BioLiP

>protein
LAFFRNMYDKYRDAFLSHLNEYSLEEEIKEHISKYYKLLFDYNCLGGKNNRGILVILIYEYVKINSSEWEKAACLAWCIE
ILQAAFLVADDIMDKGEMRRNKYCWYLLKDVETKNAVNDVLLLYNSIYKLIEIYLRNESCYVDVIATFRDATLKTIIGQH
LDTNIFSDKYSEIDVNNINVPEQPVIDINMINFGVYKNIVIHKTAYYSFFLPIVCGMLLAGIAVDNLIYKKIEDISMLMG
EYFQIHDDYLDIFGDSTKTGKVGSDIQNNKLTWPLIKTFELCSEPDKIKIVKNYGKNNLACVKVIDSLYEQYKIRKHYES
YEKAQKAKILSAINELHHEGIEYVLKYLLEILFTGV

The query sequence (length=356) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3rbm:B	362	362	1.0000	0.9834	0.9834	0.0	3cc9:A, 3cc9:B, 3cc9:D, 3ez3:A, 3ez3:B, 3ez3:C, 3ez3:D, 5hn7:A, 5hn7:B, 5hn7:C, 5hn7:D, 5hn7:G, 5hn7:E, 5hn7:F, 5hn7:H, 5hn8:C, 5hn9:A, 5hn9:B, 5hn9:D, 5hna:A, 5hna:B, 5hna:C, 5hna:D, 3ldw:A, 3ldw:B, 3ldw:C, 3ldw:D, 3ph7:A, 3ph7:B, 3ph7:D, 3rbm:A, 3rbm:C, 3rbm:D, 3ryw:A, 3ryw:D, 3ryw:B, 3ryw:C
2	5hn8:D	334	353	0.9382	1.0000	0.9462	0.0	3cc9:C, 5hn8:A, 5hn8:B, 5hn9:C, 3ph7:C
3	4dem:F	346	314	0.3230	0.3324	0.3662	3.24e-61	3b7l:A, 5cg5:A, 5cg6:A, 3cp6:A, 5dgm:F, 5dgn:F, 5dgs:F, 5diq:F, 5djp:F, 5djr:F, 5djv:F, 2f7m:F, 2f89:F, 2f8c:F, 2f8z:F, 2f92:F, 2f94:F, 2f9k:F, 4ga3:A, 4h5c:F, 4h5d:F, 4h5e:F, 5ja0:F, 5juz:F, 4jvj:F, 5jv0:F, 5jv1:F, 5jv2:F, 4kfa:A, 4kpd:A, 4kpj:A, 4kq5:A, 4kqs:A, 4kqu:A, 5ksx:F, 4l2x:F, 4lfv:F, 4lpg:F, 4lph:F, 3n1v:F, 3n1w:F, 4n1z:F, 3n3l:F, 3n45:F, 3n46:F, 3n49:F, 3n5h:F, 3n5j:F, 3n6k:F, 6n7y:F, 6n7z:F, 6n82:F, 6n83:F, 4n9u:A, 4nfi:F, 4nfj:F, 4nfk:F, 4ng6:A, 4nke:A, 4nkf:A, 4nua:A, 6oag:F, 6oah:F, 4ogu:A, 2opm:A, 2opn:A, 4p0v:A, 4p0w:A, 4p0x:A, 4pvx:F, 4pvy:F, 4q23:A, 2qis:A, 4qpf:A, 4qxs:F, 2rah:A, 4rxa:A, 3rye:A, 3s4j:A, 2vf6:A, 5ygi:A, 1yq7:A, 1yv5:A, 1zw5:A
4	6b04:A	341	320	0.3006	0.3138	0.3344	1.48e-58	6b04:B, 6b04:C, 6b06:A, 6b06:B, 6b06:C, 6b07:A, 6b07:B, 6b07:C
5	4jzb:A	362	350	0.3315	0.3260	0.3371	1.89e-58	4jzb:B, 4jzx:A, 4jzx:B, 4k10:A, 4k10:B, 4k10:D, 4k10:C, 6vjc:A, 6vjc:B, 6w7i:A, 6w7i:B, 6ww1:A, 6ww1:B
6	1ubw:A	348	292	0.2949	0.3017	0.3596	1.63e-56	1ubx:A, 1uby:A
7	8a7l:A	346	309	0.2781	0.2861	0.3204	6.46e-52	8a6v:A, 8a6v:B, 8a6z:A, 8a6z:B, 8a6z:C, 8a6z:D, 8a6z:E, 8a6z:F, 8a70:A, 8a73:A, 8a73:B, 8a74:A, 8a74:B, 8a78:A, 8a7a:A, 8a7b:A, 8a7c:A, 8a7c:B, 8a7j:A, 8a7j:B, 8a7k:A, 8a7k:B, 8a7r:A, 8a7u:A
8	2ewg:A	367	353	0.3258	0.3161	0.3286	1.48e-51	5ael:A, 5ael:B, 5afx:A, 5afx:B, 5ahu:B, 5ahu:D, 3dyf:A, 3dyf:B, 3dyg:A, 3dyg:B, 3dyh:A, 3dyh:B, 3efq:A, 3efq:B, 3egt:A, 3egt:B, 2ewg:B, 2i19:A, 2i19:B, 2ogd:A, 2ogd:B, 2p1c:A, 2p1c:B, 4rxc:A, 4rxc:B, 4rxd:A, 4rxd:B, 4rxd:C, 4rxe:A, 4rxe:B
9	4dxj:A	362	344	0.3034	0.2983	0.3140	3.01e-48	4dwb:A, 4dwg:A, 4dxj:B, 4dxj:C, 4dzw:A, 4e1e:A, 3iba:A, 3ick:A, 3icm:A, 3icn:A, 3icz:A, 3id0:A, 5qpd:A, 5qpe:A, 5qpf:A, 5qpg:A, 5qph:A, 5qpi:A, 5qpj:A, 5qpk:A, 5qpl:A, 5qpm:A, 5qpn:A, 5qpo:A, 5qpp:A, 5qpq:A, 5qpr:A, 5qps:A, 5qpt:A, 5qpu:A, 5qpv:A, 5qpw:A, 5qpx:A, 5qpy:A, 5qpz:A, 5qq0:A, 5qq1:A, 5qq2:A, 5qq3:A, 5qq4:A, 5qq5:A, 5qq6:A, 5qq7:A, 5qq8:A, 5qq9:A, 5qqa:A, 5qqb:A, 6r05:A, 6r06:A, 6r07:A, 6r08:A, 6r09:A, 6r0a:A, 6r0b:A, 6sdn:A, 6sdo:A, 6sdp:A, 6sdq:A, 6se2:A, 6sf8:A, 6sf9:A, 6sfa:A, 6shv:A, 6si5:A, 6t7n:AAAA, 1yhl:A, 1yhm:A, 1yhm:B, 1yhm:C
10	2o1o:A	335	356	0.3034	0.3224	0.3034	3.84e-44	2o1o:B, 2q58:A, 2q58:B
11	6r38:A	331	342	0.2921	0.3142	0.3041	3.18e-42	5qt4:A, 5qt5:A, 5qt6:A, 5qt7:A, 5qt8:A, 5qt9:A, 5qta:A, 5qte:A, 5qtf:A, 5qtg:A, 5qth:A, 5qti:A, 5qtj:A, 5qtk:A, 6r37:A, 6r39:A, 6sii:A
12	6kd7:A	327	239	0.1910	0.2080	0.2845	5.70e-15
13	3aqb:D	325	248	0.1770	0.1938	0.2540	1.66e-08	3aqb:B, 3aqc:B, 3aqc:D
14	3krf:D	295	257	0.1854	0.2237	0.2568	6.99e-08	3kra:A, 3kra:D, 3krc:A, 3krc:D, 3krf:A, 3kro:A, 3kro:D, 3krp:A, 3krp:D, 3oab:A, 3oab:D, 3oac:D
15	5h9d:A	318	340	0.2500	0.2799	0.2618	1.25e-07	5h9d:B
16	3qqv:A	357	250	0.1826	0.1821	0.2600	1.81e-07
17	5ze6:A	315	250	0.1798	0.2032	0.2560	1.85e-07	3wjn:A, 3wjo:A, 5ze6:C, 5ze6:B, 5ze6:D
18	3oyr:B	328	241	0.1657	0.1799	0.2448	2.52e-07
19	2dh4:A	326	238	0.1629	0.1779	0.2437	2.76e-07	2dh4:B, 2e8t:A, 2e8t:B, 2e8u:A, 2e8u:B, 2e8v:A, 2e8v:B, 2e8w:A, 2e8w:B, 2e8x:A, 2e8x:B, 2e90:A, 2e90:B, 2e91:A, 2e91:B, 2e92:A, 2e92:B, 2e93:A, 2e93:B, 2e94:A, 2e94:B, 2e95:A, 2e95:B, 2z4v:A, 2z4v:B, 2z4w:A, 2z4w:B, 2z4x:A, 2z4x:B, 2z4y:A, 2z4y:B, 2z4z:A, 2z4z:B, 2z50:A, 2z52:A, 2z52:B, 2z78:A, 2z78:B, 2z7h:A, 2z7h:B, 2z7i:A, 2z7i:B, 2zeu:A, 2zeu:B, 2zev:A, 2zev:B
20	8f8k:A	353	141	0.1124	0.1133	0.2837	6.87e-07	8f8l:A
21	2z50:B	280	207	0.1433	0.1821	0.2464	2.51e-06
22	4gp2:A	342	240	0.1629	0.1696	0.2417	4.56e-06	4gp1:A, 4gp2:B
23	4lfg:A	290	237	0.1713	0.2103	0.2574	4.78e-06	4lfe:A, 4lfe:B, 4lfg:B
24	5zlf:A	293	238	0.1629	0.1980	0.2437	5.71e-05
25	2j1p:A	276	269	0.1770	0.2283	0.2342	8.24e-05
26	4lls:A	300	237	0.1854	0.2200	0.2785	8.52e-05	4lls:B, 4llt:A, 4llt:B
27	3q1o:A	303	192	0.1433	0.1683	0.2656	1.29e-04	3q1o:B, 3q1o:C, 3q1o:D
28	1rqi:A	300	43	0.0506	0.0600	0.4186	0.005	2for:A, 2for:B, 1rqi:B, 1rqj:A, 1rqj:B
29	6r4v:C	294	270	0.1685	0.2041	0.2222	0.047	6g31:A, 6g31:B, 6g31:C, 6g31:D, 6g31:F, 6g31:G, 6g31:H, 6g31:I, 6g31:J, 6g31:K, 6g31:L, 2q80:A, 2q80:B, 2q80:C, 2q80:D, 2q80:E, 2q80:F, 6r4v:A, 6r4v:F, 6r4v:E, 6r4v:B, 6r4v:D
30	3q2q:A	314	234	0.1545	0.1752	0.2350	0.054
31	4jxy:A	311	255	0.1573	0.1801	0.2196	0.082
32	3exj:A	194	59	0.0562	0.1031	0.3390	0.084	3exj:B, 3exl:A, 2geq:A, 2geq:B, 1hu8:A, 1hu8:B, 1hu8:C, 2ioi:A, 2iom:A, 2ioo:A
33	4mzr:A	234	39	0.0393	0.0598	0.3590	0.26	4mzr:B, 4mzr:C, 4mzr:D, 3q01:A, 3q01:B, 3q05:A, 3q05:C, 3q05:B, 3q05:D, 3q06:A, 3q06:C, 3q06:D, 3q06:B, 3ts8:A, 3ts8:B, 3ts8:C, 3ts8:D
34	7ye1:C	1312	52	0.0506	0.0137	0.3462	0.27	7ye2:C
35	3aq0:C	327	43	0.0478	0.0520	0.3953	0.27	3aq0:A, 3aq0:B, 3aq0:E, 3aq0:F, 3aq0:G, 3aq0:H
36	7s0m:B	305	256	0.1742	0.2033	0.2422	0.32	7s0m:A
37	4fp4:A	243	98	0.0702	0.1029	0.2551	0.85
38	1ze2:B	218	55	0.0421	0.0688	0.2727	0.87
39	7my6:A	287	235	0.1461	0.1812	0.2213	1.5	7my6:B
40	6uw3:B	326	65	0.0506	0.0552	0.2769	1.7	6uvx:B, 6uw1:B, 6uw3:A, 6uw5:B, 6uw5:A, 6uw7:B
41	6n9x:B	500	69	0.0618	0.0440	0.3188	1.9	1e0j:A, 1e0j:B, 1e0j:C, 1e0j:D, 1e0j:E, 1e0j:F, 6n7i:A, 6n7i:B, 6n7i:C, 6n7i:D, 6n7i:E, 6n7n:A, 6n7n:B, 6n7n:C, 6n7n:D, 6n7n:E, 6n7n:F, 6n7s:A, 6n7s:B, 6n7s:C, 6n7s:D, 6n7s:E, 6n7t:A, 6n7t:B, 6n7t:C, 6n7t:D, 6n7t:E, 6n7t:F, 6n7v:A, 6n7v:B, 6n7v:C, 6n7v:D, 6n7v:E, 6n7v:F, 6n9u:E, 6n9v:A, 6n9v:B, 6n9v:C, 6n9v:D, 6n9v:E, 6n9v:F, 6n9w:A, 6n9w:B, 6n9w:C, 6n9w:D, 6n9w:E, 6n9x:A, 6n9x:C, 6n9x:D, 6n9x:E
42	4hnx:A	713	33	0.0393	0.0196	0.4242	2.2
43	6c56:B	267	201	0.1292	0.1723	0.2289	3.6	6c57:B, 6g31:E
44	3crv:A	551	35	0.0478	0.0309	0.4857	3.8	5h8c:A
45	1v9p:A	584	39	0.0365	0.0223	0.3333	4.1	1dgs:A, 1dgs:B, 1v9p:B
46	5epo:A	261	33	0.0365	0.0498	0.3939	4.5	5epo:B, 5epo:C, 5epo:D
47	2rmn:A	233	42	0.0365	0.0558	0.3095	6.5	3qym:A, 3qym:B, 3qym:C, 3qym:D, 3qym:E, 3qym:F, 3qym:G, 3qym:H, 3qyn:A, 3qyn:B, 3qyn:D, 3qyn:C, 3us0:A, 3us0:B, 3us0:D, 3us0:C, 3us1:A, 3us1:D, 3us2:A, 3us2:C, 3us2:B, 3us2:D, 3us2:G, 3us2:I, 3us2:H, 3us2:J, 7z71:A, 7z71:C, 7z7e:A
48	7ezj:k	206	25	0.0281	0.0485	0.4000	7.8	4a63:C, 4a63:E, 4a63:G, 4a63:I, 4a63:K, 7ezj:A, 7ezj:B, 7ezj:C, 7ezj:D, 7ezj:I, 7ezj:J, 7ezj:K, 7ezj:L, 7ezj:a, 7ezj:b, 7ezj:c, 7ezj:d, 7ezj:i, 7ezj:j, 7ezj:l, 4g82:A, 4g82:B, 4g83:B, 4g83:A, 4guo:A, 4guo:B, 4guo:C, 4guo:D, 4guo:J, 4guo:I, 4guo:K, 4guo:L, 4guq:A, 4guq:B, 5kbd:A, 5kbd:B, 3vd0:A, 3vd0:B, 3vd0:C, 3vd0:D, 3vd0:I, 3vd0:J, 3vd0:K, 3vd0:L, 3vd1:A, 3vd1:B, 3vd1:C, 3vd1:D, 3vd1:J, 3vd1:I, 3vd1:K, 3vd1:L, 3vd2:A, 3vd2:B, 3vd2:C, 3vd2:D, 3vd2:I, 3vd2:J, 2xwc:A
49	8fvu:A	1361	62	0.0506	0.0132	0.2903	8.1	2vm5:A
50	3t0c:A	737	48	0.0421	0.0204	0.3125	9.5

[Back]