Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KTLVYCSEGSPEGFNPQLFTSGTTYDASSVPLYNRLVEFKIGTTEVIPGLAEKWEVSEDGKTYTFHLRKGVKWHDNKEFK
PTRELNADDVVFSFDRQKNAQNPYHKVSGGSYEYFEGMGLPELISEVKKVDDNTVQFVLTRPEAPFLADLAMDFASILSK
EYADAMMKAGTPEKLDLNPIGTGPFQLQQYQKDSRIRYKAFDGYWGTKPQIDTLVFSITPDASVRYAKLQKNECQVMPYP
NPADIARMKQDKSINLMEMPGLNVGYLSYNVQKKPLDDVKVRQALTYAVNKDAIIKAVYQGAGVSAKNLIPPTMWGYNDD
VQDYTYDPEKAKALLKEAGLEKGFSIDLWAMPVQRPYNPNARRMAEMIQADWAKVGVQAKIVTYEWGEYLKRAKDGEHQT
VMMGWTGDNGDPDNFFATLFSCAASEQGSNYSKWCYKPFEDLIQPARATDDHNKRVELYKQAQVVMHDQAPALIIAHSTV
FEPVRKEVKGYVVDPLGKHHFENVSIE

The query sequence (length=507) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1dpp:A 507 507 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 1dpp:C, 1dpp:E, 1dpp:G
2 5f1q:A 513 507 0.8600 0.8499 0.8600 0.0 5f1q:B
3 3m8u:A 508 497 0.5227 0.5217 0.5332 0.0
4 4qfl:A 507 502 0.4241 0.4241 0.4283 4.41e-154 4qfl:B, 4qfn:A, 4qfn:B, 4qfo:A, 4qfo:B, 4qfp:A, 4qfp:B
5 6ofq:A 512 508 0.3905 0.3867 0.3898 4.86e-122 6pu3:A
6 7og0:B 498 507 0.3097 0.3153 0.3097 1.80e-90 7ofw:A, 7ofz:A, 7og0:A
7 8upi:A 510 441 0.3057 0.3039 0.3515 3.65e-59
8 1uqw:A 487 466 0.2643 0.2752 0.2876 2.59e-57 1uqw:B
9 8arn:A 509 474 0.2604 0.2593 0.2785 8.27e-42 8are:A, 8arn:B
10 3e3k:B 500 510 0.2722 0.2760 0.2706 3.67e-41 7a0c:A, 7a0c:B, 4dcx:A, 4dcx:B, 4dcy:A, 4dcy:B, 3dp8:A, 3dp8:B, 3dp8:C, 3e3k:A, 3e3k:C, 4i8c:A, 4i8c:B, 4i8c:C, 4i9d:A, 4i9d:B, 5l8d:A, 5l8d:B, 3mvw:A, 3mvw:B, 3mvx:A, 3mvx:B, 3mvy:A, 3mvy:B, 3mvz:A, 3mvz:B, 3mw0:A, 3mw0:B, 5mwu:A, 5mwu:B, 3mz9:A, 3mz9:B, 3mzb:A, 3mzb:B, 2noo:A, 5on0:A, 5on0:B, 5on1:A, 5on1:B, 5on4:A, 5on4:B, 5on5:A, 5on5:B, 5on8:A, 5on8:B, 5on9:A, 5on9:B, 6r4q:A, 6r4q:B, 8spm:A, 1zlq:A, 1zlq:B
11 6hlx:A 491 463 0.2584 0.2668 0.2829 9.69e-41
12 4oev:A 494 513 0.2604 0.2672 0.2573 2.64e-40 4oeu:A, 4oeu:B, 4oev:B
13 7kz9:A 478 475 0.2623 0.2782 0.2800 1.83e-37 7kz9:B
14 1xoc:A 504 502 0.2604 0.2619 0.2629 3.19e-37
15 4gl8:A 500 436 0.2189 0.2220 0.2546 1.09e-36 4gl8:B
16 6tfx:B 494 475 0.2564 0.2632 0.2737 7.59e-35 6tfq:A, 6tfq:B, 6tfs:A, 6tfs:B, 6tfx:A
17 8ay0:B 496 516 0.2604 0.2661 0.2558 1.58e-32 8ay0:A, 8ay0:C
18 5yh8:A 510 503 0.2702 0.2686 0.2724 2.64e-32 5yhe:A, 5yhe:B, 5yhg:A
19 4oes:A 498 491 0.2446 0.2490 0.2525 6.27e-32
20 5z99:A 485 329 0.1913 0.2000 0.2948 1.24e-28 5yyb:A, 5yyb:B
21 1b05:A 517 489 0.2525 0.2476 0.2618 1.32e-28 1b0h:A, 1b1h:A, 1b2h:A, 1b32:A, 1b3f:A, 1b3g:A, 1b3h:A, 1b3l:A, 1b3l:C, 1b40:A, 1b46:A, 1b4h:A, 1b4z:A, 1b51:A, 1b52:A, 1b58:A, 1b5h:A, 1b5i:A, 1b5j:A, 1b6h:A, 1b7h:A, 1b9j:A, 1jet:A, 1jeu:A, 1jev:A, 1ola:A, 1olc:A, 2olb:A, 1qka:A, 1qkb:A, 2rkm:A
22 3tcf:A 517 488 0.2406 0.2360 0.2500 1.99e-28 3tcf:B, 3tcf:C, 3tcf:D, 3tcf:E, 3tcf:F, 3tcf:G, 3tcf:H, 3tcg:A, 3tcg:B, 3tcg:C, 3tcg:D, 3tcg:E, 3tcg:F, 3tcg:G, 3tcg:H
23 8cko:A 492 453 0.2288 0.2358 0.2561 3.88e-28 8ckd:A, 8cke:A, 6i7w:A, 4ra1:A, 4ze9:A, 4zeb:A, 4zeb:B, 4zec:A, 4zed:A, 4zei:A, 4zek:A
24 2z23:A 517 480 0.2268 0.2224 0.2396 1.07e-26
25 8ch2:A 479 462 0.2308 0.2443 0.2532 4.85e-26 8ch1:A, 8ch3:A, 8chc:A, 8ci6:A, 8cju:A
26 8caw:A 491 457 0.2130 0.2200 0.2363 7.62e-23 8cay:A, 8cb9:A, 8cdo:A
27 3o9p:A 509 466 0.2012 0.2004 0.2189 4.77e-21
28 4pfu:B 542 493 0.2485 0.2325 0.2556 4.75e-20 5hm4:B, 4pfu:A, 4pfw:A, 4pfw:B
29 6dtg:A 522 526 0.2426 0.2356 0.2338 5.30e-20 6dqq:A, 6dqr:A, 6dqt:A, 6dqu:A, 6dtf:A, 6dth:A
30 4pfy:A 539 491 0.2367 0.2226 0.2444 9.30e-20 4pft:A, 4pft:B, 4pfy:B
31 8qlg:A 624 558 0.2623 0.2131 0.2384 1.49e-17 8qlg:B
32 3zs6:A 506 473 0.2189 0.2194 0.2347 5.08e-17
33 4ofj:A 465 350 0.1558 0.1699 0.2257 1.52e-15 3rqt:A, 4xkn:A, 4xkp:A, 4xkq:A, 4xkr:A
34 8a42:A 627 302 0.1598 0.1292 0.2682 4.13e-15 8qm0:A, 8qm0:B, 8qm0:C, 8qm0:D
35 4ofo:A 497 340 0.1637 0.1670 0.2441 2.29e-13 4ofl:A, 4ofl:B, 4ofo:B, 4ofo:C, 4ofo:D
36 7z8e:A 590 464 0.2071 0.1780 0.2263 5.85e-13
37 4gfr:A 529 492 0.2347 0.2250 0.2419 1.48e-12 8i5j:A, 8i5j:B, 8i5k:A, 1zu0:A
38 8qlj:A 621 173 0.1105 0.0902 0.3237 5.24e-12 8qlk:A, 8qlm:A, 8qlm:B, 8qlv:A
39 2d5w:A 602 248 0.1243 0.1047 0.2540 1.97e-11 2d5w:B
40 3ryb:A 563 384 0.1775 0.1599 0.2344 2.63e-11 3drf:A, 3drg:A, 3drh:A, 3dri:A, 3drj:A, 3drk:A, 3rya:A
41 5kzt:B 510 489 0.2091 0.2078 0.2168 8.32e-11 5kzt:A
42 6epz:C 673 146 0.0986 0.0743 0.3425 6.64e-10 6epy:A, 6epy:B, 6epy:C, 6epy:D, 6epz:A, 6epz:D, 6epz:B, 6eq0:A, 6eq0:B, 6eq1:A, 6eq1:B, 6eq8:D, 6eq8:B, 6eq8:C, 6eq8:A
43 7ebi:A 537 524 0.2229 0.2104 0.2156 1.53e-09 7ebm:A, 6lzq:A, 6lzt:A, 6lzu:A, 6lzv:A, 6lzw:A
44 6npo:A 518 472 0.2032 0.1988 0.2182 3.02e-09
45 4faj:A 507 492 0.1953 0.1953 0.2012 7.00e-09
46 2wop:A 554 480 0.2130 0.1949 0.2250 7.38e-09 2wok:A
47 8j5u:A 534 405 0.1696 0.1610 0.2123 1.58e-08 8j5q:A, 8j5s:A
48 3i5o:A 582 499 0.1953 0.1701 0.1984 8.15e-07 3i5o:B, 4jsd:A, 4jso:A, 2o7i:A
49 7veu:A 612 111 0.0750 0.0621 0.3423 1.48e-06 7vev:A, 7vew:A, 7vew:B
50 8wda:A 517 317 0.1400 0.1373 0.2240 7.13e-05 6e3d:A, 6e4d:A, 7jls:A
51 7z6f:E 581 142 0.0533 0.0465 0.1901 0.23 7atr:A, 8fsq:A, 8fsr:A, 8fss:A
52 5yb6:A 556 74 0.0375 0.0342 0.2568 1.1 3we0:A, 3we0:B, 5yb6:C, 5yb6:B, 5yb6:D, 5yb7:A, 5yb7:C, 5yb7:B, 5yb7:D, 5yb8:A, 5yb8:D, 5yb8:B, 5yb8:C
53 5b47:B 275 83 0.0513 0.0945 0.3133 5.7
54 5bwe:A 857 38 0.0316 0.0187 0.4211 6.1 5bwd:A, 5bwe:D
55 8bj3:A 360 222 0.0966 0.1361 0.2207 6.6 8bj3:B
56 3bry:A 389 46 0.0355 0.0463 0.3913 6.8 3bry:B
57 2xcu:A 353 60 0.0375 0.0538 0.3167 7.8 2xcu:B, 2xcu:C, 2xcu:D
58 6fih:A 379 54 0.0375 0.0501 0.3519 8.9
59 8if7:A 342 34 0.0256 0.0380 0.3824 9.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218