BioLiP

>protein
KPLPADKQIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIKAVISGNITKIKAVYDTNPAKFRTLQNILEVEKEMYGAEWPKVG
ATLALMWLKRGLRFIQVFLQSICDGERDENHPNLIRVNATKAYEMALKKYHGWIVQKIFQAALYAAPYKSDFLKALSKGQ
NVTEEECLEKIRLFLVNYTATIDVIYEMYTQMNAELNYKV

The query sequence (length=200) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4gxg:A	209	200	0.9950	0.9522	0.9950	4.16e-150	2bv7:A, 2euk:A, 2eum:A, 2evd:A, 2evl:A, 2evs:A, 2evs:E, 4gh0:A, 4ghp:A, 4ghs:A, 4ghs:B, 4gix:A, 4gjq:A, 4gjq:B, 4gvt:A, 4gxd:A, 4gxg:B, 4gxg:D, 4gxg:E, 4h2z:A, 3ric:A, 3rzn:A, 3s0i:A, 3s0k:A, 1sx6:A
2	5kdi:A	211	195	0.3600	0.3412	0.3692	1.57e-31	5kdi:B
3	4nti:A	202	167	0.2150	0.2129	0.2575	3.37e-09	4nt2:A, 4ntg:A, 4ntg:B, 4nti:B, 4nto:A, 4nto:B, 4nto:C
4	4kbr:B	207	144	0.1850	0.1787	0.2569	1.46e-05	4kbr:A, 4kbr:C, 4kbr:D, 4kbr:F, 4kbr:G, 4kbr:H
5	4k80:A	209	164	0.1950	0.1866	0.2378	9.92e-05	4k84:A, 4k84:B, 4k85:A, 4k85:B, 4k85:C, 4k85:D, 4k8n:A, 4k8n:E, 4k8n:B, 4k8n:C, 4k8n:D, 4k8n:F, 4kf6:A, 4kf6:B, 4kf6:C, 4kf6:D, 4kf6:E, 4kf6:F
6	8bja:A	1563	137	0.1650	0.0211	0.2409	0.34
7	8e0q:A	1689	136	0.1600	0.0189	0.2353	1.0	8d4x:A, 8e0q:B
8	8d4x:B	1669	136	0.1600	0.0192	0.2353	1.1	8c06:A, 8c06:D
9	6s83:A	400	47	0.0800	0.0400	0.3404	1.1	6s83:B, 6s83:C, 6s83:D, 6s83:E, 6s83:F, 6s83:G, 6s83:H
10	8ewi:A	1775	136	0.1600	0.0180	0.2353	1.2	8ewi:B, 8ewi:C, 8ewi:D
11	8p82:A	1596	142	0.1650	0.0207	0.2324	1.3	8p82:B
12	8bja:B	1638	145	0.1700	0.0208	0.2345	2.4
13	8q59:A	280	32	0.0600	0.0429	0.3750	2.6	8q57:A, 8q57:B, 8q59:B
14	6s6z:A	1083	87	0.1300	0.0240	0.2989	6.1	6s6z:D, 6s6z:B, 6s6z:H, 6s6z:F, 6s6z:G, 6s6z:E, 6s6z:C, 6sd0:A, 6sd0:B, 6sd0:C, 6sd0:D
15	8q5a:A	276	26	0.0600	0.0435	0.4615	7.1	8q58:A
16	6dbi:C	622	37	0.0450	0.0145	0.2432	7.8	6dbi:A, 6dbj:A, 6dbj:C, 6dbl:A, 6dbl:C, 6dbo:A, 6dbo:C, 6dbq:A, 6dbq:C, 6dbr:A, 6dbr:C, 6dbt:A, 6dbt:C, 6dbu:A, 6dbu:C, 6dbv:A, 6dbv:C, 6dbw:A, 6dbw:C, 6dbx:A, 6dbx:C, 3jbw:A, 3jbw:C, 3jbx:A, 3jbx:C, 3jby:A, 3jby:C
17	6oet:C	623	37	0.0550	0.0177	0.2973	9.9	6cg0:A, 6cg0:C, 6cij:A, 6cij:C, 6cik:A, 6cik:C, 6cil:A, 6cil:C, 6cim:A, 6cim:C, 3gna:A, 3gnb:A, 6oem:A, 6oem:C, 6oen:A, 6oen:C, 6oeo:A, 6oeo:C, 6oep:A, 6oep:C, 6oeq:A, 6oeq:C, 6oer:A, 6oer:C, 6oes:A, 6oes:C, 6oet:A, 6v0v:A, 4wwx:B, 4wwx:E, 6xnx:A, 6xnx:C, 6xny:A, 6xny:C, 6xnz:A, 6xnz:C, 5zdz:A, 5zdz:C, 5ze0:A, 5ze0:C, 5ze1:A, 5ze1:C, 5ze2:A, 5ze2:C

[Back]