Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KTTLFCASDAKAYEKEVHNVWATHACVPTDPNPQEMVLANVTENFNMWKNDMVEQMHEDIISLWDESLKPCVKLTGGSAI
TQACPKVSFDPIPLHYCAPAGFAILKCNNKTFNGTGPCRNVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEIIIRSENLTNNA
KTIIVHLNESVNIVCTRPNNIRQAHCNINESKWNNTLQKVGEELAKHFPSKTIKFEPSSGGDLEITTHSFNCRGEFFYCN
TSDLFNGTYRNGTYNHTGRSSNGTITLQCKIKQIINMWQEVGRAIYAPPIEGEITCNSNITGLLLLRDDTETFRPGGGDM
RDNWRSELYKYKVVEI

The query sequence (length=336) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3tgs:A 345 339 1.0000 0.9739 0.9912 0.0 5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
2 4laj:A 343 343 0.7917 0.7755 0.7755 0.0 4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
3 5fa2:A 336 344 0.7679 0.7679 0.7500 0.0
4 5w4l:G 357 344 0.7679 0.7227 0.7500 0.0 6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
5 6opp:A 389 362 0.7827 0.6761 0.7265 0.0 6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
6 4xmp:G 337 342 0.7708 0.7685 0.7573 0.0
7 4r4n:B 342 345 0.7649 0.7515 0.7449 0.0 4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
8 7lu9:e 461 430 0.8244 0.6009 0.6442 0.0 7lu9:f
9 4j6r:G 343 342 0.7768 0.7609 0.7632 0.0
10 6x5b:A 353 343 0.7649 0.7280 0.7493 0.0 6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
11 6meo:G 398 384 0.7708 0.6508 0.6745 0.0 6met:G
12 6cm3:D 372 357 0.7560 0.6828 0.7115 0.0 6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
13 7txd:A 397 376 0.7649 0.6474 0.6835 1.33e-180 7txd:E
14 5te4:G 341 349 0.7440 0.7331 0.7163 2.55e-180
15 6edu:D 401 388 0.7679 0.6434 0.6649 2.16e-177 6edu:E, 6edu:F
16 8czz:A 440 417 0.7708 0.5886 0.6211 2.36e-175 8czz:E, 8czz:I
17 8d53:G 446 419 0.7470 0.5628 0.5990 3.10e-166
18 1gc1:G 297 311 0.6458 0.7306 0.6977 5.43e-153
19 8tgw:A 387 371 0.6577 0.5711 0.5957 5.94e-145
20 8fae:A 468 294 0.5893 0.4231 0.6735 2.91e-133 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
21 8fae:A 468 74 0.2054 0.1474 0.9324 4.52e-42 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
22 6ch9:G 448 288 0.5833 0.4375 0.6806 3.37e-133 6mug:G
23 6ch9:G 448 74 0.2024 0.1518 0.9189 4.64e-42 6mug:G
24 8d0y:G 455 289 0.5833 0.4308 0.6782 1.06e-131 5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
25 8d0y:G 455 75 0.1905 0.1407 0.8533 3.15e-38 5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
26 7n6u:B 595 288 0.5714 0.3227 0.6667 1.23e-131 5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
27 7n6u:B 595 74 0.1964 0.1109 0.8919 2.03e-39 5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
28 7mxd:A 472 291 0.5774 0.4110 0.6667 9.29e-131 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
29 7mxd:A 472 88 0.1964 0.1398 0.7500 9.68e-39 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
30 5fyj:G 479 290 0.5625 0.3946 0.6517 4.52e-127
31 5fyj:G 479 74 0.1994 0.1399 0.9054 3.21e-40
32 6pwu:A 615 289 0.5565 0.3041 0.6471 7.22e-123 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
33 6pwu:A 615 75 0.1875 0.1024 0.8400 2.97e-38 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
34 6tyb:G 345 349 0.3720 0.3623 0.3582 2.62e-61 3fus:A
35 7t4g:A 493 294 0.2798 0.1907 0.3197 2.50e-37 7t4g:C, 7t4g:E
36 7t4g:A 493 87 0.1042 0.0710 0.4023 8.83e-10 7t4g:C, 7t4g:E
37 4z67:A 309 82 0.0655 0.0712 0.2683 0.43 6e13:A, 3jxp:A, 1xto:A, 4z5y:A, 4z5z:A, 4z60:A, 4z6x:A
38 1fay:A 236 31 0.0387 0.0551 0.4194 0.72 1f9k:A, 1f9k:B, 1fay:B, 1fay:C, 1fay:D, 1fay:E, 1fay:F, 1fay:G, 1fay:H
39 3atp:A 151 40 0.0298 0.0662 0.2500 0.98 3atp:B
40 2yy7:A 312 65 0.0417 0.0449 0.2154 3.7 2yy7:B
41 8tgo:D 236 104 0.0774 0.1102 0.2500 4.5 6opa:I, 8tgo:L, 8tgo:b
42 8eti:A 254 62 0.0446 0.0591 0.2419 5.8 8esq:A, 8esr:A, 8etg:A, 8eth:A, 8eup:A, 8euy:A, 8ev3:A
43 2bdz:A 212 88 0.0685 0.1085 0.2614 6.5 2bdz:D, 2bdz:B, 2bdz:C
44 6j6o:A 192 63 0.0476 0.0833 0.2540 9.9 6j6p:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218