Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KMLYDLAKKRKTVRRFKKEKPPLEDLIYSLKVANEAPSGMNAQPWRFLIVEDEKLKGQIRRVCERSEKTFYENVRGRLKE
WLDEKRFTWRKPFLKEAPYLLLVFSEKSAPYSRESVWLAVGYLLLALEEKGLGSVPYTPPDFREVEKLVNTPSELRLEVI
LPVGYPDDPKPKYPRNEVIVRYNTF

The query sequence (length=185) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6pz0:A 185 185 1.0000 1.0000 1.0000 1.48e-132 6pz0:B, 6q1b:A, 6q1b:B, 6q1l:A, 6q1l:B, 6tyk:A, 6tyk:B
2 5ko8:B 218 179 0.3405 0.2890 0.3520 3.91e-32 5ko7:A, 5ko8:A, 5krd:A, 5krd:B
3 5ko7:B 200 175 0.3081 0.2850 0.3257 5.98e-27
4 4ttc:A 220 179 0.3297 0.2773 0.3408 2.44e-23 4ttc:B, 4ttc:C, 4ttc:D, 4ttc:E, 4ttc:F, 5yak:A, 5yak:F, 5yak:B, 5yak:C, 5yak:D, 5yak:E
5 4ttb:A 189 166 0.2973 0.2910 0.3313 3.41e-21 4ttb:B
6 3gb5:A 185 165 0.2919 0.2919 0.3273 5.49e-18 3to0:A, 3to0:B
7 3tnz:A 222 179 0.3514 0.2928 0.3631 1.89e-16 3gfd:A, 3gfd:B, 3gh8:A, 3gh8:B, 3gh8:C, 3gh8:D, 3gh8:E, 3gh8:F, 3gh8:G, 3gh8:H, 3tnz:B
8 8cqt:B 164 183 0.2865 0.3232 0.2896 3.44e-15 8cqt:A
9 4dn2:A 191 188 0.3135 0.3037 0.3085 2.20e-14 4dn2:B
10 4eo3:A 321 167 0.2703 0.1558 0.2994 3.37e-12 4eo3:B
11 3gfa:A 197 193 0.2649 0.2487 0.2539 2.48e-11 3gfa:B
12 5j6c:A 173 196 0.2865 0.3064 0.2704 2.31e-10 5j6c:B
13 4g8s:A 182 166 0.2595 0.2637 0.2892 2.59e-10 4g8s:B
14 5j62:B 209 153 0.2162 0.1914 0.2614 5.22e-10 5j62:A
15 3eo8:A 219 203 0.2757 0.2329 0.2512 2.99e-09 3eo8:B, 3eo8:C, 3eo8:D, 3eo8:E, 3eo8:F
16 2b67:A 201 198 0.2486 0.2289 0.2323 1.67e-08 2b67:B, 2b67:C, 2b67:D
17 3ge5:A 176 188 0.2324 0.2443 0.2287 4.39e-08 3ge5:B
18 3e10:B 167 181 0.2216 0.2455 0.2265 1.91e-05 3e10:A
19 3kwk:A 168 200 0.2811 0.3095 0.2600 2.51e-05
20 3m5k:A 168 183 0.2757 0.3036 0.2787 2.77e-05 3m5k:B
21 3e39:A 175 166 0.2216 0.2343 0.2470 3.08e-05 3e39:B
22 3ek3:A 187 165 0.1946 0.1925 0.2182 3.13e-05
23 3koq:A 173 191 0.2649 0.2832 0.2565 4.64e-05 3h4o:A, 3koq:B, 3koq:C, 3koq:D
24 1nox:A 200 57 0.1189 0.1100 0.3860 7.00e-05
25 3gag:A 206 172 0.2378 0.2136 0.2558 1.60e-04 3gag:B, 3gag:C, 3gag:D
26 3ge6:A 210 56 0.1027 0.0905 0.3393 2.33e-04 3ge6:B
27 3qdl:A 178 147 0.1838 0.1910 0.2313 3.38e-04 3qdl:B, 3qdl:C, 3qdl:D
28 3gr3:A 226 204 0.2324 0.1903 0.2108 3.58e-04 3gr3:B
29 2hay:D 222 108 0.1514 0.1261 0.2593 4.42e-04 2hay:A, 2hay:B, 2hay:C
30 8dor:A 217 213 0.2378 0.2028 0.2066 0.001 8dor:B, 8dor:C, 8dor:D
31 3pxv:B 189 80 0.1351 0.1323 0.3125 0.001 3pxv:A, 3pxv:C, 3pxv:D
32 3gbh:B 213 52 0.0973 0.0845 0.3462 0.001 3gbh:A, 3gbh:C, 3gbh:D
33 2wzv:B 223 45 0.0919 0.0762 0.3778 0.003 2wzv:A, 2wzw:A, 2wzw:B
34 6wt2:A 221 54 0.0811 0.0679 0.2778 0.008 6wt2:B, 6wt2:C, 6wt2:D
35 7tmf:B 183 49 0.0919 0.0929 0.3469 0.012 7tmf:A, 7tmg:A, 7tmg:B
36 1v5y:A 217 60 0.0919 0.0783 0.2833 0.015 1v5y:B, 1v5z:A, 1v5z:B, 1vfr:A, 1vfr:B
37 2fre:A 200 39 0.0919 0.0850 0.4359 0.026 2fre:B
38 7jh4:A 223 203 0.1892 0.1570 0.1724 0.030 7jh4:B, 7jh4:C, 7jh4:D, 7jh4:E
39 2isj:A 219 178 0.2054 0.1735 0.2135 0.037 2isj:B, 2isj:C, 2isj:D, 2isj:E, 2isj:F, 2isj:G, 2isj:H, 2isk:A, 2isk:B, 2isk:C, 2isk:D, 2isk:E, 2isk:F, 2isk:G, 2isk:H, 2isl:A, 2isl:B, 2isl:C, 2isl:D, 2isl:E, 2isl:F, 2isl:G, 2isl:H
40 7dp0:A 223 58 0.0973 0.0807 0.3103 0.038 7dp0:B, 7dp1:A, 7dp1:B, 7dp2:A, 7dp2:B
41 8qyg:B 225 206 0.2162 0.1778 0.1942 0.051 8q5g:A, 8q5g:B, 8qyg:A
42 6czp:A 219 211 0.2703 0.2283 0.2370 0.070 6czp:B, 6czp:C, 6czp:D, 6czp:E, 6czp:F, 6czp:G, 6czp:H, 7uwt:A, 7uwt:B
43 3bm1:A 177 49 0.0811 0.0847 0.3061 0.079 3bm1:B
44 1zch:A 249 178 0.2054 0.1526 0.2135 0.10
45 5j8d:A 216 164 0.2054 0.1759 0.2317 0.11 5j8d:B, 5j8d:C, 5j8d:D, 5j8g:A, 5j8g:B, 5j8g:C, 5j8g:D, 1kqb:A, 1kqb:B, 1kqb:C, 1kqb:D, 1kqc:A, 1kqc:B, 1kqc:C, 1kqc:D, 1kqd:A, 1kqd:B, 1kqd:C, 1kqd:D, 1nec:A, 1nec:B, 1nec:C, 1nec:D
46 8dil:A 175 49 0.0811 0.0857 0.3061 0.14 8dil:B, 8dil:C, 8dil:D, 8dil:E, 8dil:F
47 4qlx:A 217 60 0.0973 0.0829 0.3000 0.15 4qlx:B, 4qly:A, 4qly:B, 4qly:C, 4qly:D
48 2ymv:A 327 48 0.1027 0.0581 0.3958 0.19
49 5hei:A 246 180 0.2162 0.1626 0.2222 0.28 5hei:B, 5hei:C, 5hei:D, 5hei:E, 5hei:F, 5hei:G, 5hei:H
50 7s14:B 223 57 0.0757 0.0628 0.2456 0.28 7ldq:A, 7rzl:A, 7rzl:B, 7rzp:A, 7rzp:B, 7s14:A, 7s14:C, 7s14:D, 7s1a:A, 7s1a:B, 7t2z:A, 7t2z:B, 7t33:A, 7t33:B
51 1ds7:A 217 62 0.0973 0.0829 0.2903 0.29 8c5e:A, 8c5e:B, 8c5f:A, 8c5f:B, 8c5p:A, 8c5p:B, 8ccv:A, 8ccv:B, 8cj0:A, 8cj0:B, 1ds7:B, 1icr:A, 1icr:B, 1icu:A, 1icu:B, 1icu:C, 1icu:D, 1icv:A, 1icv:B, 1icv:C, 1icv:D, 1idt:A, 1idt:B, 8og3:A, 8og3:B, 1oo5:A, 1oo5:B, 1oo6:A, 1oo6:B, 1oon:A, 1oon:B, 1ooq:A, 1ooq:B, 8qes:A, 8qes:C, 8qes:B, 8qes:D, 8qpo:A, 8qpo:B, 8qpo:C, 8qpo:G, 8qpo:D, 8qpo:E, 8qpo:F, 8qpo:H, 3x21:A, 3x21:B, 3x21:C, 3x21:D, 3x21:E, 3x21:F, 3x21:G, 3x21:H, 3x21:I, 3x21:J, 3x22:A, 3x22:B, 7x32:A, 7x32:C, 7x32:B, 7x32:H, 7x32:D, 7x32:F, 7x32:E, 7x32:G, 7xww:B, 7xww:A, 7xww:H, 7xww:I, 1yki:A, 1yki:B, 1yki:C, 1yki:D, 1ylr:A, 1ylr:B, 1ylu:A, 1ylu:B
52 4xoq:A 204 177 0.2054 0.1863 0.2147 0.60 4xoo:A, 4xoo:B, 4xoo:C, 4xoo:D, 4xoq:B, 4xoq:C, 4xoq:D
53 8uc3:A 180 49 0.0865 0.0889 0.3265 0.79 8uc3:B
54 1ywq:A 199 180 0.2270 0.2111 0.2333 0.83
55 9ay7:B 322 81 0.1189 0.0683 0.2716 2.2 4an2:A, 4an3:A, 4an9:A, 4anb:A, 4ark:A, 9axa:B, 9axa:D, 9axc:B, 9axc:D, 9axh:A, 9axh:B, 9axm:A, 9axm:C, 9axx:A, 9axx:C, 9axy:B, 9aya:B, 7b3m:A, 7b3m:B, 7b7r:B, 7b94:B, 7b9l:B, 5bx0:A, 8dgs:B, 8dgt:B, 3dv3:A, 3dy7:A, 3e8n:A, 3eqb:A, 3eqc:A, 3eqd:A, 3eqf:A, 3eqg:A, 3eqh:A, 3eqi:A, 7f2x:A, 5hze:A, 7juq:C, 7jur:C, 7jus:C, 7jut:C, 7juu:C, 7juv:C, 7juw:C, 7jux:C, 7juy:C, 7juz:C, 7jv0:C, 7jv1:C, 4lmn:A, 7m0t:B, 7m0u:B, 7m0v:B, 7m0w:B, 7m0x:B, 7m0y:B, 7m0z:B, 3mbl:A, 7mfd:B, 4mne:A, 4mne:D, 4mne:E, 4mne:H, 6nyb:B, 3orn:A, 3os3:A, 2p55:A, 3pp1:A, 6pp9:B, 7pqv:A, 6q0j:C, 6q0j:D, 6q0t:C, 1s9j:A, 3sls:B, 6u2g:A, 4u7z:A, 4u80:A, 4u81:A, 7umb:C, 3v01:A, 3v04:A, 6v2w:B, 3vvh:A, 3vvh:B, 3vvh:C, 3w8q:A, 3wig:A, 7xlp:A, 7xnc:A, 2y4i:C, 5yt3:A, 5yt3:B, 5yt3:D, 3zls:A, 3zlw:A, 3zlx:A, 3zly:A, 3zm4:A
56 5yt3:C 288 87 0.1243 0.0799 0.2644 2.5
57 2i7h:A 187 175 0.2162 0.2139 0.2286 4.7 2i7h:B, 2i7h:C, 2i7h:D
58 4ijd:A 215 63 0.1027 0.0884 0.3016 5.3 4ijd:B, 6nm4:A, 6nm4:B
59 7y0a:C 387 47 0.0811 0.0388 0.3191 7.4 1jqi:A, 1jqi:B, 8sgs:A, 8sgs:B, 8sgs:C, 8sgs:D, 2vig:A, 2vig:B, 2vig:C, 2vig:D, 2vig:E, 2vig:F, 2vig:G, 2vig:H, 7y0a:A, 7y0a:B, 7y0a:D, 7y0b:A, 7y0b:B, 7y0b:C, 7y0b:D
60 6hg1:A 371 55 0.0919 0.0458 0.3091 7.8 4by3:A, 4c6c:A, 4c6d:A, 4c6e:A, 4c6f:A, 4c6i:A, 4c6j:A, 4c6k:A, 4c6l:A, 4c6m:A, 4c6n:A, 4c6o:A, 4c6p:A, 4c6q:A, 8gvz:A, 8gw0:A, 6hfd:A, 6hfe:A, 6hff:A, 6hfh:A, 6hfi:A, 6hfj:A, 6hfk:A, 6hfl:A, 6hfn:A, 6hfp:A, 6hfq:A, 6hfr:A, 6hfs:A, 6hfu:A, 6hg2:A, 6hg3:A, 8pbe:A, 8pbg:A, 8pbh:A, 8pbi:A, 8pbj:A, 8pbk:A, 8pbm:A, 8pbn:A, 8pbp:A, 8pbq:A, 8pbr:A, 8pbs:A, 8pbt:A, 8pbu:A, 5ynz:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218