Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KQYIISEELISEGKWVKLEKTTYMDPTGKTRTWESVKRTTADGVAVIPVLQRTLHYECIVLVKQFRPPMGGYCIEFPAGL
IDDGETPEAAALRELEEETGYKGDIAECSPAVCMDPGLSNCTIHIVTVTINGDDAENARPKPKPGDGEFVEVISLPKNDL
LQRLDALVAEEHLTVDARVYSYALALKHAN

The query sequence (length=190) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3bm4:A 197 195 1.0000 0.9645 0.9744 1.23e-139 3ac9:A, 3ac9:B, 3aca:A, 3aca:B, 3bm4:B, 2dsc:A, 2dsc:B, 2dsd:A, 2dsd:B, 6gru:A, 6gru:B, 6gru:C, 6gru:D, 3l85:A, 3l85:B, 5nqr:A, 5nqr:B, 5nwh:A, 5nwh:B, 8ptt:A, 8ptt:B, 8ptt:C, 8ptt:D, 5qj4:A, 5qj4:B, 5qj4:C, 5qj4:D, 5qj5:A, 5qj5:B, 5qj5:C, 5qj5:D, 5qj6:A, 5qj6:B, 5qj6:C, 5qj6:D, 5qj7:A, 5qj7:B, 5qj7:C, 5qj7:D, 5qj8:A, 5qj8:B, 5qj8:C, 5qj9:A, 5qj9:B, 5qj9:C, 5qj9:D, 5qja:A, 5qja:B, 5qja:C, 5qja:D, 5qjb:A, 5qjb:B, 5qjb:C, 5qjb:D, 5qjc:A, 5qjc:B, 5qjc:C, 5qjc:D, 5qjd:A, 5qjd:B, 5qjd:C, 5qjd:D, 5qje:A, 5qje:B, 5qje:C, 5qje:D, 5qjf:A, 5qjf:B, 5qjf:C, 5qjf:D, 5qjg:A, 5qjg:B, 5qjg:C, 5qjg:D, 5qjh:A, 5qjh:B, 5qjh:C, 5qji:A, 5qji:B, 5qji:C, 5qji:D, 5qjj:A, 5qjj:B, 5qjj:C, 5qjj:D, 5qjk:A, 5qjk:B, 5qjk:C, 5qjk:D, 5qjl:A, 5qjl:B, 5qjl:C, 5qjl:D, 5qjm:A, 5qjm:B, 5qjm:C, 5qjm:D, 5qjn:A, 5qjn:B, 5qjn:C, 5qjo:A, 5qjo:B, 5qjo:C, 5qjo:D, 5qjp:A, 5qjp:B, 5qjp:C, 5qjp:D, 5qjq:A, 5qjq:B, 5qjq:C, 5qjq:D, 5qjr:A, 5qjr:B, 5qjr:C, 5qjr:D, 5qjs:A, 5qjs:B, 5qjs:C, 5qjs:D, 5qjt:A, 5qjt:B, 5qjt:C, 5qjt:D, 5qju:A, 5qju:B, 5qju:C, 5qju:D, 5qjv:A, 5qjv:B, 5qjv:C, 5qjv:D, 5qjw:A, 5qjw:B, 5qjw:C, 5qjw:D, 5qjx:A, 5qjx:B, 5qjx:C, 5qjx:D, 5qjy:A, 5qjy:B, 5qjy:C, 5qjy:D, 5qjz:A, 5qjz:B, 5qjz:C, 5qjz:D, 5qk0:A, 5qk0:B, 5qk0:C, 5qk0:D, 5qk1:A, 5qk1:B, 5qk1:C, 5qk1:D, 5qk2:A, 5qk2:B, 5qk2:C, 5qk2:D, 5qk3:A, 5qk3:B, 5qk3:C, 5qk3:D, 5qk4:A, 5qk4:B, 5qk4:C, 5qk4:D, 5qk5:A, 5qk5:B, 5qk5:C, 5qk5:D, 5qk6:A, 5qk6:B, 5qk6:C, 5qk6:D, 5qk7:A, 5qk7:B, 5qk7:C, 5qk7:D, 5qk8:A, 5qk8:B, 5qk8:C, 5qk8:D, 5qk9:A, 5qk9:B, 5qk9:C, 5qk9:D, 5qka:A, 5qka:B, 5qka:C, 5qka:D, 5qkb:A, 5qkb:B, 5qkb:C, 5qkb:D, 5qtl:A, 5qtl:B, 5qtl:C, 5qtl:D, 5qtm:A, 5qtm:B, 5qtm:C, 5qtm:D, 5qtn:A, 5qtn:B, 5qtn:C, 5qtn:D, 5qto:A, 5qto:B, 5qto:C, 5qto:D, 5qtp:A, 5qtp:B, 5qtp:C, 5qtp:D, 5qtq:A, 5qtq:B, 5qtq:C, 5qtq:D, 5qtr:A, 5qtr:B, 5qtr:C, 5qtr:D, 5qts:A, 5qts:B, 5qts:C, 5qts:D, 8rdz:A, 8rdz:C, 8rdz:B, 8rdz:D, 8riy:AAA, 8riy:BBB
2 2yvm:A 182 121 0.2316 0.2418 0.3636 4.35e-14 2yvo:A, 2yvp:A
3 1v8m:A 159 106 0.1947 0.2327 0.3491 4.30e-11 1v8l:A, 1v8r:A, 1v8s:A, 1v8t:A, 1v8v:A, 1v8y:A, 3x0k:A, 3x0l:A, 3x0m:A, 3x0n:A, 3x0o:A, 3x0p:A, 3x0q:A, 3x0r:A
4 5c7t:A 182 158 0.2316 0.2418 0.2785 2.45e-10 5c7t:B, 5c8l:A, 5c8l:B
5 1vhz:A 186 145 0.1842 0.1882 0.2414 1.69e-09 1vhz:B
6 1mqw:A 200 126 0.2000 0.1900 0.3016 6.77e-06 1mk1:A, 1mqe:A, 1mr2:A
7 3ffu:A 133 73 0.1526 0.2180 0.3973 7.70e-06 3ef5:A, 3ef5:B, 3ffu:B
8 3o61:D 190 168 0.2421 0.2421 0.2738 1.52e-04 3o61:A, 3o61:B, 3o61:C, 3o69:A, 3o69:B, 3o6z:A, 3o6z:B
9 3hhj:B 131 26 0.0895 0.1298 0.6538 1.62e-04 3hhj:A
10 1ppx:A 129 27 0.0895 0.1318 0.6296 4.50e-04 3a6t:A, 3a6u:A, 3a6v:A, 3a6v:B, 1pun:A, 1puq:A, 1pus:A, 1tum:A, 7ww5:A, 7ww6:A, 7ww7:A, 7ww8:A, 7ww9:A, 7wwa:A, 7x9h:A, 7x9i:A, 7x9j:A, 7x9k:A, 7x9l:A, 7x9n:A, 7x9o:A
11 3i7v:A 134 30 0.0947 0.1343 0.6000 4.63e-04 3i7v:B
12 3r03:A 131 44 0.1263 0.1832 0.5455 7.70e-04
13 7syc:A 122 27 0.0842 0.1311 0.5926 0.002
14 1jkn:A 165 26 0.0842 0.0970 0.6154 0.007
15 4s2v:A 139 32 0.0789 0.1079 0.4688 0.021
16 6vcr:A 161 32 0.0789 0.0932 0.4688 0.033 6d1v:B, 4s2x:A, 4s2y:A, 7sp3:A, 6vck:B, 6vcl:B, 6vcm:B, 6vcn:A, 6vco:A, 6vcp:A, 6vcq:A
17 6o3p:B 320 99 0.1526 0.0906 0.2929 0.035
18 8otv:A 212 169 0.2368 0.2123 0.2663 0.036 8otv:B
19 6scx:A 328 99 0.1526 0.0884 0.2929 0.039 6o3p:A, 6scx:B, 6scx:C
20 1k26:A 150 42 0.1000 0.1267 0.4524 0.059
21 7b66:A 161 113 0.1579 0.1863 0.2655 0.072 7aom:A, 7aom:B, 7aop:A, 7b63:A, 7b63:B, 7b64:A, 7b65:A, 7b65:B, 7b66:B, 7b66:C, 7b66:D, 7b67:A, 7b67:B, 7b7v:A, 7b7v:B, 5bon:A, 5bon:B, 5bon:C, 5bon:D, 5bon:E, 5bon:F, 5bon:G, 5bon:H, 5lpg:A, 5lpg:B, 7nr6:A, 7nr6:B, 7r0d:AAA, 7r0d:BBB, 6t5j:A, 6t5j:B
22 1su2:A 159 26 0.0737 0.0881 0.5385 0.081 1su2:B, 1sz3:A, 1sz3:B
23 5gp0:I 139 43 0.0842 0.1151 0.3721 0.13 6dbz:A, 6dbz:B, 6fl4:A, 6fl4:B, 5gp0:E, 5gp0:F, 5gp0:A, 5wwd:A, 5wwd:B
24 2qkm:B 266 86 0.1474 0.1053 0.3256 0.15 5j3t:B, 5kq4:E, 5kq4:B, 5n2v:B, 5n2v:E, 2qkm:F
25 5gg6:B 295 26 0.0737 0.0475 0.5385 0.25 5gg6:A, 5gg7:A, 5gg7:B, 5gg8:A, 5gg9:A, 5gga:A, 5ggb:A, 5ggc:A, 5ggc:B, 5ggd:A, 5ggd:B, 6m65:A, 6m69:A, 6m6y:A, 6m72:A, 5xd1:A, 5xd2:A, 5xd3:A, 5xd4:A, 5xd5:B, 5xd5:A
26 9b21:A 205 103 0.1421 0.1317 0.2621 0.34 9b20:A, 9b20:B, 9b21:B, 9b22:A, 9b22:B
27 1vc8:A 126 35 0.0789 0.1190 0.4286 0.35 1vc8:B, 1vc9:A, 1vc9:B
28 4zbp:C 262 33 0.0737 0.0534 0.4242 0.38
29 2qjo:B 336 46 0.0895 0.0506 0.3696 0.38 2qjo:A, 2qjo:C
30 4jzt:A 158 26 0.0737 0.0886 0.5385 0.61 4jzu:A, 4jzv:A, 4jzv:B
31 7nnj:B 133 53 0.0842 0.1203 0.3019 1.0
32 6nci:B 197 28 0.0737 0.0711 0.5000 1.1 6nch:B
33 4mpo:B 148 25 0.0737 0.0946 0.5600 1.2 4mpo:A, 4mpo:C, 4mpo:D, 4mpo:E, 4mpo:F, 4mpo:G, 4mpo:H
34 1g9q:A 205 47 0.0895 0.0829 0.3617 1.3 1g9q:B, 1khz:B, 1khz:A
35 7vhc:A 284 70 0.1053 0.0704 0.2857 1.5 8cx8:A, 8cx8:B, 7d6r:A, 2ga4:A, 8gcw:A, 1r4p:A, 8sz2:A, 8sz2:B, 6u3u:A, 7u6v:A, 7vhd:A, 7vhe:A, 7vhf:A, 6x6h:A1
36 5qoh:A 149 53 0.1000 0.1275 0.3585 1.8 5qoi:A, 5qoj:A, 5qok:A, 5qom:A, 5qon:A, 5qoo:A, 5qop:A, 5qoq:A, 5qor:A, 5qos:A, 5qot:A, 5qou:A, 5qov:A, 5qow:A, 5qox:A, 5qoy:A, 5qoz:A, 5qp0:A, 5qp1:A, 5qp2:A, 5qp3:A, 5qp4:A, 5qp5:A, 5qp6:A, 5qp7:A, 5qp8:A, 5qp9:A, 5qpa:A, 5qpb:A
37 6aa3:A 162 69 0.1053 0.1235 0.2899 2.0 8a07:A, 8a07:B, 8a0s:A, 8a0t:A, 8a0t:B, 8a34:A, 8a34:B, 8a3a:A, 6aa4:A, 6aa5:A, 5ans:A, 5ant:A, 5ant:B, 5ant:C, 5anu:A, 5anv:A, 5anw:A, 4c9w:A, 4c9x:A, 6eq2:A, 6eq3:A, 6eq4:A, 6eq5:A, 6eq6:A, 6eq7:A, 6f1x:A, 6f1x:B, 6f20:A, 6f20:B, 6f22:A, 6f22:B, 6f23:A, 6f23:B, 5fsi:A, 5fsk:A, 5fsl:A, 5fsm:A, 5fsn:A, 5fso:A, 5ghi:A, 5ghi:B, 5ghj:A, 5ghj:B, 5ghm:A, 5ghm:B, 5ghn:A, 5ghn:B, 5gho:B, 5ghq:A, 5ghq:B, 6gle:A, 6glg:A, 6glh:A, 6gli:A, 6glj:A, 6gll:A, 6gll:B, 6glm:A, 6gln:A, 6glp:A, 6glp:B, 6glq:A, 6glq:B, 6glr:A, 6glr:B, 6gls:A, 6gls:B, 6glu:A, 6glv:A, 8i18:A, 8i18:B, 8i19:A, 8i19:B, 8i1a:A, 8i1a:B, 8i1d:A, 8i1d:B, 8i1e:A, 8i1e:B, 8i1f:A, 8i1f:B, 8i1g:A, 8i1i:A, 8i1i:B, 8i1j:A, 8i1j:B, 8i8s:A, 8i8s:B, 8i8t:A, 8i8t:B, 6ijy:A, 6ijy:B, 6ili:A, 6ili:B, 6imz:A, 6jvg:A, 6jvg:B, 6jvh:A, 6jvh:B, 6jvi:A, 6jvi:B, 6jvj:A, 6jvj:B, 6jvk:A, 6jvl:A, 6jvm:A, 6jvn:A, 6jvn:B, 6jvo:A, 6jvo:B, 6jvp:A, 6jvp:B, 6jvq:A, 6jvq:B, 6jvr:A, 6jvs:A, 6jvt:A, 6jvt:B, 7n03:A, 4n1t:A, 4n1u:A, 4n1u:B, 7n13:A, 7n13:B, 5ngr:A, 5ngr:B, 5ngs:A, 5ngs:B, 5ngt:A, 5nhy:A, 5nhy:B, 5otm:A, 5otm:B, 6qvo:A, 6qvo:B, 6qvo:C, 6qvo:D, 6us2:A, 6us3:A, 6us4:A, 3whw:A, 3whw:B, 5ws7:A, 5ws7:B, 3zr0:A, 3zr0:B
38 5mzg:A 155 88 0.1263 0.1548 0.2727 2.3 6ehh:A, 6ehh:B, 6ehh:C, 6ehh:D, 5mze:A, 5mze:B, 5mze:C, 5mze:D, 5mzg:B
39 6ieh:B 929 128 0.1895 0.0388 0.2812 2.5 6ieg:B, 7s7b:A, 7s7b:E, 7s7c:A
40 6ypf:A 129 34 0.0737 0.1085 0.4118 2.7
41 2fvv:A 135 62 0.0895 0.1259 0.2742 3.4 8g9c:A, 8g9d:A, 6pck:A, 6pcl:A, 2q9p:A, 8t98:A, 8t99:A, 8tf9:A, 8tfa:A, 7tn4:A, 6wo7:A, 6wo8:A, 6wo9:A, 6woa:A, 6wob:A, 6woc:A, 6wod:A, 6woe:A, 6wof:A, 6wog:A, 6woh:A, 6woi:A
42 2b06:A 150 40 0.0789 0.1000 0.3750 3.9
43 2gb5:A 265 25 0.0684 0.0491 0.5200 4.7 7e44:A, 7e44:B, 7e44:E, 7e44:F, 2gb5:B, 5isy:A, 5isy:C, 5iw4:A, 5iw4:B, 5iw5:B, 5iw5:A, 1vk6:A
44 7cpx:A 2262 35 0.0632 0.0053 0.3429 6.2 7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B
45 5zrk:A 129 50 0.0789 0.1163 0.3000 7.8 5zrg:A, 5zrh:A, 5zri:A, 5zrk:B, 5zrl:A, 5zrl:B, 5zro:A, 5zro:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218