BioLiP

>protein
KTAHSQGIEGKAMSEEWARYYPRQFDSWKKTKESDNITDMLKEKPALVVAWAGYPFSKDYNAPRGHYYALQDNINTLRTG
APVDGKTGPLPSACWTCKSPDVPRIIEQDGELEYFTGKWAKYGDEIVNTIGCYNCHDDKSAELKSKVPYLDRGLSAAGFK
TFAESTHQEKRSLVCAQCHVEFYFKKTEWKDDKGVDKTAMVVTLPWSKGISTEQMEAYYDEINFADWTHGISKTPMLKAQ
HPDWELYKTGIHGQKGVSCADCHMPYTQEGAVKYSDHKVGNPLDNMDKSCMNCHRESEQKLKDIVKQKFERKEFLQDIAF
DNIGKAHLETGKAMELGATDAELKEIRTHIRHAQWRADMAIAGHGSFFHAPEEVLRLLASGNEEAQKARIKLVKVLAKYG
AIDYVAPDFETKEKAQKLAKVDMEAFIAEKLKFKQTLEQEWKKQAIAKGRLNPESLKGVDEKSSYYDKTKK

The query sequence (length=471) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3bnf:A	471	471	0.9979	0.9979	0.9979	0.0	3bng:A, 3bnh:A, 3bnj:A, 2e80:A, 2e81:A, 1fs7:A, 1fs8:A, 1fs9:A
2	1qdb:A	473	461	0.7452	0.7421	0.7614	0.0	1qdb:B, 1qdb:C
3	6p73:A	439	427	0.4628	0.4966	0.5105	3.65e-156	6p73:B, 3ubr:A, 3ubr:B
4	1gu6:A	441	454	0.4522	0.4830	0.4692	7.88e-145	1gu6:G, 1gu6:C, 1gu6:E, 3l1t:A, 3l1t:B, 3l1t:C, 3l1t:D, 2rdz:A, 2rdz:B, 2rdz:C, 2rdz:D, 2rf7:A, 2rf7:B, 2rf7:C, 2rf7:D, 3tor:A, 3tor:D, 3tor:B, 3tor:C, 4wjy:A, 4wjy:B
5	1oah:B	482	437	0.3015	0.2946	0.3249	2.95e-57	1oah:A
6	2j7a:B	498	442	0.3036	0.2871	0.3235	4.62e-56	2j7a:A, 2j7a:D, 2j7a:E, 2j7a:G, 2j7a:H, 2j7a:J, 2j7a:K, 2j7a:M, 2j7a:N, 2j7a:P, 2j7a:Q, 2vr0:A, 2vr0:B, 2vr0:D, 2vr0:E
7	8bcx:D	444	418	0.2781	0.2950	0.3134	4.66e-49	8bcx:A, 8bcx:B, 8bcx:C
8	6v0a:B	444	457	0.2887	0.3063	0.2976	4.86e-47	6v0a:A, 6v0a:C, 6v0a:D, 6v0a:E, 6v0a:F
9	8rv0:Y	495	407	0.2272	0.2162	0.2629	1.89e-23	8rvm:YYY, 8rxu:AAA, 8rxu:MMM, 8rxu:YYY
10	3sxq:A	519	342	0.1720	0.1561	0.2368	3.82e-18	3sxq:B, 3ttb:A, 3ttb:B
11	3f29:B	520	346	0.1720	0.1558	0.2341	8.81e-16	3d1i:A, 3d1i:B, 3f29:A, 3fo3:A, 3fo3:B, 3gm6:A, 3gm6:B, 4l38:A, 4l38:B, 4l3x:A, 4l3x:B, 4l3y:A, 4l3y:B, 4l3z:A, 4l3z:B, 3lg1:A, 3lg1:B, 3lgq:A, 3lgq:B, 3mmo:A, 3mmo:B, 2ot4:A, 2ot4:B, 3owm:A, 3owm:B, 4q0t:A, 4q0t:B, 4q17:A, 4q17:B, 4q1o:A, 4q1o:B, 4q4u:A, 4q4u:B, 4q5b:A, 4q5b:B, 4q5c:A, 4q5c:B, 3rkh:A, 3rkh:B, 3s7w:A, 3s7w:B, 3sce:A, 3sce:B, 3uu9:A, 3uu9:B, 2zo5:A, 2zo5:B
12	5chc:A	895	82	0.0425	0.0223	0.2439	0.027	5ch7:A, 5ch7:C, 5ch7:E, 5chc:C, 5chc:E, 5e7o:A, 5e7o:C, 5e7o:E, 5e7o:G, 5e7o:I, 5e7o:K, 4ydd:A, 4ydd:C, 4ydd:E
13	2ozy:A	142	65	0.0382	0.1268	0.2769	0.26	2p0b:A
14	2ozy:A	142	114	0.0616	0.2042	0.2544	4.0	2p0b:A
15	6i5b:A	484	55	0.0446	0.0434	0.3818	0.54	6i5b:B
16	8k9e:A	218	66	0.0361	0.0780	0.2576	0.62	8k9f:A, 8x2j:A
17	6f0k:A	207	67	0.0425	0.0966	0.2985	1.9
18	6v59:A	419	56	0.0340	0.0382	0.2857	1.9	6nx0:A, 6v59:B
19	6lod:A	218	61	0.0382	0.0826	0.2951	2.1	6loe:A
20	4rap:E	390	78	0.0488	0.0590	0.2949	4.8	4rap:A, 4rap:D, 4rap:G, 4rap:K, 4rb4:K, 4rb4:L, 4rb4:C, 4rb4:D, 4rb4:E, 4rb4:H, 4rb4:B, 4rb4:F, 4rb4:G, 4rb4:I, 4rb4:J, 4rb4:A
21	1l3i:A	186	35	0.0276	0.0699	0.3714	5.5	1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
22	1tv2:A	457	52	0.0382	0.0394	0.3462	6.8	1tv3:A, 1tv4:A
23	8d2k:A	1105	38	0.0276	0.0118	0.3421	7.7	8d2l:A, 8d2n:A, 8d2p:A
24	8d2q:A	906	33	0.0276	0.0143	0.3939	8.2
25	6wbr:A	942	34	0.0276	0.0138	0.3824	8.6	6wc0:A
26	8d2o:A	749	33	0.0276	0.0174	0.3939	8.7
27	6ojt:B	481	58	0.0446	0.0437	0.3621	10.0	6ojr:A, 6ojt:A, 6ojw:B, 6ojw:A

[Back]