Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIIN

The query sequence (length=32) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8g5y:SA 222 32 1.0000 0.1441 1.0000 2.62e-18 7a01:U3, 7a09:a, 5a2q:A, 5aj0:BA, 9bdl:AS00, 9bdn:AS00, 9bdp:AS00, 8bhf:B3, 9bkd:N, 9bln:N, 8btk:AZ, 7cpu:SA, 7cpv:SA, 4d5l:A, 4d61:A, 6d90:BB, 6d9j:BB, 9f1b:AZ, 9f1c:AZ, 9f1d:AZ, 6fec:f, 5flx:A, 6g18:A, 6g4s:A, 6g51:A, 6g53:A, 6g5h:A, 6g5i:A, 8g5z:SA, 8g60:SA, 8g61:SA, 8g6j:SA, 8glp:SA, 6gz3:BA, 6gz4:BA, 6gz5:BA, 6hcf:B1, 6hcj:B2, 6hcm:B1, 6hcq:B2, 8ifd:2n, 8ife:2n, 6ip5:2n, 6ip6:2n, 6ip8:2n, 3j7p:SA, 3j7r:SA, 3jag:AA, 3jah:AA, 3jai:AA, 3jaj:SA, 3jan:SA, 8jdj:x, 8jdk:x, 8jdl:x, 8jdm:x, 7jqb:B, 7jqc:B, 5k0y:f, 8k2c:SA, 7k5i:A, 4kzx:A, 4kzy:A, 4kzz:A, 5lks:SA, 7ls1:o2, 7ls2:o2, 5lzs:AA, 5lzt:AA, 5lzu:AA, 5lzv:AA, 5lzw:AA, 5lzx:AA, 5lzy:AA, 5lzz:AA, 7mdz:AA, 6mtb:AA, 6mtc:AA, 6mtd:AA, 6mte:AA, 7nwg:B2, 7nwh:AA, 7nwi:AA, 7o7y:AZ, 7o7z:AZ, 7o80:AZ, 7o81:AZ, 5oa3:A, 6ole:SA, 6olf:SA, 6olg:BA, 6oli:SA, 6olz:BA, 6om0:SA, 6om7:SA, 7oya:A2, 7oyb:A2, 7oyc:A2, 7oyd:AA, 8oz0:Q, 8p03:C, 8p09:C, 8p2k:AZ, 6p4g:B, 6p4h:B, 6p5i:B, 6p5j:B, 6p5k:B, 6p5n:B, 8pj1:N, 8pj2:N, 8pj3:N, 8pj4:N, 8pj5:N, 8pj6:N, 8ppk:A, 8ppl:AA, 8q7z:AZ, 8q87:AZ, 7qgg:SA, 8qoi:SA, 7qp6:N, 7qp7:N, 7qvp:SA, 7qvp:RA, 6qzp:SA, 7r4x:A, 6r5q:q, 6r6g:q, 6r6p:q, 6r7q:q, 8rg0:N, 8scb:AA, 6sgc:B1, 7syg:B, 7syh:B, 7syi:B, 7syj:B, 7syk:B, 7syl:B, 7sym:B, 7syn:B, 7syo:B, 7syp:B, 7syq:B, 7syr:B, 7sys:B, 7syt:B, 7syu:B, 7syv:B, 7syw:B, 7syx:B, 5t2c:Ao, 8t4s:A, 7toq:AS00, 7tor:AS00, 7tql:B, 7ucj:AA, 7uck:AA, 4ug0:SA, 4ujc:CA, 4ujd:CA, 4uje:BA, 4v6x:AA, 5vyc:A1, 5vyc:A2, 5vyc:A3, 5vyc:A4, 5vyc:A5, 5vyc:A6, 6w2s:B, 6w2t:B, 7wtw:A, 7wtx:A, 7wtz:A, 7wu0:A, 6xa1:SA, 7xnx:SA, 7xny:SA, 8xsx:SA, 8xsy:SA, 8xsz:SA, 8xxl:SA, 8xxm:SA, 8xxn:SA, 6y0g:SA, 8y0w:SA, 8y0x:SA, 6y2l:SA, 6y57:SA, 6yal:C, 6yam:C, 6yan:C, 6ybw:N, 8yoo:SA, 8yop:SA, 6z6l:SA, 6z6m:SA, 6z6n:SA, 7zjw:SL, 7zjx:SL, 6zlw:B, 6zm7:SA, 6zme:SA, 6zmi:SA, 6zmo:SA, 6zmt:B, 6zmw:N, 6zn5:B, 6zoj:A, 6zok:A, 6zon:a, 6zp4:a, 6zuo:A, 6zv6:A, 6zvh:A, 6zvj:a, 6zvk:U3, 6zxd:A, 6zxe:A, 6zxf:A, 6zxg:A, 6zxh:A
2 4v3p:SA 260 32 0.7188 0.0885 0.7188 1.06e-11 8auv:Z, 8b2l:Z1, 8ip8:za, 8ip9:za, 8ipa:za, 8ipb:za, 8jiw:BA, 7qix:E, 7qiz:u, 8r6f:k, 4v7e:BA
3 4v6w:AA 218 32 0.6250 0.0917 0.6250 1.61e-10 6xu6:AA, 6xu7:AA, 6xu8:AA
4 6zj3:SB 207 32 0.5000 0.0773 0.5000 2.94e-06
5 9bh5:AA 207 32 0.5938 0.0918 0.5938 6.97e-06 9cai:AA
6 4v6i:AA 252 32 0.4375 0.0556 0.4375 1.59e-05 7a1g:P, 7b7d:P, 8bn3:S0, 8bqd:P, 8bqx:P, 8c01:P, 8cah:P, 8cas:P, 8cbj:A, 8ccs:d, 8cdl:d, 8cdr:d, 8ceh:d, 8cf5:d, 8cg8:d, 8cgn:d, 8civ:d, 8cku:d, 8cmj:d, 5dat:S0, 5dat:s0, 5dc3:S0, 5dc3:s0, 5dge:S0, 5dge:s0, 5dgf:S0, 5dgf:s0, 5dgv:S0, 5dgv:s0, 6eml:P, 8eub:BA, 8evp:BA, 8evq:BA, 8evr:BA, 8evs:BA, 8evt:BA, 8ewb:BA, 8ewc:BA, 6fai:A, 5fci:S0, 5fci:s0, 5fcj:S0, 5fcj:s0, 6fyx:A, 6fyy:A, 6gq1:q, 6gqb:q, 6gqv:q, 6gsm:A, 6gsn:A, 6hhq:B, 6hhq:s0, 5i4l:S0, 5i4l:s0, 6i7o:P, 6i7o:Pb, 8i7j:A, 5it7:A, 5it9:A, 3j6x:S0, 3j6y:S0, 3j77:S0, 3j78:S0, 3j80:A, 3j81:A, 3jam:A, 3jap:A, 5juo:XA, 5jup:XA, 5jus:XA, 5jut:XA, 5juu:XA, 8k2d:SA, 8k82:SA, 5ll6:P, 5lyb:S0, 5lyb:s0, 5m1j:A2, 5mc6:P, 5mei:s0, 5mei:B, 7mpi:BA, 7mpj:BA, 7n8b:BA, 5ndg:S0, 5ndg:s0, 5ndv:S0, 5ndv:s0, 5ndw:S0, 5ndw:s0, 7nrc:SP, 7nrd:SP, 5obm:S0, 5obm:s0, 5on6:s0, 5on6:B, 7osa:uS2, 7osm:uS2, 6q8y:P, 6rbd:A, 6rbe:A, 7rr5:SA, 8rw1:A, 6s47:BB, 8s8d:A, 8s8e:A, 8s8f:A, 8s8g:A, 8s8h:A, 8s8i:A, 8s8j:A, 6snt:A, 6sv4:P, 6sv4:Pb, 6sv4:Pc, 6t4q:SA, 6t7i:SA, 6t7t:SA, 6t83:Ab, 6t83:b, 5tbw:B, 5tbw:s0, 6tb3:P, 5tga:S0, 5tga:s0, 5tgm:S0, 5tgm:s0, 6tnu:P, 4u3m:S0, 4u3m:s0, 4u3n:S0, 4u3n:s0, 4u3u:S0, 4u3u:s0, 4u4n:S0, 4u4n:s0, 4u4o:S0, 4u4o:s0, 4u4q:S0, 4u4q:s0, 4u4r:S0, 4u4r:s0, 4u4u:S0, 4u4u:s0, 4u4y:S0, 4u4y:s0, 4u4z:S0, 4u4z:s0, 4u50:S0, 4u50:s0, 4u51:S0, 4u51:s0, 4u52:S0, 4u52:s0, 4u53:S0, 4u53:s0, 4u55:S0, 4u55:s0, 4u56:S0, 4u56:s0, 4u6f:S0, 4u6f:s0, 4uer:B, 6uz7:A, 4v4b:AB, 4v7h:AB, 4v7r:CA, 4v88:AA, 4v88:CA, 4v8y:AA, 4v8z:AA, 4v92:BA, 6wdr:A, 6woo:AA, 6xiq:q, 6xir:q, 8y0u:SA, 6y7c:A, 6z6j:SA, 6z6k:SA, 6zce:B, 7zpq:AA, 7zrs:AA, 6zu9:P, 7zuw:AA, 7zux:DA, 6zvi:i, 7zw0:sP
7 8fvy:A 199 32 0.4688 0.0754 0.4688 2.06e-05 8br8:SA, 8brm:SA, 8bsi:SA, 8bsj:SA, 8btd:SA, 8btr:SA, 8g4s:A, 7pwf:A, 7pwo:A1
8 5xyi:A 204 32 0.4688 0.0735 0.4688 3.01e-05
9 3j7a:C 195 32 0.4375 0.0718 0.4375 3.17e-05 3jbn:C, 3jbo:C, 3jbp:C, 6okk:C, 8tpu:SC
10 7r81:B2 209 32 0.4375 0.0670 0.4375 6.23e-05 7olc:SA, 7old:SA, 8oo0:SA, 7z3n:SA, 7z3o:SA
11 8c3a:C 208 32 0.4688 0.0721 0.4688 9.16e-05 8c3a:CN, 8cq7:C, 8cq7:CN, 8cqw:C, 8cqw:CN, 8cre:C, 8cre:CN, 8oeq:C, 8oeq:CN, 7pzy:B, 7q08:B, 7q0f:B, 7q0p:B, 7q0r:B, 8q5i:B
12 5jb3:B 202 32 0.3750 0.0594 0.3750 5.45e-04 5jbh:B, 6skf:Ab, 6skg:Ab, 6sw9:B, 6swc:B, 6swd:B, 6th6:Ab, 6tmf:B, 4v4n:BB, 4v6u:AB, 7zag:B, 7zah:B, 7zai:B, 7zhg:B
13 5xxu:A 198 32 0.3750 0.0606 0.3750 0.001
14 8hkx:AS2P 196 32 0.3438 0.0561 0.3438 0.003 8hky:AS2P, 8hkz:AS2P, 8hl1:AS2P, 8hl2:AS2P, 8hl3:AS2P, 8hl4:AS2P, 8hl5:AS2P, 8wkp:AS2P, 8wq2:AS2P, 8wq4:AS2P
15 8ova:AC 208 32 0.4688 0.0721 0.4688 0.006 7ase:F, 5opt:f, 8ove:AC, 4v8m:AC
16 6az1:B 211 32 0.4062 0.0616 0.4062 0.015 8a3w:SB, 8a98:SB, 8ovj:SB, 8rxh:SB, 8rxx:SB, 5t2a:AC
17 4v5o:AB 204 32 0.4062 0.0637 0.4062 0.024 4bts:AB, 4bts:BB, 4bts:CB, 4bts:DB, 4v5o:BB
18 6zu5:SA0 202 33 0.4062 0.0644 0.3939 0.037
19 8p5d:SA0 220 28 0.3438 0.0500 0.3929 0.72 8p60:SA0, 8p60:RA0, 7qca:SA0
20 7qep:S0 203 33 0.3750 0.0591 0.3636 1.1
21 3kvg:B 382 30 0.3438 0.0288 0.3667 1.4 3kvg:A, 3l4i:A, 3l4i:B
22 6rm3:SA0 197 33 0.3750 0.0609 0.3636 2.0
23 7b04:A 409 13 0.2812 0.0220 0.6923 2.3 7b04:D, 7b04:G, 7b04:J, 7b04:M, 7b04:P, 7b04:S, 7b04:V
24 6ap1:B 322 24 0.3125 0.0311 0.4167 3.1 6ap1:A, 6ap1:C, 6ap1:D, 6ap1:E, 6bmf:A, 6bmf:B, 6bmf:C, 6bmf:D, 6bmf:E, 3eih:A, 3eih:B, 3eih:C, 6ndy:A, 6ndy:B, 6ndy:C, 6ndy:D, 6ndy:E, 6oo2:A, 6oo2:B, 6oo2:C, 6oo2:D, 6oo2:E, 2qpa:A, 5uie:A, 5uie:B, 5uie:C, 5uie:D, 5uie:E, 5xmi:B, 5xmi:C, 5xmi:D, 5xmi:E, 5xmi:F, 5xmk:B, 5xmk:C, 5xmk:D, 5xmk:E, 5xmk:F
25 6asy:A 606 24 0.3750 0.0198 0.5000 4.1 7a4v:A, 6asy:B, 6cz1:A, 6cz1:B, 6dfm:A, 6dfm:B, 6dfo:A, 6dfo:B, 6do2:A, 6do2:B, 6dws:A, 6dws:B, 5e84:A, 5e84:B, 5e84:C, 5e84:D, 5e84:E, 5e84:F, 6eoe:A, 6eof:A, 5evz:A, 5evz:B, 5ex5:A, 5ex5:B, 5exw:A, 5exw:B, 5ey4:A, 5ey4:B, 5f0x:A, 5f0x:B, 5f1x:A, 5f1x:B, 5f2r:A, 5f2r:B, 3iuc:A, 3iuc:C, 3ldl:A, 3ldl:B, 3ldo:A, 3ldo:B, 3ldp:A, 3ldp:B, 7n1r:A, 7n1r:B, 6zmd:A, 6zyh:A, 6zyh:B
26 1y7i:B 262 19 0.3125 0.0382 0.5263 5.2 1xkl:A, 1xkl:B, 1xkl:C, 1xkl:D, 1y7i:A
27 5tky:A 597 21 0.2812 0.0151 0.4286 5.5 5tky:B
28 7krw:A 608 30 0.3438 0.0181 0.3667 6.6 4b9q:A, 4b9q:B, 4b9q:C, 4b9q:D, 1dkx:A, 1dky:A, 1dky:B, 1dkz:A, 3dpo:B, 3dpo:A, 3dpp:A, 3dpp:B, 3dpq:B, 3dpq:A, 3dpq:F, 3dpq:E, 4e81:A, 4e81:B, 4ezn:A, 4ezn:B, 4ezo:A, 4ezo:B, 4ezp:A, 4ezp:B, 4ezq:A, 4ezr:A, 4ezs:A, 4ezt:A, 4ezu:A, 4ezv:A, 4ezv:B, 4ezw:A, 4ezw:B, 4ezw:C, 4ezw:D, 4ezx:A, 4ezx:B, 4ezy:A, 4ezz:A, 4f00:A, 4hy9:A, 4hy9:B, 4hyb:A, 4hyb:B, 7jmm:A, 4jn4:A, 4jn4:B, 4jne:A, 4jne:B, 7jn8:A, 7jn9:A, 7jne:A, 4jwc:A, 4jwc:B, 4jwd:B, 4jwd:A, 4jwe:A, 4jwe:B, 4jwi:A, 4jwi:B, 7ko2:A, 7ko2:B, 7ko2:C, 7ko2:D, 7krt:A, 7krt:B, 7krt:C, 7krt:D, 7kru:B, 7kru:A, 7krv:B, 7krv:A, 7krw:C, 7krw:B, 7krw:D, 7kzi:A, 7kzi:B, 7kzu:A, 7n46:A, 7n6j:A, 7n6k:A, 7n6l:A, 7n6m:A, 5nro:A, 5oow:A, 5oow:B, 1q5l:A, 3qnj:A, 3qnj:B, 4r5g:B, 4r5i:A, 4r5j:A, 4r5j:C, 4r5j:B, 4r5j:D, 4r5k:A, 4r5k:B, 7rax:A
29 5ch7:B 329 15 0.2500 0.0243 0.5333 7.1 5ch7:D, 5ch7:F, 5chc:B, 5chc:D, 5chc:F, 5e7o:B, 5e7o:D, 5e7o:F, 5e7o:H, 5e7o:J, 5e7o:L, 4ydd:B, 4ydd:D, 4ydd:F
30 5umb:A 378 28 0.3125 0.0265 0.3571 7.6 8d1p:A, 8d1q:A, 8d1s:A, 8d1w:A, 8d1y:A, 8d20:A, 8d22:A, 8d24:A, 5umb:B, 5umb:C, 5umb:D
31 3egw:B 509 13 0.2500 0.0157 0.6154 8.4 3ir5:B, 3ir6:B, 3ir7:B, 1q16:B, 1r27:B, 1r27:D, 1siw:B, 1y4z:B, 1y5i:B, 1y5l:B, 1y5n:B
32 3c7n:B 540 26 0.3438 0.0204 0.4231 8.8 5aqf:A, 5aqf:C, 5aqg:A, 5aqg:C, 5aqg:E, 5aqh:A, 5aqi:A, 5aqi:C, 5aqj:A, 5aqj:C, 5aqj:E, 5aqk:A, 5aqn:A, 5aqn:C, 5aqn:E, 5aqo:A, 5aqo:C, 5aqo:E, 5aqp:A, 5aqp:C, 5aqp:E, 5aqq:A, 5aqq:C, 5aqq:E, 5aqr:A, 5aqr:C, 5aqr:E, 5aqs:A, 5aqs:C, 5aqt:A, 5aqu:A, 5aqv:A, 1atr:A, 1ats:A, 6b1i:A, 6b1i:B, 6b1m:B, 6b1m:A, 6b1n:A, 6b1n:B, 1ba0:A, 1ba1:A, 1bup:A, 2bup:A, 4fl9:A, 5fpd:A, 5fpd:B, 5fpe:A, 5fpe:B, 5fpm:A, 5fpm:B, 5fpn:A, 5fpn:B, 3fzf:A, 3fzh:A, 3fzk:A, 3fzl:A, 3fzm:A, 4h5n:A, 4h5n:B, 4h5r:A, 4h5r:B, 4h5t:A, 4h5v:A, 4h5w:A, 4h5w:B, 6h54:A, 1hpm:A, 3hsc:A, 3i33:A, 1kax:A, 1kay:A, 1kaz:A, 3ldq:A, 3m3z:A, 1nga:A, 1ngb:A, 1ngc:A, 1ngd:A, 1nge:A, 1ngf:A, 1ngg:A, 1ngh:A, 1ngi:A, 1ngj:A, 7o6r:A, 7odb:A, 7odd:A, 7odi:A, 7plk:A, 1qqm:A, 1qqn:A, 1qqo:A, 2qwl:A, 2qwl:B, 2qwm:A, 2qwm:B, 2qwn:A, 2qwo:A, 2qwp:A, 2qwq:A, 2qwr:A, 2v7z:A, 2v7z:B, 6zyj:A, 6zyj:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218