Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KTYQCQYCELRSADSSNLKTHIKTKHSKEK

The query sequence (length=30) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1klr:A 30 30 0.9667 0.9667 0.9667 2.01e-15 1kls:A, 1xrz:A, 5znf:A, 7znf:A
2 2dmd:A 96 30 0.4333 0.1354 0.4333 0.050
3 2dmd:A 96 24 0.2667 0.0833 0.3333 3.0
4 2elq:A 36 30 0.4333 0.3611 0.4333 0.069 2rv2:A
5 4is1:D 54 26 0.3000 0.1667 0.3462 0.11 4f2j:C, 4is1:C, 3uk3:C, 3uk3:D
6 6ml4:A 143 30 0.5000 0.1049 0.5000 0.13 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
7 6ml4:A 143 27 0.3667 0.0769 0.4074 5.3 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
8 2lvr:A 30 30 0.3667 0.3667 0.3667 0.23
9 6b0o:A 119 30 0.4333 0.1092 0.4333 0.26 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
10 2ct1:A 77 28 0.3667 0.1429 0.3929 0.26
11 2ct1:A 77 25 0.2667 0.1039 0.3200 4.1
12 1x5w:A 70 27 0.3000 0.1286 0.3333 0.30
13 1llm:C 87 30 0.4333 0.1494 0.4333 0.33 1llm:D
14 2rsj:A 92 30 0.4333 0.1413 0.4333 0.40 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
15 2rsj:A 92 28 0.3333 0.1087 0.3571 2.5 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
16 1p47:A 87 30 0.4333 0.1494 0.4333 0.43 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
17 8e3e:F 121 30 0.4000 0.0992 0.4000 0.43 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
18 2rsi:A 92 30 0.4333 0.1413 0.4333 0.50 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
19 2rsi:A 92 28 0.3333 0.1087 0.3571 3.5 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
20 2rsi:A 92 26 0.2667 0.0870 0.3077 5.4 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
21 2lce:A 64 30 0.4333 0.2031 0.4333 0.51
22 7w1m:H 322 30 0.4333 0.0404 0.4333 0.51 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
23 7w1m:H 322 28 0.3667 0.0342 0.3929 0.61 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
24 7w1m:H 322 30 0.3667 0.0342 0.3667 2.4 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
25 7w1m:H 322 30 0.3667 0.0342 0.3667 3.4 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
26 7w1m:H 322 25 0.2667 0.0248 0.3200 7.7 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
27 2ghf:A 102 25 0.2333 0.0686 0.2800 0.52
28 3w5k:B 110 22 0.3000 0.0818 0.4091 0.63
29 7ysf:A 113 26 0.3667 0.0973 0.4231 0.70
30 1bbo:A 57 22 0.3333 0.1754 0.4545 0.73 3znf:A, 4znf:A
31 1bbo:A 57 30 0.4000 0.2105 0.4000 0.90 3znf:A, 4znf:A
32 2rsh:A 37 28 0.3333 0.2703 0.3571 0.96 2ruv:A
33 1f2i:G 66 24 0.3333 0.1515 0.4167 0.99 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
34 8fld:NP 108 28 0.3667 0.1019 0.3929 1.1 8fl2:NP, 8fl3:NP, 8fl4:NP, 8fl6:NP, 8fl7:NP, 8fl9:NP, 8fla:NP, 8flb:NP, 8flc:NP, 8fle:NP, 8flf:NP, 8idt:9, 8idy:9, 8ie3:9, 8ine:9, 8inf:9, 8ink:9, 8ipd:9, 8ipx:9, 8ipy:9, 8ir3:9, 6lss:9, 6lu8:9, 1zr9:A
35 2eps:A 54 30 0.3667 0.2037 0.3667 1.4
36 2ep3:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 1.5
37 7mc3:A 31 26 0.3333 0.3226 0.3846 1.8
38 7mc1:A 31 23 0.3333 0.3226 0.4348 1.8
39 8fjl:D 1138 28 0.2667 0.0070 0.2857 1.8 8fjk:E, 8fjk:G, 8fjk:I, 8fjk:K, 8fjl:E, 8fjl:G, 8fjl:I, 8fjl:K, 6m99:C
40 2m0d:A 30 24 0.3000 0.3000 0.3750 1.9
41 2elu:A 37 25 0.2667 0.2162 0.3200 2.1 2elw:A, 2ruw:A, 2rv4:A
42 8tho:A 100 24 0.3333 0.1000 0.4167 2.5 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
43 2en2:A 42 22 0.2333 0.1667 0.3182 4.0
44 2elo:A 37 24 0.3000 0.2432 0.3750 4.4 2rv0:A
45 1ubd:C 114 26 0.3667 0.0965 0.4231 4.5
46 2kmk:A 82 21 0.3000 0.1098 0.4286 4.6
47 2gli:A 155 29 0.4000 0.0774 0.4138 4.7 7t91:A, 7t91:B
48 1g2d:C 89 30 0.3667 0.1236 0.3667 4.8 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
49 1mey:F 84 30 0.4333 0.1548 0.4333 6.3 1mey:C
50 2lv2:A 85 29 0.3000 0.1059 0.3103 6.7
51 2em6:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 8.4
52 5v3g:D 170 30 0.4333 0.0765 0.4333 8.7 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
53 5v3g:D 170 30 0.4333 0.0765 0.4333 8.7 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218