Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KNIITTIDDYARTQPNNVVYDVQGVTHTYAELKAYSDALAAHLDTLDLPAKDPIIVFGGQTFEMIATFLGVVKSGRAYIP
IDTHSPNERLTMINEIAKPAAVIAVADLPTGVGTTPVITPDQLAAIFATPVDYQADHVVSGDDNYYIIFTSGTTGMPKGV
QISHDNLVSYVDWMLSDDFGLPDQPNSLSQPPYSFDLSVMDVYPTLALGGTLYALPKAVTDDFKQLFAALPTLPINVWVS
TPSFMDICLLEPKFNAENLPTLTHFLFCGEELTHKTAATLKKRFPDARIFNTYGPTETCVAVTQIEITDAALAQYDRLPI
GYAKADTRILVVDENGEAVPNGTEGELIIAGPSVSKGYLNNPEKTAKAFFELDGQPAYHSGDIGTMDADGLFRYRGRV

The query sequence (length=398) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7r27:B 398 398 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7r27:A
2 3lgx:A 508 399 0.5276 0.4134 0.5263 3.89e-151 3lgx:B, 3lgx:C, 3lgx:D
3 3fcc:A 500 404 0.4472 0.3560 0.4406 2.31e-108 3dhv:A, 3fce:A
4 3e7w:A 508 398 0.4296 0.3366 0.4296 7.09e-104 3e7x:A
5 7vhv:A 485 402 0.4045 0.3320 0.4005 3.69e-86 7vhv:D, 7vhv:C, 7vhv:B
6 6p4u:A 843 397 0.3040 0.1435 0.3048 1.24e-43 6ozv:A, 6p3i:A
7 4d56:A 482 383 0.2814 0.2324 0.2924 5.63e-43 4d4g:A, 4d4i:A, 4d57:A
8 6ea3:B 417 400 0.3015 0.2878 0.3000 7.05e-42
9 6mfz:A 1789 412 0.2940 0.0654 0.2840 3.80e-41 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
10 6mfz:A 1789 394 0.2889 0.0643 0.2919 1.40e-38 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
11 7thq:B 505 397 0.2789 0.2198 0.2796 4.74e-40 6o6e:B, 7thq:A
12 6mg0:B 1687 394 0.2889 0.0682 0.2919 1.44e-38
13 6mg0:B 1687 412 0.2839 0.0670 0.2743 2.92e-36
14 5n9x:A 489 398 0.3015 0.2454 0.3015 2.38e-38 5n9x:B
15 8www:A 501 408 0.3116 0.2475 0.3039 9.94e-38 8www:B
16 7ywk:A 401 408 0.2764 0.2743 0.2696 2.79e-36 5n81:A, 5n81:B, 5n82:A, 7ywk:B
17 4oxi:A 526 260 0.2161 0.1635 0.3308 3.00e-35
18 4zxh:A 1314 378 0.2789 0.0845 0.2937 7.02e-34 4zxi:A
19 5u89:A 1039 408 0.2714 0.1039 0.2647 9.29e-34
20 8jbr:A 1023 399 0.2688 0.1046 0.2682 9.86e-34
21 7ly7:A 908 397 0.2764 0.1211 0.2771 1.05e-33
22 5wmm:A 870 381 0.2638 0.1207 0.2756 2.49e-33
23 3vnq:A 497 400 0.3116 0.2495 0.3100 3.25e-33 3vnr:A, 3vns:A
24 8g96:A 406 399 0.2663 0.2611 0.2657 5.04e-33 8g96:B, 8g97:A, 8g97:B, 8g98:A
25 2vsq:A 1273 384 0.2613 0.0817 0.2708 6.04e-32
26 5ja2:A 1238 383 0.2688 0.0864 0.2794 7.42e-32 5ja1:A, 5t3d:A
27 8yyr:A 496 401 0.2889 0.2319 0.2868 1.04e-30 7dq5:A, 7dq5:B, 7dq6:A, 7dq6:B, 6m01:A, 8yyq:A
28 8gic:A 392 376 0.2538 0.2577 0.2686 5.40e-30 8gic:B, 8gkm:A, 8gkm:B
29 6ltb:A 928 400 0.2839 0.1218 0.2825 2.05e-29 6ltc:A, 6ltd:A, 6ltd:B
30 7en2:B 1410 341 0.2412 0.0681 0.2815 5.63e-29 7emy:A, 7emy:B, 7en1:A, 7en1:B, 7en2:A
31 7wew:A 481 404 0.2864 0.2370 0.2822 1.03e-28
32 1amu:A 509 409 0.2563 0.2004 0.2494 1.92e-28 1amu:B
33 7thn:B 478 403 0.2839 0.2364 0.2804 4.36e-28
34 7xbt:A 487 411 0.3040 0.2485 0.2944 7.01e-28 7xbu:A, 7xbv:A
35 6n8e:A 1332 410 0.3040 0.0908 0.2951 2.64e-27
36 8hlk:A 910 420 0.2663 0.1165 0.2524 4.10e-26
37 3wv5:A 387 397 0.2638 0.2713 0.2645 3.93e-24 3wvn:A
38 4dg9:A 575 356 0.2487 0.1722 0.2781 7.76e-24 4dg8:A
39 8k4r:A 506 404 0.2814 0.2213 0.2772 2.28e-23 8k4r:C
40 4gr5:C 457 376 0.2513 0.2188 0.2660 1.31e-22 4gr5:A, 4gr5:B, 4gr5:D
41 5jjq:C 489 385 0.2513 0.2045 0.2597 2.36e-22 5jjq:A, 5jjq:B, 5jjq:D
42 6akd:A 488 364 0.2638 0.2152 0.2885 1.80e-21
43 4gxq:A 506 395 0.2714 0.2134 0.2734 2.69e-19 4fut:A, 4gxq:B, 4gxq:C, 4gxr:A
44 8wev:A 486 392 0.2613 0.2140 0.2653 8.24e-19 8wev:B
45 3a9v:A 528 380 0.2337 0.1761 0.2447 1.93e-15 3ni2:A
46 3wv5:B 359 388 0.2462 0.2730 0.2526 2.63e-15 3wvn:B
47 3r44:A 502 389 0.2362 0.1873 0.2416 3.97e-15 5zrn:A, 5zrn:B
48 6k4d:A 539 394 0.2487 0.1837 0.2513 6.94e-15 6k4c:A
49 2d1r:A 539 249 0.1683 0.1243 0.2691 8.69e-15 2d1q:A, 2d1s:A, 2d1t:A
50 7kyd:A 534 277 0.1809 0.1348 0.2599 2.85e-13
51 6q2m:A 544 400 0.2588 0.1893 0.2575 4.22e-13 1ba3:A, 5dwv:A, 4e5d:A, 4g36:A, 4g36:B, 4g37:A, 4g37:B, 5gyz:A, 5gz2:A, 6hps:A, 6hps:B, 3ies:A, 5kyt:A, 5kyt:B, 5kyv:A, 5kyv:B, 6q2m:B, 6q2m:C, 3rix:A, 5wys:A
52 5wm3:A 537 413 0.2538 0.1881 0.2446 4.25e-13 5wm2:A, 5wm4:A, 5wm5:A, 5wm6:A, 5wm7:A
53 4ir7:A 508 421 0.2538 0.1988 0.2399 2.38e-12
54 6qjz:A 504 395 0.2337 0.1845 0.2354 7.74e-12
55 5bsm:A 530 375 0.2161 0.1623 0.2293 2.30e-11 5bsm:B, 5bsr:A, 5bst:A, 5bsu:A, 5bsv:A, 5bsw:A, 5bsw:B, 5u95:D, 5u95:B, 5u95:C
56 5ie2:A 506 260 0.1709 0.1344 0.2615 2.98e-11 5ie2:B, 5ie3:A, 5ie3:B
57 3dlp:X 504 399 0.2563 0.2024 0.2556 7.43e-11 3cw8:X, 3cw9:A, 3cw9:B, 2qvx:X, 2qvy:X, 2qvz:X, 2qw0:X, 1t5d:X, 1t5h:X
58 3b7w:A 537 436 0.2437 0.1806 0.2225 8.90e-11 3c5e:A, 3day:A, 3eq6:A, 3eq6:B, 3gpc:A, 3gpc:B, 2vze:A, 2vze:B, 2vze:C, 2wd9:A, 2wd9:B, 2wd9:C
59 1v26:B 510 371 0.2211 0.1725 0.2372 4.79e-10 1v25:A, 1v25:B, 1v26:A
60 3kxw:A 572 420 0.2412 0.1678 0.2286 6.86e-10 3lnv:A
61 4r0m:A 637 272 0.1633 0.1020 0.2390 7.68e-10 4r0m:B
62 3rg2:C 613 399 0.2437 0.1582 0.2431 1.09e-09 6iyk:A, 6iyk:B, 6iyl:A, 6iyl:B, 4iz6:A, 4iz6:B, 8k5s:A, 8k5s:B, 8k5t:A, 8k5t:B, 3rg2:A, 3rg2:B, 3rg2:H, 3rg2:D, 3rg2:E, 3rg2:F, 3rg2:I, 3rg2:G, 3rg2:J
63 6vhy:C 540 421 0.2714 0.2000 0.2565 1.77e-09 6vhv:A, 6vhw:A, 6vhw:B, 6vhx:A, 6vhx:B, 6vhy:D, 6vhy:A, 6vhy:B, 6vhz:A, 6vhz:B
64 5d6j:A 630 190 0.1231 0.0778 0.2579 2.97e-09 5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
65 5d6j:A 630 59 0.0452 0.0286 0.3051 0.30 5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
66 3nyq:A 460 330 0.2236 0.1935 0.2697 3.37e-09 3nyr:A
67 7r7e:A 567 450 0.2663 0.1869 0.2356 6.10e-09 7r7e:B, 7r7f:A, 7r7f:B, 7r7g:A, 7r7g:B
68 3u16:B 437 260 0.1533 0.1396 0.2346 8.27e-09 3o82:A, 3o82:B, 3o83:A, 3o83:B, 3o84:A, 3o84:B, 3u16:A, 3u17:A, 3u17:B
69 7tz4:A 530 390 0.2236 0.1679 0.2282 8.41e-09 7tyb:A
70 6sq8:B 494 257 0.1683 0.1356 0.2607 2.12e-08 6h1b:A, 6h1b:B, 6h1b:C, 6h1b:D, 6h1b:E, 6sq8:A, 6sq8:C, 6sq8:D, 6sq8:E
71 5hm3:A 625 227 0.1307 0.0832 0.2291 3.42e-07 5ey9:A, 5ey9:B
72 3pbk:A 555 420 0.2362 0.1694 0.2238 4.64e-07 3pbk:B
73 1md9:A 536 399 0.2236 0.1660 0.2231 5.16e-07 1mdb:A
74 8ppp:A 500 273 0.1759 0.1400 0.2564 7.78e-07 8ppp:B, 8pyx:A, 8pyx:B
75 5x8f:B 485 400 0.2286 0.1876 0.2275 1.31e-06 5buq:B, 5bur:A, 5bur:B, 5bus:A, 5bus:B, 5gtd:A, 5gtd:B, 5x8f:A, 5x8f:C, 5x8f:D, 5x8g:A, 5x8g:B, 5x8g:D, 5x8g:C
76 4rlf:B 519 415 0.2211 0.1696 0.2120 1.80e-06 6m2t:A, 6m2t:B, 6m2t:C, 6m2t:D, 6m2u:A, 6m2u:B, 4rlf:A, 4rlq:A, 4rlq:B, 4rm2:A, 4rm2:B, 4rm3:A, 4rm3:B, 4rmn:A, 4rmn:B, 4zjz:A, 4zjz:B
77 5oe3:A 394 409 0.2236 0.2259 0.2176 2.01e-06 5oe3:B, 5oe3:C, 5oe3:D, 5oe4:A, 5oe4:B, 5oe5:A, 5oe6:A, 5oe6:B, 5oe6:C, 5oe6:D
78 6e97:B 537 426 0.2412 0.1788 0.2254 2.06e-06 6e8o:A, 6e8o:B, 6e97:A
79 6ijb:B 538 444 0.2362 0.1747 0.2117 4.50e-05 6ihk:B
80 6ulw:A 1193 194 0.1206 0.0402 0.2474 7.95e-05 6ulw:D, 6ulx:A, 6uly:A, 6uly:B
81 6ulw:A 1193 69 0.0578 0.0193 0.3333 0.006 6ulw:D, 6ulx:A, 6uly:A, 6uly:B
82 8iqu:A 545 399 0.2362 0.1725 0.2356 6.53e-04 8hd4:A, 8hdf:A
83 8rpl:B 630 288 0.1709 0.1079 0.2361 0.001 8rpk:A, 8rpk:B, 8rpk:C, 8rpk:D, 8rpl:A, 8rpl:C, 8rpl:D
84 7wua:A 603 413 0.2312 0.1526 0.2228 0.002 7wua:B, 7wua:C, 7wua:D
85 8i22:A 530 270 0.1558 0.1170 0.2296 0.003 8i22:F, 8i22:B, 8i22:C, 8i22:D, 8i22:E, 8i3i:A, 8i3i:D, 8i3i:B, 8i3i:C, 8i49:A, 8i49:D, 8i49:E, 8i49:F, 8i49:C, 8i49:B, 8i51:A, 8i51:B, 8i51:C, 8i51:D, 8i51:E, 8i51:F, 8i6m:A, 8i6m:F, 8i6m:D, 8i6m:C, 8i6m:B, 8i6m:E, 8i8d:A, 8i8d:B, 8i8d:C, 8i8d:D, 8i8d:E, 8i8d:F, 8i8e:F, 8i8e:D, 8i8e:A, 8i8e:B, 8i8e:C, 8i8e:E, 8jyl:A, 8jyl:B, 8jyl:C, 8jyl:D, 8jyl:E, 8jyl:F, 8jyu:A, 8jyu:D, 8jyu:B, 8jyu:C, 8jyu:E, 8jyu:F
86 5mss:A 717 261 0.1683 0.0934 0.2567 0.003 5mst:A, 5mst:B, 5msw:A
87 5ups:A 520 281 0.1558 0.1192 0.2206 0.004 5upq:A, 5upq:B, 5ups:B, 5upt:A
88 4wv3:B 518 261 0.1432 0.1100 0.2184 0.008 4wv3:A
89 6eqo:A 1804 306 0.1658 0.0366 0.2157 0.040 6eqo:B
90 5gxd:A 627 275 0.1608 0.1021 0.2327 0.076
91 8biq:A 562 398 0.2186 0.1548 0.2186 0.095 8biq:B, 8biq:C, 8biq:D, 8bit:A, 8bit:B
92 4jyo:X 217 95 0.0653 0.1198 0.2737 0.27 4epu:A, 4epu:B
93 7a9j:A 503 172 0.0905 0.0716 0.2093 0.32 7a9i:A
94 3dff:A 266 113 0.0804 0.1203 0.2832 0.47 3dfk:A, 3dfm:A, 2x9l:A, 2xad:A, 2xad:B, 2xad:C, 2xad:D
95 5msd:A 636 274 0.1734 0.1085 0.2518 0.56 5msc:A, 5msq:A
96 2p20:A 641 289 0.1558 0.0967 0.2145 0.56 5jrh:A, 5jrh:B, 2p20:B, 2p2b:A, 2p2b:B, 2p2f:A, 2p2f:B, 2p2j:A, 2p2j:B, 2p2m:A, 2p2m:B, 2p2q:A, 2p2q:B, 1pg3:A, 1pg3:B, 1pg4:A, 1pg4:B
97 8rwj:D 676 25 0.0327 0.0192 0.5200 1.1 8rwj:I, 8rwj:A, 8rwj:B, 8rwj:C, 8rwj:E, 8rwj:F, 8rwj:G, 8rwj:H, 1ry2:A
98 7kdn:A 622 28 0.0327 0.0209 0.4643 1.9 7kdn:B, 7kdn:C, 7kdn:D, 7kdn:E, 7kdn:F
99 4iee:A 452 77 0.0528 0.0465 0.2727 2.2 5c12:A, 5c15:A, 5c2d:A, 5c2f:A, 4iei:A, 4ife:A
100 6oz1:A 643 318 0.1884 0.1166 0.2358 3.3
101 7l4g:B 668 22 0.0276 0.0165 0.5000 4.5 9c8s:A, 9c8s:B, 9c8s:C, 8eps:A, 8eps:B, 8eps:C, 8g0r:A, 8g0r:B, 8g0r:C, 8g0s:A, 8g0s:B, 8g0s:C, 8g0t:A, 8g0t:B, 8g0t:C, 8g0u:A, 8g0u:B, 8g0v:A, 8g0v:B, 8g0v:C, 5ifi:A, 5ifi:B, 5ifi:C, 5k85:A, 5k85:B, 5k85:C, 5k8f:A, 5k8f:B, 5k8f:C, 7kno:A, 7kno:B, 7kno:C, 7knp:A, 7knp:B, 7knp:C, 7l4g:A, 7l4g:C, 5u29:A, 5u29:B, 5u29:C, 8v5g:A, 8v5g:B
102 7mmz:A 559 19 0.0276 0.0197 0.5789 4.7
103 4ijn:A 376 36 0.0452 0.0479 0.5000 5.4 4ijn:B
104 3b8e:A 998 98 0.0628 0.0251 0.2551 5.6 3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
105 8w0b:A 667 22 0.0276 0.0165 0.5000 5.8 7kds:A, 8v4o:A, 8v4o:B, 8v4o:C, 8v4p:A, 8v4p:B, 8v4p:C, 8v4r:A, 8v4r:B, 8v4r:C, 8w0b:B, 8w0b:C, 8w0c:A, 8w0c:B, 8w0c:C, 8w0d:A, 8w0d:B, 8w0d:C, 8w0h:A, 8w0h:B, 8w0h:C, 8w0j:A, 8w0j:B, 8w0j:C, 8w0l:A, 8w0l:B, 8w0l:C, 8w0m:A, 8w0m:B, 8w0m:C
106 7udu:D 701 54 0.0503 0.0285 0.3704 7.3 7rb8:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218