BioLiP

>protein
KTMKKIYVTMKTLSPLYTGEVRREDKEAAQKRVNFPVRKTATNKVLIPFKGALRSALEIMLKAKGENVCDTGESRARPCG
RCVTCSLFGSMGRAGRASVDFLISNDTKEQIVRESTHLRIERQTKSASDTFKGEEVIEGATFTATITISNPQEKDLSLIQ
SALKFIEENGIGGWLNKGYGRVSFEVKSEDVATDRFLK

The query sequence (length=198) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8yhd:B	199	198	1.0000	0.9950	1.0000	3.24e-147	8yhd:C, 8yhd:D, 8yhd:E, 8yhd:F, 8yhd:J, 8yhd:O, 8yhe:B, 8yhe:C, 8yhe:D, 8yhe:E, 8yhe:F, 8yhe:J, 8z4j:C, 8z4j:D, 8z4j:E, 8z4j:F, 8z4j:J, 8z4l:B, 8z4l:C, 8z4l:D, 8z4l:E, 8z4l:F, 8z4l:J, 8z99:B, 8z99:C, 8z99:D, 8z99:E, 8z99:F, 8z99:J, 8z99:P, 8z9c:B, 8z9c:C, 8z9c:D, 8z9c:E, 8z9c:F, 8z9c:J, 8z9e:C, 8z9e:D, 8z9e:E, 8z9e:F, 8z9e:J
2	8z9e:B	170	198	0.8535	0.9941	0.8535	7.40e-115	8yhd:A, 8z4j:B, 8z4l:A, 8z99:A, 8z9c:A
3	8yhe:A	115	197	0.5808	1.0000	0.5838	1.38e-61
4	4qts:C	186	157	0.1919	0.2043	0.2420	6.51e-06	4qts:D
5	6ifn:F	220	183	0.2576	0.2318	0.2787	1.19e-04	6ifk:G, 6ifk:F, 6ifk:E, 6ifl:D, 6ifl:E, 6ifl:F, 6ifn:E, 6ifn:G, 6ifr:G, 6ifr:F, 6ifr:E, 6ifu:D, 6ifu:E, 6ifu:F, 6ify:G, 6ify:F, 6ify:E, 6ifz:G, 6ifz:F, 6ifz:E, 6ig0:G, 6ig0:F, 6ig0:E, 6nud:C, 6nud:E, 6nud:N, 6nud:O, 6nud:P, 6nue:C, 6nue:E, 6nue:N, 6nue:O, 6nue:P
6	7zol:B	1702	108	0.1667	0.0194	0.3056	3.08e-04	7zoq:B
7	7zol:B	1702	151	0.2323	0.0270	0.3046	5.44e-04	7zoq:B
8	8bmw:N	251	116	0.1717	0.1355	0.2931	3.40e-04
9	4n0l:A	335	36	0.0808	0.0478	0.4444	0.002	4n0l:B
10	6mur:D	287	227	0.2677	0.1847	0.2335	0.013	6iqw:C, 6iqw:D, 6mur:C, 6mus:C, 6mus:D, 6mus:K, 6mut:C, 6mut:D, 6muu:C, 6muu:D, 6o7e:C, 6o7e:D, 6o7h:C, 6o7h:D, 6o7i:C, 6o7i:D, 6o7i:K
11	8wm4:A	1331	81	0.1111	0.0165	0.2716	0.10
12	7yn9:A	1514	81	0.1111	0.0145	0.2716	0.11
13	8eey:A	1544	81	0.1111	0.0142	0.2716	0.11	7yna:A, 7ynb:A, 7ync:A
14	8wmi:A	1237	81	0.1111	0.0178	0.2716	0.11
15	8wmi:A	1237	63	0.0909	0.0146	0.2857	2.7
16	7ynd:A	1567	81	0.1111	0.0140	0.2716	0.11
17	8wmc:A	1249	81	0.1111	0.0176	0.2716	0.12
18	8eex:A	1284	81	0.1111	0.0171	0.2716	0.12
19	8d1v:A	1229	81	0.1111	0.0179	0.2716	0.13
20	7xss:B	1282	129	0.1616	0.0250	0.2481	0.26	8d9f:B, 8d9h:B, 7x8a:A, 7xso:A, 7xsp:B, 7xt4:B
21	7lt2:A	387	92	0.1162	0.0594	0.2500	0.30
22	7wah:A	1473	80	0.1061	0.0143	0.2625	0.57
23	7y9x:A	1458	80	0.1061	0.0144	0.2625	0.63	8gs2:A
24	7y9y:A	1482	81	0.1111	0.0148	0.2716	0.71	8wml:A
25	8bmw:J	270	116	0.1364	0.1000	0.2328	0.81
26	8gna:A	1188	130	0.1566	0.0261	0.2385	1.2
27	9ash:H	214	69	0.1111	0.1028	0.3188	1.5	9ash:F, 9ash:G, 9ash:I, 9asi:F, 9asi:H, 9asi:G, 9asi:I, 6xn3:F, 6xn3:H, 6xn3:G, 6xn3:I, 6xn4:F, 6xn4:H, 6xn4:G, 6xn5:I, 6xn5:F, 6xn5:H, 6xn5:G, 6xn7:F, 6xn7:H, 6xn7:G, 6xn7:I
28	8x5d:K	235	41	0.0707	0.0596	0.3415	2.0	8wfx:I, 8wfx:J, 8wfx:K, 8wfx:L, 8wfx:G, 8wfx:H, 8x5d:L, 8x5d:J, 8x5d:I, 8x5d:H
29	7v01:H	297	72	0.0960	0.0640	0.2639	3.6	8do6:B, 7uzw:H, 7uzx:H, 7uzy:H, 7uzz:H, 7v00:H, 7v02:H
30	6xn7:B	277	30	0.0606	0.0433	0.4000	4.2	6xn3:B, 6xn4:B
31	9ash:B	297	28	0.0606	0.0404	0.4286	4.7	9asi:B, 6xn5:B
32	3aql:B	388	86	0.1263	0.0644	0.2907	7.3	3aqn:A, 3aqn:B
33	2afb:A	329	63	0.0909	0.0547	0.2857	7.3
34	6rfl:Y	600	54	0.0909	0.0300	0.3333	9.2	7aoh:Y, 8c8h:Y
35	2imd:A	203	44	0.0606	0.0591	0.2727	9.4	2ime:A, 2imf:A

[Back]