Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LCPVCGDKVSGYHYGLLTCESCKGFFKRTVQNNKRYTCDKTQRKRCPYCRFQKCLSVGMKLEAVRADRMRGGRNKFGPMY
KRDRAL

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2ff0:A 102 94 0.9535 0.8039 0.8723 1.66e-55 2a66:A, 5l0m:A, 8pki:K
2 1lo1:A 90 84 0.5465 0.5222 0.5595 7.97e-27 8cef:C, 8cef:D, 8cef:J, 8cef:G, 8cef:H, 8cef:K, 8ifo:A, 8ifo:B, 8ifo:F
3 7wnh:D 316 86 0.5465 0.1487 0.5465 1.42e-25 8cyo:A, 6dda:B, 6dda:A, 6dda:C, 6l6l:A, 6l6l:B, 6l6q:A, 6l6q:B, 7wnh:A, 7wnh:C, 7wnh:B, 5y41:A, 5y41:B, 5yd6:A, 5yd6:B, 5yd6:C, 5yd6:D
4 4nqa:H 319 79 0.5233 0.1411 0.5696 3.36e-25 6a5y:D, 6a5z:D, 6a5z:L, 6a60:D, 7a77:A, 7a78:A, 7a79:A, 7a79:B, 3a9e:A, 2acl:A, 2acl:C, 2acl:E, 2acl:G, 7aos:A, 7b88:A, 7b9o:A, 7bk4:A, 7bk4:C, 1by4:A, 1by4:B, 1by4:C, 1by4:D, 7cfo:A, 7cfo:B, 7cfo:D, 7cfo:C, 4cn2:C, 4cn2:D, 4cn3:A, 4cn3:D, 4cn3:B, 4cn3:C, 4cn5:A, 4cn5:B, 4cn7:A, 4cn7:B, 4cn7:E, 4cn7:F, 1dsz:B, 3dzy:A, 3e94:A, 5ec9:A, 3fal:A, 3fal:C, 1fby:A, 1fby:B, 6fbq:A, 6fbq:B, 6fbr:A, 6fbr:B, 3fc6:A, 3fc6:C, 1fm6:A, 1fm6:U, 1fm9:A, 3fug:A, 1g5y:B, 1g5y:C, 3h0a:A, 1h9u:A, 1h9u:B, 1h9u:C, 1h9u:D, 8hbm:A, 8hbm:E, 6hn6:A, 8j54:C, 8j54:D, 8j54:E, 8j54:F, 5ji0:A, 6jno:A, 6jno:D, 6jnr:A, 6jnr:B, 4k4j:A, 4k6i:A, 1k74:A, 3kwy:A, 6l6k:A, 6lb4:A, 6lb5:A, 6lb5:C, 6lb6:A, 5lyq:A, 4m8e:A, 4m8h:A, 5mj5:A, 5mk4:A, 5mk4:C, 5mkj:A, 5mku:A, 5mmw:A, 1mv9:A, 1mvc:A, 1mzn:A, 1mzn:C, 1mzn:E, 1mzn:G, 4n5g:A, 4n5g:D, 4n8r:A, 4n8r:D, 7nke:A, 7nke:C, 2nll:A, 4nqa:A, 3nsq:B, 3oap:A, 4oc7:A, 3ozj:A, 3ozj:C, 2p1t:A, 2p1u:A, 2p1v:A, 3pcu:A, 7pdq:A, 7pdt:A, 7pdt:B, 4poh:A, 4poj:A, 4pp3:A, 4pp5:A, 8pp0:A, 1r0n:A, 3r29:A, 3r29:B, 3r2a:B, 3r2a:D, 3r2a:A, 3r2a:C, 3r5m:A, 3r5m:C, 1rdt:A, 4rfw:A, 4rmc:A, 4rmd:A, 4rme:A, 1rxr:A, 6sjm:A, 6sti:A, 5tbp:A, 5tbp:C, 5tbp:B, 5tbp:D, 1uhl:A, 3uvv:B, 7uw2:A, 7uw4:A, 1xdk:A, 1xdk:E, 1xls:A, 1xls:B, 1xls:C, 1xls:D, 1xv9:A, 1xv9:C, 1xvp:A, 1xvp:C, 6xwg:C, 6xwh:C, 6xwh:D, 1ynw:B, 5z12:C, 5z12:B, 5zqu:A, 5zqu:C, 5zqu:B, 5zqu:D, 4zsh:A, 2zxz:A, 2zy0:A, 2zy0:C
5 1cit:A 89 83 0.5233 0.5056 0.5422 5.48e-25 6lc1:J, 6lc1:G, 6lc1:A, 6lc1:D
6 3dzu:A 289 82 0.5116 0.1522 0.5366 7.30e-25 3e00:A, 5uan:A
7 2han:A 78 76 0.5000 0.5513 0.5658 1.01e-24 1r0o:A, 4umm:A
8 5krb:G 82 81 0.4651 0.4878 0.4938 3.15e-24 5krb:B
9 7xv6:A 84 75 0.4535 0.4643 0.5200 9.26e-23 7xv6:B, 7xv8:A, 7xv8:B, 7xv9:A, 7xv9:B
10 3e00:D 363 75 0.4767 0.1129 0.5467 1.19e-22 4a4v:A, 4a4v:B, 4a4w:A, 4a4w:B, 7a7h:A, 3ads:A, 3ads:B, 3adt:A, 3adu:A, 3adu:B, 3adv:A, 3adv:B, 3adw:A, 3adw:B, 3adx:A, 3adx:B, 6ad9:A, 8adf:A, 8adf:B, 7ahj:A, 3an3:A, 3an4:A, 6an1:A, 8aqm:A, 8aqm:B, 8aqn:A, 8aqn:B, 2ath:A, 2ath:B, 8aty:A, 8atz:A, 6aug:A, 6aug:B, 6avi:A, 6avi:B, 7awc:A, 7awd:A, 5azv:A, 5azv:B, 3b0q:A, 3b0r:A, 3b0r:B, 3b1m:A, 3b3k:A, 8b8w:A, 8b8w:B, 8b8x:A, 8b8x:B, 8b8y:A, 8b8y:B, 8b8z:A, 8b8z:B, 8b90:A, 8b90:B, 8b91:A, 8b91:B, 8b92:A, 8b92:B, 8b93:A, 8b93:B, 8b94:A, 8b94:B, 8b95:A, 8b95:B, 3bc5:A, 8bf1:A, 8bf2:A, 8bf2:B, 8bff:A, 8c0c:B, 6c1i:A, 6c1i:B, 6c5q:A, 6c5t:A, 3cdp:A, 3cds:A, 4ci5:A, 4ci5:B, 9ck0:A, 8cph:A, 8cph:B, 8cpi:A, 3cs8:A, 3cwd:A, 3cwd:B, 9cwn:A, 7cxf:A, 7cxh:A, 7cxi:A, 7cxj:A, 7cxk:A, 7cxl:A, 6d3e:A, 3d6d:A, 6d8x:A, 6d94:A, 6dbh:A, 6dbh:B, 6dcu:A, 6dcu:B, 6dgl:A, 6dgl:B, 6dgo:A, 6dgp:A, 6dgp:B, 6dgq:A, 6dgr:A, 6dh9:A, 6dha:A, 6dha:B, 8dk4:A, 8dkn:A, 8dkv:A, 5dsh:A, 8dsy:A, 8dsy:B, 8dsz:A, 8dsz:B, 5dv3:A, 5dv6:A, 5dv8:A, 5dvc:A, 5dwl:A, 3dzu:D, 3dzy:D, 7e0a:A, 4e4k:A, 4e4q:A, 6e5a:A, 6e5a:B, 7efq:A, 4em9:A, 4em9:B, 4ema:A, 6enq:A, 3et0:A, 3et0:B, 3et3:A, 6f2l:A, 2f4b:A, 9f7w:A, 9f7x:A, 4f9m:A, 5f9b:B, 3fej:A, 4fgy:A, 8fhe:B, 8fhf:A, 8fhf:B, 8fhg:B, 8fkc:A, 8fkd:A, 8fke:A, 8fkf:A, 8fkg:A, 1fm6:D, 1fm6:X, 1fm9:D, 3fur:A, 2fvj:A, 6fzf:A, 6fzf:B, 6fzg:A, 6fzj:A, 6fzj:B, 6fzp:A, 2g0g:A, 2g0h:A, 2g0h:B, 3g9e:A, 3gbk:A, 2gtk:A, 5gtn:A, 5gto:A, 5gtp:A, 3h0a:D, 4hee:X, 2hfp:A, 8hhp:A, 8hhq:A, 8hhq:B, 3ho0:A, 3hod:A, 8hum:A, 8hup:A, 2hwq:A, 2hwr:A, 5hzc:A, 5hzc:B, 2i4j:A, 2i4p:A, 2i4z:A, 1i7i:A, 1i7i:B, 3ia6:A, 3ia6:B, 6icj:A, 6ijr:A, 6ijr:C, 6ijs:A, 6ilq:A, 6izm:A, 6izn:A, 4jaz:A, 6jey:A, 6jey:B, 6jf0:A, 6jf0:B, 5ji0:D, 4jl4:A, 6jq7:A, 7jqg:A, 7jqg:B, 6k0t:A, 6k0t:C, 1k74:D, 3k8s:A, 3k8s:B, 3kmg:A, 3kmg:D, 1knu:A, 6ktm:A, 6ktn:A, 6l89:A, 6l89:B, 4l96:A, 4l98:A, 4l98:B, 3lmp:A, 7lot:A, 7lot:B, 5lsg:A, 6mcz:A, 6mcz:B, 6md1:B, 6md2:A, 6md2:B, 6md4:A, 6ms7:A, 3noa:A, 3noa:B, 1nyx:A, 6o67:A, 6o68:A, 4o8f:A, 4o8f:B, 4oj4:A, 2om9:A, 2om9:B, 2om9:C, 2om9:D, 6oni:B, 6onj:A, 3osi:A, 3osw:A, 7p4e:A, 3pba:A, 8pbo:A, 6pdz:B, 6pdz:A, 2pob:A, 3po9:A, 3po9:B, 2prg:A, 2prg:B, 4prg:A, 4prg:B, 4prg:C, 4prg:D, 4pvu:B, 4pwl:A, 2q59:A, 2q59:B, 2q5p:A, 2q5p:B, 2q5s:A, 2q5s:B, 2q61:A, 2q61:B, 2q6r:A, 2q6r:B, 2q6s:B, 2q8s:A, 7qb1:AAA, 7qb1:BBB, 6qj5:A, 3qt0:A, 4r06:A, 4r2u:A, 4r2u:D, 3r5n:A, 4r6s:A, 4r6s:B, 3r8a:A, 3r8a:B, 3r8i:A, 1rdt:D, 7rle:A, 7rle:C, 3s9s:A, 8sc9:B, 7sqa:B, 7sqa:A, 7sqb:A, 3sz1:A, 3sz1:B, 3t03:A, 3t03:B, 6t1s:A, 6t1v:A, 6t6b:A, 6t9c:A, 6tdc:A, 6tsg:A, 5tto:A, 5tto:B, 5two:A, 3ty0:A, 3ty0:B, 5u5l:A, 8u57:A, 3u9q:A, 5ugm:A, 5ugm:B, 3v9t:A, 3v9v:A, 3v9y:A, 3vjh:A, 3vji:A, 3vn2:A, 2vsr:A, 2vsr:B, 2vst:A, 2vst:B, 3vso:A, 3vsp:A, 2vv0:A, 2vv0:B, 2vv1:A, 2vv1:B, 2vv2:A, 2vv2:B, 2vv3:A, 2vv4:A, 2vv4:B, 6vzl:A, 6vzl:B, 6vzm:A, 6vzm:B, 7wgo:A, 7wgp:A, 7wgq:A, 3wj4:A, 3wj4:B, 3wj5:A, 3wj5:B, 1wm0:X, 3wmh:A, 3wmh:B, 7wox:A, 5wqx:A, 5wr0:A, 5wr1:A, 3x1h:A, 3x1h:B, 3x1i:A, 3x1i:B, 2xkw:A, 2xkw:B, 4xld:A, 4xta:A, 4xta:B, 4xuh:A, 4xuh:B, 4xum:A, 4xum:B, 4y29:A, 5y2o:A, 5y2t:A, 5y2t:B, 6y3u:A, 5ycn:A, 5ycp:A, 2yfe:A, 2yfe:B, 4yt1:B, 5z5s:A, 5z6s:A, 1zeo:A, 8zfn:A, 8zfn:B, 8zfo:A, 8zfo:B, 8zfp:A, 8zfp:B, 8zfq:A, 8zfq:B, 8zfr:B, 8zfs:A, 8zfs:B, 8zft:A, 8zft:B, 1zgy:A, 2zk1:A, 2zk1:B, 2zk2:A, 2zk3:A, 2zk3:B, 2zk4:A, 2zk4:B, 2zk5:A, 2zk5:B, 2zk6:A, 2zk6:B, 6zly:A, 2zno:A, 2zno:B, 2zvt:A, 2zvt:B
11 6xwg:D 80 74 0.4767 0.5125 0.5541 1.91e-22
12 1a6y:B 84 78 0.4651 0.4762 0.5128 3.26e-22 1a6y:A, 1ga5:A, 1ga5:B, 1ga5:E, 1ga5:F, 1hlz:A, 1hlz:B
13 4iqr:F 314 78 0.4302 0.1178 0.4744 3.23e-21 8c1l:B, 3cbb:A, 3cbb:B, 6cht:A, 6cht:D, 6cht:G, 6cht:J, 3fs1:A, 4iqr:A, 4iqr:B, 4iqr:E, 1pzl:A
14 2ebl:A 89 72 0.4651 0.4494 0.5556 7.71e-21
15 5uan:B 308 83 0.4767 0.1331 0.4940 1.08e-20 4dm6:A, 4dm6:B, 4dm8:A, 4dm8:B, 1dsz:A, 1hra:A, 4jyg:B, 4jyg:A, 4jyh:B, 4jyh:A, 4jyi:B, 4jyi:A, 6ssq:B, 6ssq:A, 1xap:A, 1xdk:B, 1xdk:F
16 1lat:B 74 70 0.4419 0.5135 0.5429 1.83e-20 1lat:A
17 7xvn:A 83 91 0.5000 0.5181 0.4725 1.96e-20 7xvn:B, 7xvn:C, 7xvn:D
18 6cfn:C 81 71 0.4535 0.4815 0.5493 2.47e-20 6cfn:A, 6cfn:E, 6cfn:F, 5e6c:A, 3fyl:B, 3g6p:B, 3g6q:A, 3g6r:A, 3g6t:A, 3g6u:A, 3g6u:B, 3g8u:A, 3g8x:A, 3g8x:B, 3g99:A, 3g9i:A, 3g9i:B, 3g9j:B, 3g9m:A, 3g9m:B, 1glu:A, 1glu:B, 1r4o:A, 1r4o:B, 1r4r:B
19 2nll:B 103 86 0.4767 0.3981 0.4767 3.12e-20 3m9e:A, 3m9e:B, 3m9e:E, 3m9e:F
20 4ond:A 72 69 0.4186 0.5000 0.5217 8.47e-20 4ond:B, 4ond:E, 4ond:F
21 2env:A 88 71 0.4186 0.4091 0.5070 1.26e-19
22 7prw:A 326 69 0.4302 0.1135 0.5362 1.73e-19 3bqd:A, 6bqu:B, 6bqu:A, 6bse:A, 6bse:B, 6bsf:B, 6bsf:A, 5cbx:A, 5cbx:B, 5cbx:E, 5cbx:F, 5cby:A, 5cby:B, 5cbz:A, 5cbz:B, 5cbz:E, 5cc1:A, 5cc1:B, 5cc1:W, 5cc1:X, 6cfn:B, 6cfn:D, 6cfn:G, 6cfn:H, 3cld:A, 3cld:B, 4csj:A, 6dxk:A, 6dxk:B, 5e69:A, 5e69:B, 5e6a:A, 5e6a:B, 5e6b:A, 5e6b:B, 5e6c:B, 5e6d:A, 5e6d:B, 3e7c:A, 3e7c:B, 6el6:A, 6el7:A, 6el9:A, 5emc:A, 5emc:B, 5emp:A, 5emp:B, 5emq:A, 5emq:B, 8ffv:C, 8ffw:C, 3fyl:A, 5g3j:A, 5g5w:A, 3g6p:A, 3g6q:B, 3g6r:B, 3g6t:B, 3g8u:B, 3g97:B, 3g97:A, 3g99:B, 3g9j:A, 3g9o:B, 3g9o:A, 3g9p:B, 3g9p:A, 1gdc:A, 2gda:A, 3h52:A, 3h52:B, 3h52:C, 3h52:D, 4hn5:A, 4hn5:B, 4hn6:A, 4hn6:B, 3k22:A, 3k22:B, 3k23:A, 3k23:B, 3k23:C, 7krj:D, 4lsj:A, 1m2z:A, 1m2z:D, 4mdd:A, 4mdd:B, 3mne:A, 3mno:A, 3mnp:A, 5nfp:A, 5nft:A, 1nhz:A, 4p6w:A, 4p6x:A, 4p6x:C, 4p6x:I, 4p6x:E, 4p6x:G, 4p6x:K, 1p93:A, 1p93:B, 1p93:C, 1p93:D, 7prv:A, 7prv:B, 7prw:B, 7prx:A, 1r4r:A, 1rgd:A, 4tnt:A, 4tnt:B, 5uc1:A, 5uc1:B, 5uc3:A, 5uc3:B, 4udc:A, 4udd:A, 5va0:A, 5va0:B, 5va7:A, 5va7:B, 8vkz:A, 8vkz:B, 6x6d:A, 6x6d:B, 6x6e:A, 6x6e:B
23 2han:B 87 72 0.4302 0.4253 0.5139 4.76e-19 1r0n:B, 1r0o:B, 4umm:E
24 1r4i:A 74 70 0.4070 0.4730 0.5000 1.72e-17 1r4i:B, 8rm6:B, 8rm6:A, 8rm7:B, 8rm7:A
25 8hbm:B 73 70 0.3953 0.4658 0.4857 2.96e-17 8hbm:F
26 4oln:A 70 65 0.3953 0.4857 0.5231 2.96e-17 4oln:B
27 1hcp:A 75 66 0.3837 0.4400 0.5000 3.19e-17 4aa6:A, 4aa6:B, 4aa6:E, 4aa6:F, 1hcq:A, 1hcq:B, 1hcq:E, 1hcq:F
28 2c7a:A 78 69 0.3953 0.4359 0.4928 3.79e-17 2c7a:B, 5cbz:F, 5cc0:A, 5cc0:B, 4oor:A, 4oor:B, 4oor:E, 4oor:F, 4ov7:A, 4ov7:B, 4ov7:E, 4ov7:F
29 4nqa:I 385 77 0.3953 0.0883 0.4416 1.20e-16 4dk7:A, 4dk7:C, 4dk8:A, 4dk8:C, 5hjp:B, 5hjp:D, 5i4v:A, 5i4v:E, 6jio:A, 6jio:D, 5jy3:A, 5jy3:B, 5jy3:C, 5jy3:D, 6k9g:A, 6k9g:B, 6k9g:D, 6k9m:A, 6k9m:B, 6k9m:C, 6k9m:D, 3kfc:A, 3kfc:B, 3kfc:D, 5kya:A, 5kya:E, 5kyj:A, 5kyj:E, 3l0e:A, 4nqa:B, 1p8d:A, 1p8d:B, 1pq6:A, 1pq6:B, 1pq6:D, 1pq9:A, 1pq9:B, 1pq9:C, 1pq9:D, 1pqc:A, 1pqc:B, 1pqc:C, 1pqc:D, 4rak:A, 4rak:B, 6s4n:D, 6s4n:A, 6s4n:B, 6s4n:C, 6s4t:A, 6s4u:A, 6s4u:B, 6s4u:C, 6s5k:A, 1upv:A, 1upw:A
30 1kb6:B 101 75 0.3256 0.2772 0.3733 9.61e-16 1kb2:A, 1kb2:B, 1kb4:A, 1kb4:B, 1kb6:A, 1ynw:A
31 5ijl:A 943 50 0.1744 0.0159 0.3000 0.33
32 8ppt:B 1191 50 0.1744 0.0126 0.3000 0.36 8ppu:B, 8ppv:B, 6t8h:B
33 8d49:A 1072 20 0.1163 0.0093 0.5000 0.57
34 8sun:B 743 36 0.1744 0.0202 0.4167 1.6 8b8k:A, 8b8k:B, 8b8m:A, 6qp6:A, 6qp6:B, 8sur:B, 8tag:B, 8tai:B, 8tal:B
35 5n5y:I 99 21 0.1163 0.1010 0.4762 2.5 5n5z:I, 5n60:I
36 6ob0:A 442 39 0.1395 0.0271 0.3077 3.0 6e7k:A, 6e7k:B, 6ob0:B, 6ob0:C, 6ob0:D
37 6oau:A 422 39 0.1395 0.0284 0.3077 3.1 6oau:B, 6oaz:A, 6oaz:B, 6oaz:C, 6oaz:D
38 9b00:16 53 36 0.1977 0.3208 0.4722 4.9 5a9z:Ac, 5aa0:Ac, 7azo:L33A, 7azo:L33B, 7azs:L33A, 7azs:L33B, 9b00:26, 6b4v:DA, 6b4v:HC, 6boh:DA, 6boh:IC, 6bok:DA, 6bok:GC, 6buw:R6, 6buw:Y6, 6bz6:R6, 6bz6:Y6, 6bz7:R6, 6bz7:Y6, 6bz8:R6, 6bz8:Y6, 6c5l:B6, 6c5l:D6, 6cae:16, 6cae:26, 6cfj:16, 6cfj:26, 6cfk:16, 6cfk:26, 6cfl:16, 6cfl:26, 8cvj:16, 8cvj:26, 8cvk:16, 8cvk:26, 8cvl:16, 8cvl:26, 5czp:Y6, 5czp:R6, 6czr:16, 6czr:26, 5d8b:Z, 5d8b:VB, 5dfe:Y6, 5dfe:R6, 5dox:16, 5dox:26, 5doy:16, 5doy:26, 8ekb:16, 8ekb:26, 8ev6:16, 8ev6:26, 8ev7:16, 8ev7:26, 5f8k:16, 5f8k:26, 8fc1:16, 8fc1:26, 8fc2:16, 8fc2:26, 8fc3:16, 8fc3:26, 8fc4:16, 8fc4:26, 8fc5:16, 8fc5:26, 8fc6:16, 8fc6:26, 5fdu:16, 5fdu:26, 5fdv:16, 5fdv:26, 6fkr:16, 6fkr:26, 8fom:R6, 8fom:Y6, 8fon:R6, 8fon:Y6, 8g29:16, 8g29:26, 8g2a:16, 8g2a:26, 8g2b:16, 8g2b:26, 8g2c:16, 8g2c:26, 8g2d:16, 8g2d:26, 6gsl:O8, 6gzq:b1, 6gzx:b1, 6gzx:b2, 6gzz:b1, 6gzz:b2, 5hau:14, 5hau:24, 5hcp:16, 5hcp:26, 5hcq:16, 5hcq:26, 5hcr:16, 5hcr:26, 5hd1:16, 5hd1:26, 5ib7:O8, 5imq:x, 5imr:x, 5j30:R6, 5j30:Y6, 5j3c:R6, 5j3c:Y6, 5j4b:16, 5j4b:26, 5j4c:16, 5j4c:26, 5j4d:DA, 5j4d:IC, 5j8b:6, 7jql:16, 7jql:26, 7jqm:16, 7jqm:26, 4l47:R6, 4l47:Y6, 4l71:R6, 4l71:Y6, 4lel:R6, 4lel:Y6, 4lfz:R6, 4lfz:Y6, 7lh5:B6, 7lh5:D6, 4lnt:R6, 4lnt:Y6, 4lsk:R6, 4lsk:Y6, 4lt8:R6, 4lt8:Y6, 7md7:16, 7md7:26, 6n1d:AL33, 6n1d:BL33, 6n9e:16, 6n9e:26, 6n9f:16, 6n9f:26, 6nd5:16, 6nd5:26, 6nd6:16, 6nd6:26, 6ndk:R6, 6ndk:Y6, 6nsh:R6, 6nsh:Y6, 6nta:R6, 6nta:Y6, 6nuo:R6, 6nuo:Y6, 6nwy:R6, 6nwy:Y6, 6o3m:R6, 6o3m:Y6, 6o97:16, 6o97:26, 6of1:16, 6of1:26, 6of6:R6, 6of6:Y6, 6oj2:R6, 6oj2:Y6, 6ope:R6, 6ope:Y6, 6ord:R6, 6ord:Y6, 6osi:R6, 6osi:Y6, 5ot7:b, 6otr:R6, 6otr:Y6, 6oxa:R6, 6oxa:Y6, 6oxi:R6, 6oxi:Y6, 4p6f:R6, 4p6f:Y6, 4p70:R6, 4p70:Y6, 6q95:c, 6qnq:O8, 6qnq:K5, 6qnr:O8, 6qnr:K5, 7rq8:16, 7rq8:26, 7rq9:16, 7rq9:26, 7rqa:16, 7rqa:26, 7rqb:16, 7rqb:26, 7rqc:16, 7rqc:26, 7rqd:16, 7rqd:26, 7rqe:16, 7rqe:26, 8t8b:16, 8t8b:26, 8t8c:16, 8t8c:26, 4tua:R6, 4tua:Y6, 4tub:R6, 4tub:Y6, 4tuc:R6, 4tuc:Y6, 4tud:R6, 4tud:Y6, 4tue:R6, 4tue:Y6, 7u2h:16, 7u2h:26, 7u2i:16, 7u2i:26, 7u2j:16, 7u2j:26, 6ucq:16, 6ucq:26, 8ud6:16, 8ud6:26, 8ud7:16, 8ud7:26, 8ud8:16, 8ud8:26, 6uo1:16, 6uo1:26, 5uq7:6, 5uq8:6, 8uvr:16, 8uvr:26, 8uvs:16, 8uvs:26, 4v4x:B5, 4v4y:B5, 4v4z:B5, 4v51:B6, 4v51:D6, 4v5a:B6, 4v5a:D6, 4v5c:B6, 4v5c:D6, 4v5d:B6, 4v5d:D6, 4v5e:B6, 4v5e:D6, 4v5f:B6, 4v5f:D6, 4v5g:B6, 4v5g:D6, 4v5j:B6, 4v5j:D6, 4v5k:B6, 4v5k:D6, 4v5l:B6, 4v5m:B6, 4v5n:B6, 4v5p:B6, 4v5p:D6, 4v5q:B6, 4v5q:D6, 4v5r:B6, 4v5r:D6, 4v5s:B6, 4v5s:D6, 4v63:B6, 4v63:D6, 4v67:B6, 4v67:D6, 4v68:B6, 4v6a:B6, 4v6a:D6, 4v6f:A6, 4v6f:D6, 4v6g:B6, 4v6g:D6, 4v7j:A6, 4v7j:B6, 4v7k:A6, 4v7k:B6, 4v7l:B6, 4v7l:D6, 4v7m:B6, 4v7m:D6, 4v7p:B3, 4v7p:C3, 4v7w:B6, 4v7w:D6, 4v7x:B6, 4v7x:D6, 4v7y:B6, 4v7y:D6, 4v7z:B6, 4v7z:D6, 4v83:B3, 4v83:D3, 4v84:B3, 4v84:D3, 4v87:A6, 4v87:D6, 4v8a:A6, 4v8a:B6, 4v8b:B6, 4v8b:D6, 4v8c:A6, 4v8c:B6, 4v8d:B6, 4v8d:D6, 4v8e:A6, 4v8e:C6, 4v8f:A6, 4v8f:D6, 4v8g:B6, 4v8g:D6, 4v8h:B6, 4v8h:D6, 4v8i:B6, 4v8i:D6, 4v8j:B6, 4v8j:D6, 4v8n:B6, 4v8n:D6, 4v8o:B6, 4v8q:A6, 4v8u:B6, 4v8u:D6, 4v8x:B6, 4v8x:D6, 5v8i:16, 5v8i:26, 4v90:B6, 4v95:B6, 4v95:D6, 4v97:B6, 4v97:D6, 4v9a:B6, 4v9a:D6, 4v9b:B6, 4v9b:D6, 4v9h:B6, 4v9i:B6, 4v9i:D6, 4v9j:B6, 4v9j:D6, 4v9k:B6, 4v9k:D6, 4v9l:B6, 4v9l:D6, 4v9m:B6, 4v9m:D6, 4v9n:B6, 4v9n:D6, 4v9q:A3, 4v9q:C3, 4v9r:B6, 4v9r:D6, 4v9s:B6, 4v9s:D6, 5vp2:16, 5vp2:26, 5vpo:R6, 5vpo:Y6, 5vpp:R6, 5vpp:Y6, 8vtu:16, 8vtu:26, 8vtv:16, 8vtv:26, 8vtw:16, 8vtw:26, 8vtx:16, 8vtx:26, 8vty:16, 8vty:26, 1vvj:R6, 1vvj:Y6, 1vy4:B6, 1vy4:D6, 1vy5:B6, 1vy5:D6, 1vy6:B6, 1vy6:D6, 1vy7:B6, 1vy7:D6, 4w29:B6, 4w29:D6, 4w2e:6, 4w2f:B6, 4w2f:D6, 4w2g:B6, 4w2g:D6, 4w2h:B6, 4w2h:D6, 4w2i:B6, 4w2i:D6, 4w4g:R6, 4w4g:Y6, 5w4k:16, 5w4k:26, 5wis:16, 5wis:26, 5wit:16, 5wit:26, 4wpo:A6, 4wpo:C6, 4wq1:O8, 4wq1:K5, 4wqf:A6, 4wqf:C6, 4wqr:O8, 4wqr:K5, 4wqu:A6, 4wqu:C6, 4wqy:A6, 4wqy:C6, 4wro:O8, 4wsd:O8, 4wsd:K5, 4wt1:O8, 4wt1:K5, 4wt8:C7, 4wt8:D7, 4wzd:O8, 4wzd:K5, 4xej:AL33, 4xej:BL33, 6xhv:16, 6xhv:26, 6xhw:16, 6xhw:26, 6xhx:16, 6xhx:26, 6xhy:16, 6xhy:26, 6xqd:16, 6xqd:26, 6xqe:16, 6xqe:26, 4y4o:16, 4y4o:26, 4y4p:16, 4y4p:26, 4ypb:R6, 4ypb:Y6, 4yzv:R6, 4yzv:Y6, 4z3s:16, 4z3s:26, 4z8c:16, 4z8c:26, 4zer:16, 4zer:26, 5zlu:y, 4zsn:R6, 4zsn:Y6
39 6knb:B 1120 48 0.1628 0.0125 0.2917 5.3 6knc:B
40 8tn3:A 388 31 0.1395 0.0309 0.3871 5.5 8tn3:B, 7uky:A, 7uky:B
41 8hmf:A 533 35 0.1279 0.0206 0.3143 5.8 8hme:A
42 7x6v:B 48 43 0.1512 0.2708 0.3023 9.2
43 6pq1:A 320 33 0.1279 0.0344 0.3333 9.5
44 2aus:D 53 32 0.1163 0.1887 0.3125 9.6 2aus:B, 2ey4:E, 2ey4:F, 3hax:C, 3hay:C, 3hjw:B, 2hvy:C, 3lwo:B, 3lwp:B, 3lwq:B, 3lwr:B, 3lwv:B, 2rfk:B
45 6t6f:A 288 26 0.1163 0.0347 0.3846 9.6 8bfm:A, 8bfs:A, 2jc6:A, 2jc6:C, 6t28:AAA, 6t29:AAA, 6t6f:B
46 5u23:D 366 28 0.1047 0.0246 0.3214 9.7 5u21:A, 5u21:B, 5u21:C, 5u21:D, 5u23:C, 5u23:A, 5u23:B, 5u24:A, 5u24:B, 5u24:C, 5u24:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218