Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KTYQCQYCEARSADSSNLKTHIKTKHSKEK

The query sequence (length=30) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1klr:A 30 30 0.9667 0.9667 0.9667 5.58e-15 1kls:A, 1xrz:A, 5znf:A, 7znf:A
2 2ct1:A 77 28 0.4000 0.1558 0.4286 0.032
3 2ct1:A 77 25 0.2667 0.1039 0.3200 2.7
4 2dmd:A 96 30 0.4333 0.1354 0.4333 0.081
5 2dmd:A 96 24 0.2667 0.0833 0.3333 4.1
6 7w1m:H 322 28 0.4000 0.0373 0.4286 0.089 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
7 7w1m:H 322 30 0.4333 0.0404 0.4333 0.63 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
8 7w1m:H 322 30 0.3667 0.0342 0.3667 3.1 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
9 7w1m:H 322 30 0.3667 0.0342 0.3667 3.9 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
10 7w1m:H 322 25 0.2667 0.0248 0.3200 5.0 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
11 2lce:A 64 30 0.4667 0.2188 0.4667 0.090
12 2lce:A 64 30 0.4333 0.2031 0.4333 3.2
13 2elq:A 36 30 0.4333 0.3611 0.4333 0.11 2rv2:A
14 4is1:D 54 26 0.3000 0.1667 0.3462 0.15 4f2j:C, 4is1:C, 3uk3:C, 3uk3:D
15 2lvr:A 30 30 0.3667 0.3667 0.3667 0.17
16 1llm:C 87 30 0.4333 0.1494 0.4333 0.18 1llm:D
17 6b0o:A 119 30 0.4333 0.1092 0.4333 0.21 6b0o:D, 6b0p:D, 6b0p:A, 6b0q:D, 6b0q:A, 6b0r:D, 6b0r:A, 6blw:A, 2jp9:A, 2jpa:A, 5kl2:A, 5kl3:A, 5kl4:A, 5kl4:D, 5kl5:A, 5kl6:A, 5kl7:A, 2prt:A, 4r2e:A, 4r2p:A, 4r2q:A, 4r2r:A, 4r2s:A, 6wlh:A
18 8fjl:D 1138 28 0.3000 0.0079 0.3214 0.28 8fjk:E, 8fjk:G, 8fjk:I, 8fjk:K, 8fjl:E, 8fjl:G, 8fjl:I, 8fjl:K, 6m99:C
19 1p47:A 87 30 0.4333 0.1494 0.4333 0.28 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
20 8e3e:F 121 30 0.4000 0.0992 0.4000 0.53 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
21 8e3e:F 121 24 0.3333 0.0826 0.4167 2.4 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
22 3w5k:B 110 22 0.3000 0.0818 0.4091 0.55
23 1f2i:G 66 24 0.3333 0.1515 0.4167 0.55 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
24 2en2:A 42 22 0.2667 0.1905 0.3636 0.58
25 2rsj:A 92 30 0.4333 0.1413 0.4333 0.59 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
26 2rsj:A 92 28 0.3333 0.1087 0.3571 5.6 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
27 6ml4:A 143 30 0.4667 0.0979 0.4667 0.72 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
28 6ml4:A 143 27 0.3667 0.0769 0.4074 3.6 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
29 2rsi:A 92 30 0.4333 0.1413 0.4333 0.73 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
30 2rsi:A 92 26 0.2667 0.0870 0.3077 2.9 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
31 2rsi:A 92 28 0.3333 0.1087 0.3571 8.0 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
32 2eps:A 54 30 0.3667 0.2037 0.3667 0.80
33 1x5w:A 70 27 0.3000 0.1286 0.3333 0.89
34 7mc1:A 31 23 0.3333 0.3226 0.4348 0.89
35 2lv2:A 85 29 0.3333 0.1176 0.3448 0.99
36 2ghf:A 102 25 0.2333 0.0686 0.2800 1.0
37 2ep3:A 46 30 0.4667 0.3043 0.4667 1.0
38 2elu:A 37 25 0.2667 0.2162 0.3200 1.1 2elw:A, 2ruw:A, 2rv4:A
39 7mc3:A 31 26 0.3333 0.3226 0.3846 1.1
40 8fld:NP 108 28 0.3667 0.1019 0.3929 1.3 8fl2:NP, 8fl3:NP, 8fl4:NP, 8fl6:NP, 8fl7:NP, 8fl9:NP, 8fla:NP, 8flb:NP, 8flc:NP, 8fle:NP, 8flf:NP, 8idt:9, 8idy:9, 8ie3:9, 8ine:9, 8inf:9, 8ink:9, 8ipd:9, 8ipx:9, 8ipy:9, 8ir3:9, 6lss:9, 6lu8:9, 1zr9:A
41 2m0d:A 30 24 0.3000 0.3000 0.3750 1.4
42 2ma7:A 73 30 0.4000 0.1644 0.4000 1.7
43 6h0f:C 32 23 0.3000 0.2812 0.3913 1.8 6h0f:F, 6h0f:I, 6h0f:L
44 1bbo:A 57 22 0.3333 0.1754 0.4545 1.9 3znf:A, 4znf:A
45 1bbo:A 57 30 0.4000 0.2105 0.4000 2.3 3znf:A, 4znf:A
46 2elo:A 37 24 0.3000 0.2432 0.3750 2.0 2rv0:A
47 2rsh:A 37 28 0.3333 0.2703 0.3571 2.2 2ruv:A
48 1ubd:C 114 26 0.3667 0.0965 0.4231 2.2
49 2gli:A 155 29 0.4000 0.0774 0.4138 2.5 7t91:A, 7t91:B
50 2kmk:A 82 21 0.3000 0.1098 0.4286 2.5
51 2kmk:A 82 21 0.3333 0.1220 0.4762 6.7
52 1x6f:A 88 21 0.2333 0.0795 0.3333 2.5
53 1g2d:C 89 30 0.3667 0.1236 0.3667 3.2 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
54 8tho:A 100 24 0.3333 0.1000 0.4167 3.3 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
55 7ysf:A 113 26 0.3333 0.0885 0.3846 3.4
56 8dey:C 57 30 0.4000 0.2105 0.4000 4.0 8dey:F
57 5hwa:A 259 19 0.3667 0.0425 0.5789 4.2
58 1mey:F 84 30 0.4333 0.1548 0.4333 4.3 1mey:C
59 2em6:A 46 30 0.4000 0.2609 0.4000 5.2
60 2eos:A 42 23 0.2667 0.1905 0.3478 5.6
61 2drp:D 65 26 0.2667 0.1231 0.3077 6.0 2drp:A
62 5v3g:D 170 30 0.4333 0.0765 0.4333 6.3 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
63 5v3g:D 170 30 0.4333 0.0765 0.4333 6.3 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
64 2elx:A 35 25 0.2667 0.2286 0.3200 8.0 2rv5:A
65 2ct5:A 73 28 0.3333 0.1370 0.3571 9.1
66 1onf:A 439 13 0.2667 0.0182 0.6154 9.2
67 8ibw:C 922 27 0.2667 0.0087 0.2963 9.2 8gh6:A, 8ibx:C, 8iby:C, 8ibz:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218