Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KPGSLTIAGSGIASIGHITLETLALIKEADKIFYAVTDPATECYIQENSRGDHFDLTTFYDTNKKRYESYVQMSEVMLRD
VRAGRNVLGIFYGHPGVFVAPSHRAIAIAREEGFQAKMLPGISAEDYMFADLGFDPSTYGCMTQEATELLVRNKKLDPSI
HNIIWQVGSVGVDTMVFDNGKFHLLVERLEKDFGLDHKIQHYIGAILPQSVTVKDTFAIRDLRKEEVLKQFTTTSTFYVP
PRTPAPIDPKAVQALGLPATPAYGPDEMRAVAALDSFVPSQEKAVVHASRAMQSLMVDLALRPALLEQYKADPVAFANTR
NGLTAQEKFALGLKKPGPIFVVMRQLPSAIASGQEPSQEEIARADDATA

The query sequence (length=369) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7twk:B 392 384 1.0000 0.9413 0.9609 0.0 7twk:A, 7twk:C, 7twk:D, 7twl:A, 7twl:B, 7twl:C, 7twl:D, 7twm:A, 7twm:B, 7twm:C, 7twm:D
2 6mjg:A 386 374 0.4390 0.4197 0.4332 5.64e-106 6mjf:A, 6mjf:B, 6mjf:C, 6mjf:D, 6mjf:F
3 5n0s:B 404 390 0.4417 0.4035 0.4179 6.86e-101 6gew:A, 5n0n:A, 5n0o:A, 5n0o:B, 5n0p:A, 5n0p:B, 5n0q:A, 5n0q:B, 5n0r:A, 5n0s:A, 5n0t:A, 5n0t:B, 5n0u:A, 5n0v:A, 5n0v:B, 5n0w:A, 5n0w:B, 5n0x:A, 5n0x:B, 5n4i:A, 5ouf:A, 6qzy:A, 6qzz:A, 6qzz:B, 6r00:A, 6tsc:A
4 7lte:A 262 272 0.2358 0.3321 0.3199 4.63e-40 7lte:C, 7ltr:A, 7ltr:H, 7lts:A, 7lts:C, 8t1s:A, 8t1s:C, 8t1t:A, 8t1t:C
5 2e0n:B 238 128 0.1057 0.1639 0.3047 0.012 2e0n:A
6 1cbf:A 239 120 0.0813 0.1255 0.2500 0.058 2cbf:A
7 2ybo:A 248 191 0.1247 0.1855 0.2408 0.27 2ybq:A
8 1pjq:B 455 124 0.0705 0.0571 0.2097 1.1 6p5x:A, 6p5x:B, 6p5z:A, 6p5z:B, 6p7c:A, 6p7c:B, 6p7d:A, 6p7d:B, 1pjs:A, 1pjs:B, 1pjt:A, 1pjt:B, 6pqz:A, 6pqz:B, 6pr0:A, 6pr0:B, 6pr1:A, 6pr1:B, 6pr2:A, 6pr2:B, 6pr3:A, 6pr3:B, 6pr4:A, 6pr4:B, 6ulu:A, 6ulu:B, 6veb:A, 6veb:B
9 4nas:B 399 69 0.0623 0.0576 0.3333 1.5 4nas:A, 4nas:C, 4nas:D
10 8eya:A 301 125 0.0894 0.1096 0.2640 4.1 1aax:A, 2azr:A, 2b07:A, 6b8z:A, 6b95:A, 2bgd:A, 2bge:A, 4bjo:A, 4bjo:B, 1bzc:A, 1bzh:A, 1bzj:A, 1c83:A, 1c84:A, 1c85:A, 1c86:A, 1c87:A, 1c88:A, 2cm7:A, 2cm8:A, 2cma:A, 2cmb:A, 2cmc:A, 2cne:A, 2cnf:A, 2cng:A, 2cnh:A, 2cni:A, 3cwe:A, 3d9c:A, 3eax:A, 3eb1:A, 1ecv:A, 1een:A, 1eeo:A, 8exj:A, 8exk:A, 8exm:A, 8exn:A, 8eya:B, 8eyb:A, 8eyb:B, 8eyc:A, 2f6t:A, 2f6v:A, 2f6w:A, 2f6y:A, 2f6z:A, 2f70:A, 2f71:A, 8f88:A, 8f88:B, 8f88:C, 2fjm:A, 2fjm:B, 2fjn:A, 2fjn:B, 7fqm:A, 7fqn:A, 7fqo:A, 7fqp:A, 7fqq:A, 7fqs:A, 7fqt:A, 7fqu:A, 7fqx:A, 7fqy:A, 7fqz:A, 7frf:A, 7frg:A, 7fri:A, 7frj:A, 7frl:A, 7frm:A, 7frn:A, 7fro:A, 7frp:A, 7frq:A, 7frr:A, 1g1f:A, 1g1g:A, 1g1h:A, 8g65:A, 8g65:B, 8g67:A, 8g68:A, 8g68:B, 8g69:A, 8g69:B, 8g6a:A, 1g7f:A, 1g7g:A, 1gfy:A, 7gs7:A, 7gs8:A, 7gs9:A, 7gsa:A, 7gsb:A, 7gsc:A, 7gse:A, 7gsf:A, 7gsg:A, 7gsh:A, 7gsi:A, 7gsj:A, 7gsk:A, 7gsl:A, 7gsm:A, 7gsn:A, 7gso:A, 7gsq:A, 7gsr:A, 7gst:A, 7gsu:A, 7gsv:A, 7gsx:A, 7gsy:A, 7gsz:A, 7gt0:A, 7gt1:A, 7gt2:A, 7gt3:A, 7gt4:A, 7gt5:A, 7gt6:A, 7gt7:A, 7gt8:A, 7gt9:A, 7gta:A, 7gtb:A, 7gtc:A, 7gtd:A, 7gte:A, 7gtf:A, 7gtg:A, 7gth:A, 7gti:A, 7gtj:A, 7gtk:A, 7gtl:A, 7gtm:A, 7gtn:A, 7gto:A, 7gtp:A, 7gtq:A, 7gtr:A, 7gts:A, 7gtt:A, 7gtu:A, 7gtv:A, 2h4g:A, 2h4k:A, 2hb1:A, 2hnq:A, 3i7z:A, 3i80:A, 4i8n:A, 1jf7:B, 5k9w:A, 1kak:A, 1kav:A, 5ka1:A, 5ka3:A, 5ka7:A, 5ka9:A, 5kab:A, 5kad:A, 5kad:B, 7klx:A, 1l8g:A, 1lqf:A, 1lqf:B, 1lqf:C, 1lqf:D, 7mm1:A, 7mn7:A, 7mna:A, 7mnb:A, 7mnd:A, 7mnf:A, 7mow:A, 1nl9:A, 1nny:A, 1no6:A, 2nt7:A, 2nta:A, 1nwe:A, 1nwl:A, 1nz7:A, 1oeu:A, 1ony:A, 1onz:A, 1ph0:A, 1ptt:A, 1ptu:A, 1ptv:A, 1pty:A, 1pxh:A, 1pyn:A, 1q1m:A, 1q6j:A, 1q6m:A, 1q6n:A, 1q6n:B, 1q6p:A, 1q6p:B, 1q6s:A, 1q6s:B, 1q6t:A, 1q6t:B, 2qbp:A, 2qbq:A, 2qbr:A, 2qbs:A, 5qde:A, 5qdf:A, 5qdh:A, 5qdi:A, 5qdj:A, 5qdk:A, 5qdl:A, 5qdm:A, 5qdn:A, 5qdo:A, 5qdp:A, 5qdq:A, 5qdr:A, 5qds:A, 5qdt:A, 5qdu:A, 5qdv:A, 5qdw:A, 5qdx:A, 5qdy:A, 5qdz:A, 5qe0:A, 5qe1:A, 5qe2:A, 5qe4:A, 5qe5:A, 5qe6:A, 5qe8:A, 5qe9:A, 5qea:A, 5qeb:A, 5qec:A, 5qed:A, 5qef:A, 5qeg:A, 5qeh:A, 5qei:A, 5qej:A, 5qek:A, 5qel:A, 5qem:A, 5qen:A, 5qeo:A, 5qep:A, 5qeq:A, 5qer:A, 5qes:A, 5qet:A, 5qeu:A, 5qew:A, 5qex:A, 5qey:A, 5qez:A, 5qf0:A, 5qf1:A, 5qf2:A, 5qf3:A, 5qf4:A, 5qf5:A, 5qf6:A, 5qf7:A, 5qf8:A, 5qf9:A, 5qfa:A, 5qfb:A, 5qfc:A, 5qfd:A, 5qfe:A, 5qff:A, 5qfg:A, 5qfh:A, 5qfi:A, 5qfj:A, 5qfk:A, 5qfl:A, 5qfm:A, 5qfn:A, 5qfo:A, 5qfp:A, 5qfq:A, 5qfr:A, 5qfs:A, 5qft:A, 5qfu:A, 5qfv:A, 5qfw:A, 5qfx:A, 5qfy:A, 5qfz:A, 5qg0:A, 5qg1:A, 5qg2:A, 5qg3:A, 5qg4:A, 5qg5:A, 5qg6:A, 5qg7:A, 5qg8:A, 5qg9:A, 5qga:A, 5qgb:A, 5qgc:A, 5qgd:A, 5qge:A, 5qgf:A, 1qxk:A, 8skl:A, 5t19:A, 1t48:A, 1t49:A, 1t4j:A, 2veu:A, 2vev:A, 2vew:A, 2vex:A, 2vey:A, 6w30:A, 1wax:A, 1xbo:A, 6xe8:A, 6xed:A, 6xef:A, 6xeg:A, 4y14:A, 4y14:B, 2zmm:A, 3zmp:B, 3zmp:A, 3zmq:A, 2zn7:A, 4zrt:A
11 6mij:A 388 52 0.0569 0.0541 0.4038 4.5
12 6ynx:g 256 105 0.0650 0.0938 0.2286 5.8 6ynx:G, 6yny:g, 6yny:G, 6ynz:g, 6ynz:G, 6ynz:g3, 6ynz:G3
13 3opy:B 884 52 0.0461 0.0192 0.3269 6.4 3opy:D, 3opy:F, 3opy:H
14 6u1x:A 2059 76 0.0596 0.0107 0.2895 6.9
15 5vkw:B 469 57 0.0461 0.0362 0.2982 6.9
16 5a22:A 2002 76 0.0596 0.0110 0.2895 7.2
17 1s4d:E 265 125 0.0813 0.1132 0.2400 7.4 1s4d:A, 1s4d:B, 1s4d:D, 1s4d:F, 1s4d:G, 1s4d:H, 1s4d:I, 1s4d:J, 1s4d:K, 1s4d:L, 1s4d:M
18 6fw8:B 417 116 0.0813 0.0719 0.2586 9.4 6esd:B, 6esd:A, 6fw7:B, 6fw7:A, 6fw8:A, 6fw9:B, 6fw9:A, 6fwa:B, 6fwa:A, 6g2p:B, 6g2p:A, 5g3s:A, 5g3s:B, 5g3t:A, 5g3t:B, 5g3t:C, 5g3t:D, 5g3u:A, 5g3u:B, 5zbc:A, 5zbc:B, 5zbd:A, 5zbd:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218