BioLiP

>protein
KTMKKIYVTMKTLSPLYTGEVRREDKEAAQKRVNFPVRKTATNKVLIPFKGALRSALEIMLKAKGENVCDTGARPCGRCV
TCSLFGSMGRAGRASVDFLISNDTKEQIVRESTHLRIERQTKSASDTFKGEEVIEGATFTATITISNPQEKDLSLIQSAL
KFIEENGIGGWLNKGYGRVSFEVKSEDVA

The query sequence (length=189) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8yhd:B	199	192	1.0000	0.9497	0.9844	3.57e-138	8yhd:C, 8yhd:D, 8yhd:E, 8yhd:F, 8yhd:J, 8yhd:O, 8yhe:B, 8yhe:C, 8yhe:D, 8yhe:E, 8yhe:F, 8yhe:J, 8z4j:C, 8z4j:D, 8z4j:E, 8z4j:F, 8z4j:J, 8z4l:B, 8z4l:C, 8z4l:D, 8z4l:E, 8z4l:F, 8z4l:J, 8z99:B, 8z99:C, 8z99:D, 8z99:E, 8z99:F, 8z99:J, 8z99:P, 8z9c:B, 8z9c:C, 8z9c:D, 8z9c:E, 8z9c:F, 8z9c:J, 8z9e:C, 8z9e:D, 8z9e:E, 8z9e:F, 8z9e:J
2	8z9e:B	170	192	0.8466	0.9412	0.8333	8.69e-106	8yhd:A, 8z4j:B, 8z4l:A, 8z99:A, 8z9c:A
3	8yhe:A	115	192	0.5661	0.9304	0.5573	3.01e-53
4	4qts:C	186	154	0.2063	0.2097	0.2532	1.90e-06	4qts:D
5	7zol:B	1702	148	0.2434	0.0270	0.3108	4.35e-05	7zoq:B
6	7zol:B	1702	108	0.1746	0.0194	0.3056	1.75e-04	7zoq:B
7	6ifn:F	220	186	0.2804	0.2409	0.2849	1.78e-04	6ifk:G, 6ifk:F, 6ifk:E, 6ifl:D, 6ifl:E, 6ifl:F, 6ifn:E, 6ifn:G, 6ifr:G, 6ifr:F, 6ifr:E, 6ifu:D, 6ifu:E, 6ifu:F, 6ify:G, 6ify:F, 6ify:E, 6ifz:G, 6ifz:F, 6ifz:E, 6ig0:G, 6ig0:F, 6ig0:E, 6nud:C, 6nud:E, 6nud:N, 6nud:O, 6nud:P, 6nue:C, 6nue:E, 6nue:N, 6nue:O, 6nue:P
8	8bmw:N	251	115	0.1799	0.1355	0.2957	3.98e-04
9	4n0l:A	335	36	0.0847	0.0478	0.4444	0.001	4n0l:B
10	6mur:D	287	227	0.2857	0.1882	0.2379	0.014	6iqw:C, 6iqw:D, 6mur:C, 6mus:C, 6mus:D, 6mus:K, 6mut:C, 6mut:D, 6muu:C, 6muu:D, 6o7e:C, 6o7e:D, 6o7h:C, 6o7h:D, 6o7i:C, 6o7i:D, 6o7i:K
11	8wm4:A	1331	78	0.1164	0.0165	0.2821	0.020
12	8wmi:A	1237	78	0.1164	0.0178	0.2821	0.020
13	8wmi:A	1237	63	0.0952	0.0146	0.2857	3.0
14	7yn9:A	1514	78	0.1164	0.0145	0.2821	0.020
15	8eey:A	1544	78	0.1164	0.0142	0.2821	0.020	7yna:A, 7ynb:A, 7ync:A
16	7ynd:A	1567	78	0.1164	0.0140	0.2821	0.021
17	8wmc:A	1249	78	0.1164	0.0176	0.2821	0.022
18	8eex:A	1284	78	0.1164	0.0171	0.2821	0.022
19	8d1v:A	1229	78	0.1164	0.0179	0.2821	0.025
20	7xss:B	1282	129	0.1693	0.0250	0.2481	0.097	8d9f:B, 8d9h:B, 7x8a:A, 7xso:A, 7xsp:B, 7xt4:B
21	7y9x:A	1458	77	0.1111	0.0144	0.2727	0.11	8gs2:A
22	7wah:A	1473	77	0.1111	0.0143	0.2727	0.11
23	8gna:A	1188	130	0.1693	0.0269	0.2462	0.15
24	7y9y:A	1482	78	0.1164	0.0148	0.2821	0.30	8wml:A
25	7y80:A	1218	133	0.1693	0.0263	0.2406	0.30	8gu6:A
26	7y84:A	1242	133	0.1693	0.0258	0.2406	0.31	7x7a:A, 7x7r:A, 7xc7:A, 7y83:A, 7y85:A
27	7y8t:A	1298	136	0.1693	0.0247	0.2353	0.72	8d9g:B, 7xsq:A, 7xsr:B, 7y8y:A
28	9ash:H	214	163	0.2381	0.2103	0.2761	0.73	9ash:F, 9ash:G, 9ash:I, 9asi:F, 9asi:H, 9asi:G, 9asi:I, 6xn3:F, 6xn3:H, 6xn3:G, 6xn3:I, 6xn4:F, 6xn4:H, 6xn4:G, 6xn5:I, 6xn5:F, 6xn5:H, 6xn5:G, 6xn7:F, 6xn7:H, 6xn7:G, 6xn7:I
29	8bmw:J	270	116	0.1429	0.1000	0.2328	0.83
30	8x5d:K	235	41	0.0741	0.0596	0.3415	1.7	8wfx:I, 8wfx:J, 8wfx:K, 8wfx:L, 8wfx:G, 8wfx:H, 8x5d:L, 8x5d:J, 8x5d:I, 8x5d:H
31	7lt2:A	387	77	0.1058	0.0517	0.2597	3.9
32	7v01:H	297	72	0.1005	0.0640	0.2639	3.9	8do6:B, 7uzw:H, 7uzx:H, 7uzy:H, 7uzz:H, 7v00:H, 7v02:H
33	3aql:B	388	86	0.1323	0.0644	0.2907	5.8	3aqn:A, 3aqn:B
34	2afb:A	329	63	0.0952	0.0547	0.2857	6.0
35	6rfl:Y	600	54	0.0952	0.0300	0.3333	7.6	7aoh:Y, 8c8h:Y
36	6xn7:B	277	20	0.0529	0.0361	0.5000	8.7	6xn3:B, 6xn4:B
37	2imd:A	203	44	0.0635	0.0591	0.2727	8.8	2ime:A, 2imf:A
38	9ash:B	297	18	0.0529	0.0337	0.5556	9.1	9asi:B, 6xn5:B

[Back]