B	645	325	0.1367	0.1039	0.2062	0.16	1nyq:A, 1nyr:A, 1nyr:B
26	7l3o:B	401	66	0.0469	0.0574	0.3485	0.28	7l3o:A, 7l3o:C, 7l3o:D
27	4h19:A	372	84	0.0490	0.0645	0.2857	1.8	4h19:B, 4h19:C, 4h19:D, 4h19:F, 4h19:E, 4h19:G, 4h19:H, 4h19:I, 4h19:K, 4h19:L, 4h19:M, 4h19:N, 4h19:P, 4h19:J, 4h19:O
28	5svc:A	763	114	0.0673	0.0433	0.2895	2.1	5m45:A, 5m45:D, 5m45:G, 5m45:J, 5svb:A, 5svb:D, 5svc:D
29	4wwc:A	213	78	0.0449	0.1033	0.2821	2.8
30	8hi5:A	647	78	0.0429	0.0325	0.2692	3.1
31	1x46:A	150	52	0.0286	0.0933	0.2692	4.9
32	7nfe:A	3585	59	0.0347	0.0047	0.2881	6.8
33	8bot:A	3528	59	0.0347	0.0048	0.2881	7.3

[Back]