Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KTVLDANLDPLKGKTIGVIGYGNQGRVQATIMRENGLNVIVGNVKDKYYELAKKEGFEVYEIDEAVRRSDVALLLIPDEV
MKEVYEKKIAPVLQGKKEFVLDFASGYNVAFGLIRPPKSVDTIMVAPRMVGEGIMDLHKQGKGYPVLLGVKQDASGKAWD
YAKAIAKGIGAIPGGIAVISSFEEEALLDLMSEHTWVPILFGAIKACYDIAVKEYGVSPEAALLEFYASGELAEIARLIA
EEGIFNQMVHHSTTSQYGTLTRMFKYYDVVRRIVENEAKYIWDGSFAKEWSLEQQAGYPVFYRLWELATQSEMAKAEKEL
YKLLGRKVKND

The query sequence (length=331) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6jcz:C 331 331 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 6jcw:A, 6jcw:B, 6jcw:C, 6jcw:D, 6jcw:E, 6jcw:F, 6jcw:G, 6jcw:H, 6jcw:I, 6jcw:J, 6jcw:K, 6jcw:L, 6jcz:A, 6jcz:B, 6jcz:D, 6jcz:E, 6jcz:F, 6jcz:G, 6jcz:H, 6jcz:I, 6jcz:J, 6jcz:K, 6jcz:L, 6jd1:A, 6jd1:B, 6jd1:C, 6jd1:D, 6jd1:E, 6jd1:F, 6jd1:G, 6jd1:H, 6jd1:I, 6jd1:J, 6jd1:K, 6jd1:L, 6jd2:A, 6jd2:B, 6jd2:C, 6jd2:D, 6jd2:E, 6jd2:F, 6jd2:G, 6jd2:H, 6jd2:I, 6jd2:J, 6jd2:K, 6jd2:L, 6kou:A, 6kou:B, 6kou:C, 6kou:D, 6kou:E, 6kou:F, 6kou:G, 6kou:H, 6kou:I, 6kou:J, 6kou:K, 6kou:L, 6kpa:A, 6kpa:B, 6kpa:C, 6kpa:D, 6kpa:E, 6kpa:F, 6kpa:G, 6kpa:H, 6kpa:I, 6kpa:J, 6kpa:K, 6kpa:L, 6kph:A, 6kph:B, 6kph:C, 6kph:D, 6kph:E, 6kph:F, 6kph:G, 6kph:H, 6kph:I, 6kph:J, 6kph:K, 6kph:L, 6kpi:A, 6kpi:B, 6kpi:C, 6kpi:D, 6kpi:E, 6kpi:F, 6kpi:G, 6kpi:H, 6kpi:I, 6kpi:J, 6kpi:K, 6kpi:L, 6kpj:A, 6kpj:B, 6kpj:C, 6kpj:D, 6kpj:E, 6kpj:F, 6kpj:G, 6kpj:H, 6kpj:I, 6kpj:J, 6kpj:K, 6kpj:L, 6kq4:A, 6kq4:B, 6kq4:C, 6kq4:D, 6kq4:E, 6kq4:F, 6kq4:G, 6kq4:H, 6kq4:I, 6kq4:J, 6kq4:K, 6kq4:L, 6kqj:A, 6kqj:B, 6kqj:C, 6kqj:D, 6kqj:E, 6kqj:F, 6kqj:G, 6kqj:H, 6kqj:I, 6kqj:J, 6kqj:K, 6kqj:L, 6kqk:A, 6kqk:B, 6kqk:C, 6kqk:D, 6kqk:E, 6kqk:F, 6kqk:G, 6kqk:H, 6kqk:I, 6kqk:J, 6kqk:K, 6kqk:L, 6kqo:A, 6kqo:B, 6kqo:C, 6kqo:D, 6kqo:E, 6kqo:F, 6kqo:G, 6kqo:H, 6kqo:I, 6kqo:J, 6kqo:K, 6kqo:L
2 7q03:A 328 327 0.3625 0.3659 0.3670 2.71e-55 7q07:A
3 8k32:C 333 338 0.3897 0.3874 0.3817 5.24e-54 8k32:A, 8k32:B, 8k32:D
4 8ep7:C 328 331 0.3625 0.3659 0.3625 2.95e-53 8ep7:A, 8ep7:B
5 4tsk:A 333 306 0.3625 0.3604 0.3922 2.40e-50
6 6bul:B 327 327 0.3293 0.3333 0.3333 3.25e-49 6aqj:A, 6aqj:B, 6bul:A, 6c55:A, 6c55:B, 6c5n:A, 6c5n:B, 7ke2:B, 7ke2:A, 7kh7:A, 7kh7:B, 6vo2:A, 6vo2:B, 5w3k:A, 5w3k:B
7 7pci:A 345 230 0.2779 0.2667 0.4000 7.69e-49 7pcc:A, 7pcc:B, 7pce:A, 7pcg:A, 7pcg:B, 7pcl:A, 7pcl:B, 7pcm:A, 7pcm:B, 7pcn:A, 7pcn:B, 7pco:A, 7pco:B, 7pct:A, 7pct:B
8 5e4r:A 466 331 0.3444 0.2446 0.3444 4.47e-46 4xdz:A, 4xdz:B
9 5e4r:A 466 127 0.1178 0.0837 0.3071 2.12e-05 4xdz:A, 4xdz:B
10 4xdy:A 331 333 0.3323 0.3323 0.3303 5.94e-44 4xdy:B
11 6l2i:A 324 326 0.3263 0.3333 0.3313 2.05e-42 6l2i:B, 6l2z:A, 6l2z:B
12 4kqx:B 335 306 0.3172 0.3134 0.3431 4.48e-41 4kqw:A, 4kqw:B, 4kqx:A
13 8upq:B 342 325 0.3051 0.2953 0.3108 8.48e-41 8cy8:A, 8cy8:B, 8cy8:C, 8cy8:D, 8cy8:E, 8cy8:F, 8cy8:G, 8cy8:H, 8cy8:I, 8cy8:J, 8cy8:K, 8cy8:L, 7lat:A, 7rdu:A, 8swm:A, 8sxd:A, 8upn:A, 8upp:B, 8upp:A, 8upp:H, 8upp:K, 8upp:I, 8upp:J, 8upp:D, 8upp:E, 8upp:G, 8upp:F, 8upp:L, 8upp:C, 8upq:A, 8upq:C, 8upq:D, 8upq:F, 8upq:E
14 5yeq:B 329 298 0.3051 0.3070 0.3389 3.54e-39
15 4xiy:A 328 318 0.3202 0.3232 0.3333 4.75e-38 4xiy:B, 4xiy:C, 4xiy:D
16 4ypo:A 325 332 0.3082 0.3138 0.3072 1.92e-32 4ypo:B
17 6jx2:B 327 291 0.2719 0.2752 0.3093 1.87e-29 6jx2:A, 6jx2:C, 6jx2:D
18 7toc:A 359 278 0.2387 0.2201 0.2842 8.73e-16 7toc:B
19 3ulk:A 489 230 0.2145 0.1452 0.3087 3.96e-15 3ulk:B
20 3fr8:B 517 364 0.2749 0.1760 0.2500 1.18e-11 3fr7:A, 3fr7:B, 3fr8:A
21 1qmg:A 514 262 0.2115 0.1362 0.2672 1.49e-09 1qmg:B, 1qmg:C, 1qmg:D, 1yve:I, 1yve:J, 1yve:K, 1yve:L
22 5m5k:C 471 148 0.1178 0.0828 0.2635 0.002 6exi:A, 6exi:B, 6exi:C, 6exi:D, 4lvc:A, 4lvc:B, 4lvc:C, 4lvc:D, 5m5k:A, 5m5k:B, 5m5k:D, 5m65:A, 5m65:B, 5m66:A, 5m66:B, 5m66:C, 5m66:D, 5m67:A, 5m67:B, 5m67:C, 5m67:D
23 6bii:A 332 74 0.0785 0.0783 0.3514 0.004 6bii:B
24 5aov:A 334 82 0.0785 0.0778 0.3171 0.007
25 6gbn:B 435 63 0.0634 0.0483 0.3333 0.015 6gbn:A, 6gbn:C, 6gbn:D
26 2rir:E 298 98 0.0755 0.0839 0.2551 0.025 2rir:A, 2rir:B, 2rir:C, 2rir:D, 2rir:F, 2rir:G, 2rir:H
27 2dld:A 337 68 0.0725 0.0712 0.3529 0.076 2dld:B
28 1j49:A 332 68 0.0695 0.0693 0.3382 0.085 1j49:B
29 3ce6:A 486 63 0.0574 0.0391 0.3016 0.11 3ce6:B, 3ce6:C, 3ce6:D, 3dhy:A, 3dhy:B, 3dhy:C, 3dhy:D, 2ziz:A, 2ziz:B, 2ziz:C, 2ziz:D, 2zj0:A, 2zj0:B, 2zj0:C, 2zj0:D, 2zj1:A, 2zj1:B, 2zj1:C, 2zj1:D
30 1a7a:A 431 61 0.0604 0.0464 0.3279 0.13 1a7a:B, 5axa:A, 5axa:C, 5axb:A, 5axb:C, 5axc:A, 5axc:C, 5axd:A, 5axd:C, 1b3r:A, 1b3r:B, 1b3r:C, 1b3r:D, 8cod:A, 8cod:B, 1d4f:A, 1d4f:B, 1d4f:C, 1d4f:D, 2h5l:A, 2h5l:B, 2h5l:C, 2h5l:D, 2h5l:E, 2h5l:F, 2h5l:G, 2h5l:H, 1k0u:A, 1k0u:B, 1k0u:C, 1k0u:D, 1k0u:E, 1k0u:F, 1k0u:G, 1k0u:H, 1ky4:A, 1ky4:B, 1ky4:C, 1ky4:D, 1ky5:A, 1ky5:B, 1ky5:C, 1ky5:D, 1li4:A, 3nj4:A, 3nj4:B, 3nj4:C, 3nj4:D, 4pfj:A, 4pfj:B, 4pgf:A, 4pgf:B, 5w49:A, 5w49:B, 5w4b:A, 5w4b:B, 5w4b:C, 5w4b:D, 5w4b:E, 5w4b:F, 1xwf:A, 1xwf:B, 1xwf:C, 1xwf:D, 4yvf:A, 4yvf:B
31 7r3a:A 411 61 0.0665 0.0535 0.3607 0.14 7r3a:B, 7r3a:C, 7r3a:D, 7r3a:E, 7r3a:F, 7r3a:G, 7r3a:H
32 3jtm:A 351 68 0.0604 0.0570 0.2941 0.20 3n7u:A, 3n7u:B, 3n7u:C, 3n7u:D, 3n7u:E, 3n7u:F, 3n7u:G, 3n7u:H, 3n7u:I, 3n7u:J, 3n7u:K, 3n7u:L
33 5t9f:B 253 66 0.0453 0.0593 0.2273 0.29 5t95:A, 5t95:B, 5t9e:A, 5t9e:B, 5t9f:A, 5whx:A, 5whx:B
34 6aph:A 432 63 0.0604 0.0463 0.3175 0.30
35 3ond:B 488 61 0.0544 0.0369 0.2951 0.31 3ond:A, 3one:A, 3one:B, 3onf:A, 3onf:B
36 2ekl:A 312 64 0.0634 0.0673 0.3281 0.37
37 6uk3:A 475 61 0.0544 0.0379 0.2951 0.38 6uk3:C, 6uk3:B, 6uk3:D
38 3h9u:C 435 61 0.0574 0.0437 0.3115 0.40 3h9u:A, 3h9u:B, 3h9u:D
39 1v8b:A 476 60 0.0574 0.0399 0.3167 0.48 1v8b:B, 1v8b:C, 1v8b:D
40 3n58:B 461 63 0.0604 0.0434 0.3175 0.52 3n58:A, 3n58:C, 3n58:D
41 3g1u:C 424 56 0.0544 0.0425 0.3214 0.55 3g1u:A, 3g1u:B, 3g1u:D
42 8qno:A 421 61 0.0665 0.0523 0.3607 0.64 8qno:B, 7r37:A, 7r37:B, 7r38:A, 7r38:B
43 7o5l:A 417 61 0.0665 0.0528 0.3607 0.80 7o5l:C, 7o5m:A, 7o5m:C, 7zd7:A, 7zd7:C, 7zd8:A, 7zd8:C, 7zd9:A, 7zd9:C
44 7a3w:B 293 93 0.0604 0.0683 0.2151 1.0 7a3w:A
45 8cfu:A 467 49 0.0574 0.0407 0.3878 1.1 8ajs:AAA, 8ajs:DDD, 8ajs:BBB, 8ajs:CCC, 8ajt:AAA, 8ajt:DDD, 8ajt:BBB, 8ajt:CCC, 8aju:AAA, 8aju:CCC, 8ajv:AAA, 8ajv:DDD, 8ajv:BBB, 8ajv:CCC, 8ajv:FFF, 8ajv:III, 8ajv:GGG, 8ajv:HHH, 8ajw:AAA, 8ajw:DDD, 8ajw:BBB, 8ajw:CCC, 8azf:A, 8azf:C, 8cfb:A, 8cfb:D, 8cfb:B, 8cfb:C, 8cfc:A, 8cfc:D, 8cfc:B, 8cfc:C, 8cfd:A, 8cfd:D, 8cfd:B, 8cfd:C, 8cfe:A, 8cfe:D, 8cfe:B, 8cfe:C, 8cfg:A, 8cfg:D, 8cfg:B, 8cfg:C, 8cfh:A, 8cfh:D, 8cfh:B, 8cfh:C, 8cfi:A, 8cfi:D, 8cfi:B, 8cfi:C, 8cfj:A, 8cfj:D, 8cfj:B, 8cfj:C, 8cfk:A, 8cfk:D, 8cfk:B, 8cfk:C, 8cfl:A, 8cfl:D, 8cfl:B, 8cfl:C, 8cfm:A, 8cfm:D, 8cfm:B, 8cfm:C, 8cfn:A, 8cfn:C, 8cfo:A, 8cfo:D, 8cfo:B, 8cfo:C, 8cfp:A, 8cfp:D, 8cfp:B, 8cfp:C, 8cfq:A, 8cfq:D, 8cfq:B, 8cfq:C, 8cfr:A, 8cfr:D, 8cfr:B, 8cfr:C, 8cfs:A, 8cfs:D, 8cfs:B, 8cfs:C, 8cft:A, 8cft:D, 8cft:B, 8cft:C, 8cfu:D, 8cfu:B, 8cfu:C, 8cfv:A, 8cfv:D, 8cfv:B, 8cfv:C, 8cfw:A, 8cfw:D, 8cfw:B, 8cfw:C, 8cfx:A, 8cfx:D, 8cfx:B, 8cfx:C, 8cfx:G, 8cfx:J, 8cfx:H, 8cfx:I, 8cfy:A, 8cfy:D, 8cfy:B, 8cfy:C, 8cfy:G, 8cfy:J, 8cfy:H, 8cfy:I, 8cfz:A, 8cfz:D, 8cfz:B, 8cfz:C, 8cfz:H, 8cfz:K, 8cfz:I, 8cfz:J, 8cg0:A, 8cg0:D, 8cg0:B, 8cg0:C, 8cg1:A, 8cg1:D, 8cg1:B, 8cg1:C, 8cg1:G, 8cg1:J, 8cg1:H, 8cg1:I, 8cg2:A, 8cg2:C, 6f3m:A, 6f3m:B, 6f3m:C, 6f3m:D, 6f3n:A, 6f3n:B, 6f3n:C, 6f3n:D, 6f3o:A, 6f3o:B, 6f3o:C, 6f3o:D, 6f3p:A, 6f3p:C, 6f3q:A, 6f3q:B, 6f3q:C, 6f3q:D, 7zd0:A, 7zd0:D, 7zd0:B, 7zd0:C, 7zd1:A, 7zd1:D, 7zd1:B, 7zd1:C, 7zd2:A, 7zd2:D, 7zd2:B, 7zd2:C, 7zd3:A, 7zd3:D, 7zd3:B, 7zd3:C, 7zd4:A, 7zd4:D, 7zd4:B, 7zd4:C
46 7cvp:A 254 30 0.0423 0.0551 0.4667 1.7
47 5z21:B 331 64 0.0634 0.0634 0.3281 1.7 5z21:A, 5z21:C, 5z21:D
48 7dkm:A 306 30 0.0423 0.0458 0.4667 1.9 7cvp:B, 6cwa:A, 6cwa:B, 7dkm:B, 7ewh:A, 7ewh:B, 2g76:A, 2g76:B, 5n53:B, 5n53:A, 5n6c:A, 5n6c:B, 5nzo:B, 5nzo:A, 5nzp:B, 5nzp:A, 5nzq:B, 5nzq:A, 5ofm:B, 5ofm:A, 5ofv:B, 5ofv:A, 5ofw:B, 5ofw:A, 6plf:A, 6plf:B, 6plg:A, 6plg:B, 6plg:C, 6plg:D, 6plg:E, 6plg:F, 6plg:G, 6plg:H, 6rih:A, 6rih:B, 6rj2:A, 6rj2:B, 6rj3:A, 6rj3:B, 6rj5:A, 6rj5:B, 6rj6:A, 6rj6:B, 7va1:B, 7va1:A, 7va1:C, 7va1:D
49 5jpi:A 496 69 0.0604 0.0403 0.2899 1.9 5hm8:A, 5hm8:B, 5hm8:C, 5hm8:D, 5hm8:E, 5hm8:F, 5hm8:G, 5hm8:H, 5jpi:B, 5jpi:C, 5jpi:D, 5jxw:A, 5jxw:B, 5jxw:C, 5jxw:D, 5t8k:A, 5t8k:C, 5t8k:B, 5t8k:D, 5tj9:A, 5tj9:B, 5tj9:C, 5tj9:D, 5tls:A, 5tls:B, 5tls:C, 5tls:D, 5utu:A, 5utu:B, 5utu:C, 5utu:D, 5utu:E, 5utu:F, 5utu:G, 5utu:H
50 3gvp:A 433 61 0.0483 0.0370 0.2623 2.2 3gvp:B, 3gvp:C, 3gvp:D, 3mtg:A, 3mtg:B
51 3wyc:A 327 62 0.0544 0.0550 0.2903 2.6 5gz3:A, 5gz3:B, 5gz6:A, 3wyc:B
52 1gpj:A 399 71 0.0755 0.0627 0.3521 2.7
53 6iv6:A 1209 153 0.1148 0.0314 0.2484 3.0
54 3zrq:A 382 71 0.0695 0.0602 0.3239 3.1 3zrp:A, 3zrp:B, 3zrq:B, 3zrr:A, 3zrr:B
55 2p9e:A 406 68 0.0544 0.0443 0.2647 3.3 2p9c:A, 2p9c:B, 2p9e:B, 2p9e:C, 2p9e:D, 2p9g:A, 2p9g:B, 2pa3:A, 1psd:A, 1psd:B, 1sc6:A, 1sc6:B, 1yba:A, 1yba:B, 1yba:C, 1yba:D
56 1dxy:A 330 67 0.0574 0.0576 0.2836 3.6
57 3dc2:A 526 67 0.0604 0.0380 0.2985 3.8 3dc2:B, 3ddn:B
58 1sc6:D 384 68 0.0544 0.0469 0.2647 4.0 1sc6:C
59 1rjw:A 339 47 0.0453 0.0442 0.3191 4.9 3pii:A, 3pii:C, 3pii:B, 3pii:D, 1rjw:B, 1rjw:C, 1rjw:D
60 8ati:A 330 71 0.0574 0.0576 0.2676 5.4 8ati:B, 8ati:C, 8ati:D, 4lcj:A, 4lcj:B, 4lcj:C, 4lcj:D, 4lcj:E, 4lcj:F, 4lcj:G, 4lcj:H, 2ome:A, 2ome:B, 2ome:C, 2ome:D, 2ome:E, 2ome:F, 2ome:G, 2ome:H, 6wkw:D, 6wkw:C, 6wkw:B, 6wkw:A
61 6ha8:V 541 98 0.0755 0.0462 0.2551 6.0
62 2yg3:B 450 38 0.0363 0.0267 0.3158 6.2 2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
63 5bqf:A 317 63 0.0574 0.0599 0.3016 6.2 5tsd:A, 5tsd:B, 4xcv:A
64 8xd5:A 419 52 0.0574 0.0453 0.3654 6.3 8hho:A, 8hiq:A, 8hiz:A, 8hj9:A, 8xco:A, 8xcp:A, 8xcq:A, 8xcr:A, 8xcs:A, 8xct:A, 8xcu:A, 8xcv:A, 8xcw:A, 8xcx:A, 8xcy:A, 8xcz:A, 8xd0:A, 8xd1:A, 8xd2:A, 8xd3:A, 8xd4:A, 8xd6:A, 8znb:A, 8znc:A, 8znd:A, 8zne:A, 8zng:A
65 5dt9:A 379 64 0.0514 0.0449 0.2656 7.9
66 6bza:C 501 146 0.0906 0.0599 0.2055 8.4 6bza:A, 6bza:B, 6bzn:D, 6bzq:A, 6bzq:B, 6bzq:C, 6bzq:D, 6bzt:A, 6bzt:B, 6bzt:C, 6bzt:D, 6bzz:A, 6bzz:B, 6bzz:C, 6bzz:D
67 3oet:H 378 67 0.0514 0.0450 0.2537 8.6 3oet:A, 3oet:B, 3oet:C, 3oet:D, 3oet:E, 3oet:F, 3oet:G

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218