BioLiP

>protein
LAQPGGISDPNLIKLVNKLQDDLPQIVVVGSQSSGKSSVLENIVGRDFLPRGQGIVTRRPLVLQLINRQSWGEFLHLPGQ
KFYDFNKIRDEINRETEAKVGRNAGISPAPINLRIYSPHVLNLTLVDLPGLTRVPVGDQPRDIERQIRDMILKYIQKPNA
IILAVTAANVDLANSDGLKLAREVDPEGQRTIGVLTKVDLMDEGTDVVDILAGRIIPLRLGYVPVVNRGQRDIDNKKPIT
AALEAEKAFFENHKAYRNKSAYCGTPYLARKLNLILMMHIKQTLPDIKQRISSSLQKYQQELEALDYTVRRRKECQQMVE
SLQRAAEIVS

The query sequence (length=330) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6djq:B	330	330	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	6def:C	368	366	1.0000	0.8967	0.9016	0.0	6def:A, 6def:B, 6def:D, 6di7:A, 6djq:A, 6djq:C, 6djq:D, 6vjf:A, 6vjf:B, 6vjf:C, 6vjf:D
3	7ax3:D2	582	327	0.5848	0.3316	0.5902	2.57e-129	7ax3:B2, 7ax3:B, 7ax3:D, 7ax3:F, 7ax3:H, 7ax3:J, 7ax3:M, 7ax3:O, 7ax3:Q, 7ax3:S, 7ax3:U, 7ax3:W, 7ax3:Y, 7ax3:E2, 7ax3:G2, 7ax3:H2, 7ax3:I2, 7ax3:J2
4	6dlu:P	747	329	0.5879	0.2597	0.5897	3.68e-128	2aka:B, 5d3q:A, 5d3q:B, 6dlu:B, 6s9a:B, 2x2e:A, 2x2e:D, 2x2f:A, 2x2f:D, 3zyc:A, 3zyc:D
5	8sxz:c	699	329	0.5848	0.2761	0.5866	1.39e-127	8sxz:b, 8sxz:f, 8sxz:g, 8sz8:b, 8sz8:c, 8sz8:f, 8sz8:g, 8t0k:b, 8t0k:c, 8t0k:f, 8t0k:g, 8t0r:b, 8t0r:c, 8t0r:f, 8t0r:g, 8tym:c, 8tym:f, 8tym:B, 8tym:C, 8tyn:c, 8tyn:f, 8tyn:C, 8tyn:F
6	4h1v:A	358	352	0.5515	0.5084	0.5170	4.78e-121
7	5wp9:A	590	307	0.5273	0.2949	0.5668	1.49e-117	8skn:A, 8skn:B, 3w6n:A, 3w6n:B, 3w6o:A, 3w6o:B, 3w6p:A, 3w6p:B, 5wp9:C, 5wp9:E, 5wp9:G, 5wp9:I, 5wp9:K, 5wp9:M, 5wp9:O
8	6s9a:A	312	331	0.5455	0.5769	0.5438	8.51e-116
9	3l43:B	246	251	0.4848	0.6504	0.6375	1.08e-108	3l43:A, 3l43:C, 3l43:D
10	1jwy:A	1039	303	0.5152	0.1636	0.5611	2.46e-102	4ae3:A, 2aka:A, 7b19:A, 7b1a:A, 3bz7:A, 3bz8:A, 3bz9:A, 1d0x:A, 1d0y:A, 1d0z:A, 1d1a:A, 1d1b:A, 1d1c:A, 1fmw:A, 2jhr:A, 2jj9:A, 1jx2:A, 1lvk:A, 3mjx:A, 3mkd:A, 1mma:A, 1mmd:A, 1mmg:A, 1mmn:A, 1mne:A, 3mnq:A, 3myh:X, 3myk:X, 3myl:X, 4pjk:A, 1vom:A, 1w9i:A, 1w9j:A, 1w9k:A, 1w9l:A, 2x9h:A, 2xel:A, 2xo8:A, 2y8i:X, 1yv3:A, 6z2s:A, 6z7t:A, 6z7t:B, 6z7u:A
11	3t34:B	341	339	0.5091	0.4927	0.4956	1.59e-98	3t34:A, 3t35:A, 3t35:B, 3t35:C, 3t35:D
12	4p4s:B	336	292	0.4061	0.3988	0.4589	2.78e-72	4p4s:A, 4p4t:A
13	6jsj:A	625	295	0.3576	0.1888	0.4000	7.09e-44	6jsj:B, 6jsj:C
14	8eew:A	766	250	0.2697	0.1162	0.3560	1.95e-32	8eew:B, 8eff:A, 8eff:B, 8eff:C, 8eff:D, 8efr:A, 8efr:B, 8efr:C, 8efr:K, 8efr:D, 8efr:L, 8efr:E, 8efr:M, 8efr:F, 8efr:N, 8efr:G, 8efr:O, 8efr:H, 8efr:P, 8efr:I, 8efr:Q, 8efr:J, 8efr:R, 6jtg:A
15	5oxf:C	601	111	0.1152	0.0632	0.3423	0.004	5oxf:D
16	7byi:A	463	247	0.1727	0.1231	0.2308	1.5	8aql:A, 8aql:B, 8aql:C, 8aql:D, 9box:A, 9box:C, 9box:B, 9box:D, 7byi:B, 8fjt:A, 8fjt:B, 8fju:A, 8fju:B, 8gks:A, 8gks:B, 8gkt:A, 8gkt:B, 8gku:A, 8gku:B, 8gkw:A, 8gkw:B, 8gky:A, 8gky:B, 8gkz:A, 8gkz:B, 6m5o:A, 6m5o:B, 6qvg:A, 6qvg:B, 6qvl:A, 6qvl:B, 8t4o:A, 8t4o:B, 8t4p:A, 8t4p:B, 8tlc:A, 8tlc:B, 5v7i:A, 5v7i:B
17	5n2j:B	1381	58	0.0667	0.0159	0.3793	1.9	6fsn:A, 5mu1:A, 5mzo:A, 5n2j:A, 3wzs:A, 7zhb:A, 7zkc:A, 7zle:A, 7zll:A, 7zlu:A, 7zlu:B, 7zlu:C, 7zxw:A
18	5c2v:B	352	38	0.0333	0.0312	0.2895	2.2	5c2v:E, 5c2w:B, 5c2w:E
19	5fhd:B	400	54	0.0455	0.0375	0.2778	2.8
20	8kab:h	430	84	0.0576	0.0442	0.2262	2.8
21	5ftc:A	431	54	0.0455	0.0348	0.2778	3.0	5fhd:A, 5fhe:A, 5fhf:A, 5ftb:A, 5fte:A, 5ftf:A, 6l3g:A, 6l3g:B
22	2d2m:A	140	32	0.0303	0.0714	0.3125	3.0	2d2n:A, 7e96:A, 7e97:A, 7e98:A, 7e99:A, 2zfo:A, 2zs0:A, 2zs1:A
23	4y0a:A	179	36	0.0424	0.0782	0.3889	3.4
24	1svw:A	190	69	0.0606	0.1053	0.2899	3.5	1svi:A, 1svw:B
25	1toa:A	277	106	0.0788	0.0939	0.2453	3.6	1toa:B
26	3w5m:A	1030	53	0.0545	0.0175	0.3396	3.8	3w5n:A
27	5m1j:A6	539	110	0.1030	0.0631	0.3091	4.1
28	5gom:A	407	33	0.0394	0.0319	0.3939	4.9	5gnr:A, 5gof:A, 5gom:B, 5yew:A, 5yew:B, 5yew:C
29	5goe:A	384	33	0.0394	0.0339	0.3939	4.9	5gns:A, 5gnt:A
30	5u34:A	960	41	0.0394	0.0135	0.3171	5.2
31	8szh:A	835	42	0.0424	0.0168	0.3333	6.4	9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
32	4qq8:C	569	44	0.0515	0.0299	0.3864	7.5	2ag0:A, 2ag0:B, 2ag0:C, 2ag0:D, 2ag1:A, 2ag1:B, 2ag1:C, 2ag1:D, 3d7k:A, 3d7k:B, 3iae:A, 3iae:B, 3iaf:A, 3iaf:B, 3iaf:C, 3iaf:D, 4qpz:A, 4qpz:B, 4qpz:C, 4qpz:D, 4qpz:E, 4qpz:F, 4qpz:G, 4qpz:H, 4qq8:A, 4qq8:B, 4qq8:D, 2uz1:A, 2uz1:B, 2uz1:C, 2uz1:D
33	6ha8:V	541	64	0.0515	0.0314	0.2656	7.6
34	5irm:C	770	50	0.0455	0.0195	0.3000	8.4	5irl:A, 5irm:A, 5irn:A
35	7r89:B	529	43	0.0394	0.0246	0.3023	8.9
36	4oll:A	316	114	0.0879	0.0918	0.2544	9.3	4onu:A
37	8ips:B	588	77	0.0788	0.0442	0.3377	9.4	8ipt:A, 8ipt:E, 7zda:D, 7zdb:D, 7zdc:D, 7zde:D, 7zdf:D, 7zdg:D, 7zdk:D, 7zdl:D, 7zdr:D, 7zdt:D, 7zdu:D, 7zdv:D, 7zdw:D, 7ze5:D, 7zec:D
38	6o8h:A	571	93	0.0727	0.0420	0.2581	9.6	6o8g:B, 6o8g:C
39	4tsd:B	181	31	0.0364	0.0663	0.3871	10.0	4tsd:A

[Back]