BioLiP

>protein
LAQPGGISDPNLIKLVNKLQDVFTTVGVNNPIDLPQIVVVGSQSSGKSSVLENIVGRDFLPRGQGIVTRRPLVLQLINRK
AANLDEWGEFLHLPGQKFYDFNKIRDEINRETEAKVGRNAGISPAPINLRIYSPHVLNLTLVDLPGLTRVPVGDQPRDIE
RQIRDMILKYIQKPNAIILAVTAANVDLANSDGLKLAREVDPEGQRTIGVLTKVDLMDEGTDVVDILAGRIIPLRLGYVP
VVNRGQRDIDNKKPITAALEAEKAFFENHKAYRNKSAYCGTPYLARKLNLILMMHIKQTLPDIKQRISSSLQKYECQQMV
ESLQRAA

The query sequence (length=327) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6def:C	368	362	1.0000	0.8886	0.9033	0.0	6def:A, 6def:B, 6def:D, 6di7:A, 6djq:A, 6djq:C, 6djq:D, 6vjf:A, 6vjf:B, 6vjf:C, 6vjf:D
2	6djq:B	330	342	0.9450	0.9364	0.9035	0.0
3	7ax3:D2	582	303	0.5810	0.3265	0.6271	3.15e-133	7ax3:B2, 7ax3:B, 7ax3:D, 7ax3:F, 7ax3:H, 7ax3:J, 7ax3:M, 7ax3:O, 7ax3:Q, 7ax3:S, 7ax3:U, 7ax3:W, 7ax3:Y, 7ax3:E2, 7ax3:G2, 7ax3:H2, 7ax3:I2, 7ax3:J2
4	6dlu:P	747	301	0.5810	0.2544	0.6312	4.96e-132	2aka:B, 5d3q:A, 5d3q:B, 6dlu:B, 6s9a:B, 2x2e:A, 2x2e:D, 2x2f:A, 2x2f:D, 3zyc:A, 3zyc:D
5	8sxz:c	699	305	0.5810	0.2718	0.6230	2.02e-131	8sxz:b, 8sxz:f, 8sxz:g, 8sz8:b, 8sz8:c, 8sz8:f, 8sz8:g, 8t0k:b, 8t0k:c, 8t0k:f, 8t0k:g, 8t0r:b, 8t0r:c, 8t0r:f, 8t0r:g, 8tym:c, 8tym:f, 8tym:B, 8tym:C, 8tyn:c, 8tyn:f, 8tyn:C, 8tyn:F
6	4h1v:A	358	317	0.5535	0.5056	0.5710	1.57e-124
7	5wp9:A	590	304	0.5474	0.3034	0.5888	6.00e-123	8skn:A, 8skn:B, 3w6n:A, 3w6n:B, 3w6o:A, 3w6o:B, 3w6p:A, 3w6p:B, 5wp9:C, 5wp9:E, 5wp9:G, 5wp9:I, 5wp9:K, 5wp9:M, 5wp9:O
8	6s9a:A	312	317	0.5474	0.5737	0.5647	1.53e-117
9	3l43:B	246	255	0.4985	0.6626	0.6392	7.95e-110	3l43:A, 3l43:C, 3l43:D
10	1jwy:A	1039	304	0.5382	0.1694	0.5789	6.08e-109	4ae3:A, 2aka:A, 7b19:A, 7b1a:A, 3bz7:A, 3bz8:A, 3bz9:A, 1d0x:A, 1d0y:A, 1d0z:A, 1d1a:A, 1d1b:A, 1d1c:A, 1fmw:A, 2jhr:A, 2jj9:A, 1jx2:A, 1lvk:A, 3mjx:A, 3mkd:A, 1mma:A, 1mmd:A, 1mmg:A, 1mmn:A, 1mne:A, 3mnq:A, 3myh:X, 3myk:X, 3myl:X, 4pjk:A, 1vom:A, 1w9i:A, 1w9j:A, 1w9k:A, 1w9l:A, 2x9h:A, 2xel:A, 2xo8:A, 2y8i:X, 1yv3:A, 6z2s:A, 6z7t:A, 6z7t:B, 6z7u:A
11	3t34:B	341	318	0.4924	0.4721	0.5063	6.29e-101	3t34:A, 3t35:A, 3t35:B, 3t35:C, 3t35:D
12	4p4s:B	336	309	0.4281	0.4167	0.4531	1.26e-75	4p4s:A, 4p4t:A
13	6jsj:A	625	297	0.3578	0.1872	0.3939	1.14e-43	6jsj:B, 6jsj:C
14	8eew:A	766	272	0.2844	0.1214	0.3419	1.47e-31	8eew:B, 8eff:A, 8eff:B, 8eff:C, 8eff:D, 8efr:A, 8efr:B, 8efr:C, 8efr:K, 8efr:D, 8efr:L, 8efr:E, 8efr:M, 8efr:F, 8efr:N, 8efr:G, 8efr:O, 8efr:H, 8efr:P, 8efr:I, 8efr:Q, 8efr:J, 8efr:R, 6jtg:A
15	5oxf:C	601	115	0.1193	0.0649	0.3391	0.076	5oxf:D
16	7r89:B	529	55	0.0459	0.0284	0.2727	1.5
17	5n2j:B	1381	58	0.0673	0.0159	0.3793	1.9	6fsn:A, 5mu1:A, 5mzo:A, 5n2j:A, 3wzs:A, 7zhb:A, 7zkc:A, 7zle:A, 7zll:A, 7zlu:A, 7zlu:B, 7zlu:C, 7zxw:A
18	1svw:A	190	65	0.0642	0.1105	0.3231	2.0	1svi:A, 1svw:B
19	2px0:A	258	104	0.0795	0.1008	0.2500	2.1	2px0:B, 2px0:C, 2px0:D, 2px0:E, 2px0:F, 2px0:G, 2px0:H, 2px3:A, 3syn:A, 3syn:B, 3syn:C, 3syn:D
20	5c2v:B	352	38	0.0336	0.0312	0.2895	2.2	5c2v:E, 5c2w:B, 5c2w:E
21	8kab:h	430	99	0.0795	0.0605	0.2626	2.3
22	3w5m:A	1030	53	0.0550	0.0175	0.3396	3.8	3w5n:A
23	5gom:A	407	33	0.0398	0.0319	0.3939	6.0	5gnr:A, 5gof:A, 5gom:B, 5yew:A, 5yew:B, 5yew:C
24	5goe:A	384	33	0.0398	0.0339	0.3939	6.1	5gns:A, 5gnt:A
25	7byi:A	463	175	0.1162	0.0821	0.2171	6.7	8aql:A, 8aql:B, 8aql:C, 8aql:D, 9box:A, 9box:C, 9box:B, 9box:D, 7byi:B, 8fjt:A, 8fjt:B, 8fju:A, 8fju:B, 8gks:A, 8gks:B, 8gkt:A, 8gkt:B, 8gku:A, 8gku:B, 8gkw:A, 8gkw:B, 8gky:A, 8gky:B, 8gkz:A, 8gkz:B, 6m5o:A, 6m5o:B, 6qvg:A, 6qvg:B, 6qvl:A, 6qvl:B, 8t4o:A, 8t4o:B, 8t4p:A, 8t4p:B, 8tlc:A, 8tlc:B, 5v7i:A, 5v7i:B
26	5d0u:A	705	75	0.0734	0.0340	0.3200	7.6	5lta:A, 5ltj:A, 5ltk:A, 6qid:A, 6qie:A
27	5m1j:A6	539	52	0.0550	0.0334	0.3462	8.1
28	4y0a:A	179	30	0.0398	0.0726	0.4333	8.3
29	4tsd:B	181	31	0.0367	0.0663	0.3871	8.9	4tsd:A

[Back]