Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KTGGTQTDLFTCGKCKKKNCTYTQVQTRSADEPMTTFVVCNECGNRWKFC

The query sequence (length=50) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5iy6:U 170 50 1.0000 0.2941 1.0000 5.41e-33 5iy7:U, 5iy8:U, 5iya:U, 5iyb:U, 5iyc:U, 6o9l:U, 1tfi:A
2 5fmf:2 174 43 0.6200 0.1782 0.7209 1.02e-17 3po3:S, 1y1v:S
3 5xon:U 155 43 0.5400 0.1742 0.6279 7.78e-14
4 7d59:I 108 40 0.4200 0.1944 0.5250 1.01e-08 7a6h:I, 7ae1:I, 7ae3:I, 7aea:I, 7dn3:I, 7du2:I, 7fji:I, 7fjj:I, 8ity:I, 8iue:I, 8iuh:I
5 5fj9:I 92 34 0.3800 0.2065 0.5588 4.55e-08 5fja:I
6 7z0h:I 110 34 0.3800 0.1727 0.5588 6.07e-08 8bws:I, 6cnb:I, 6cnc:I, 6cnd:I, 6cnf:I, 6eu0:I, 6eu1:I, 6eu2:I, 6eu3:I, 6f40:I, 6f41:I, 6f42:I, 5fj8:I, 6tut:I, 7z1l:I, 7z1m:I, 7z1o:I, 7z2z:I, 7z30:I, 7z31:I
7 1qyp:A 57 39 0.3200 0.2807 0.4103 1.83e-06
8 6hlq:I 111 37 0.2800 0.1261 0.3784 0.002 5g5l:I, 6hls:I
9 4c2m:I 124 37 0.2800 0.1129 0.3784 0.002 4c2m:X, 4c3h:I, 4c3i:I, 4c3j:I, 6h67:I, 6h68:I, 6hko:I, 6hlr:I, 5lmx:I, 5m3f:I, 5m3m:I, 5m5x:I, 5n61:I, 5oa1:I, 6rqt:I, 6ruo:I, 6rwe:I, 6tps:I, 5w5y:I, 5w64:I, 5w65:I, 5w66:I, 4ym7:AI, 4ym7:BI, 4ym7:CI, 4ym7:DI, 4ym7:EI, 4ym7:FI
10 5iy6:I 125 44 0.2800 0.1120 0.3182 0.018 8a3y:I, 8a40:I, 7b0y:I, 8b3d:I, 8b3f:I, 7b7u:I, 8bvw:I, 8byq:I, 8bz1:I, 6drd:I, 7edx:w, 7eg7:w, 7eg8:w, 7eg9:w, 7ega:w, 7egb:w, 7egc:w, 7ena:PI, 7enc:PI, 6exv:I, 7f4g:I, 5flm:I, 6gmh:I, 6gml:I, 8gxq:PI, 8gxs:PI, 5iy7:I, 5iy8:I, 5iy9:I, 5iya:I, 5iyb:I, 5iyc:I, 5iyd:I, 7lbm:I, 7nvr:I, 7nvs:I, 7nvt:I, 7nvu:I, 7nvy:I, 7nvz:I, 7nw0:I, 8oeu:I, 8oev:I, 8oew:I, 8of0:I, 5oik:I, 7okx:I, 7oky:I, 7ol0:I, 7oo3:I, 7oob:I, 7oop:I, 7opc:I, 7opd:I, 7ozn:I, 7ozn:U, 7ozo:I, 7ozo:U, 7ozp:I, 7ozp:U, 8p4a:I, 8p4b:I, 8p4e:I, 8p4f:I, 7pks:I, 8rbx:I, 8s51:I, 8s52:I, 8s54:I, 8s55:I, 8s5n:I, 6ted:I, 8uha:I, 8uhd:I, 8uhg:I, 8ui0:I, 8uis:I, 7unc:I, 7und:I, 8w8e:I, 8w8f:I, 8wak:w, 8wal:w, 8wan:w, 8wao:w, 8wap:w, 8waq:w, 8war:w, 8was:w, 8wat:w, 8wau:w, 8wav:w, 8waw:w, 8wax:w, 8way:w, 8waz:w, 8wb0:w, 6xre:I, 7ycx:7, 7zwd:I, 7zx7:I, 7zx8:I
11 5x4z:I 113 37 0.2600 0.1150 0.3514 0.020 6a5l:I, 6a5o:I, 6a5p:I, 6a5r:I, 6a5t:I, 6a5u:I, 8h0v:I, 8h0w:I, 8he5:I, 6inq:I, 6ir9:I, 6j4w:I, 6j4x:I, 6j4y:I, 6j4z:I, 6j50:I, 6j51:I, 8jh2:I, 8jh3:I, 8jh4:I, 7wbv:I, 7wbw:I, 7wbx:I, 5x4z:U, 5x50:I, 5x51:I, 5x51:U, 7xn7:I, 5xog:I, 5xon:I, 7xse:I, 7xsx:I, 7xsz:I, 7xt7:I, 7xtd:I, 7xti:I, 8yfq:I, 8yfr:I
12 7eu0:I 113 45 0.3200 0.1416 0.3556 0.020 7eu1:I, 8xmb:I, 8xmc:I, 8xmd:I, 8xme:I
13 8hil:I 99 45 0.3200 0.1616 0.3556 0.054 8him:I, 8hyj:I
14 7oba:I 105 32 0.2600 0.1238 0.4062 0.12 7ob9:I, 7obb:I
15 3h0g:I 111 33 0.2200 0.0991 0.3333 0.13 3h0g:U
16 5oc7:D 112 48 0.3000 0.1339 0.3125 0.22
17 1i3q:I 122 34 0.2400 0.0984 0.3529 0.24 4a3b:I, 4a3c:I, 4a3d:I, 4a3e:I, 4a3f:I, 4a3g:I, 4a3i:I, 4a3j:I, 4a3k:I, 4a3l:I, 4a3m:I, 4a93:I, 2b8k:I, 4bbr:I, 4bbs:I, 6blo:I, 6blp:I, 6bm2:I, 6bm4:I, 6bqf:I, 4bxx:I, 4bxz:I, 4by1:I, 4by7:I, 5c3e:I, 5c4a:I, 5c4j:I, 5c4x:I, 8cen:I, 8ceo:I, 3cqz:I, 2e2h:I, 2e2i:I, 2e2j:I, 3fki:I, 5fmf:I, 5fyw:I, 5fz5:I, 3gtg:I, 3gtj:I, 3gtk:I, 3gtl:I, 3gtm:I, 3gto:I, 3gtp:I, 3gtq:I, 6gyk:I, 6gyl:I, 6gym:I, 3h3v:J, 3hou:I, 3hou:U, 3hov:I, 3how:I, 3hox:I, 3hoy:I, 3hoz:I, 3i4m:I, 3i4n:I, 1i50:I, 1i6h:I, 6i84:I, 5ip7:I, 5ip9:I, 3j0k:I, 2ja5:I, 2ja6:I, 2ja7:I, 2ja7:U, 2ja8:I, 8jch:I, 3k1f:I, 8k5p:I, 3k7a:I, 1k83:I, 7ked:I, 7kee:I, 7kef:I, 3m3y:I, 3m4o:I, 7mei:i, 7mei:I, 7mk9:I, 7mka:i, 7ml0:I, 7ml1:I, 7ml2:I, 7ml4:I, 1nik:I, 7nkx:I, 7nky:I, 2nvq:I, 2nvt:I, 2nvx:I, 2nvy:I, 2nvz:I, 7o4i:I, 7o4j:I, 6o6c:G, 7o72:I, 7o73:I, 7o75:I, 5oqj:I, 5oqm:I, 5ot2:I, 3po2:I, 3po3:I, 1r5u:I, 1r9s:I, 1r9t:I, 2r92:I, 7rim:I, 7rip:I, 7riq:I, 7riw:I, 7rix:I, 7riy:I, 3rzd:I, 3rzo:I, 3s14:I, 3s15:I, 3s16:I, 3s17:I, 3s1m:I, 3s1n:I, 3s1q:I, 3s1r:I, 3s2d:I, 3s2h:I, 1sfo:I, 5sva:I, 8tug:I, 8tvp:I, 8tvq:I, 8tvs:I, 8tvv:I, 8tvw:I, 8tvx:I, 8tvy:I, 1twa:I, 1twc:I, 1twf:I, 1twg:I, 1twh:I, 5u5q:I, 8u9r:I, 8u9x:I, 8ukq:I, 8ukr:I, 8uks:I, 8ukt:I, 8uku:I, 6upx:I, 6upy:I, 6upz:I, 6uq0:I, 6uq1:I, 6uq2:I, 6uq3:I, 4v1m:I, 4v1n:I, 4v1o:I, 2vum:I, 5vvr:I, 5vvs:I, 5w4u:I, 5w51:I, 1wcm:I, 4x67:I, 4x6a:I, 1y1v:I, 1y1w:I, 4y52:I, 1y77:I, 4y7n:I, 2yu9:I, 7zs9:I, 7zsa:I, 7zsb:I
18 7qug:A 397 30 0.2000 0.0252 0.3333 5.1
19 8dgf:A 1541 41 0.2200 0.0071 0.2683 8.4 8dgf:B, 8dgf:C, 8dgf:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218