Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
LDPRLGANAFLIIRLDRIIEKLRTKLDEAEKIDPEHFVSEIDARVTKIEGTHCEKRTFQCGGNEQECISDLLVCDGHKDC
HNAHDEDPDVCDTSVVKAGNVFSGTSTWHGCLAREDHVTRITITASKRRKFFTARIWLRALVESELERHGENVTSSFNAK
GYYNFASRRLILLPTDDHDDHLAVVCSFNRGDNERAECHRVTEATLHQCADLFVTLEEHD

The query sequence (length=220) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2gtl:N 220 220 1.0000 1.0000 1.0000 7.16e-164
2 4u8u:N 219 218 0.6091 0.6119 0.6147 1.47e-101 4u8u:c, 4u8u:r
3 2gtl:M 217 201 0.3182 0.3226 0.3483 2.48e-43
4 4u8u:M 222 203 0.3273 0.3243 0.3547 5.29e-41 4u8u:b, 4u8u:q
5 2gtl:O 215 209 0.3000 0.3070 0.3158 2.24e-20
6 4u8u:O 213 198 0.2727 0.2817 0.3030 5.98e-20 4u8u:s, 4u8u:d
7 5oyl:D 46 34 0.0682 0.3261 0.4412 2.49e-04
8 1f5y:A 85 55 0.0909 0.2353 0.3636 3.56e-04
9 1f5y:A 85 34 0.0682 0.1765 0.4412 0.024
10 2kny:A 80 41 0.0727 0.2000 0.3902 0.003 2knx:A
11 8em4:A 3818 68 0.1136 0.0065 0.3676 0.005 8em4:B
12 8em4:A 3818 42 0.0682 0.0039 0.3571 0.011 8em4:B
13 8em4:A 3818 72 0.1136 0.0065 0.3472 0.018 8em4:B
14 8em4:A 3818 51 0.0773 0.0045 0.3333 0.020 8em4:B
15 8em4:A 3818 34 0.0682 0.0039 0.4412 0.17 8em4:B
16 8em4:A 3818 41 0.0682 0.0039 0.3659 0.17 8em4:B
17 8em4:A 3818 35 0.0591 0.0034 0.3714 0.28 8em4:B
18 8em4:A 3818 59 0.0818 0.0047 0.3051 0.39 8em4:B
19 8em4:A 3818 34 0.0636 0.0037 0.4118 0.41 8em4:B
20 8em4:A 3818 42 0.0727 0.0042 0.3810 0.43 8em4:B
21 8em4:A 3818 34 0.0591 0.0034 0.3824 1.3 8em4:B
22 8em4:A 3818 40 0.0591 0.0034 0.3250 1.8 8em4:B
23 8em4:A 3818 41 0.0773 0.0045 0.4146 3.3 8em4:B
24 8em4:A 3818 55 0.0818 0.0047 0.3273 4.4 8em4:B
25 8em4:A 3818 34 0.0682 0.0039 0.4412 4.9 8em4:B
26 8em7:A 4378 68 0.1136 0.0057 0.3676 0.009 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
27 8em7:A 4378 42 0.0682 0.0034 0.3571 0.016 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
28 8em7:A 4378 72 0.1136 0.0057 0.3472 0.027 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
29 8em7:A 4378 51 0.0773 0.0039 0.3333 0.028 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
30 8em7:A 4378 50 0.0864 0.0043 0.3800 0.086 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
31 8em7:A 4378 43 0.0773 0.0039 0.3953 0.11 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
32 8em7:A 4378 46 0.0818 0.0041 0.3913 0.14 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
33 8em7:A 4378 41 0.0682 0.0034 0.3659 0.24 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
34 8em7:A 4378 35 0.0682 0.0034 0.4286 0.26 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
35 8em7:A 4378 35 0.0591 0.0030 0.3714 0.39 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
36 8em7:A 4378 34 0.0636 0.0032 0.4118 0.56 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
37 8em7:A 4378 33 0.0636 0.0032 0.4242 0.59 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
38 8em7:A 4378 42 0.0727 0.0037 0.3810 0.59 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
39 8em7:A 4378 37 0.0682 0.0034 0.4054 0.64 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
40 8em7:A 4378 46 0.0682 0.0034 0.3261 1.1 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
41 8em7:A 4378 34 0.0591 0.0030 0.3824 1.7 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
42 8em7:A 4378 40 0.0591 0.0030 0.3250 2.3 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
43 8em7:A 4378 35 0.0682 0.0034 0.4286 4.5 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
44 8em7:A 4378 55 0.0818 0.0041 0.3273 6.2 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
45 8em7:A 4378 41 0.0682 0.0034 0.3659 6.5 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
46 8em7:A 4378 34 0.0591 0.0030 0.3824 9.2 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
47 2m96:A 44 35 0.0682 0.3409 0.4286 0.016
48 2jm4:A 43 35 0.0727 0.3721 0.4571 0.046
49 1n7d:A 639 63 0.0955 0.0329 0.3333 0.067 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
50 1n7d:A 639 34 0.0591 0.0203 0.3824 1.6 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
51 8jxc:A 1337 45 0.0864 0.0142 0.4222 0.071 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
52 8jxc:A 1337 43 0.0864 0.0142 0.4419 0.13 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
53 8jxc:A 1337 34 0.0682 0.0112 0.4412 2.7 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
54 8jxc:A 1337 38 0.0682 0.0112 0.3947 3.1 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
55 8jxc:A 1337 33 0.0636 0.0105 0.4242 4.3 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
56 8jxc:A 1337 42 0.0727 0.0120 0.3810 8.4 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
57 8jxc:A 1337 32 0.0455 0.0075 0.3125 9.3 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
58 2m7p:A 42 34 0.0682 0.3571 0.4412 0.075
59 1jrf:A 47 39 0.0636 0.2979 0.3590 0.11
60 4e0s:B 898 46 0.0773 0.0189 0.3696 0.73 7nyc:B, 7nyd:B
61 1gp7:A 124 70 0.0818 0.1452 0.2571 0.73 1gp7:B, 1gp7:C
62 4a5w:B 871 46 0.0773 0.0195 0.3696 0.74
63 8v14:A 167 26 0.0455 0.0599 0.3846 1.2 8v14:B
64 8ufb:R 35 34 0.0636 0.4000 0.4118 1.4 8ufb:S, 8ufb:T, 8ufb:U
65 8xi4:M 79 39 0.0636 0.1772 0.3590 1.5 8ua4:R, 8ufb:V, 8ufb:W, 8ufb:X, 8ufb:Y, 8ufc:V, 8ufc:W, 8ufc:X, 8ufc:Y, 8xi4:N, 8xi4:O, 8xi4:P, 8ys2:M, 8ys2:N, 8ys2:O, 8ys2:P
66 8xi4:M 79 34 0.0682 0.1899 0.4412 4.2 8ua4:R, 8ufb:V, 8ufb:W, 8ufb:X, 8ufb:Y, 8ufc:V, 8ufc:W, 8ufc:X, 8ufc:Y, 8xi4:N, 8xi4:O, 8xi4:P, 8ys2:M, 8ys2:N, 8ys2:O, 8ys2:P
67 1d2l:A 45 41 0.0636 0.3111 0.3415 2.5
68 3t5o:A 871 50 0.0818 0.0207 0.3600 3.1
69 6byv:A 121 39 0.0636 0.1157 0.3590 3.1 3dpr:E, 8ihp:M, 8ihp:N, 8ihp:O, 8ua8:R, 1v9u:5, 8xi5:Q, 8xi5:R, 8xi5:S, 8xi5:T, 8ys4:Q, 8ys4:R, 8ys4:S, 8ys4:T
70 4rgu:B 144 72 0.0909 0.1389 0.2778 3.2 5bmz:A, 5bmz:B, 5bmz:C, 5bmz:D, 4rgs:A, 4rgs:B, 4rgu:A
71 7nyc:C 809 42 0.0773 0.0210 0.4048 3.4 7nyd:C
72 8e73:G2 258 47 0.0682 0.0581 0.3191 3.9 6x89:G2
73 7aqq:y 268 57 0.0727 0.0597 0.2807 4.0 7ar7:y, 7ar8:y, 7arb:y, 8bef:y, 8bpx:y, 8bq5:y, 8bq6:y
74 7nyd:E 484 37 0.0682 0.0310 0.4054 4.6 7nyc:E
75 5g2x:C 486 53 0.0818 0.0370 0.3396 4.6 7d0f:C, 7d0g:C, 7d1a:C
76 8b0f:E 513 37 0.0682 0.0292 0.4054 4.9 3ojy:A
77 1j8e:A 44 38 0.0682 0.3409 0.3947 5.1
78 5b4x:B 479 35 0.0682 0.0313 0.4286 5.3 3a7q:B, 5b4x:D, 5b4y:B
79 7mhs:E 489 80 0.1182 0.0532 0.3250 6.5
80 4ote:B 240 64 0.0682 0.0625 0.2344 7.1 4ote:A
81 5oy9:D 37 34 0.0591 0.3514 0.3824 7.4
82 7aqq:z 233 47 0.0636 0.0601 0.2979 7.8 7a23:q, 7a23:p, 7a24:q, 7a24:p, 7ar7:z, 7ar8:z, 7arb:z, 8bef:z, 8bpx:z, 8bq5:z, 8bq6:z
83 8jxj:A 570 34 0.0682 0.0263 0.4412 9.7 8jxj:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218