Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KMRHLRFENLTEEQLKRLAKILTENLKGGEVVILSGNLGAGKTTFVKGMIRAIGLDEKMVKSPTFTLMNVYPGLKTIYHL
DLYRLQDTDFLSLDVEDILEDEDGIMVVEWGDLFDGFWPEDSIKVKIEIADESHRNVEILIPEEVNFLVEKIERYRKELQ
N

The query sequence (length=161) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6nak:D 165 161 1.0000 0.9758 1.0000 1.23e-115 6n9a:E, 6nak:E, 6s84:E, 6s84:B
2 5np9:A 152 156 0.3106 0.3289 0.3205 1.67e-23 5mvr:A
3 1htw:A 158 128 0.3230 0.3291 0.4062 1.24e-19 1htw:B, 1htw:C
4 8hra:C 852 55 0.0994 0.0188 0.2909 0.043 8hr8:A, 8hr8:C, 8hr8:F, 8hr8:H, 8hr9:A, 8hr9:C, 8hr9:F, 8hr9:H, 8hr9:I, 8hr9:J, 8hr9:M, 8hr9:O, 8hra:D, 8hra:E, 8hra:H, 8hra:A, 8hra:B, 8hra:G, 8hrb:D, 8hrb:E, 8hrb:C, 8hrb:H, 8hrb:A, 8hrb:B, 8hrb:M, 8hrb:P, 8hrb:L, 8hrb:R, 8hrb:F, 8hrb:K, 8hrb:Q, 8hrb:G
5 5d4w:A 688 42 0.1056 0.0247 0.4048 0.096 5d4w:B, 5d4w:C, 5zui:A
6 6z4w:A 230 49 0.0807 0.0565 0.2653 0.11 6z63:A, 6z63:B, 6z63:C, 6z67:C, 6z67:B, 6z67:E
7 2xsz:E 315 45 0.0932 0.0476 0.3333 0.12 6fo1:D, 6fo1:E, 6fo1:F, 6k0r:D, 6k0r:E, 6k0r:F, 6k0r:J, 6k0r:K, 6k0r:L, 6qi8:D, 3uk6:A, 3uk6:D, 3uk6:E, 3uk6:F, 3uk6:H, 3uk6:I, 3uk6:J, 3uk6:K, 2xsz:D, 2xsz:F
8 9emc:F 337 45 0.0932 0.0445 0.3333 0.13 9ema:D, 9ema:E, 9ema:F, 9emc:D, 9emc:E, 6qi8:E, 6qi8:F, 6qi9:E, 6qi9:F, 3uk6:B, 3uk6:C, 3uk6:G
9 6bge:A 323 54 0.0994 0.0495 0.2963 0.14 6bge:B, 1g6o:A, 1g6o:B, 1nly:A, 1nly:B
10 6hyp:A 2272 40 0.0870 0.0062 0.3500 0.15
11 9c57:B 389 45 0.0932 0.0386 0.3333 0.16 6h7x:A
12 8w6i:D 219 45 0.0932 0.0685 0.3333 0.17 8hd0:A, 8hd0:B, 8w6i:B, 8w6j:B, 8w6j:D, 8x61:A, 8x61:B, 8y3x:A, 8y3x:B
13 7zi4:D 439 45 0.0932 0.0342 0.3333 0.17 9c57:D, 9c57:F, 9c62:D, 9c62:F, 6hts:B, 6hts:D, 6hts:F, 5oaf:B, 7ole:B, 7ole:D, 7ole:F, 8x15:P, 8x15:R, 8x19:P, 8x19:R, 8x1c:N, 8x1c:P, 8x1c:R, 8xvg:D, 8xvg:F, 8xvt:D, 8xvt:F, 7zi4:B, 7zi4:F
14 5oaf:D 411 45 0.0932 0.0365 0.3333 0.17 9c62:B, 5oaf:F, 8x15:N, 8x19:N, 8xvg:B, 8xvt:B
15 5jcs:s 2003 40 0.0870 0.0070 0.3500 0.19
16 8j5f:A 238 40 0.0994 0.0672 0.4000 0.19 8j5e:A, 8j5g:A, 8j5h:A
17 3m6a:A 496 52 0.1180 0.0383 0.3654 0.23 3m6a:B, 3m6a:C, 3m6a:D, 3m6a:E, 3m6a:F
18 6qex:A 1182 60 0.1304 0.0178 0.3500 0.26 7a65:A, 7a69:A, 7a6c:A, 7a6e:A, 7a6f:A, 6c0v:A, 7o9w:A
19 7vex:A 412 68 0.1242 0.0485 0.2941 0.27 8h4m:A
20 7jlv:A 437 39 0.0932 0.0343 0.3846 0.35 7jlv:B, 7jlv:D, 7jlv:G
21 8hr8:G 830 51 0.1056 0.0205 0.3333 0.37 8hr9:G, 8hr9:N
22 7c3k:B 389 87 0.1491 0.0617 0.2759 0.40 7c3k:A, 8jqz:A, 8jqz:B
23 8cas:k 579 59 0.1118 0.0311 0.3051 0.42 5ll6:h, 6zce:k, 6zu9:k
24 6ltb:A 928 57 0.1056 0.0183 0.2982 0.67 6ltc:A, 6ltd:A, 6ltd:B
25 8a8w:F 552 42 0.0932 0.0272 0.3571 0.77 8a8u:F, 8a8v:F
26 8dgf:A 1541 37 0.0870 0.0091 0.3784 0.82 8dgf:B, 8dgf:C, 8dgf:D
27 2a2z:B 221 39 0.0807 0.0588 0.3333 0.96 2a2z:D, 2a30:B, 2a30:D, 3mjr:D, 2zi5:A, 2zi5:C, 2zi5:D, 2zi6:A, 2zi6:C, 2zi6:D, 2zi7:B, 2zi7:A, 2zia:A, 2zia:B
28 8xoo:O 572 42 0.0932 0.0262 0.3571 0.98
29 8xon:O 593 42 0.0932 0.0253 0.3571 1.1 8xon:S, 8xon:R, 8xon:Q, 8xon:P, 8xon:T, 8xoo:R, 8xoo:Q, 8xoo:P, 8xoo:T, 8xoo:S
30 8a8w:D 577 42 0.0932 0.0260 0.3571 1.2 8a8u:B, 8a8u:C, 8a8u:D, 8a8u:E, 8a8u:A, 8a8v:B, 8a8v:C, 8a8v:D, 8a8v:E, 8a8v:A, 8a8w:A, 8a8w:B, 8a8w:C, 8a8w:E
31 9c4o:A 661 38 0.0870 0.0212 0.3684 1.2 6v81:A
32 2no0:A 242 39 0.0807 0.0537 0.3333 1.4 2a2z:A, 2a2z:C, 2a30:A, 2a30:C, 2a7q:A, 3hp1:A, 3ipx:A, 3ipy:A, 3ipy:B, 4jlj:A, 4jlj:B, 4jlk:A, 4jlk:B, 4jlm:A, 4jlm:B, 4jln:A, 4jln:B, 4kcg:A, 4kcg:B, 3kfx:A, 3kfx:B, 4l5b:A, 4l5b:B, 3mjr:A, 3mjr:B, 3mjr:C, 5mqj:A, 5mqj:B, 5mqj:C, 5mqj:D, 5mql:A, 5mql:B, 5mql:C, 5mql:D, 5mqt:A, 5mqt:B, 5mqt:C, 5mqt:D, 2no0:B, 2no1:A, 2no1:B, 2no6:A, 2no6:B, 2no7:A, 2no7:B, 2no9:A, 2no9:B, 2noa:A, 2noa:B, 8ooj:A, 8ooj:B, 8ooj:C, 8ooj:D, 1p5z:B, 1p60:A, 1p60:B, 1p61:B, 1p62:B, 4q18:A, 4q18:B, 4q19:A, 4q19:B, 4q1a:A, 4q1a:B, 4q1b:A, 4q1b:B, 4q1c:A, 4q1c:B, 4q1d:A, 4q1d:B, 4q1e:A, 4q1e:B, 4q1f:A, 4q1f:B, 3qej:A, 3qej:B, 3qen:A, 3qen:B, 3qeo:A, 3qeo:B, 2qrn:A, 2qrn:B, 2qrn:C, 2qrn:D, 2qro:A, 2qro:B, 2qro:C, 2qro:D, 2zi3:A, 2zi3:B, 2zi4:A, 2zi5:B, 2zi6:B, 2zi9:A, 2zi9:B, 7zi1:A, 7zi2:A, 7zi3:A, 7zi5:A, 7zi6:A, 7zi7:A, 7zi8:A, 7zi9:A, 7zia:A, 7zib:A
33 7swl:E 480 64 0.1242 0.0417 0.3125 1.4
34 5fhd:B 400 33 0.0870 0.0350 0.4242 1.6
35 5ftc:A 431 33 0.0870 0.0325 0.4242 1.7 5fhd:A, 5fhe:A, 5fhf:A, 5ftb:A, 5fte:A, 5ftf:A, 6l3g:A, 6l3g:B
36 8e2l:C 461 142 0.2236 0.0781 0.2535 1.9 8e2l:A, 8e2l:B, 8e2l:D, 8e2l:E, 8e2l:F
37 1cr1:A 245 25 0.0683 0.0449 0.4400 2.1 1cr2:A, 1cr4:A
38 7eaw:A 560 65 0.1118 0.0321 0.2769 2.1 7eaw:B
39 6n9x:B 500 21 0.0621 0.0200 0.4762 2.2 1e0j:A, 1e0j:B, 1e0j:C, 1e0j:D, 1e0j:E, 1e0j:F, 6n7i:A, 6n7i:B, 6n7i:C, 6n7i:D, 6n7i:E, 6n7n:A, 6n7n:B, 6n7n:C, 6n7n:D, 6n7n:E, 6n7n:F, 6n7s:A, 6n7s:B, 6n7s:C, 6n7s:D, 6n7s:E, 6n7t:A, 6n7t:B, 6n7t:C, 6n7t:D, 6n7t:E, 6n7t:F, 6n7v:A, 6n7v:B, 6n7v:C, 6n7v:D, 6n7v:E, 6n7v:F, 6n9u:E, 6n9v:A, 6n9v:B, 6n9v:C, 6n9v:D, 6n9v:E, 6n9v:F, 6n9w:A, 6n9w:B, 6n9w:C, 6n9w:D, 6n9w:E, 6n9x:A, 6n9x:C, 6n9x:D, 6n9x:E
40 6quz:D 574 58 0.1118 0.0314 0.3103 2.2 6quz:B, 6qv0:B, 6qv0:D, 6qv1:B, 6qv1:D, 6qv2:B, 6qv2:D
41 7met:B 455 27 0.0745 0.0264 0.4444 2.3
42 4m1m:A 1188 48 0.1118 0.0152 0.3750 2.4 8avy:A, 6fn1:A, 3g60:A, 3g60:B, 3g61:A, 3g61:B, 5koy:A, 5koy:B, 4m1m:B, 4m2s:A, 4m2s:B, 4m2t:A, 4m2t:B, 7otg:A, 8pee:A, 6q81:A, 4q9i:A, 4q9j:A, 4q9k:A, 4q9l:A, 6qee:A, 6ujn:A, 6ujp:A, 6ujr:A, 6ujs:A, 6ujt:A, 6ujw:A, 4xwk:A, 7zk4:A, 7zk5:A, 7zk6:A, 7zk7:A, 7zk8:A, 7zk9:A, 7zka:A, 7zkb:A
43 8fgw:A 1081 47 0.1118 0.0167 0.3830 2.4
44 1vci:A 353 52 0.1180 0.0538 0.3654 2.5
45 7nhl:0 465 28 0.0621 0.0215 0.3571 2.6
46 9csi:A 569 32 0.0807 0.0228 0.4062 2.8 8gk7:A, 8gk7:B, 7met:A
47 4nmn:A 425 35 0.0745 0.0282 0.3429 2.9 4nmn:B
48 6mat:A 578 64 0.1242 0.0346 0.3125 3.0 6mat:C, 6mat:E, 6mat:B, 6mat:D, 6mat:F, 7swl:A, 7swl:B, 7swl:C, 7swl:D, 7t0v:A, 7t0v:B, 7t0v:C, 7t0v:D, 7t0v:E, 7t0v:F, 7t3i:A, 7t3i:B, 7t3i:C, 7t3i:E, 7t3i:D
49 3tr0:A 201 26 0.0559 0.0448 0.3462 3.0
50 2v1u:A 382 42 0.0932 0.0393 0.3571 3.1
51 8f4b:A 1182 39 0.0870 0.0118 0.3590 3.2
52 4oko:A 290 46 0.0932 0.0517 0.3261 3.2 4oko:B, 4oko:C, 4oko:D
53 6bhu:A 1328 39 0.0870 0.0105 0.3590 3.3 5uja:A, 6uy0:A
54 8tzj:A 220 29 0.0870 0.0636 0.4828 3.3 8tzj:B, 8tzk:A, 8tzk:B, 8tzl:A, 8tzl:B
55 7o12:B 298 40 0.1118 0.0604 0.4500 3.5 7o12:C, 7o17:B, 7o17:C, 7qba:B, 7qba:C
56 8pts:A 195 26 0.0683 0.0564 0.4231 3.6 8pts:B
57 4wyd:A 430 28 0.0745 0.0279 0.4286 4.0 3bv0:A, 3bv0:B, 4cxq:A, 4cxq:B, 4cxr:A, 4cxr:B, 6ge8:A, 6ge8:B, 5kgs:A, 5kgs:B, 5kgt:A, 5kgt:B, 3lv2:A, 3lv2:B, 4mqp:A, 4mqp:B, 4mqq:A, 4mqq:B, 4mqr:A, 4mqr:B, 5te2:B, 5te2:A, 3tft:A, 3tft:B, 3tfu:A, 3tfu:B, 4w1v:A, 4w1v:B, 4w1w:A, 4w1w:B, 4w1x:A, 4w1x:B, 4wya:A, 4wya:B, 4wya:C, 4wya:D, 4wyc:A, 4wyc:B, 4wyd:B, 4wye:A, 4wye:B, 4wyf:A, 4wyf:B, 4wyg:A, 4wyg:B, 4xew:A, 4xew:B, 4xjl:A, 4xjl:B, 4xjm:A, 4xjm:B, 4xjo:A, 4xjo:B, 4xjp:A, 4xjp:B
58 8rq4:A 1402 40 0.0870 0.0100 0.3500 4.2
59 1qvr:A 803 42 0.0932 0.0187 0.3571 4.3 4fcv:A, 4fcv:B, 4fcv:C, 4fcw:A, 4fcw:C, 4fcw:F, 4fd2:A, 4fd2:B, 4fd2:D, 4lj5:A, 4lj6:A, 4lj7:A, 4lj7:B, 4lj7:C, 4lj8:A, 4lj9:A, 4lja:A, 1qvr:B, 1qvr:C
60 5t05:B 677 49 0.0994 0.0236 0.3265 4.6 5t03:A, 5t03:B, 5t05:A, 5t0a:A, 5t0a:B
61 4twb:A 278 80 0.1429 0.0827 0.2875 4.9 4twb:B, 4twb:C, 4twb:D, 4twb:E, 4twb:F
62 6tmf:d 582 46 0.0994 0.0275 0.3478 5.2 3ozx:A, 3ozx:B
63 4hse:A 369 42 0.0932 0.0407 0.3571 5.2
64 7z15:K 224 25 0.0559 0.0402 0.3600 5.2 7z15:L
65 3c41:J 242 25 0.0621 0.0413 0.4000 5.3 3c41:K, 3c4j:A, 3c4j:B, 2olj:A, 2olj:B, 2olk:A, 2olk:B, 2olk:C, 2olk:D, 2q0h:A, 2q0h:B
66 4xgu:B 382 52 0.0994 0.0419 0.3077 5.4 4xgu:E
67 7z6h:K 439 93 0.1553 0.0569 0.2688 5.4
68 3gp8:A 551 52 0.1118 0.0327 0.3462 5.5 3gpl:A, 3gpl:B
69 7jgr:A 401 44 0.0870 0.0349 0.3182 5.5 7jgs:A, 7jk2:A, 7jk3:A, 7jk4:A, 7jk5:A, 7jk6:A
70 4ymu:J 240 46 0.1056 0.0708 0.3696 5.8 4ymu:A, 4ymv:J, 4ymv:A
71 6lt4:A 623 41 0.0807 0.0209 0.3171 5.8 6lt4:B, 6lt4:C, 6lt4:D, 6lt4:E, 6lt4:F, 6lt4:G, 6lt4:H, 6lt4:I, 6lt4:J, 6lt4:K, 6lt4:L, 6lt4:M, 6lt4:N
72 6w6j:D 707 42 0.0807 0.0184 0.3095 6.2 6dju:D, 6dju:E, 6djv:D, 6djv:E, 6djv:F, 7l6n:D, 7l6n:E, 7l6n:F, 6w6e:D, 6w6e:E, 6w6e:F, 6w6g:D, 6w6g:E, 6w6h:D, 6w6h:E, 6w6i:D, 6w6i:E, 6w6j:E
73 3ndb:B 420 71 0.1429 0.0548 0.3239 6.3 2v3c:C, 2v3c:D, 4xco:D
74 8t3k:C 541 30 0.0621 0.0185 0.3333 6.7
75 8fhk:C 574 27 0.0621 0.0174 0.3704 6.8 8fmv:C, 8fpf:C, 7m33:C, 8szc:C, 8t1p:C
76 8xku:B 845 35 0.0807 0.0154 0.3714 7.4 8xkv:B
77 6w6i:F 605 42 0.0807 0.0215 0.3095 7.5 6w6j:F
78 6e10:1 719 21 0.0683 0.0153 0.5238 7.5 6e10:2, 6e10:3, 6e10:4, 6e10:5, 6e10:6, 6e11:1, 6e11:3, 6e11:2, 6e11:4, 6e11:5, 6e11:6
79 6oay:F 558 42 0.0870 0.0251 0.3333 7.8 6og2:F
80 6dju:F 531 42 0.0807 0.0245 0.3095 8.0 6w6g:F
81 8egl:C 203 46 0.0932 0.0739 0.3261 8.1 8egl:A, 8egl:B, 8egl:D, 8egl:E, 8egl:F, 8egl:G, 8egl:H, 8egl:I, 8egl:J, 8egl:K, 8egl:L, 7u5f:A, 7u5f:B, 7u5f:C, 7u5f:D
82 6qs4:C 630 42 0.0870 0.0222 0.3333 8.1 5og1:C, 5og1:D, 6qs4:D, 6qs4:E, 6qs6:C, 6qs6:D, 6qs7:C, 6qs7:D, 6qs7:E, 6qs8:C, 6qs8:D, 6qs8:E
83 7nhn:0 461 27 0.0745 0.0260 0.4444 8.2
84 4ciu:A 657 42 0.0870 0.0213 0.3333 8.6
85 7w02:A 1566 44 0.0932 0.0096 0.3409 8.9
86 6jbj:A 565 32 0.0683 0.0195 0.3438 9.0 6jbj:B
87 6rn4:F 680 42 0.0870 0.0206 0.3333 9.0 6rn3:F, 6rn4:A
88 7l6n:C 675 42 0.0807 0.0193 0.3095 9.1 7l6n:A, 7l6n:B, 6w6e:A
89 5og1:A 819 42 0.0870 0.0171 0.3333 9.1 5ofo:C, 5ofo:F, 5ofo:E, 5ofo:D, 5ofo:B, 5ofo:A, 5og1:E, 6rn2:A, 6rn2:B, 6rn2:C, 6rn2:D, 6rn2:F, 6rn2:E, 6rn3:A, 6rn3:B, 6rn3:C, 6rn3:D, 6rn3:E, 6rn4:B, 6rn4:C, 6rn4:D, 6rn4:E
90 6w6h:C 636 42 0.0807 0.0204 0.3095 9.3 6w6e:B, 6w6e:C, 6w6g:A, 6w6g:B, 6w6g:C, 6w6h:A, 6w6h:B, 6w6h:F, 6w6i:A, 6w6i:B, 6w6i:C, 6w6j:A, 6w6j:B, 6w6j:C
91 3bk7:A 593 22 0.0745 0.0202 0.5455 9.4 3j15:B, 5lw7:B, 1yqt:A, 5yv5:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218