Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KRPKSNQDWWPSKLNLEILDQNARDVGPVEDDFDYAEEFQKLDLEAVKSDLEELMTSSQDWWPADYGHYGPLFIRMAWHS
AGTYRTADGRGGAAGGRQRFAPINSWPDNANLDKARRLLLPIKQKYGQKISWADLMILAGNVAIESMGFKTFGYAGGRED
AFEEDKAVNWGPEDEFETQERFDEPGEIQEGLGASVMGLIYVNPEGPDGNPDPEASAKNIRQTFDRMAMNDKETAALIAG
GHTFGKVHGADDPEENLGPEPEAAPIEQQGLGWQNKNKGGEMITSGIEGPWTQSPTEWDMGYINNLLDYEWEPEKGPGGA
WQWAPKSEELKNSVPDAHDPDEKQTPMMLTTDIALKRDPDYREVMETFQENPMEFGMNFAKAWYKLTHLDMGPPERFLGP
EVPDEEMIWQDPLPDADYDLIGDEEIAELKEEILDSDLSVSQLVKTAWASASTYRDSDKRGGANGARLRLEPQKNWEVNE
PEQLETVLGTLENIQTEFNDSRSDGTQVSLADLIVLGGNAAVEQAAANAGYDVEIPFEPGRVDAGPEHTDAPSFDALKPK
VDGVRNYIQDDITRPAEEVLVDNADLLNLTASELTALIGGMRSIGANYQDTDLGVFTDEPETLTNDFFVNLLDMGTEWEP
AADSEHRYKGLDRDTGEVKWEATRIDLIFGSNDRLRAISEVYGSADAEKKLVHDFVDTWSKVMKLDRFDLE

The query sequence (length=711) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1itk:B 714 714 0.9986 0.9944 0.9944 0.0 1itk:A, 3uw8:A, 3uw8:B, 3vlh:A, 3vlh:B, 3vli:A, 3vli:B, 3vlj:A, 3vlj:B, 3vlk:A, 3vlk:B, 3vll:A, 3vll:B
2 3vlm:A 663 697 0.9297 0.9970 0.9484 0.0 3vlm:B
3 5kqi:A 714 714 0.6104 0.6078 0.6078 0.0 6b9b:A, 6b9b:B, 6caw:A, 6caw:B, 6cc6:A, 6cc6:B, 6cdq:A, 6cdq:B, 6cek:A, 6cek:B, 6cfq:A, 6cfq:B, 5kq0:A, 5kq0:B, 5kq2:A, 5kq2:B, 5kq3:A, 5kq3:B, 5kq6:A, 5kq6:B, 5kqh:A, 5kqh:B, 5kqi:B, 5kqk:A, 5kqk:B, 5kqn:A, 5kqn:B, 5kqq:A, 5kqq:B, 5ksf:A, 5ksf:B, 5ksg:A, 5ksg:B, 5ksk:A, 5ksk:B, 5ksn:A, 5ksn:B, 5kt8:A, 5kt8:B, 5kt9:A, 5kt9:B, 5l02:A, 5l02:B, 5l05:A, 5l05:B, 6mpy:A, 6mpy:B, 6mq0:A, 6mq0:B, 6mq1:A, 6mq1:B, 5sw4:A, 5sw4:B, 5sw5:A, 5sw5:B, 5sw6:A, 5sw6:B, 5sx0:A, 5sx0:B, 5sx1:A, 5sx1:B, 5sx2:A, 5sx2:B, 5sx3:A, 5sx3:B, 5sx6:A, 5sx6:B, 5sx7:A, 5sx7:B, 5sxq:A, 5sxq:B, 5sxr:A, 5sxr:B, 5sxs:A, 5sxs:B, 5sxt:A, 5sxt:B, 5sxw:A, 5sxw:B, 5sxx:A, 5sxx:B, 5syh:A, 5syh:B, 5syi:A, 5syi:B, 5syj:A, 5syj:B, 5syk:A, 5syk:B, 5syl:A, 5syl:B, 5syu:A, 5syu:B, 5syv:A, 5syv:B, 5syw:A, 5syw:B, 5syx:A, 5syx:B, 5syy:A, 5syy:B, 5txq:A, 5txq:B, 5v4o:A, 5v4o:B, 5v53:A, 5v53:B
4 5whs:A 713 711 0.5724 0.5708 0.5724 0.0 5whq:A, 5whq:B, 5whs:B
5 4c51:A 717 710 0.5696 0.5649 0.5704 0.0 7ag8:A, 7ag8:B, 4c50:A, 4c50:B, 4c51:B, 2cca:A, 2cca:B, 2ccd:A, 2ccd:B, 8czp:A, 8czp:B, 8dwr:A, 8dwr:B, 8dwr:C, 8dwr:D, 1sj2:A, 1sj2:B, 8u3p:A, 8u3p:B, 8u3p:C, 8u3p:D, 6zji:AP1, 6zji:BP1
6 3wnu:A 710 715 0.5471 0.5479 0.5441 0.0 4pae:A, 1ub2:A, 3wxo:A, 3x16:A
7 5jhx:A 735 722 0.5471 0.5293 0.5388 0.0 5cjh:A, 5cjh:B, 5jhx:B, 5jhy:A, 5jhy:B, 5jhz:A, 5jhz:B, 3ut2:A, 3ut2:B
8 7a7a:B 667 704 0.5415 0.5772 0.5469 0.0 7a2i:B, 7a7a:A, 7a7c:B
9 7jz6:B 662 703 0.5232 0.5619 0.5292 0.0 7jz6:A, 7jz6:C, 7jz6:D
10 4ged:A 268 350 0.1449 0.3843 0.2943 6.36e-32 5al9:A, 5ala:A, 5ala:B, 5amm:A, 5amm:B, 3riv:A, 3riv:B, 3riw:A, 3riw:B
11 6h08:B 297 322 0.1224 0.2929 0.2702 5.81e-25 1a2f:A, 1a2g:A, 4a6z:A, 4a71:A, 4a78:A, 4a7m:A, 1aa4:A, 1ac4:A, 1ac8:A, 1aeb:A, 1aed:A, 1aee:A, 1aef:A, 1aeg:A, 1aeh:A, 1aej:A, 1aek:A, 1aem:A, 1aen:A, 1aeo:A, 1aeq:A, 1aes:A, 1aet:A, 1aeu:A, 1aev:A, 2anz:A, 2aqd:A, 2as1:A, 2as2:A, 2as3:A, 2as4:A, 2as6:A, 2b0z:A, 2b10:A, 2b10:C, 2b11:A, 2b11:C, 2b12:A, 2bcn:A, 2bcn:C, 1bej:A, 1bek:A, 1bem:A, 1bep:A, 1beq:A, 1bes:A, 7biu:A, 1bj9:A, 1bva:A, 1cca:A, 1ccb:A, 1ccc:A, 1cce:A, 1ccg:A, 1cci:A, 1ccj:A, 1cck:A, 1ccl:A, 1ccp:A, 2ccp:A, 3ccp:A, 3ccx:A, 4ccp:A, 4ccx:A, 5ccp:A, 6ccp:A, 7ccp:A, 2cep:A, 5cib:A, 5cib:C, 5cic:A, 5cic:C, 5cid:A, 5cid:C, 5cie:A, 5cie:C, 5cif:A, 5cif:C, 5cig:A, 5cig:C, 5cih:A, 5cih:C, 1cmp:A, 1cmq:A, 1cmt:A, 1cmu:A, 1cpd:A, 1cpe:A, 1cpf:A, 1cpg:A, 4cvi:A, 4cvj:A, 1cyf:A, 2cyp:A, 5d6m:A, 1dcc:A, 1dj1:A, 1dj5:A, 1ds4:A, 1dse:A, 1dsg:A, 1dso:A, 1dsp:A, 3e2n:A, 3e2o:A, 1ebe:A, 5ejt:A, 5ejx:A, 2eun:A, 2euo:A, 2eup:A, 2euq:A, 2eur:A, 2eus:A, 2eut:A, 2euu:A, 3exb:A, 2gb8:A, 6h08:A, 6h08:C, 2ia8:A, 2icv:A, 4jb4:A, 4jb4:C, 1jci:A, 1jdr:A, 4jm5:A, 4jm6:A, 4jm8:A, 4jm9:A, 4jma:A, 4jmb:A, 4jms:A, 4jmt:A, 4jmv:A, 4jmw:A, 4jmz:A, 4jn0:A, 4jpl:A, 4jpt:A, 4jpu:A, 4jqj:A, 4jqk:A, 4jqm:A, 4jqn:A, 2jti:A, 1kok:A, 1krj:A, 1kxm:A, 1kxn:A, 3m23:A, 3m25:A, 3m26:A, 3m27:A, 3m28:A, 3m29:A, 3m2a:A, 3m2b:A, 3m2c:A, 3m2d:A, 3m2e:A, 3m2f:A, 3m2g:A, 3m2h:A, 3m2i:A, 1mk8:A, 1mkq:A, 1mkr:A, 1ml2:A, 2n18:A, 4nfg:A, 4nva:A, 4nvb:A, 4nvc:A, 4nvd:A, 4nve:A, 4nvf:A, 4nvg:B, 4nvh:B, 4nvi:B, 4nvj:B, 4nvk:B, 4nvl:A, 4nvm:B, 4nvn:B, 4nvo:B, 4oq7:A, 4p4q:A, 4p4q:C, 6p41:A, 6p41:C, 6p42:A, 6p42:C, 6p43:A, 6p43:C, 2pcb:A, 2pcb:C, 2pcc:A, 2pcc:C, 3r98:A, 3r99:A, 2rbt:X, 2rbu:X, 2rbv:X, 2rbw:X, 2rbx:X, 2rby:X, 2rbz:X, 2rc0:X, 2rc1:X, 2rc2:X, 1ryc:A, 1s6v:A, 1s6v:C, 1s73:A, 1sbm:A, 1sdq:A, 1sog:A, 1stq:A, 5u5u:A, 5u5v:A, 5u5w:A, 5u5x:A, 5u5y:A, 5u5z:A, 5u60:A, 5u61:A, 1u74:A, 1u74:C, 1u75:A, 1u75:C, 5ug2:A, 2v23:A, 2v2e:A, 2x07:A, 2x08:A, 2xil:A, 2xj5:A, 2xj8:A, 4xv4:A, 4xv5:A, 4xv6:A, 4xv7:A, 4xv8:A, 4xva:A, 4xva:C, 4xva:E, 4xva:G, 6y1t:A, 6y2y:A, 2y5a:A, 2ycg:A, 1z53:A, 1zby:A, 1zbz:A
12 6h08:B 297 194 0.0774 0.1852 0.2835 2.56e-07 1a2f:A, 1a2g:A, 4a6z:A, 4a71:A, 4a78:A, 4a7m:A, 1aa4:A, 1ac4:A, 1ac8:A, 1aeb:A, 1aed:A, 1aee:A, 1aef:A, 1aeg:A, 1aeh:A, 1aej:A, 1aek:A, 1aem:A, 1aen:A, 1aeo:A, 1aeq:A, 1aes:A, 1aet:A, 1aeu:A, 1aev:A, 2anz:A, 2aqd:A, 2as1:A, 2as2:A, 2as3:A, 2as4:A, 2as6:A, 2b0z:A, 2b10:A, 2b10:C, 2b11:A, 2b11:C, 2b12:A, 2bcn:A, 2bcn:C, 1bej:A, 1bek:A, 1bem:A, 1bep:A, 1beq:A, 1bes:A, 7biu:A, 1bj9:A, 1bva:A, 1cca:A, 1ccb:A, 1ccc:A, 1cce:A, 1ccg:A, 1cci:A, 1ccj:A, 1cck:A, 1ccl:A, 1ccp:A, 2ccp:A, 3ccp:A, 3ccx:A, 4ccp:A, 4ccx:A, 5ccp:A, 6ccp:A, 7ccp:A, 2cep:A, 5cib:A, 5cib:C, 5cic:A, 5cic:C, 5cid:A, 5cid:C, 5cie:A, 5cie:C, 5cif:A, 5cif:C, 5cig:A, 5cig:C, 5cih:A, 5cih:C, 1cmp:A, 1cmq:A, 1cmt:A, 1cmu:A, 1cpd:A, 1cpe:A, 1cpf:A, 1cpg:A, 4cvi:A, 4cvj:A, 1cyf:A, 2cyp:A, 5d6m:A, 1dcc:A, 1dj1:A, 1dj5:A, 1ds4:A, 1dse:A, 1dsg:A, 1dso:A, 1dsp:A, 3e2n:A, 3e2o:A, 1ebe:A, 5ejt:A, 5ejx:A, 2eun:A, 2euo:A, 2eup:A, 2euq:A, 2eur:A, 2eus:A, 2eut:A, 2euu:A, 3exb:A, 2gb8:A, 6h08:A, 6h08:C, 2ia8:A, 2icv:A, 4jb4:A, 4jb4:C, 1jci:A, 1jdr:A, 4jm5:A, 4jm6:A, 4jm8:A, 4jm9:A, 4jma:A, 4jmb:A, 4jms:A, 4jmt:A, 4jmv:A, 4jmw:A, 4jmz:A, 4jn0:A, 4jpl:A, 4jpt:A, 4jpu:A, 4jqj:A, 4jqk:A, 4jqm:A, 4jqn:A, 2jti:A, 1kok:A, 1krj:A, 1kxm:A, 1kxn:A, 3m23:A, 3m25:A, 3m26:A, 3m27:A, 3m28:A, 3m29:A, 3m2a:A, 3m2b:A, 3m2c:A, 3m2d:A, 3m2e:A, 3m2f:A, 3m2g:A, 3m2h:A, 3m2i:A, 1mk8:A, 1mkq:A, 1mkr:A, 1ml2:A, 2n18:A, 4nfg:A, 4nva:A, 4nvb:A, 4nvc:A, 4nvd:A, 4nve:A, 4nvf:A, 4nvg:B, 4nvh:B, 4nvi:B, 4nvj:B, 4nvk:B, 4nvl:A, 4nvm:B, 4nvn:B, 4nvo:B, 4oq7:A, 4p4q:A, 4p4q:C, 6p41:A, 6p41:C, 6p42:A, 6p42:C, 6p43:A, 6p43:C, 2pcb:A, 2pcb:C, 2pcc:A, 2pcc:C, 3r98:A, 3r99:A, 2rbt:X, 2rbu:X, 2rbv:X, 2rbw:X, 2rbx:X, 2rby:X, 2rbz:X, 2rc0:X, 2rc1:X, 2rc2:X, 1ryc:A, 1s6v:A, 1s6v:C, 1s73:A, 1sbm:A, 1sdq:A, 1sog:A, 1stq:A, 5u5u:A, 5u5v:A, 5u5w:A, 5u5x:A, 5u5y:A, 5u5z:A, 5u60:A, 5u61:A, 1u74:A, 1u74:C, 1u75:A, 1u75:C, 5ug2:A, 2v23:A, 2v2e:A, 2x07:A, 2x08:A, 2xil:A, 2xj5:A, 2xj8:A, 4xv4:A, 4xv5:A, 4xv6:A, 4xv7:A, 4xv8:A, 4xva:A, 4xva:C, 4xva:E, 4xva:G, 6y1t:A, 6y2y:A, 2y5a:A, 2ycg:A, 1z53:A, 1zby:A, 1zbz:A
13 7oqr:A 274 348 0.1280 0.3321 0.2615 1.09e-23 7opt:A, 7opt:B, 7oqr:B
14 8djr:A 250 321 0.1167 0.3320 0.2586 1.49e-16 8djs:A, 8djt:A, 8dju:A, 8djw:A, 8djx:A, 8ff6:A, 8ff6:B, 8ff6:C, 8ff6:D, 8ff6:E, 8ff6:F, 8ff7:A, 8ff7:B, 8ff7:C, 8ff7:D, 8ff7:E, 8ff7:F
15 8djr:A 250 211 0.0759 0.2160 0.2559 0.035 8djs:A, 8djt:A, 8dju:A, 8djw:A, 8djx:A, 8ff6:A, 8ff6:B, 8ff6:C, 8ff6:D, 8ff6:E, 8ff6:F, 8ff7:A, 8ff7:B, 8ff7:C, 8ff7:D, 8ff7:E, 8ff7:F
16 2cl4:X 250 320 0.1167 0.3320 0.2594 9.71e-16 1apx:A, 1apx:B, 1apx:C, 1apx:D, 7bi1:A, 2ggn:X, 2ghc:X, 2ghd:X, 2ghe:X, 2ghh:X, 2ghk:X, 5jpr:A, 5jqr:A, 5l86:A, 5l86:B, 1oaf:A, 1oag:A, 7s10:A, 6tae:A, 1v0h:X, 2vcf:X, 2vcn:A, 2vcs:A, 2vnx:X, 2vnz:X, 2vo2:X, 2wd4:A, 2xi6:A, 2xif:A, 2xih:A, 2xj6:A, 6xv4:A, 2y6a:A, 2y6b:A, 3zcg:A, 3zch:A, 3zcy:A
17 2cl4:X 250 223 0.0802 0.2280 0.2556 1.46e-04 1apx:A, 1apx:B, 1apx:C, 1apx:D, 7bi1:A, 2ggn:X, 2ghc:X, 2ghd:X, 2ghe:X, 2ghh:X, 2ghk:X, 5jpr:A, 5jqr:A, 5l86:A, 5l86:B, 1oaf:A, 1oag:A, 7s10:A, 6tae:A, 1v0h:X, 2vcf:X, 2vcn:A, 2vcs:A, 2vnx:X, 2vnz:X, 2vo2:X, 2wd4:A, 2xi6:A, 2xif:A, 2xih:A, 2xj6:A, 6xv4:A, 2y6a:A, 2y6b:A, 3zcg:A, 3zch:A, 3zcy:A
18 1iyn:A 275 364 0.1364 0.3527 0.2665 1.53e-15
19 3rrw:A 255 84 0.0450 0.1255 0.3810 0.001 3rrw:B
20 3rrw:A 255 158 0.0605 0.1686 0.2722 0.009 3rrw:B
21 8qx0:A 335 318 0.0928 0.1970 0.2075 0.038 8qwx:A
22 2a4x:A 131 41 0.0239 0.1298 0.4146 0.096 2a4w:A, 2a4w:B, 1kll:A
23 7dee:A 185 115 0.0408 0.1568 0.2522 0.58
24 7kwd:A 473 189 0.0633 0.0951 0.2381 0.66 7kwd:B
25 5hbr:A 464 91 0.0422 0.0647 0.3297 1.1 5hbr:C, 4xyl:A, 4xyl:C, 4xym:A, 4xym:C, 4xz3:A, 4xz3:C, 4y8v:A, 4y8v:C, 4yak:A, 4yak:C
26 1d3a:A 303 91 0.0366 0.0858 0.2857 1.8 1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
27 5jzx:B 327 38 0.0225 0.0489 0.4211 1.8 5jzx:E
28 5jzx:A 364 38 0.0225 0.0440 0.4211 2.0 5jzx:C, 5jzx:D, 5jzx:F
29 1e6z:B 498 139 0.0464 0.0663 0.2374 2.7 7c34:A, 7c34:B, 7c92:A, 7c92:B, 7cb1:A, 7cb1:B, 1e6r:A, 1e6r:B, 1e6z:A, 1h0g:B, 1h0g:A, 1h0i:A, 1h0i:B, 6jk9:A, 6jk9:B, 6jkf:A, 6jkf:B, 1o6i:A, 1o6i:B, 1ogg:A, 1ogg:B, 1ur8:A, 1ur8:B, 1ur9:A, 1ur9:B, 1w1p:A, 1w1p:B, 1w1t:A, 1w1t:B, 1w1v:A, 1w1v:B, 1w1y:A, 1w1y:B, 3wd1:A, 3wd2:A, 3wd3:A, 3wd4:A, 4z2g:A, 4z2h:A, 4z2i:A, 4z2j:A, 4z2k:A, 4z2l:A
30 7dlh:A 302 56 0.0253 0.0596 0.3214 6.2
31 1bgp:A 309 56 0.0239 0.0550 0.3036 8.8
32 4i2w:A 904 61 0.0253 0.0199 0.2951 10.0 4i2z:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218