Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KWQFTPHQHRGPAEQFGENDHIYSPKLHNGSFKSRGLATFMGAPYCPPDRHKIREMGAKICFLAVPWDQGQIVRAGASQG
AAALRDATTQYFPYMFEYDVDLLSFFRVVDCGDVPTVPGNNIKSQEYTADYVTECLEGGAKVILFGGDHSLPIPGAKALS
RFTGSGKMGYLHVDCHLNAAPDWAGNLITNCSGAPRALDLPNCNARNMAHMGSRNGLNPKDWWDFYVDNEIRVVTMSEMI
ERGLEVCANEIFERVKKDTDSLYFTWDTDSIDISCMPGNSAPECYGLKGREVIQLARIAGRHGCDILDIVEFCPYFDPSQ
IGAKMTVNMIYHYLGSRAQTLRQQG

The query sequence (length=345) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8ryi:E 361 345 0.9710 0.9280 0.9710 0.0 8ryi:B, 8snf:D, 8snf:F, 8snk:I, 8snk:A, 8sp2:G, 8sp2:H, 8sp2:I, 8sp2:J, 8x3g:A, 8x3g:B
2 7esr:A 378 297 0.2522 0.2302 0.2929 3.52e-35
3 9fek:G 377 309 0.2493 0.2281 0.2783 5.84e-35 9fek:A, 9fek:B, 9fek:C, 9fek:D, 9fek:E, 9fek:F, 9fek:H, 9fek:I, 9fek:J, 9fek:K, 9fek:L
4 1gq6:B 301 302 0.2290 0.2625 0.2616 3.84e-25 1gq6:A, 1gq6:C, 1gq7:A, 1gq7:B, 1gq7:C, 1gq7:D, 1gq7:E, 1gq7:F
5 3nip:B 316 303 0.2348 0.2563 0.2673 1.95e-23 3nip:C, 3nip:E, 3nip:D, 3nip:F, 3niq:A, 3niq:B
6 3nio:A 316 319 0.2377 0.2595 0.2571 1.78e-22 3nio:B, 3nio:C, 3nio:D, 3nio:E, 3nio:F
7 7lba:B 310 267 0.2145 0.2387 0.2772 6.25e-18 7lba:A, 7lba:C, 7lba:D, 7lba:E, 7lba:F, 7lba:G, 7lba:H, 7lba:I, 7lba:J, 7lba:K, 7lba:L, 7lba:M, 7lba:P, 7lba:Q, 7lol:A, 7lox:A, 7lox:B, 7lox:C
8 4myn:A 298 286 0.2029 0.2349 0.2448 2.04e-17 4mxr:A, 4mxr:B, 4myf:A, 4myk:A
9 2ef5:A 273 291 0.2203 0.2784 0.2612 1.39e-13 2ef5:B, 2ef5:D, 2ef5:E, 2ef5:F, 2ef5:G
10 3pzl:B 293 295 0.1913 0.2253 0.2237 1.52e-13 3pzl:A, 3pzl:C
11 3m1r:D 321 277 0.1855 0.1994 0.2310 2.51e-13 3m1r:A, 3m1r:B, 3m1r:C, 3m1r:E, 3m1r:F
12 1cev:A 299 310 0.2087 0.2408 0.2323 8.76e-12 1cev:B, 1cev:C, 1cev:D, 1cev:E, 1cev:F, 2cev:A, 2cev:C, 2cev:B, 2cev:D, 2cev:E, 2cev:F, 3cev:A, 3cev:B, 3cev:C, 3cev:D, 3cev:E, 3cev:F, 4cev:A, 4cev:B, 4cev:C, 4cev:D, 4cev:E, 4cev:F, 5cev:A, 5cev:B, 5cev:C, 5cev:D, 5cev:F, 5cev:E
13 4dz4:B 323 267 0.1913 0.2043 0.2472 1.23e-11 4dz4:A, 4dz4:C, 4dz4:D, 4dz4:E, 4dz4:F
14 1wog:A 303 306 0.2203 0.2508 0.2484 1.43e-09 1wog:B, 1wog:C, 1wog:D, 1wog:E, 1wog:F, 1woi:A, 1woi:B, 1woi:C, 1woi:D, 1woi:E, 1woi:F
15 3lhl:A 276 280 0.1652 0.2065 0.2036 2.16e-09
16 6dkt:E 268 291 0.1942 0.2500 0.2302 8.58e-09
17 6vst:D 320 225 0.1826 0.1969 0.2800 1.16e-08 6vss:A, 6vss:B, 6vss:C, 6vss:D, 6vss:E, 6vss:F, 6vst:A, 6vst:B, 6vst:C, 6vst:E, 6vst:F, 6vst:G, 6vst:H, 6vst:I, 6vst:J, 6vst:K, 6vst:L
18 1hqf:A 314 296 0.2116 0.2325 0.2466 6.63e-08 1d3v:A, 1d3v:B, 3e8q:A, 3e8q:B, 3e8q:C, 3e8z:A, 3e8z:B, 3e8z:C, 3e9b:A, 3e9b:B, 3e9b:C, 1hq5:A, 1hq5:B, 1hqf:B, 1hqf:C, 1hqg:A, 1hqg:B, 1hqg:C, 1hqh:A, 1hqh:B, 1hqh:C, 1hqx:A, 1hqx:B, 1hqx:C, 1p8m:A, 1p8m:B, 1p8m:C, 1p8n:A, 1p8n:B, 1p8n:C, 1p8o:A, 1p8o:B, 1p8o:C, 1p8p:A, 1p8p:B, 1p8p:C, 1p8q:A, 1p8q:B, 1p8q:C, 1p8r:A, 1p8r:B, 1p8s:A, 1p8s:B, 1p8s:C, 1r1o:A, 1r1o:B, 1r1o:C, 1rla:A, 1rla:B, 1rla:C, 2rla:A, 2rla:B, 2rla:C, 3rla:A, 3rla:B, 3rla:C, 4rla:A, 4rla:B, 4rla:C, 5rla:A, 5rla:B, 5rla:C, 1t4p:A, 1t4p:B, 1t4p:C, 1t4r:A, 1t4r:B, 1t4r:C, 1t4s:A, 1t4s:B, 1t4s:C, 1t4t:A, 1t4t:B, 1t4t:C, 1t5f:A, 1t5f:B, 1t5f:C, 1t5g:A, 1t5g:B, 1t5g:C, 1ta1:A, 1ta1:B, 1ta1:C, 1tbh:A, 1tbh:B, 1tbh:C, 1tbj:A, 1tbj:B, 1tbj:C, 1tbl:A, 1tbl:B, 1tbl:C, 1zpe:A, 1zpe:B, 1zpe:C, 1zpg:A, 1zpg:B, 1zpg:C
19 6nfp:A 292 314 0.2058 0.2432 0.2261 9.94e-08 6dkt:A, 6dkt:B, 6dkt:C, 6dkt:D, 6dkt:F, 6nfp:B, 6nfp:C, 6nfp:D, 6nfp:E, 6nfp:F
20 7k4g:E 319 304 0.2087 0.2257 0.2368 1.93e-07 2aeb:A, 2aeb:B, 8aup:A, 8aup:B, 8aup:C, 8aup:D, 8aup:E, 8aup:F, 3dj8:A, 3dj8:B, 8e5m:A, 8e5m:B, 8e5m:C, 8e5m:D, 8e5m:E, 8e5m:F, 8e5n:A, 8e5n:B, 8e5n:C, 8e5n:D, 8e5n:E, 8e5n:F, 3e6k:A, 3e6k:B, 3e6v:A, 3e6v:B, 3f80:A, 3f80:B, 4fci:A, 4fci:B, 4fck:A, 4fck:B, 3gmz:A, 3gmz:B, 3gn0:A, 3gn0:B, 4gsv:A, 4gsv:B, 4gsz:A, 4gsz:B, 4gwc:A, 4gwc:B, 4gwd:A, 4gwd:B, 4hww:A, 4hww:B, 4hxq:A, 4hxq:B, 4ie1:A, 4ie1:B, 7k4g:A, 7k4g:B, 7k4g:C, 7k4g:D, 7k4g:F, 7k4h:A, 7k4h:B, 7k4h:C, 7k4h:D, 7k4h:E, 7k4h:F, 7k4i:A, 7k4i:B, 7k4i:C, 7k4i:D, 7k4i:E, 7k4i:F, 7k4j:A, 7k4j:B, 7k4j:C, 7k4j:D, 7k4j:E, 7k4j:F, 7k4k:A, 7k4k:B, 7k4k:C, 7k4k:D, 7k4k:E, 7k4k:F, 7klk:A, 7klk:B, 7klk:C, 7klk:D, 7klk:E, 7klk:F, 7kll:A, 7kll:B, 7kll:C, 7kll:D, 7kll:E, 7kll:F, 7klm:A, 7klm:B, 7klm:C, 7klm:D, 7klm:E, 7klm:F, 3kv2:A, 3kv2:B, 7ley:A, 7ley:B, 7ley:C, 7lez:A, 7lez:B, 7lez:C, 7lez:M, 7lez:N, 7lez:J, 7lf1:A, 7lf1:B, 7lf1:C, 7lf1:J, 7lf1:M, 7lf1:N, 7lf2:A, 7lf2:B, 7lf2:C, 7lf2:J, 7lf2:Q, 7lf2:R, 3lp4:A, 3lp4:B, 3lp7:A, 3lp7:B, 3mfv:A, 3mfv:B, 3mfw:A, 3mfw:B, 3mjl:A, 3mjl:B, 2pha:A, 2pha:B, 2pho:A, 2pho:B, 2pll:A, 2pll:B, 6q92:A, 6q92:B, 6q9p:A, 6q9p:B, 6qaf:A, 6qaf:B, 3sjt:A, 3sjt:B, 3skk:A, 3skk:B, 3th7:A, 3th7:B, 3the:A, 3the:B, 3thh:A, 3thh:B, 3thj:A, 3thj:B, 6v7c:A, 6v7c:B, 6v7c:C, 6v7c:D, 6v7c:E, 6v7c:F, 6v7d:A, 6v7d:B, 6v7d:C, 6v7d:D, 6v7d:E, 6v7d:F, 6v7e:A, 6v7e:B, 6v7e:C, 6v7e:D, 6v7e:E, 6v7e:F, 6v7f:A, 6v7f:B, 6v7f:C, 6v7f:D, 6v7f:E, 6v7f:F, 1wva:A, 1wva:B, 1wvb:A, 1wvb:B, 2zav:A, 2zav:B
21 6ss2:AAA 320 329 0.2203 0.2375 0.2310 3.02e-07 4hze:A, 4hze:B, 4hze:C, 4i06:A, 4i06:B, 4i06:C, 4ie2:A, 4ie2:B, 4ie2:C, 4ie3:A, 4ie3:B, 4ie3:C, 4ixu:A, 4ixu:B, 4ixu:C, 4ixv:A, 4ixv:B, 4ixv:C, 1pq3:A, 1pq3:B, 1pq3:C, 1pq3:D, 1pq3:E, 1pq3:F, 6q37:A, 6q37:B, 6q37:C, 6q39:A, 6q39:B, 6q39:C, 6ss4:AAA, 6ss6:AAA, 6ss6:BBB, 6ss6:CCC
22 6nbk:A 289 256 0.1884 0.2249 0.2539 3.47e-07 6nbk:B, 6nbk:C, 6nbk:D, 6nbk:E, 6nbk:F
23 6vsu:E 318 244 0.1681 0.1824 0.2377 2.85e-06 6vsu:A, 6vsu:B, 6vsu:C, 6vsu:D, 6vsu:F, 6vsu:G, 6vsu:I, 6vsu:H, 6vsu:J, 6vsu:K, 6vsu:L, 6vsu:M, 6vsu:N, 6vsu:O, 6vsu:P, 6vsu:Q, 6vsu:R, 6vsu:S, 6vsu:T, 6vsu:U, 6vsu:V, 6vsu:W, 6vsu:X
24 5hj9:A 311 215 0.1420 0.1576 0.2279 0.009 5hja:A, 4ity:A, 4iu0:A, 4iu1:A, 4iu4:A, 4iu5:A
25 2ioy:A 274 85 0.0667 0.0839 0.2706 0.56 2ioy:B
26 8k1l:A 979 45 0.0580 0.0204 0.4444 0.68
27 7x20:A 986 79 0.0725 0.0254 0.3165 1.4 8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A
28 7cim:A 524 99 0.0725 0.0477 0.2525 1.7 7cig:A, 7cig:B, 7cii:A, 7cii:B, 7cij:A, 7cij:B, 7cim:B
29 4rhm:A 308 168 0.1130 0.1266 0.2321 1.7 4rhl:A, 4rhl:B, 4rhm:B, 4rhm:C
30 8t41:A 859 35 0.0319 0.0128 0.3143 2.0
31 8d2z:A 306 59 0.0522 0.0588 0.3051 3.3 8d2z:B
32 3u0o:B 335 82 0.0696 0.0716 0.2927 4.0 3u0o:A
33 3mmr:A 308 57 0.0493 0.0552 0.2982 4.1 3sl0:A, 3sl1:A
34 1nvt:A 287 40 0.0435 0.0523 0.3750 4.3 1nvt:B
35 3b8e:A 998 82 0.0725 0.0251 0.3049 4.9 3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
36 6wcd:A 314 60 0.0522 0.0573 0.3000 5.5
37 1lws:A 427 57 0.0377 0.0304 0.2281 5.6 1ef0:A, 1um2:A, 1um2:B
38 1lwt:A 448 55 0.0464 0.0357 0.2909 6.6
39 1ef0:B 394 38 0.0319 0.0279 0.2895 8.4
40 5z5d:A 504 141 0.0928 0.0635 0.2270 8.9 5z5f:A, 5z5h:A, 5z5i:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218