BioLiP

>protein
LDLAAIRADFPILKRIMRGGNPLAYLDSGATSQRPLQVLDAEREFLTASNGAVHRGAHQLMEEATDAYEQGRADIALFVG
ADTDELVFTKNATEALNLVSYVLGDSRFERAVGPGDVIVTTELEHHANLIPWQELARRTGATLRWYGVTDDGRIDLDSLY
LDDRVKVVAFTHHSNVTGVLTPVSELVSRAHQSGALTVLDACQSVPHQPVDLHELGVDFAAFSGHKMLGPNGIGVLYGRR
ELLAQMPPFLTGGSMIETVTMEGATYAPAPQRFEAGTPMTSQVVGLAAAARYLGAIGMAAVEAHERELVAAAIEGLSGID
GVRILGPTSMRDRGSPVAFVVEGVHAHDVGQVLDDGGVAVRVGHHCALPLHRRFGLAATARASFAVYNTADEVDRLVAGV
RRSRHFFG

The query sequence (length=408) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8odq:D	410	408	1.0000	0.9951	1.0000	0.0	8odq:B
2	6ndn:A	406	407	0.4534	0.4557	0.4545	3.03e-121	1c0n:A, 5db5:A, 5db5:B, 1i29:A, 1jf9:A, 1kmj:A, 1kmk:A, 6mr2:A, 6mr6:A, 6mre:A, 6mrh:A, 6mri:A, 6o10:A, 6o11:A, 6o12:A, 6o13:A, 7rrn:A, 7ruj:A, 7rw3:A, 6uy5:A, 6uy5:B
3	7cep:A	414	411	0.4289	0.4227	0.4258	2.07e-116	7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
4	1t3i:A	406	409	0.4265	0.4286	0.4254	4.39e-113	1t3i:B
5	7tlm:A	415	411	0.4314	0.4241	0.4282	9.01e-109	7tlp:B, 7tlp:C, 7tlp:D, 7tlp:E, 7tlp:F, 7tlq:A, 7tlq:B, 7tlr:A, 7tlr:B
6	7tlp:A	391	409	0.4118	0.4297	0.4108	9.60e-100
7	5b7u:A	402	394	0.4167	0.4229	0.4315	3.32e-99	5b7u:B, 5b87:A, 5b87:B, 5b89:A, 5b89:B
8	6a6e:A	422	421	0.4044	0.3910	0.3919	1.35e-94	6a6e:B, 6a6e:C, 6a6e:D, 6a6g:A, 6a6g:B
9	5ft8:A	401	404	0.3775	0.3840	0.3812	6.82e-83	5ft4:A, 5ft4:B, 5ft5:A, 5ft5:B, 5ft6:A, 5ft6:B, 5ft8:C, 5ft8:E, 5ft8:G, 5ft8:I, 5ft8:K, 5ft8:M, 5ft8:O, 4lw2:A, 4lw2:B, 4lw2:C, 4lw4:A, 4lw4:B
10	3lvm:B	394	390	0.2745	0.2843	0.2872	2.36e-27	3lvj:A, 3lvj:B, 3lvk:A, 3lvl:B, 3lvm:A, 1p3w:B, 1p3w:A
11	1ecx:B	365	388	0.2402	0.2685	0.2526	1.51e-24	1ecx:A, 1eg5:A, 1eg5:B
12	6nzu:A	402	268	0.1936	0.1965	0.2948	2.21e-23	6nzu:E, 8pk8:A, 8pk9:A, 8pka:A, 7rtk:A, 8tvt:A, 6uxe:A, 6w1d:A, 6wi2:A, 6wih:A, 5wkp:A, 5wkp:E, 5wlw:A, 5wlw:E
13	5zss:A	388	394	0.2623	0.2758	0.2716	2.53e-20
14	5wgb:A	291	202	0.1471	0.2062	0.2970	3.44e-19
15	3vax:A	358	278	0.2010	0.2291	0.2950	2.97e-18	3vax:B
16	4eb5:A	379	237	0.1716	0.1847	0.2954	2.34e-17	4eb5:B, 4eb7:A, 4eb7:B, 4hvk:A, 4r5f:A
17	3a9y:A	403	315	0.2132	0.2159	0.2762	1.04e-16	3a9x:A, 3a9x:B, 3a9y:B, 3a9z:A, 3a9z:B
18	5wt6:A	366	388	0.2377	0.2650	0.2500	1.92e-16	7cet:A, 7ceu:A, 6kg0:A, 6kg1:A, 5wt2:A, 5wt4:A, 7xeq:A, 7xes:A
19	3gzc:A	403	299	0.1936	0.1960	0.2642	2.33e-16	3gzc:B, 3gzd:A, 3gzd:B, 3gzd:C, 3gzd:D
20	8irk:A	379	308	0.2083	0.2243	0.2760	2.18e-14	8irk:B, 8irk:C, 8irk:D, 8iry:A, 8iry:B, 8iry:C, 8iry:D, 8irz:A, 8irz:B, 8is0:A, 8is0:B
21	6m4j:A	347	248	0.1716	0.2017	0.2823	7.74e-14	6m4j:B
22	1n31:A	386	269	0.1789	0.1891	0.2714	3.43e-13	1elq:A, 1elq:B, 1elu:A, 1elu:B, 1n2t:A, 1n2t:B, 1n31:B
23	1qz9:A	404	369	0.2230	0.2252	0.2466	3.35e-08
24	6pd2:C	616	77	0.0637	0.0422	0.3377	6.71e-06	6pd1:A, 6pd1:B, 6pd1:D, 6pd2:A, 6pd2:B, 6pd2:D
25	1m32:B	362	140	0.0931	0.1050	0.2714	8.23e-06	1m32:A, 1m32:C, 1m32:D, 1m32:E, 1m32:F
26	5hh9:A	390	262	0.1544	0.1615	0.2405	9.45e-06	5hh9:B, 5i90:A, 5i90:B
27	2yri:A	352	71	0.0613	0.0710	0.3521	2.28e-05	2yri:B, 2yrr:A, 2yrr:B
28	2dr1:A	381	148	0.0882	0.0945	0.2432	0.001	2dr1:B
29	2z9v:A	392	133	0.0833	0.0867	0.2556	0.002	2z9v:B, 2z9w:A, 2z9w:B, 2z9x:A, 2z9x:B
30	3ffr:A	361	72	0.0564	0.0637	0.3194	0.006
31	3w1k:B	452	129	0.0760	0.0686	0.2403	0.016	3w1k:A, 3w1k:C, 3w1k:D, 3w1k:E
32	3zrq:A	382	61	0.0490	0.0524	0.3279	0.016	3zrp:A, 3zrp:B, 3zrq:B, 3zrr:A, 3zrr:B
33	6ba0:A	312	44	0.0392	0.0513	0.3636	0.025	6ba0:B, 6ba0:C, 6ba0:D
34	1vjo:A	377	132	0.0858	0.0928	0.2652	0.060
35	2ch1:A	388	104	0.0686	0.0722	0.2692	0.087	2ch1:D, 2ch1:B, 2ch1:C, 2ch2:A, 2ch2:D, 2ch2:B, 2ch2:C
36	6hrh:A	429	40	0.0392	0.0373	0.4000	0.11	6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
37	6xdk:D	359	46	0.0417	0.0474	0.3696	0.14	6xdk:B, 6xdk:A, 6xdk:C
38	2e7i:A	344	70	0.0515	0.0610	0.3000	0.17	2e7i:B, 2e7j:A, 2e7j:B
39	6egr:A	396	87	0.0662	0.0682	0.3103	0.26	5d5s:A, 5e4z:A, 4hf8:A, 3jw9:A, 3jwa:A, 3jwb:A, 5k30:A, 5m3z:A, 3mkj:A, 4oma:A, 6s0c:A
40	2fyf:A	368	71	0.0588	0.0652	0.3380	0.41	2fyf:B, 3vom:A, 3vom:B
41	6i33:B	925	114	0.0809	0.0357	0.2895	0.49
42	6i34:B	954	114	0.0809	0.0346	0.2895	0.54	6i33:A, 6i34:A, 6i34:C, 6i34:D, 6i35:A, 6i35:B, 6i35:C, 6i35:D
43	3tqx:A	396	192	0.1078	0.1111	0.2292	0.56	3tqx:B
44	1p7a:A	37	33	0.0294	0.3243	0.3636	0.77	1u85:A, 1u86:A
45	2zc0:A	405	84	0.0637	0.0642	0.3095	0.84	2zc0:B, 2zc0:C, 2zc0:D
46	2bkw:A	381	71	0.0539	0.0577	0.3099	0.89
47	3isl:A	387	114	0.0735	0.0775	0.2632	0.94	3isl:B
48	5x6b:J	377	79	0.0564	0.0610	0.2911	0.95	5x6b:I
49	3kgw:B	388	71	0.0441	0.0464	0.2535	1.2	3kgw:A, 3kgx:A
50	2bwo:B	399	98	0.0662	0.0677	0.2755	1.3	2bwn:A, 2bwn:B, 2bwn:D, 2bwn:E, 2bwo:A, 2bwo:D, 2bwo:E, 2bwp:A, 2bwp:B, 2bwp:D, 2bwp:E
51	2huf:A	385	123	0.0784	0.0831	0.2602	1.3	2huf:B, 2hui:A, 2hui:B, 2huu:A, 2huu:B
52	8t7j:A	365	80	0.0637	0.0712	0.3250	2.0	8t7j:B, 8t7j:C, 8t7j:D
53	5v1x:D	447	65	0.0417	0.0380	0.2615	2.4	5v12:F, 5v12:B, 5v1x:C, 5v1x:A, 5v1x:B
54	8a5v:E	366	51	0.0441	0.0492	0.3529	2.4	8a5v:C, 8a5v:F, 8a5v:B, 8a5v:A, 8a5v:G, 8a5v:H, 8a5w:D, 8a5w:C, 8a5w:E, 8a5w:F, 8a5w:B, 8a5w:A, 8a5w:H, 3e77:A, 3e77:B
55	6mfb:D	386	71	0.0490	0.0518	0.2817	3.0	6mfb:A, 6mfb:B, 6mfb:C
56	2hzp:A	447	207	0.1176	0.1074	0.2319	3.5	3e9k:A
57	1j04:A	387	71	0.0441	0.0465	0.2535	3.8	4cbr:A, 4cbs:A, 5f9s:A, 5f9s:B, 1h0c:A, 5hhy:A, 5hhy:B, 5luc:A, 5luc:B, 5luc:E, 5luc:G, 5luc:M, 5luc:N, 5luc:S, 5luc:T, 5ofy:A, 5og0:A, 6rv0:A, 6rv1:A, 2yob:A, 2yob:B
58	7bmk:A	406	79	0.0564	0.0567	0.2911	4.4	7bmk:B, 6hv0:A, 6hx1:A, 3p23:A, 3p23:B, 3p23:C, 3p23:D, 4pl3:A, 4pl3:B, 4pl4:A, 4pl4:B, 4pl4:C, 4pl5:B, 4pl5:A, 4pl5:C, 4pl5:D, 4u6r:A, 6urc:A, 6urc:B, 8uvl:A, 6w3e:B, 6w3k:A, 6xdb:A, 6xdd:A, 6xdd:B, 6xdf:A, 4yzc:A, 4yzc:B, 4yzd:A, 4yzd:B, 4z7h:A, 4z7h:B
59	4yz9:A	381	79	0.0564	0.0604	0.2911	4.5	4pl4:D, 6w39:A, 6w39:B, 6w3a:A, 6w3a:B, 6w3e:A, 4yz9:B, 4yz9:C, 4yzd:C
60	8ban:C	251	119	0.0735	0.1195	0.2521	7.2	8ban:D, 8bbj:C, 8bbj:D

[Back]