Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KTISVIGMPMDLGQARRGVDMGPSAIRYAHLIERLSDMGYTVEDLGDIPINNLNSVLAGNEKLAQKVNKVIEEKKFPLVL
GGDHSIAIGTLAGTAKHYDNLGVIWYDAHGDLNTLETSPSGNIHGMPLAVSLGIGHESLVNLEGYAPKIKPENVVIIGAR
SLDEGERKYIKESGMKVYTMHEIDRLGMTKVIEETLDYLSACDGVHLSLDLDGLDPNDAPGVGTPVVGGISYRESHLAME
MLYDAGIITSAEFVEVNPILDHKNKTGKTAVELVESLLGKKLL

The query sequence (length=283) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6nfp:A 292 292 1.0000 0.9692 0.9692 0.0 6dkt:A, 6dkt:B, 6dkt:C, 6dkt:D, 6dkt:F, 6nfp:B, 6nfp:C, 6nfp:D, 6nfp:E, 6nfp:F
2 6dkt:E 268 283 0.9470 1.0000 0.9470 0.0
3 1cev:A 299 298 0.7279 0.6890 0.6913 1.86e-150 1cev:B, 1cev:C, 1cev:D, 1cev:E, 1cev:F, 2cev:A, 2cev:C, 2cev:B, 2cev:D, 2cev:E, 2cev:F, 3cev:A, 3cev:B, 3cev:C, 3cev:D, 3cev:E, 3cev:F, 4cev:A, 4cev:B, 4cev:C, 4cev:D, 4cev:E, 4cev:F, 5cev:A, 5cev:B, 5cev:C, 5cev:D, 5cev:F, 5cev:E
4 6nbk:A 289 288 0.7314 0.7163 0.7188 2.28e-147 6nbk:B, 6nbk:C, 6nbk:D, 6nbk:E, 6nbk:F
5 2ef5:A 273 285 0.5159 0.5348 0.5123 2.61e-96 2ef5:B, 2ef5:D, 2ef5:E, 2ef5:F, 2ef5:G
6 7k4g:E 319 300 0.4346 0.3856 0.4100 5.20e-70 2aeb:A, 2aeb:B, 8aup:A, 8aup:B, 8aup:C, 8aup:D, 8aup:E, 8aup:F, 3dj8:A, 3dj8:B, 8e5m:A, 8e5m:B, 8e5m:C, 8e5m:D, 8e5m:E, 8e5m:F, 8e5n:A, 8e5n:B, 8e5n:C, 8e5n:D, 8e5n:E, 8e5n:F, 3e6k:A, 3e6k:B, 3e6v:A, 3e6v:B, 3f80:A, 3f80:B, 4fci:A, 4fci:B, 4fck:A, 4fck:B, 3gmz:A, 3gmz:B, 3gn0:A, 3gn0:B, 4gsv:A, 4gsv:B, 4gsz:A, 4gsz:B, 4gwc:A, 4gwc:B, 4gwd:A, 4gwd:B, 4hww:A, 4hww:B, 4hxq:A, 4hxq:B, 4ie1:A, 4ie1:B, 7k4g:A, 7k4g:B, 7k4g:C, 7k4g:D, 7k4g:F, 7k4h:A, 7k4h:B, 7k4h:C, 7k4h:D, 7k4h:E, 7k4h:F, 7k4i:A, 7k4i:B, 7k4i:C, 7k4i:D, 7k4i:E, 7k4i:F, 7k4j:A, 7k4j:B, 7k4j:C, 7k4j:D, 7k4j:E, 7k4j:F, 7k4k:A, 7k4k:B, 7k4k:C, 7k4k:D, 7k4k:E, 7k4k:F, 7klk:A, 7klk:B, 7klk:C, 7klk:D, 7klk:E, 7klk:F, 7kll:A, 7kll:B, 7kll:C, 7kll:D, 7kll:E, 7kll:F, 7klm:A, 7klm:B, 7klm:C, 7klm:D, 7klm:E, 7klm:F, 3kv2:A, 3kv2:B, 7ley:A, 7ley:B, 7ley:C, 7lez:A, 7lez:B, 7lez:C, 7lez:M, 7lez:N, 7lez:J, 7lf1:A, 7lf1:B, 7lf1:C, 7lf1:J, 7lf1:M, 7lf1:N, 7lf2:A, 7lf2:B, 7lf2:C, 7lf2:J, 7lf2:Q, 7lf2:R, 3lp4:A, 3lp4:B, 3lp7:A, 3lp7:B, 3mfv:A, 3mfv:B, 3mfw:A, 3mfw:B, 3mjl:A, 3mjl:B, 2pha:A, 2pha:B, 2pho:A, 2pho:B, 2pll:A, 2pll:B, 6q92:A, 6q92:B, 6q9p:A, 6q9p:B, 6qaf:A, 6qaf:B, 3sjt:A, 3sjt:B, 3skk:A, 3skk:B, 3th7:A, 3th7:B, 3the:A, 3the:B, 3thh:A, 3thh:B, 3thj:A, 3thj:B, 6v7c:A, 6v7c:B, 6v7c:C, 6v7c:D, 6v7c:E, 6v7c:F, 6v7d:A, 6v7d:B, 6v7d:C, 6v7d:D, 6v7d:E, 6v7d:F, 6v7e:A, 6v7e:B, 6v7e:C, 6v7e:D, 6v7e:E, 6v7e:F, 6v7f:A, 6v7f:B, 6v7f:C, 6v7f:D, 6v7f:E, 6v7f:F, 1wva:A, 1wva:B, 1wvb:A, 1wvb:B, 2zav:A, 2zav:B
7 1hqf:A 314 302 0.4417 0.3981 0.4139 1.08e-68 1d3v:A, 1d3v:B, 3e8q:A, 3e8q:B, 3e8q:C, 3e8z:A, 3e8z:B, 3e8z:C, 3e9b:A, 3e9b:B, 3e9b:C, 1hq5:A, 1hq5:B, 1hqf:B, 1hqf:C, 1hqg:A, 1hqg:B, 1hqg:C, 1hqh:A, 1hqh:B, 1hqh:C, 1hqx:A, 1hqx:B, 1hqx:C, 1p8m:A, 1p8m:B, 1p8m:C, 1p8n:A, 1p8n:B, 1p8n:C, 1p8o:A, 1p8o:B, 1p8o:C, 1p8p:A, 1p8p:B, 1p8p:C, 1p8q:A, 1p8q:B, 1p8q:C, 1p8r:A, 1p8r:B, 1p8s:A, 1p8s:B, 1p8s:C, 1r1o:A, 1r1o:B, 1r1o:C, 1rla:A, 1rla:B, 1rla:C, 2rla:A, 2rla:B, 2rla:C, 3rla:A, 3rla:B, 3rla:C, 4rla:A, 4rla:B, 4rla:C, 5rla:A, 5rla:B, 5rla:C, 1t4p:A, 1t4p:B, 1t4p:C, 1t4r:A, 1t4r:B, 1t4r:C, 1t4s:A, 1t4s:B, 1t4s:C, 1t4t:A, 1t4t:B, 1t4t:C, 1t5f:A, 1t5f:B, 1t5f:C, 1t5g:A, 1t5g:B, 1t5g:C, 1ta1:A, 1ta1:B, 1ta1:C, 1tbh:A, 1tbh:B, 1tbh:C, 1tbj:A, 1tbj:B, 1tbj:C, 1tbl:A, 1tbl:B, 1tbl:C, 1zpe:A, 1zpe:B, 1zpe:C, 1zpg:A, 1zpg:B, 1zpg:C
8 6ss2:AAA 320 301 0.4170 0.3688 0.3920 1.42e-68 4hze:A, 4hze:B, 4hze:C, 4i06:A, 4i06:B, 4i06:C, 4ie2:A, 4ie2:B, 4ie2:C, 4ie3:A, 4ie3:B, 4ie3:C, 4ixu:A, 4ixu:B, 4ixu:C, 4ixv:A, 4ixv:B, 4ixv:C, 1pq3:A, 1pq3:B, 1pq3:C, 1pq3:D, 1pq3:E, 1pq3:F, 6q37:A, 6q37:B, 6q37:C, 6q39:A, 6q39:B, 6q39:C, 6ss4:AAA, 6ss6:AAA, 6ss6:BBB, 6ss6:CCC
9 5hj9:A 311 308 0.3498 0.3183 0.3214 6.26e-55 5hja:A, 4ity:A, 4iu0:A, 4iu1:A, 4iu4:A, 4iu5:A
10 3mmr:A 308 305 0.3852 0.3539 0.3574 5.69e-54 3sl0:A, 3sl1:A
11 5zee:B 297 293 0.3604 0.3434 0.3481 3.78e-51 5zee:A, 5zef:A, 5zef:B, 5zeh:A, 5zeh:B
12 4q3v:C 339 304 0.3675 0.3068 0.3421 1.46e-48 4q3p:A, 4q3p:B, 4q3p:C, 4q3p:D, 4q3q:A, 4q3q:B, 4q3q:C, 4q3q:D, 4q3r:A, 4q3r:B, 4q3r:C, 4q3r:D, 4q3s:A, 4q3s:B, 4q3s:C, 4q3s:D, 4q3t:A, 4q3t:B, 4q3t:C, 4q3t:D, 4q3u:A, 4q3u:B, 4q3u:C, 4q3u:D, 4q3v:A, 4q3v:B, 4q3v:D, 4q40:A, 4q40:B, 4q40:C, 4q40:D, 4q41:A, 4q41:B, 4q41:C, 4q41:D, 4q42:A, 4q42:B, 4q42:C, 4q42:D
13 4g3h:C 310 305 0.2933 0.2677 0.2721 3.46e-24 4g3h:A, 4g3h:B, 4g3h:D
14 3nio:A 316 293 0.2933 0.2627 0.2833 2.50e-22 3nio:B, 3nio:C, 3nio:D, 3nio:E, 3nio:F
15 3nip:B 316 287 0.2756 0.2468 0.2718 9.54e-20 3nip:C, 3nip:E, 3nip:D, 3nip:F, 3niq:A, 3niq:B
16 9fek:G 377 295 0.2721 0.2042 0.2610 1.66e-19 9fek:A, 9fek:B, 9fek:C, 9fek:D, 9fek:E, 9fek:F, 9fek:H, 9fek:I, 9fek:J, 9fek:K, 9fek:L
17 3m1r:D 321 293 0.2792 0.2461 0.2696 1.02e-18 3m1r:A, 3m1r:B, 3m1r:C, 3m1r:E, 3m1r:F
18 7esr:A 378 283 0.2473 0.1852 0.2473 3.90e-18
19 6vst:D 320 249 0.2580 0.2281 0.2932 7.32e-17 6vss:A, 6vss:B, 6vss:C, 6vss:D, 6vss:E, 6vss:F, 6vst:A, 6vst:B, 6vst:C, 6vst:E, 6vst:F, 6vst:G, 6vst:H, 6vst:I, 6vst:J, 6vst:K, 6vst:L
20 1gq6:B 301 292 0.3074 0.2890 0.2979 9.19e-17 1gq6:A, 1gq6:C, 1gq7:A, 1gq7:B, 1gq7:C, 1gq7:D, 1gq7:E, 1gq7:F
21 7lba:B 310 277 0.2686 0.2452 0.2744 2.37e-16 7lba:A, 7lba:C, 7lba:D, 7lba:E, 7lba:F, 7lba:G, 7lba:H, 7lba:I, 7lba:J, 7lba:K, 7lba:L, 7lba:M, 7lba:P, 7lba:Q, 7lol:A, 7lox:A, 7lox:B, 7lox:C
22 3lhl:A 276 240 0.2120 0.2174 0.2500 3.13e-16
23 6vsu:E 318 246 0.2509 0.2233 0.2886 9.84e-15 6vsu:A, 6vsu:B, 6vsu:C, 6vsu:D, 6vsu:F, 6vsu:G, 6vsu:I, 6vsu:H, 6vsu:J, 6vsu:K, 6vsu:L, 6vsu:M, 6vsu:N, 6vsu:O, 6vsu:P, 6vsu:Q, 6vsu:R, 6vsu:S, 6vsu:T, 6vsu:U, 6vsu:V, 6vsu:W, 6vsu:X
24 3pzl:B 293 287 0.2756 0.2662 0.2718 1.81e-14 3pzl:A, 3pzl:C
25 4dz4:B 323 282 0.2650 0.2322 0.2660 5.47e-14 4dz4:A, 4dz4:C, 4dz4:D, 4dz4:E, 4dz4:F
26 9iq9:B 275 137 0.1378 0.1418 0.2847 2.40e-13 7euk:A, 7euk:B, 7eul:A, 7eun:A, 7eun:B, 7euq:A, 7euq:B, 9iq9:A, 8ius:A, 8ius:B, 8iut:A, 8iut:B, 8iuu:A, 8iuu:B, 8iuv:A, 8iuv:B, 8iuw:A, 8iuw:B, 6lug:A, 6lug:B, 6luh:A, 6luh:B
27 1wog:A 303 290 0.2580 0.2409 0.2517 4.87e-13 1wog:B, 1wog:C, 1wog:D, 1wog:E, 1wog:F, 1woi:A, 1woi:B, 1woi:C, 1woi:D, 1woi:E, 1woi:F
28 4myn:A 298 292 0.2438 0.2315 0.2363 5.32e-12 4mxr:A, 4mxr:B, 4myf:A, 4myk:A
29 4rhm:A 308 210 0.2049 0.1883 0.2762 1.03e-08 4rhl:A, 4rhl:B, 4rhm:B, 4rhm:C
30 8ryi:E 361 308 0.2544 0.1994 0.2338 1.59e-08 8ryi:B, 8snf:D, 8snf:F, 8snk:I, 8snk:A, 8sp2:G, 8sp2:H, 8sp2:I, 8sp2:J, 8x3g:A, 8x3g:B
31 6ksy:B 289 146 0.1307 0.1280 0.2534 6.54e-06 6ksy:A, 6ksy:C, 6ksy:D
32 1vdc:A 322 60 0.0495 0.0435 0.2333 1.5
33 6a7s:B 138 32 0.0495 0.1014 0.4375 2.4 6a7t:B, 6m5m:B
34 1cdg:A 686 31 0.0495 0.0204 0.4516 2.6 1cgv:A, 1cgw:A, 1cgx:A, 1cgy:A, 1cxe:A, 1cxf:A, 1cxh:A, 1cxi:A, 1cxk:A, 1cxl:A, 2cxg:A, 1d3c:A, 2dij:A, 1dtu:A, 1eo5:A, 1eo7:A, 1kck:A, 1kcl:A, 1ot1:A, 1ot2:A, 1pez:A, 1pj9:A, 1tcm:A, 1tcm:B
35 2x0f:B 382 65 0.0707 0.0524 0.3077 3.3 2x0e:A, 2x0e:B, 2x0f:A
36 3ovg:A 351 55 0.0671 0.0541 0.3455 3.4 3ovg:B, 3ovg:C, 3ovg:D, 3ovg:E, 3ovg:F
37 6gbn:B 435 195 0.1590 0.1034 0.2308 3.6 6gbn:A, 6gbn:C, 6gbn:D
38 5m0i:C 240 48 0.0495 0.0583 0.2917 3.7 5m0i:D, 5m0i:B, 5m0i:A, 5m0j:D, 5m0j:C, 5m0j:B, 5m0j:A, 4wnl:D, 4wnl:C, 4wnl:B, 4wnl:A
39 4d0t:A 496 95 0.0919 0.0524 0.2737 5.4 5ajn:A, 5ajo:A, 5ajp:A, 4d0t:C, 4d0t:F, 4d0t:B, 4d0t:D, 4d0t:E, 4d0z:B, 4d0z:E, 4d0z:A, 4d0z:C, 4d0z:D, 4d0z:F, 4d11:D, 4d11:E, 4d11:B, 4d11:A, 4d11:F, 6e7i:A, 6egs:A, 6egs:B, 2ffu:A, 2ffv:A, 2ffv:B, 5fv9:A, 5fv9:B, 5fv9:C, 5fv9:D, 5fv9:E, 5fv9:F, 5ndf:A, 5ndf:B, 5ndf:C, 5ndf:D, 5ndf:E, 5ndf:F, 6nqt:A, 6nqt:B, 6nqt:C, 6nqt:D, 6nqt:E, 6nqt:F
40 7w2i:A 183 35 0.0459 0.0710 0.3714 5.7 7w2i:B, 7w2i:C, 7w2i:D
41 8fia:A 1772 31 0.0495 0.0079 0.4516 7.4
42 4d11:C 436 57 0.0671 0.0436 0.3333 7.5
43 5dxo:A 272 55 0.0601 0.0625 0.3091 9.7 5dxn:A, 5dxo:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218