Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KTVFHLGVTEADLNGATLAIIPGDPARVQKIAELMDNPVFLASHREYTVYRAELDGQSVVVCSTGIGGPSTSIAVEELAQ
LGVRTFLRVGTTGAIQPHVNVGDMIVTTGSVRLDGASLHFAPMEFPAVPDFDVATAMKAAAQESGATVHMGVTASSDTFY
PGQERYDTFTGRVVRRFQGSMKEWQDMGVLNFEMESATLLTMCASSGLKAGCVAGVIINRTQKEIPDHATLKETEARSIK
VVVEAARKMLK

The query sequence (length=251) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5efo:B 253 251 1.0000 0.9921 1.0000 0.0 5c80:A, 5c80:B, 5c80:C, 5c80:D, 5c80:E, 5c80:F, 5efo:A, 5efo:C, 5efo:D, 5efo:E, 5efo:F, 5epu:A, 5epu:B, 5epu:C, 5epu:D, 5epu:E, 5epu:F, 4k6o:A, 4k6o:B, 4k6o:C, 4k6o:D, 4k6o:E, 4k6o:F, 5lhv:A, 5lhv:B, 5lhv:C, 5lhv:D, 5lhv:E, 5lhv:F, 5lok:A, 5lok:B, 5lok:C, 5lok:D, 5lok:E, 5lok:F, 5m2t:A, 5m2t:B, 5m2t:C, 5m2t:D, 5m2t:E, 5m2t:F, 5miw:A, 5miw:B, 5miw:C, 5miw:D, 5miw:E, 5miw:F, 4oeh:A, 4oeh:B, 4oeh:E, 4oeh:F, 4ogl:A, 4ogl:B, 4ogl:C, 4ogl:D, 4ogl:E, 4ogl:F, 3pns:B, 3pns:C, 3pns:D, 3pns:E, 3pns:F, 3pns:G, 3pns:H, 3pns:I, 3pns:J, 3pns:K, 3pns:L, 6rca:A, 6rca:B, 6rca:C, 6rca:D, 6rca:E, 6rca:F, 4u2k:B, 4u2k:D, 4u2k:F
2 2hn9:A 253 248 0.7530 0.7470 0.7621 7.03e-147 3c74:A, 3c74:F, 3c74:B, 3c74:C, 3c74:D, 3c74:E, 4e1v:A, 4e1v:E, 4e1v:F, 4e1v:D, 4e1v:C, 4e1v:B, 4e1v:H, 4e1v:G, 3fwp:B, 3fwp:D, 3fwp:C, 3fwp:E, 3fwp:A, 3fwp:F, 2hn9:B, 2hn9:D, 2hn9:F, 2hrd:A, 2hrd:B, 2hrd:C, 2hrd:D, 2hrd:E, 2hrd:F, 2hwu:A, 2hwu:B, 2hwu:C, 2hwu:D, 2hwu:E, 2hwu:F, 3kvv:A, 3kvv:B, 3kvv:C, 3kvv:D, 3kvv:E, 3kvv:F, 2oec:B, 2oec:F, 2pga:B, 2pga:D, 2pga:F, 2rj3:A, 2rj3:D, 2rj3:F, 2rj3:E, 2rj3:B, 1rxc:A, 1rxc:B, 1rxc:C, 1rxc:D, 1rxc:E, 1rxc:F, 1rxc:I, 1rxc:J, 1rxc:K, 1rxc:L, 1rxs:A, 1rxs:a, 1rxs:B, 1rxs:b, 1rxs:C, 1rxs:c, 1rxs:D, 1rxs:d, 1rxs:E, 1rxs:e, 1rxs:F, 1rxs:R, 1rxs:G, 1rxs:P, 1rxs:H, 1rxs:h, 1rxs:I, 1rxs:i, 1rxs:J, 1rxs:j, 1rxs:K, 1rxs:k, 1rxs:L, 1rxs:l, 1rxs:M, 1rxs:m, 1rxs:O, 1rxs:N, 1rxs:Q, 1rxs:o, 1rxu:A, 1rxu:B, 1rxu:C, 1rxu:D, 1rxu:E, 1rxu:F, 1rxu:G, 1rxu:H, 1rxu:I, 1rxu:J, 1rxu:K, 1rxu:L, 1rxu:M, 1rxu:N, 1rxu:O, 1rxu:P, 1rxu:Q, 1rxu:R, 1rxy:A, 1rxy:B, 1sj9:B, 1tgv:A, 1tgv:B, 1tgy:A, 1tgy:B, 1u1c:A, 1u1c:B, 1u1c:C, 1u1c:D, 1u1c:E, 1u1c:F, 1u1d:A, 1u1d:B, 1u1d:C, 1u1d:D, 1u1d:E, 1u1d:F, 1u1e:A, 1u1e:B, 1u1e:C, 1u1e:D, 1u1e:E, 1u1e:F, 1u1f:A, 1u1f:B, 1u1f:C, 1u1f:D, 1u1f:E, 1u1f:F, 1u1g:A, 1u1g:B, 1u1g:C, 1u1g:D, 1u1g:E, 1u1g:F, 1y1q:C, 1y1r:D, 1y1r:B, 1y1s:A, 1y1s:D, 1y1s:F, 1y1s:E, 1y1s:B, 1zl2:B, 1zl2:D, 1zl2:F
3 4r2w:D 251 248 0.7530 0.7530 0.7621 1.69e-143 7q2w:FFF, 4r2w:A, 4r2w:B, 4r2w:C, 4r2w:E, 4r2w:F, 4r2x:C, 4r2x:D, 4r2x:E, 4r2x:F, 4r2x:A, 4r2x:B, 4yjk:D, 4yjk:F, 4yjk:A
4 3qpb:C 254 249 0.4024 0.3976 0.4056 2.08e-54 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
5 4mch:A 243 214 0.2829 0.2922 0.3318 1.27e-36
6 1jdv:C 235 197 0.2510 0.2681 0.3198 1.47e-33 1jds:A, 1jds:B, 1jds:C, 1jds:D, 1jds:E, 1jds:F, 1jdt:A, 1jdt:B, 1jdt:C, 1jdv:A, 1jdv:B, 1jdv:D, 1jdv:E, 1jdv:F, 1jdz:A, 1jdz:B, 1jdz:C, 1je0:A, 1je0:B, 1je0:C, 1je1:A, 1je1:B, 1je1:C, 1je1:D, 1je1:E, 1je1:F, 1jp7:A, 1jp7:B, 1jp7:C, 1jpv:A, 1jpv:B, 1jpv:C
7 1odi:A 234 231 0.3028 0.3248 0.3290 4.35e-30 1odi:B, 1odi:C, 1odi:D, 1odi:E, 1odi:F, 1odj:A, 1odj:B, 1odj:C, 1odj:D, 1odj:E, 1odj:F, 1odl:A, 1odl:F, 1odl:B, 1odl:C, 1odl:D, 1odl:E
8 3enz:C 246 215 0.2629 0.2683 0.3070 6.99e-29 6aqs:A, 2bsx:A, 3enz:A, 3enz:B, 3enz:D, 3enz:E, 3enz:F, 3fow:A, 3fow:B, 1nw4:A, 1nw4:B, 1nw4:C, 1nw4:D, 1nw4:E, 1nw4:F, 3phc:A, 3phc:B, 3phc:C, 3phc:D, 3phc:E, 3phc:F, 1q1g:A, 1q1g:B, 1q1g:C, 1q1g:D, 1q1g:E, 1q1g:F, 1sq6:A, 8w7h:A, 5znc:A, 5zni:A
9 3mb8:A 248 157 0.2351 0.2379 0.3758 1.86e-26 3mb8:B
10 3uaw:A 233 194 0.2590 0.2790 0.3351 2.99e-22 2ac7:A, 2ac7:B, 3uav:A, 3uax:A, 3uay:A, 3uaz:A
11 2isc:D 238 237 0.2749 0.2899 0.2911 1.09e-20 2i4t:A, 2i4t:B, 2i4t:C, 2isc:A, 2isc:B, 2isc:C, 2isc:E, 2isc:F, 1z34:A, 1z35:A, 1z36:A, 1z37:A, 1z38:A, 1z39:A
12 4dae:A 232 209 0.2510 0.2716 0.3014 7.39e-19 4d8v:A, 4d8v:B, 4d9h:A, 4d9h:B, 4da0:A, 4da6:A, 4da7:A, 4da8:A, 4dab:A, 4dan:A, 4dan:B, 4dao:A, 4dao:B, 4dar:A
13 3occ:F 238 215 0.2510 0.2647 0.2930 5.88e-18 1a69:A, 1a69:B, 1a69:C, 5i3c:A, 5i3c:B, 5i3c:C, 5iu6:A, 5iu6:B, 5iu6:C, 1k9s:A, 1k9s:D, 1k9s:B, 1k9s:E, 1k9s:C, 1k9s:F, 3occ:A, 3occ:B, 3occ:C, 3occ:D, 3occ:E, 3ooe:A, 3ooe:B, 3ooe:C, 3ooe:D, 3ooe:E, 3ooe:F, 3opv:A, 3opv:B, 3opv:C, 3opv:D, 3opv:E, 3opv:F, 3opv:G, 3opv:H, 3opv:I, 3opv:J, 3opv:K, 3opv:L, 1oty:A, 1oty:B, 1oty:C, 1ou4:A, 1ou4:B, 1ou4:C, 1oum:A, 1oum:B, 1oum:C, 1ov6:A, 1ov6:B, 1ov6:C, 1ovg:A, 1ovg:B, 1ovg:C, 1pk7:A, 1pk7:B, 1pk7:C, 1pk9:A, 1pk9:B, 1pk9:C, 1pke:A, 1pke:B, 1pke:C, 1pr0:A, 1pr0:B, 1pr0:C, 1pr1:A, 1pr1:B, 1pr1:C, 1pr2:A, 1pr2:B, 1pr2:C, 1pr4:A, 1pr4:B, 1pr4:C, 1pr5:A, 1pr5:B, 1pr5:C, 1pr6:A, 1pr6:B, 1pr6:C, 1pw7:A, 1pw7:B, 1pw7:C, 4ts3:A, 4ts3:D, 4ts3:B, 4ts3:C, 4ts3:E, 4ts3:F, 4ts9:A, 4ts9:C, 4ts9:B, 4tta:A, 4tta:B, 4tta:C, 4tta:F, 4tta:D, 4tta:E, 4tti:A, 4tti:B, 4tti:C, 4tti:F, 4tti:D, 4tti:E, 4ttj:A, 4ttj:D, 4ttj:B, 3ut6:A, 3ut6:B, 3ut6:C, 6xz2:B, 6xz2:C
14 3of3:A 240 210 0.2470 0.2583 0.2952 8.77e-18 3of3:B, 3of3:C, 3of3:D, 3of3:E, 3of3:F, 3of3:G, 3of3:H, 3of3:I, 3of3:J, 3of3:K, 3of3:L, 1vhw:A, 1vhw:D, 1vhw:B, 1vhw:F, 1vhw:C, 1vhw:E
15 6f4w:A 233 240 0.2789 0.3004 0.2917 1.30e-14 6f4w:D, 6f4w:B, 6f4w:E, 6f4w:C, 6f4w:F, 6f4x:A, 6f4x:D, 6f4x:B, 6f4x:E, 6f4x:C, 6f4x:F, 5lu0:A, 5lu0:B, 5lu0:C, 5lu0:E, 5mx4:C, 5mx6:A, 5mx6:B, 5mx6:C, 5mx6:D, 5mx6:F, 5mx8:A, 7ooy:B, 7ooz:B, 7op9:A, 7op9:B, 7op9:C, 7op9:D, 7op9:E, 7op9:F, 7op9:G, 7op9:H, 7op9:I, 7op9:J, 7op9:K, 7op9:L, 7opa:C, 7opa:H
16 3u40:D 241 201 0.2112 0.2199 0.2637 9.10e-14 3u40:A, 3u40:B, 3u40:C, 3u40:E, 3u40:F
17 3eue:A 295 280 0.2789 0.2373 0.2500 2.37e-09 3euf:A, 3euf:B, 3euf:C, 3euf:D, 3nbq:A, 3nbq:B, 3nbq:C, 3nbq:D
18 3ku4:B 293 214 0.2311 0.1980 0.2710 7.11e-09 3ku4:A, 3ku4:C, 3ku4:D, 3kuk:A, 3kuk:B, 3kvr:A, 3kvr:B, 3kvy:A, 3kvy:B
19 6k8p:A 294 269 0.2709 0.2313 0.2528 5.84e-08 6k5h:A, 6k5h:D, 6k5h:B, 6k5h:C, 6k5k:A, 6k5k:C, 6k5k:B, 6k5k:D, 6k8p:B, 6k8p:C, 6k8p:D
20 3p0f:A 293 261 0.2709 0.2321 0.2605 2.06e-07 3p0e:A, 3p0e:B, 3p0e:C, 3p0e:D, 3p0e:E, 3p0e:F, 2xrf:A, 2xrf:B, 2xrf:C
21 4jos:B 230 162 0.1873 0.2043 0.2901 7.94e-07 4jos:A
22 4txl:C 290 196 0.1873 0.1621 0.2398 5.45e-06 4txl:D, 4txl:A, 4txl:B, 4txm:A, 4txm:B, 4txn:A, 4txn:B, 4txn:C, 4txn:D
23 4jwt:A 245 127 0.1474 0.1510 0.2913 8.50e-05
24 3bje:A 327 320 0.2948 0.2263 0.2313 1.31e-04 3bje:B
25 4qez:B 231 128 0.1394 0.1515 0.2734 0.001 4qez:A, 4qez:C
26 4g41:B 236 130 0.1076 0.1144 0.2077 0.001
27 5dk6:A 242 132 0.1355 0.1405 0.2576 0.003
28 4l0m:A 237 179 0.1315 0.1392 0.1844 0.003
29 1zos:A 230 159 0.1474 0.1609 0.2327 0.008 3mms:A, 1zos:B, 1zos:C, 1zos:D, 1zos:E, 1zos:F
30 5ue1:A 233 62 0.0757 0.0815 0.3065 0.016 5ue1:B
31 4yo8:B 242 184 0.1633 0.1694 0.2228 0.081 4bmx:B, 4bmz:A, 4bmz:B, 5ccd:A, 5cce:A, 6dyu:A, 6dyu:B, 6dyv:A, 6dyv:B, 6dyw:A, 6dyw:B, 6dyy:A, 6dyy:B, 6dyy:C, 6dyy:D, 4ffs:A, 5jpc:A, 5k1z:A, 5kb3:A, 3nm5:A, 3nm5:B, 3nm6:B, 4ojt:A, 4oy3:A, 4p54:A, 4wkn:A, 4wko:A, 4wkp:A, 4wkp:B, 4wkp:C, 4wkp:D, 4ynb:A, 4yo8:A
32 4wkb:A 237 62 0.0677 0.0717 0.2742 0.100 3dp9:A, 3dp9:C, 4wkb:B, 4x24:A, 4x24:B
33 8swt:A 278 90 0.0837 0.0755 0.2333 0.21 8swt:B
34 1t8y:F 461 72 0.0677 0.0369 0.2361 0.21 1t8s:A, 1t8s:B, 1t8s:C, 1t8s:D, 1t8s:E, 1t8s:F, 1t8y:C, 1t8y:B, 1t8y:E, 1t8y:A
35 3bl6:A 230 157 0.1474 0.1609 0.2357 0.25
36 6j5t:H 327 51 0.0558 0.0428 0.2745 0.28 6j5t:B, 6j5t:E, 6j5t:K, 6j5t:N, 6j5u:B, 6j5v:B, 6j6i:B
37 8eui:J 169 149 0.1434 0.2130 0.2416 1.3 8eug:J
38 5b7g:A 249 79 0.0797 0.0803 0.2532 1.3 5b7g:B, 5b7n:A, 5b7n:B, 5b7p:A, 5b7p:B
39 4v58:G 2060 52 0.0677 0.0083 0.3269 2.2 4v58:H, 4v58:I, 4v58:J, 4v58:K, 4v58:L, 4v59:G, 4v59:H, 4v59:I, 4v59:J, 4v59:K, 4v59:L
40 6if8:B 228 60 0.0558 0.0614 0.2333 2.5 6if8:A, 6if8:C, 6if8:D, 6k2q:A, 6k2q:B, 6k2q:C, 6k2q:D
41 5ko6:A 285 104 0.1076 0.0947 0.2596 4.0 6awe:A, 6axa:A, 6b2l:A, 6b37:A, 6b3l:A, 6b4q:A, 6b4t:A, 6b56:A, 6b6k:A, 6b71:A, 6b7i:A, 6bb7:A, 6bfv:A, 6bhb:A, 6bi1:A, 6bi9:A, 6bif:A, 6bj6:A, 6bj7:A, 5ko5:A, 5tbs:A, 5tbt:A, 5tbu:A, 5tbv:A
42 8swu:A 269 83 0.0956 0.0892 0.2892 5.8 8swu:B, 8swu:C
43 1a9o:A 289 37 0.0478 0.0415 0.3243 8.5 1a9p:A, 1a9q:A, 1a9r:A, 1a9s:A, 1a9t:A, 2ai1:A, 2ai2:A, 2ai3:A, 1b8n:A, 1b8o:A, 3fuc:A, 3fuc:B, 3fuc:C, 1fxu:A, 1lv8:A, 1lv8:B, 1lv8:C, 1lv8:D, 1lv8:E, 1lv8:F, 1lvu:A, 1lvu:B, 1lvu:C, 1lvu:D, 1lvu:E, 1lvu:F, 2qpl:A, 1v48:A, 1vfn:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218