Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LDPGLQPGQFSADEAGAQLFAQSYQSSAEQVLFQSVAASWAHDTNITAENARRQEEAALLSQEFAEAWGQKAKELYEPIW
QQFTDPQLRRIIGAVRTLGSANLPLAKRQQYNALLSQMSRIYSTAKVCLTCWSLDPDLTNILASSRSYAMLLFAWEGWHN
AAGIPLKPLYEDFTALSNEAYKQDGFTDTGAYWRSWYNSPTFEDDLEHLYQQLEPLYLNLHAFVRRALHRRYGDRYINLR
GPIPAHLLGDMWAQSWENIYDMVVPFPDKPNLDVTSTMLQQGWQATHMFRVAEEFFTSLELSPMPPEFWEGSMLEKPADG
REVVCHASAWDFYNRKDFRIKQCTRVTMDQLSTVHHEMGHIQYYLQYKDLPVSLRRGANPGFHEAIGDVLALSVSTPEHL
HKIGLLDRVTNDTESDINYLLKMALEKIAFLPFGYLVDQWRWGVFSGRTPPSRYNFDWWYLRTKYQGICPPVTRNETHFD
AGAKFHVPNVTPYIRYFVSFVLQFQFHEALCKEAGYEGPLHQCDIYRSTKAGAKLRKVLRAGSSRPWQEVLKDMVGLDAL
DAQPLLKYFQLVTQWLQEQNQQNGEVLGWPEYQWHPPLPDNYPE

The query sequence (length=604) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7q3y:A 1201 609 0.9901 0.4979 0.9819 0.0 5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
2 7q3y:A 1201 588 0.5298 0.2664 0.5442 0.0 5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
3 6s1y:A 595 581 0.4238 0.4303 0.4406 4.20e-180 6s1z:A
4 8woy:A 596 602 0.4421 0.4480 0.4435 1.50e-179 8wox:A, 8woz:A
5 7dhx:A 593 599 0.4338 0.4418 0.4374 1.36e-177
6 8gry:A 597 599 0.4272 0.4322 0.4307 8.30e-175 8ka8:A, 8kc2:A, 7wrh:D, 7wri:A, 7xo4:D, 7xo4:E, 7yv8:A, 7yvu:A
7 7wsk:A 596 602 0.4321 0.4379 0.4336 2.86e-174
8 7e3j:A 695 601 0.4305 0.3741 0.4326 1.18e-173 7c8d:A, 7w8s:A, 7wa1:A, 7wa3:A, 7wa3:B, 7wsg:A, 7wsh:A, 8xyz:A, 8xzb:A, 8xzd:A
9 7w6u:A 597 602 0.4338 0.4389 0.4352 2.76e-173 7w6r:A, 7xby:A
10 4aa1:A 598 564 0.4023 0.4064 0.4309 2.56e-172 5a2r:A, 4aa2:A, 4asq:A, 4asr:A, 4ca7:A, 4ca8:A, 1j36:A, 1j36:B, 1j37:A, 1j37:B, 1j38:A, 1j38:B, 2x8y:A, 2x8z:A, 2x90:A, 2x91:A, 2x92:A, 2x93:A, 2x94:A, 2x95:A, 2x96:A, 2x97:A, 2xhm:A, 3zqz:A
11 7c8j:A 707 599 0.4238 0.3621 0.4274 1.64e-169 7c8k:A, 8k4u:B, 8u0t:A, 7xa7:A, 7xa7:C, 7xa7:E, 7xa7:G
12 8p2x:A 750 599 0.4156 0.3347 0.4190 3.08e-163 7a91:D, 7a92:D, 7a94:D, 2ajf:A, 2ajf:B, 8aqs:B, 8b9p:A, 8b9p:B, 8bfw:A, 8bfw:C, 7bh9:A, 8bn1:B, 8bn1:A, 8byj:B, 8byj:A, 3d0g:A, 3d0g:B, 3d0h:A, 3d0h:B, 7ddo:A, 7ddp:A, 8df5:E, 8df5:F, 7dmu:A, 7dmu:C, 7dqa:A, 7drv:A, 7drv:B, 7dwx:B, 7dwx:D, 7e7e:A, 7e7e:B, 8e7m:A, 7ekc:A, 7eke:A, 7ekf:A, 7ekg:A, 7ekh:A, 9fmm:A, 9fmm:B, 8fxc:A, 8h06:A, 8h5c:A, 8i91:A, 8i91:C, 8i92:A, 8i92:C, 8i93:A, 8i93:C, 8if2:A, 8iou:D, 8iov:A, 8jje:A, 8jyn:D, 8jyo:E, 8jyo:D, 8jyp:D, 7l0n:E, 7l0n:F, 7lo4:A, 6lzg:A, 6m0j:A, 6m17:B, 6m17:D, 7p19:A, 7p19:B, 8p2x:B, 8p2y:A, 8p2y:B, 8p30:A, 8p30:B, 8p31:A, 8p31:B, 7r0z:D, 7r10:D, 7r11:D, 7r12:D, 7r1a:D, 7r1a:E, 7r1a:F, 1r42:A, 1r4l:A, 7rpv:A, 3sci:A, 3sci:B, 3scj:A, 3scj:B, 3sck:A, 3sck:B, 3scl:A, 3scl:B, 7sn0:A, 7sn0:B, 8sph:A, 8sph:B, 8spi:A, 8spi:B, 7tn0:E, 8toq:A, 8tor:A, 8tos:A, 8tot:A, 8tot:B, 8tou:A, 7u0n:A, 7u0n:B, 7ufk:A, 7ufk:B, 7ufl:A, 7ufl:B, 8uze:A, 8uze:B, 8uzf:A, 8uzf:B, 7vib:A, 7vib:C, 8vqr:A, 8vqr:B, 7vx4:A, 7vx5:A, 7wbl:A, 7wbp:A, 7wbq:A, 7wbq:C, 8wdr:A, 8wdr:C, 8wds:A, 8wds:C, 8wdy:A, 8wdz:A, 8we0:A, 8we1:A, 8we4:A, 7whh:A, 8whs:D, 8whu:D, 8whu:E, 8whz:A, 7wnm:B, 7wpb:D, 7wpc:D, 8wp8:A, 7xaz:A, 7xaz:C, 7xb0:A, 7xb1:A, 7xbf:A, 7xbf:C, 7xbg:A, 7xbg:C, 7xbh:A, 7xch:D, 7xch:E, 7xci:A, 7xcp:A, 8xlm:D, 8xln:D, 8xn2:A, 8xn3:A, 8xn5:A, 8xnf:A, 8xnk:A, 7xo7:E, 7xo7:F, 7xo8:D, 7xo8:F, 7xo8:E, 7xo9:D, 8xsf:A, 8xsj:A, 7xwa:A, 7xwa:C, 8y16:A, 8y16:E, 8y16:F, 8y18:A, 8y6a:A, 7y75:A, 7y75:C, 7y76:A, 7y76:C, 7y9z:D, 7ya0:D, 7ya0:E, 7ya0:F, 7ya1:A, 7ydi:A, 7yeg:E, 7yeg:J, 7yeg:M, 7yhw:A, 7yj3:A, 7yr2:A, 7yr3:D, 7yr3:G, 7zf7:A
13 7wsf:A 693 601 0.4089 0.3564 0.4110 4.42e-161 8hfx:E, 8hfy:A, 8hfz:E, 8hg0:A, 8ify:F, 8wlo:E, 8wlr:A, 7wse:A
14 8xxw:A 561 581 0.3974 0.4278 0.4131 1.14e-157
15 7tn0:F 547 583 0.3858 0.4260 0.3997 6.61e-141
16 2czy:A 77 83 0.0397 0.3117 0.2892 1.0
17 6m87:L 216 60 0.0232 0.0648 0.2333 2.0 6m87:B, 6m87:H, 6m87:F, 6m87:D, 6m87:J
18 3kds:E 427 84 0.0364 0.0515 0.2619 2.9 2ce7:C, 2cea:C, 3kds:F, 3kds:G, 7tdo:A, 7tdo:B, 7tdo:C, 7tdo:D, 7tdo:E, 7tdo:F
19 6dr0:C 2193 51 0.0248 0.0068 0.2941 3.3 6dqj:A, 6dqj:B, 6dqj:C, 6dqj:D, 6dqn:A, 6dqn:B, 6dqn:C, 6dqn:D, 6dqs:A, 6dqs:B, 6dqs:C, 6dqs:D, 6dqv:A, 6dqv:B, 6dqv:C, 6dqv:D, 6dqz:A, 6dqz:B, 6dqz:D, 6dqz:C, 6dr0:A, 6dr0:B, 6dr0:D, 6dr2:A, 6dr2:B, 6dr2:C, 6dr2:D, 6dra:A, 6dra:B, 6dra:C, 6dra:D, 6drc:A, 6drc:B, 6drc:C, 6drc:D
20 8tkf:A 2272 51 0.0248 0.0066 0.2941 3.3 8tkf:D, 8tkf:B, 8tkf:C
21 1egz:A 291 81 0.0381 0.0790 0.2840 3.9 1egz:B, 1egz:C
22 5via:A 278 38 0.0232 0.0504 0.3684 3.9
23 6bs3:B 355 37 0.0248 0.0423 0.4054 4.8 6bs4:B
24 1nma:H 122 59 0.0248 0.1230 0.2542 7.3 1nmb:H
25 5xqw:H 210 60 0.0232 0.0667 0.2333 7.6
26 6db7:H 234 60 0.0215 0.0556 0.2167 9.5 6db7:I

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218