Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KSFVITDPRLPDNPIIFASDRFLELTEYTREEVLGNNCRFLQGRGTDRKAVQLIRDAVKEQRDVTVQVLNYTKGGRAFWN
LFHLQVMRDENGDVQYFIGVQQEM

The query sequence (length=104) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1g28:A 104 104 1.0000 1.0000 1.0000 8.67e-75 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
2 7qf2:AAA 117 101 0.7115 0.6325 0.7327 2.53e-53 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
3 4hhd:A 152 101 0.7019 0.4803 0.7228 1.12e-52 4hhd:B
4 2wkp:A 320 101 0.7308 0.2375 0.7525 1.26e-52 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
5 5hzh:A 320 101 0.7212 0.2344 0.7426 3.83e-51
6 7tbq:A 375 101 0.7212 0.2000 0.7426 5.77e-51 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
7 4eeu:A 109 101 0.6827 0.6514 0.7030 1.97e-50 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
8 5hzi:A 476 101 0.7212 0.1576 0.7426 1.91e-49 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
9 7tcd:A 436 101 0.7115 0.1697 0.7327 7.81e-49 4wf0:A, 4wf0:B
10 6t74:B 141 101 0.5000 0.3688 0.5149 1.88e-34 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
11 6i21:A 135 101 0.5000 0.3852 0.5149 1.71e-33 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
12 3ue6:E 138 104 0.4904 0.3696 0.4904 2.20e-33 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
13 8qi8:A 110 103 0.4808 0.4545 0.4854 2.68e-33 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
14 6ph4:B 460 101 0.4423 0.1000 0.4554 1.90e-30 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
15 2z6c:A 121 104 0.4423 0.3802 0.4423 7.08e-30 2z6c:B
16 2z6d:A 118 104 0.4231 0.3729 0.4231 1.24e-28 2z6d:B
17 6gb3:A 120 103 0.4615 0.4000 0.4660 4.31e-28 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
18 2mwg:A 261 101 0.4615 0.1839 0.4752 6.57e-28 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
19 4gcz:B 378 101 0.4615 0.1270 0.4752 6.88e-27 4gcz:A
20 8j68:A 129 103 0.4423 0.3566 0.4466 5.25e-25 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
21 8a5r:AAA 206 103 0.4135 0.2087 0.4175 2.82e-24 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
22 8pm1:A 109 104 0.4135 0.3945 0.4135 2.85e-23 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
23 6hmj:A 359 103 0.3846 0.1114 0.3883 5.45e-21 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
24 8c05:A 305 102 0.3654 0.1246 0.3725 1.66e-20
25 3hjk:A 150 113 0.3846 0.2667 0.3540 4.77e-20 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
26 4r3a:A 318 103 0.3558 0.1164 0.3592 8.58e-20 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
27 4wuj:C 145 110 0.3846 0.2759 0.3636 1.75e-19 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
28 7oo9:A 106 104 0.4135 0.4057 0.4135 1.59e-18 7oo9:B
29 4r3a:B 278 103 0.3462 0.1295 0.3495 5.64e-17
30 7a6p:A 149 102 0.2981 0.2081 0.3039 5.33e-16 7a6p:B
31 7r5n:B 151 102 0.3269 0.2252 0.3333 6.75e-16 7r5n:A
32 5svu:B 135 109 0.3750 0.2889 0.3578 8.50e-16 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
33 7wa4:B 107 101 0.3654 0.3551 0.3762 1.31e-15
34 4hj6:B 178 103 0.3558 0.2079 0.3592 2.01e-15 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
35 7yx0:A 166 102 0.3269 0.2048 0.3333 6.21e-15 7yx0:C
36 8a6x:B 368 102 0.2981 0.0842 0.3039 8.35e-15 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
37 7r56:A 137 102 0.3365 0.2555 0.3431 9.70e-15 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
38 7yid:A 660 99 0.2500 0.0394 0.2626 1.20e-09 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
39 2gj3:A 119 89 0.2019 0.1765 0.2360 0.001 2gj3:B
40 4zgn:A 279 38 0.1346 0.0502 0.3684 0.073 4zgp:A
41 5ud6:C 299 50 0.1442 0.0502 0.3000 0.084 5ud6:A, 5ud6:B, 5ud6:D
42 3ewk:A 227 90 0.1635 0.0749 0.1889 0.12
43 3j9w:AE 165 46 0.1923 0.1212 0.4348 0.34 8buu:e, 8cdu:G, 8cdv:G, 8cec:G, 8ced:G, 8cee:G, 6ha1:e, 6ha8:e, 6htq:e, 5njt:E, 7o5b:E, 8qcq:e, 7qgu:j, 7qh4:i, 8qpp:E, 7qv1:e, 7qv2:e, 7qv3:e, 8r55:E
44 6pl0:B 608 84 0.1635 0.0280 0.2024 0.37 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
45 7nhn:f 161 46 0.1827 0.1180 0.4130 0.69 8uu4:e, 8uu5:e, 8uu6:e, 8uu7:e, 8uu8:e, 8uu9:e
46 2z06:A 252 69 0.1923 0.0794 0.2899 0.93 2z06:B, 2z06:C, 2z06:D
47 2ra4:B 65 36 0.1154 0.1846 0.3333 4.9
48 8fru:Q 179 35 0.1154 0.0670 0.3429 5.1 8br8:LR, 8brm:LR, 8bsi:LR, 8bsj:LR, 8btd:LR, 8btr:LR, 7pwg:Q, 7pwo:Q2
49 2bb6:A 414 28 0.1154 0.0290 0.4286 6.1 2bb6:B, 2bb6:C, 2bb6:D, 2bbc:A, 2v3n:A, 2v3p:A
50 1s66:L 119 91 0.2404 0.2101 0.2747 6.8 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
51 2c5r:F 63 29 0.0962 0.1587 0.3448 7.7
52 1w2b:R 84 30 0.1346 0.1667 0.4667 9.0 3cc2:S, 3cc4:S, 3cc7:S, 3cce:S, 3ccj:S, 3ccl:S, 3ccm:S, 3ccq:S, 3ccr:S, 3ccs:S, 3ccu:S, 3ccv:S, 3cd6:S, 3cma:S, 3cme:S, 3cpw:R, 3cxc:R, 3g4s:S, 3g6e:S, 3g71:S, 3i55:S, 3i56:S, 1jj2:R, 1k73:T, 1k8a:T, 1k9m:T, 1kc8:T, 1kd1:T, 1kqs:R, 1m1k:T, 1m90:T, 1n8r:T, 1nji:T, 2otj:S, 2otl:S, 3ow2:R, 1q7y:T, 1q81:T, 1q82:T, 1q86:T, 2qa4:S, 2qex:S, 1qvf:R, 1qvg:R, 1s72:S, 4v4p:AT, 4v4r:BX, 4v4s:BX, 4v4t:BX, 4v9f:S, 1vq4:S, 1vq5:S, 1vq6:S, 1vq7:S, 1vq8:S, 1vq9:S, 1vqk:S, 1vql:S, 1vqm:S, 1vqn:S, 1vqo:S, 1vqp:S, 1yhq:S, 1yi2:S, 1yij:S, 1yit:S, 1yj9:S, 1yjn:S, 1yjw:S
53 1iqp:A 326 31 0.1154 0.0368 0.3871 9.5 1iqp:B, 1iqp:C, 1iqp:E

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218