Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KQLIEFVRWSPERAQHYRNKGYWIDQPLTRILTVGVQSHPHSLAIICGERQLSYIELDRLSTNLATRLAEKGLGKGDTAL
VQLPNVAEFYIVFFALLKAGVVVLNALYSHRQYELNAFIKQIQPKLLIGSRQHEVFSNNQFIDSLHDVNLSPEIILMLNH
QATDFGLLDWIETPAETFVDFSSTPADEVAFFQLSGGSTGTPKLIPRTHNDYDYSVRASAEICGLNSNTRLLCALPAPHN
FMLSSPGALGVLHAGGCVVMAPNPEPLNCFSIIQRHQVNMASLVPSAVIMWLEKAAQYKDQIQSLKLLQVGGASFPESLA
RQVPEVLNCKLQQVFGMAEGLVNYTRLDDSDEQIFTTQGRPISSDDEIKIVDEQYREVPEGEIGMLATRGPYTFCGYYQS
PEHNSQVFDEDNYYYSGDLVQRTPDGNLRVVGRIKD

The query sequence (length=436) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3u16:B 437 436 1.0000 0.9977 1.0000 0.0 3o82:A, 3o82:B, 3o83:A, 3o83:B, 3o84:A, 3o84:B, 3u16:A, 3u17:A, 3u17:B
2 3rg2:C 613 435 0.5436 0.3866 0.5448 5.97e-162 6iyk:A, 6iyk:B, 6iyl:A, 6iyl:B, 4iz6:A, 4iz6:B, 8k5s:A, 8k5s:B, 8k5t:A, 8k5t:B, 3rg2:A, 3rg2:B, 3rg2:H, 3rg2:D, 3rg2:E, 3rg2:F, 3rg2:I, 3rg2:G, 3rg2:J
3 6e97:B 537 431 0.4725 0.3836 0.4780 1.73e-133 6e8o:A, 6e8o:B, 6e97:A
4 5wm3:A 537 433 0.4312 0.3501 0.4342 9.06e-119 5wm2:A, 5wm4:A, 5wm5:A, 5wm6:A, 5wm7:A
5 1md9:A 536 431 0.4243 0.3451 0.4292 4.03e-116 1mdb:A
6 7tz4:A 530 428 0.4083 0.3358 0.4159 6.34e-113 7tyb:A
7 5u89:A 1039 405 0.2317 0.0972 0.2494 7.11e-22
8 4gxq:A 506 401 0.2225 0.1917 0.2419 8.36e-22 4fut:A, 4gxq:B, 4gxq:C, 4gxr:A
9 3a9v:A 528 401 0.2431 0.2008 0.2643 2.16e-21 3ni2:A
10 8wev:A 486 401 0.2385 0.2140 0.2594 3.90e-19 8wev:B
11 5ie2:A 506 398 0.2064 0.1779 0.2261 1.84e-17 5ie2:B, 5ie3:A, 5ie3:B
12 8jbr:A 1023 414 0.2317 0.0987 0.2440 2.17e-17
13 8www:A 501 420 0.2385 0.2076 0.2476 2.21e-17 8www:B
14 5bsm:A 530 399 0.2248 0.1849 0.2456 3.12e-17 5bsm:B, 5bsr:A, 5bst:A, 5bsu:A, 5bsv:A, 5bsw:A, 5bsw:B, 5u95:D, 5u95:B, 5u95:C
15 6ea3:B 417 425 0.2202 0.2302 0.2259 8.58e-16
16 6sq8:B 494 244 0.1491 0.1316 0.2664 2.02e-15 6h1b:A, 6h1b:B, 6h1b:C, 6h1b:D, 6h1b:E, 6sq8:A, 6sq8:C, 6sq8:D, 6sq8:E
17 6qjz:A 504 418 0.2179 0.1885 0.2273 2.52e-15
18 6k4d:A 539 412 0.2362 0.1911 0.2500 2.77e-15 6k4c:A
19 6p4u:A 843 413 0.2294 0.1186 0.2421 2.91e-15 6ozv:A, 6p3i:A
20 7thq:B 505 408 0.2202 0.1901 0.2353 1.46e-14 6o6e:B, 7thq:A
21 4wv3:B 518 414 0.2087 0.1757 0.2198 2.04e-14 4wv3:A
22 7ywk:A 401 411 0.2156 0.2344 0.2287 4.81e-14 5n81:A, 5n81:B, 5n82:A, 7ywk:B
23 6ulw:A 1193 467 0.2615 0.0956 0.2441 6.53e-14 6ulw:D, 6ulx:A, 6uly:A, 6uly:B
24 6q2m:A 544 404 0.2202 0.1765 0.2376 1.48e-13 1ba3:A, 5dwv:A, 4e5d:A, 4g36:A, 4g36:B, 4g37:A, 4g37:B, 5gyz:A, 5gz2:A, 6hps:A, 6hps:B, 3ies:A, 5kyt:A, 5kyt:B, 5kyv:A, 5kyv:B, 6q2m:B, 6q2m:C, 3rix:A, 5wys:A
25 4r0m:A 637 269 0.1651 0.1130 0.2677 1.75e-13 4r0m:B
26 5x8f:B 485 408 0.2408 0.2165 0.2574 6.46e-13 5buq:B, 5bur:A, 5bur:B, 5bus:A, 5bus:B, 5gtd:A, 5gtd:B, 5x8f:A, 5x8f:C, 5x8f:D, 5x8g:A, 5x8g:B, 5x8g:D, 5x8g:C
27 5n9x:A 489 418 0.2202 0.1963 0.2297 6.94e-13 5n9x:B
28 6mfz:A 1789 407 0.2202 0.0537 0.2359 7.74e-13 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
29 6mfz:A 1789 421 0.1950 0.0475 0.2019 2.80e-05 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
30 3r44:A 502 399 0.1995 0.1733 0.2180 1.35e-12 5zrn:A, 5zrn:B
31 4oxi:A 526 420 0.2087 0.1730 0.2167 1.95e-12
32 8gic:A 392 421 0.2385 0.2653 0.2470 6.38e-12 8gic:B, 8gkm:A, 8gkm:B
33 2vsq:A 1273 437 0.2408 0.0825 0.2403 8.20e-12
34 8ppp:A 500 416 0.2294 0.2000 0.2404 1.09e-11 8ppp:B, 8pyx:A, 8pyx:B
35 1v26:B 510 402 0.1972 0.1686 0.2139 1.81e-11 1v25:A, 1v25:B, 1v26:A
36 6ijb:B 538 257 0.1468 0.1190 0.2490 1.86e-11 6ihk:B
37 3e7w:A 508 426 0.2202 0.1890 0.2254 1.99e-11 3e7x:A
38 2d1r:A 539 406 0.2179 0.1763 0.2340 4.16e-11 2d1q:A, 2d1s:A, 2d1t:A
39 3wv5:A 387 396 0.1950 0.2196 0.2146 4.34e-11 3wvn:A
40 3nyq:A 460 259 0.1537 0.1457 0.2587 5.19e-11 3nyr:A
41 5wmm:A 870 414 0.1972 0.0989 0.2077 5.93e-11
42 3vnq:A 497 406 0.2018 0.1771 0.2167 7.49e-11 3vnr:A, 3vns:A
43 8g96:A 406 421 0.1995 0.2143 0.2067 9.31e-11 8g96:B, 8g97:A, 8g97:B, 8g98:A
44 7wew:A 481 427 0.2339 0.2121 0.2389 1.50e-10
45 1amu:A 509 427 0.2133 0.1827 0.2178 1.77e-10 1amu:B
46 4d56:A 482 434 0.2179 0.1971 0.2189 1.91e-10 4d4g:A, 4d4i:A, 4d57:A
47 7en2:B 1410 258 0.1560 0.0482 0.2636 2.71e-10 7emy:A, 7emy:B, 7en1:A, 7en1:B, 7en2:A
48 7kyd:A 534 393 0.2179 0.1779 0.2417 2.98e-10
49 6n8e:A 1332 432 0.2271 0.0743 0.2292 5.86e-10
50 4gr5:C 457 411 0.2156 0.2057 0.2287 8.85e-10 4gr5:A, 4gr5:B, 4gr5:D
51 3dlp:X 504 412 0.2225 0.1925 0.2354 9.20e-10 3cw8:X, 3cw9:A, 3cw9:B, 2qvx:X, 2qvy:X, 2qvz:X, 2qw0:X, 1t5d:X, 1t5h:X
52 5ja2:A 1238 416 0.2133 0.0751 0.2236 1.10e-09 5ja1:A, 5t3d:A
53 4ir7:A 508 404 0.2110 0.1811 0.2277 1.34e-09
54 2p20:A 641 425 0.2156 0.1466 0.2212 1.80e-09 5jrh:A, 5jrh:B, 2p20:B, 2p2b:A, 2p2b:B, 2p2f:A, 2p2f:B, 2p2j:A, 2p2j:B, 2p2m:A, 2p2m:B, 2p2q:A, 2p2q:B, 1pg3:A, 1pg3:B, 1pg4:A, 1pg4:B
55 7kvy:A 633 426 0.1927 0.1327 0.1972 1.99e-09 7kcp:A, 7kq6:A, 7kq6:B, 7kq6:C, 7kqz:A, 7l3p:A, 7l3q:A, 7l3q:B, 7l3q:C
56 7kdn:A 622 426 0.2087 0.1463 0.2136 2.20e-09 7kdn:B, 7kdn:C, 7kdn:D, 7kdn:E, 7kdn:F
57 3b7w:A 537 410 0.1972 0.1601 0.2098 3.08e-09 3c5e:A, 3day:A, 3eq6:A, 3eq6:B, 3gpc:A, 3gpc:B, 2vze:A, 2vze:B, 2vze:C, 2wd9:A, 2wd9:B, 2wd9:C
58 7ly7:A 908 416 0.2087 0.1002 0.2188 3.71e-09
59 6mg0:B 1687 419 0.2156 0.0557 0.2243 6.05e-09
60 6mg0:B 1687 421 0.1950 0.0504 0.2019 2.90e-05
61 7r27:B 398 260 0.1399 0.1533 0.2346 9.53e-09 7r27:A
62 3pbk:A 555 433 0.2110 0.1658 0.2125 3.92e-08 3pbk:B
63 7r7e:A 567 434 0.2362 0.1817 0.2373 7.93e-08 7r7e:B, 7r7f:A, 7r7f:B, 7r7g:A, 7r7g:B
64 6ltb:A 928 408 0.2179 0.1024 0.2328 9.32e-08 6ltc:A, 6ltd:A, 6ltd:B
65 7mmz:A 559 423 0.2041 0.1592 0.2104 1.18e-07
66 4rlf:B 519 413 0.2041 0.1715 0.2155 1.43e-07 6m2t:A, 6m2t:B, 6m2t:C, 6m2t:D, 6m2u:A, 6m2u:B, 4rlf:A, 4rlq:A, 4rlq:B, 4rm2:A, 4rm2:B, 4rm3:A, 4rm3:B, 4rmn:A, 4rmn:B, 4zjz:A, 4zjz:B
67 8yyr:A 496 259 0.1606 0.1411 0.2703 1.49e-07 7dq5:A, 7dq5:B, 7dq6:A, 7dq6:B, 6m01:A, 8yyq:A
68 3fcc:A 500 230 0.1261 0.1100 0.2391 1.54e-07 3dhv:A, 3fce:A
69 3wv5:B 359 374 0.1720 0.2089 0.2005 1.73e-07 3wvn:B
70 8rpl:B 630 432 0.2041 0.1413 0.2060 3.14e-07 8rpk:A, 8rpk:B, 8rpk:C, 8rpk:D, 8rpl:A, 8rpl:C, 8rpl:D
71 3lgx:A 508 247 0.1307 0.1122 0.2308 1.57e-06 3lgx:B, 3lgx:C, 3lgx:D
72 7a9j:A 503 414 0.2156 0.1869 0.2271 2.06e-06 7a9i:A
73 8i22:A 530 426 0.1995 0.1642 0.2042 5.63e-06 8i22:F, 8i22:B, 8i22:C, 8i22:D, 8i22:E, 8i3i:A, 8i3i:D, 8i3i:B, 8i3i:C, 8i49:A, 8i49:D, 8i49:E, 8i49:F, 8i49:C, 8i49:B, 8i51:A, 8i51:B, 8i51:C, 8i51:D, 8i51:E, 8i51:F, 8i6m:A, 8i6m:F, 8i6m:D, 8i6m:C, 8i6m:B, 8i6m:E, 8i8d:A, 8i8d:B, 8i8d:C, 8i8d:D, 8i8d:E, 8i8d:F, 8i8e:F, 8i8e:D, 8i8e:A, 8i8e:B, 8i8e:C, 8i8e:E, 8jyl:A, 8jyl:B, 8jyl:C, 8jyl:D, 8jyl:E, 8jyl:F, 8jyu:A, 8jyu:D, 8jyu:B, 8jyu:C, 8jyu:E, 8jyu:F
74 4zxh:A 1314 401 0.1972 0.0654 0.2145 7.32e-06 4zxi:A
75 6oz1:A 643 74 0.0550 0.0373 0.3243 1.60e-05
76 5msd:A 636 283 0.1583 0.1085 0.2438 1.95e-05 5msc:A, 5msq:A
77 8biq:A 562 412 0.2156 0.1673 0.2282 2.21e-05 8biq:B, 8biq:C, 8biq:D, 8bit:A, 8bit:B
78 5ups:A 520 106 0.0665 0.0558 0.2736 2.73e-05 5upq:A, 5upq:B, 5ups:B, 5upt:A
79 5ups:A 520 65 0.0482 0.0404 0.3231 5.38e-05 5upq:A, 5upq:B, 5ups:B, 5upt:A
80 7l4g:B 668 418 0.1950 0.1272 0.2033 2.76e-05 9c8s:A, 9c8s:B, 9c8s:C, 8eps:A, 8eps:B, 8eps:C, 8g0r:A, 8g0r:B, 8g0r:C, 8g0s:A, 8g0s:B, 8g0s:C, 8g0t:A, 8g0t:B, 8g0t:C, 8g0u:A, 8g0u:B, 8g0v:A, 8g0v:B, 8g0v:C, 5ifi:A, 5ifi:B, 5ifi:C, 5k85:A, 5k85:B, 5k85:C, 5k8f:A, 5k8f:B, 5k8f:C, 7kno:A, 7kno:B, 7kno:C, 7knp:A, 7knp:B, 7knp:C, 7l4g:A, 7l4g:C, 5u29:A, 5u29:B, 5u29:C, 8v5g:A, 8v5g:B
81 8u2r:A 664 405 0.1927 0.1265 0.2074 8.49e-05 8sf3:A, 8u2s:A, 8u2s:B, 8u2t:A, 8u2u:A
82 5gxd:A 627 439 0.1995 0.1388 0.1982 1.33e-04
83 5mss:A 717 95 0.0619 0.0377 0.2842 1.34e-04 5mst:A, 5mst:B, 5msw:A
84 7wua:A 603 460 0.2339 0.1692 0.2217 1.47e-04 7wua:B, 7wua:C, 7wua:D
85 6vhy:C 540 68 0.0528 0.0426 0.3382 2.02e-04 6vhv:A, 6vhw:A, 6vhw:B, 6vhx:A, 6vhx:B, 6vhy:D, 6vhy:A, 6vhy:B, 6vhz:A, 6vhz:B
86 7thn:B 478 263 0.1491 0.1360 0.2471 2.28e-04
87 8rwj:D 676 408 0.2041 0.1317 0.2181 4.96e-04 8rwj:I, 8rwj:A, 8rwj:B, 8rwj:C, 8rwj:E, 8rwj:F, 8rwj:G, 8rwj:H, 1ry2:A
88 7xbt:A 487 250 0.1284 0.1150 0.2240 0.002 7xbu:A, 7xbv:A
89 5oe3:A 394 68 0.0528 0.0584 0.3382 0.002 5oe3:B, 5oe3:C, 5oe3:D, 5oe4:A, 5oe4:B, 5oe5:A, 5oe6:A, 5oe6:B, 5oe6:C, 5oe6:D
90 3kxw:A 572 444 0.1972 0.1503 0.1937 0.014 3lnv:A
91 8hlk:A 910 79 0.0482 0.0231 0.2658 0.042
92 8hlk:A 910 83 0.0550 0.0264 0.2892 0.059
93 6akd:A 488 58 0.0436 0.0389 0.3276 0.049
94 4wd1:A 646 166 0.0963 0.0650 0.2530 0.071
95 5u8o:B 360 55 0.0413 0.0500 0.3273 0.076 5i0p:C, 5i0p:D, 5u8o:A, 5u8o:C, 5u8o:D
96 5i0p:B 323 55 0.0413 0.0557 0.3273 0.13 5i0p:A
97 8w0b:A 667 300 0.1537 0.1004 0.2233 0.16 7kds:A, 8v4o:A, 8v4o:B, 8v4o:C, 8v4p:A, 8v4p:B, 8v4p:C, 8v4r:A, 8v4r:B, 8v4r:C, 8w0b:B, 8w0b:C, 8w0c:A, 8w0c:B, 8w0c:C, 8w0d:A, 8w0d:B, 8w0d:C, 8w0h:A, 8w0h:B, 8w0h:C, 8w0j:A, 8w0j:B, 8w0j:C, 8w0l:A, 8w0l:B, 8w0l:C, 8w0m:A, 8w0m:B, 8w0m:C
98 5d6j:A 630 85 0.0550 0.0381 0.2824 0.21 5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
99 8k4r:A 506 271 0.1239 0.1067 0.1993 0.22 8k4r:C
100 4dg9:A 575 263 0.1445 0.1096 0.2395 0.26 4dg8:A
101 6ao1:A 354 55 0.0390 0.0480 0.3091 0.39 6ao1:B, 6ao1:C, 6ao1:D
102 8g0u:C 455 99 0.0550 0.0527 0.2424 1.3
103 7ajt:UR 482 95 0.0528 0.0477 0.2421 2.3 7aju:UR, 7d4i:B8, 7d5s:B8, 7d5t:B8, 7d63:B8, 6ke6:B8, 6lqp:B8, 6lqq:B8, 6lqr:B8, 6lqs:B8, 6lqt:B8, 6lqu:B8, 6lqv:B8, 6nd4:S, 7suk:LS, 5wlc:LS, 6zqa:UR, 6zqb:UR, 6zqc:UR, 6zqd:UR
104 5c5h:B 448 240 0.1284 0.1250 0.2333 2.9 5c5h:A, 6nj0:A
105 5gud:E 460 55 0.0413 0.0391 0.3273 3.1 5gud:A, 5gud:B, 5gud:C, 5gud:D, 5gud:F, 5ijz:A, 5ijz:B, 5ijz:C, 5ijz:D, 5ijz:E, 5ijz:F, 5ijz:G, 5ijz:H, 5ijz:J
106 1pjq:B 455 149 0.0872 0.0835 0.2550 4.0 6p5x:A, 6p5x:B, 6p5z:A, 6p5z:B, 6p7c:A, 6p7c:B, 6p7d:A, 6p7d:B, 1pjs:A, 1pjs:B, 1pjt:A, 1pjt:B, 6pqz:A, 6pqz:B, 6pr0:A, 6pr0:B, 6pr1:A, 6pr1:B, 6pr2:A, 6pr2:B, 6pr3:A, 6pr3:B, 6pr4:A, 6pr4:B, 6ulu:A, 6ulu:B, 6veb:A, 6veb:B
107 4r1m:A 435 151 0.0803 0.0805 0.2318 5.5 4r1l:A, 4r1l:B, 4r1l:C, 4r1l:D, 4r1m:B, 4r1m:C, 4r1m:D, 4rvn:A, 4rvn:B, 4rvn:C, 4rvn:D, 4rvo:A, 4rvo:B, 4rvo:C, 4rvo:D
108 5hm3:A 625 85 0.0550 0.0384 0.2824 7.9 5ey9:A, 5ey9:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218