Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KLPVREFDAVVIGAGGAGMRAALQISQSGQTCALLSKVFPTRSHTVSAQGGITVALGNTHEDNWEWHMYDTVKGSDYIGD
QDAIEYMCKTGPEAILELEHMGLPFSRLDDGRIYQRPFGGQARTAAAADRTGHALLHTLYQQNLKNHTTIFSEWYALDLV
KNQDGAVVGCTALCIETGEVVYFKARATVLATGGAGRIYQSTTNAHINTGDGVGMAIRAGVPVQDMEMWQFHPPTCHYMM
GGIPTKVTGQALTVNEKGEDVVVPGLFAVGEIACVSVHGANRLGGNSLLDLVVFGRAAGLHLQESIAEQGALRDASESDV
EASLDRLNRWNNNRNGEDPVAIRKALQECMQHNFSVFREGDAMAKGLEQLKVIRERLKNARLDDTSSEFNTQRVECLELD
NLMETAYATAVSANFRTESRGAHSRFDFPDRDDENWLCHSLYLPESESMTRRSVNMEPKLRPAFPPKIRT

The query sequence (length=470) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7jz2:A 481 479 1.0000 0.9771 0.9812 0.0 7jz2:E, 7jz2:I, 6wu6:A, 6wu6:E, 6wu6:I
2 2acz:A 588 237 0.5043 0.4031 1.0000 2.05e-171 1nek:A, 1nen:A, 2wdq:A, 2wdq:E, 2wdq:I, 2wdr:A, 2wdr:E, 2wdr:I, 2wdv:A, 2wdv:E, 2wdv:I, 2wp9:A, 2wp9:E, 2wp9:I, 2ws3:A, 2ws3:E, 2ws3:I, 2wu2:A, 2wu2:E, 2wu2:I, 2wu5:A, 2wu5:E, 2wu5:I
3 2acz:A 588 242 0.4957 0.3963 0.9628 3.17e-167 1nek:A, 1nen:A, 2wdq:A, 2wdq:E, 2wdq:I, 2wdr:A, 2wdr:E, 2wdr:I, 2wdv:A, 2wdv:E, 2wdv:I, 2wp9:A, 2wp9:E, 2wp9:I, 2ws3:A, 2ws3:E, 2ws3:I, 2wu2:A, 2wu2:E, 2wu2:I, 2wu5:A, 2wu5:E, 2wu5:I
4 6c12:B 537 233 0.4957 0.4339 1.0000 5.30e-169 6c12:A
5 6c12:B 537 233 0.4170 0.3650 0.8412 4.21e-132 6c12:A
6 6awf:E 487 453 0.3851 0.3717 0.3996 2.28e-94
7 3cir:M 504 475 0.3851 0.3591 0.3811 1.17e-90
8 8gs8:A 614 266 0.3085 0.2362 0.5451 7.01e-79 3abv:A, 3ae1:A, 3ae2:A, 3ae3:A, 3ae4:A, 3ae5:A, 3ae6:A, 3ae7:A, 3ae8:A, 3ae9:A, 3aea:A, 3aeb:A, 3aec:A, 3aed:A, 3aee:A, 3aef:A, 3aeg:A, 8dyd:A, 8dye:A, 2fbw:A, 2fbw:N, 2h88:A, 2h88:N, 2h89:A, 6myo:A, 6myp:A, 6myq:A, 6myr:A, 6mys:A, 6myt:A, 6myu:A, 3sfd:A, 3sfe:A, 6vax:A, 6vax:C, 2wqy:A, 2wqy:N, 1yq3:A, 1yq4:A, 4ytp:A, 4yxd:A, 1zoy:A, 1zp0:A
9 8gs8:A 614 201 0.1872 0.1433 0.4378 4.26e-40 3abv:A, 3ae1:A, 3ae2:A, 3ae3:A, 3ae4:A, 3ae5:A, 3ae6:A, 3ae7:A, 3ae8:A, 3ae9:A, 3aea:A, 3aeb:A, 3aec:A, 3aed:A, 3aee:A, 3aef:A, 3aeg:A, 8dyd:A, 8dye:A, 2fbw:A, 2fbw:N, 2h88:A, 2h88:N, 2h89:A, 6myo:A, 6myp:A, 6myq:A, 6myr:A, 6mys:A, 6myt:A, 6myu:A, 3sfd:A, 3sfe:A, 6vax:A, 6vax:C, 2wqy:A, 2wqy:N, 1yq3:A, 1yq4:A, 4ytp:A, 4yxd:A, 1zoy:A, 1zp0:A
10 5c2t:A 616 265 0.2830 0.2159 0.5019 7.72e-76 5c2t:E, 5c3j:A, 5c3j:E, 3vr8:A, 3vr8:E, 3vr9:A, 3vr9:E, 3vra:A, 3vra:E, 3vrb:A, 3vrb:E, 4ysx:A, 4ysx:E, 4ysy:A, 4ysy:E, 4ysz:A, 4ysz:E, 4yt0:A, 4yt0:E, 4ytm:A, 4ytm:E, 4ytn:A, 4ytn:E
11 5c2t:A 616 202 0.1957 0.1494 0.4554 3.09e-46 5c2t:E, 5c3j:A, 5c3j:E, 3vr8:A, 3vr8:E, 3vr9:A, 3vr9:E, 3vra:A, 3vra:E, 3vrb:A, 3vrb:E, 4ysx:A, 4ysx:E, 4ysy:A, 4ysy:E, 4ysz:A, 4ysz:E, 4yt0:A, 4yt0:E, 4ytm:A, 4ytm:E, 4ytn:A, 4ytn:E
12 8b6g:CA 599 237 0.2702 0.2120 0.5359 2.40e-75 8bqs:CA, 8gym:sa, 8gym:SA, 8gzu:sa, 8gzu:SA
13 8b6g:CA 599 208 0.1957 0.1536 0.4423 1.81e-43 8bqs:CA, 8gym:sa, 8gym:SA, 8gzu:sa, 8gzu:SA
14 6lum:A 539 239 0.2617 0.2282 0.5146 2.86e-70 6lum:J, 6lum:P
15 6lum:A 539 249 0.2085 0.1818 0.3936 2.96e-47 6lum:J, 6lum:P
16 3cir:A 541 245 0.2213 0.1922 0.4245 7.18e-49
17 3cir:A 541 221 0.1851 0.1608 0.3937 1.30e-35
18 5vpn:E 585 204 0.2000 0.1607 0.4608 5.48e-48 6awf:A, 2b76:A, 2b76:M, 1kf6:A, 1kf6:M, 1kfy:A, 1kfy:M, 4kx6:A, 4kx6:M, 1l0v:A, 1l0v:M, 3p4p:A, 3p4p:M, 3p4q:A, 3p4q:M, 3p4r:A, 3p4r:M, 3p4s:A, 3p4s:M, 5vpn:A
19 5vpn:E 585 221 0.1851 0.1487 0.3937 1.87e-35 6awf:A, 2b76:A, 2b76:M, 1kf6:A, 1kf6:M, 1kfy:A, 1kfy:M, 4kx6:A, 4kx6:M, 1l0v:A, 1l0v:M, 3p4p:A, 3p4p:M, 3p4q:A, 3p4q:M, 3p4r:A, 3p4r:M, 3p4s:A, 3p4s:M, 5vpn:A
20 7d6v:A 601 273 0.2021 0.1581 0.3480 5.06e-41 7d6x:A
21 7d6v:A 601 241 0.1638 0.1281 0.3195 2.66e-23 7d6x:A
22 2bs2:A 655 259 0.2021 0.1450 0.3668 5.03e-40 2bs2:D, 2bs3:A, 2bs3:D, 2bs4:A, 2bs4:D, 1e7p:A, 1e7p:D, 1e7p:G, 1e7p:J, 1qlb:A, 1qlb:D
23 2bs2:A 655 217 0.1553 0.1115 0.3364 1.71e-27 2bs2:D, 2bs3:A, 2bs3:D, 2bs4:A, 2bs4:D, 1e7p:A, 1e7p:D, 1e7p:G, 1e7p:J, 1qlb:A, 1qlb:D
24 5xmj:A 622 273 0.2149 0.1624 0.3700 1.56e-39 5xmj:E, 5xmj:I, 5xmj:M
25 5xmj:A 622 222 0.1660 0.1254 0.3514 1.11e-27 5xmj:E, 5xmj:I, 5xmj:M
26 6b58:C 544 202 0.1702 0.1471 0.3960 2.55e-37 6b58:A
27 6b58:C 544 221 0.1830 0.1581 0.3891 1.65e-33 6b58:A
28 1knp:A 529 256 0.1787 0.1588 0.3281 1.27e-21 1knr:A
29 1knp:A 529 202 0.1170 0.1040 0.2723 1.08e-11 1knr:A
30 2e5v:A 472 229 0.1362 0.1356 0.2795 4.84e-17 2e5v:B
31 2e5v:A 472 203 0.1255 0.1250 0.2906 1.75e-09 2e5v:B
32 5kxj:A 481 203 0.1149 0.1123 0.2660 6.84e-14
33 5kxj:A 481 242 0.1277 0.1247 0.2479 1.48e-11
34 1qo8:A 564 257 0.1489 0.1241 0.2724 2.06e-11 1qo8:D
35 1qo8:A 564 66 0.0681 0.0567 0.4848 4.24e-09 1qo8:D
36 5glg:A 471 65 0.0638 0.0637 0.4615 2.38e-10 6ku6:B, 6ku6:H, 5zyn:B
37 5glg:A 471 254 0.1319 0.1316 0.2441 0.002 6ku6:B, 6ku6:H, 5zyn:B
38 6t85:A 459 66 0.0638 0.0654 0.4545 8.64e-10 6t86:A, 6t87:A, 6t88:A
39 6t85:A 459 284 0.1574 0.1612 0.2606 9.11e-05 6t86:A, 6t87:A, 6t88:A
40 2b7r:A 568 66 0.0574 0.0475 0.4091 3.83e-09 2b7s:A, 1e39:A, 1jrx:A, 1jrx:B, 1jry:A, 1jry:B, 1jrz:A, 1jrz:B, 1kss:A, 1ksu:A, 1ksu:B, 1lj1:A, 1lj1:B, 1m64:A, 1m64:B, 1p2e:A, 1p2h:A, 1q9i:A, 1qjd:A, 1y0p:A
41 2b7r:A 568 276 0.1468 0.1215 0.2500 3.51e-05 2b7s:A, 1e39:A, 1jrx:A, 1jrx:B, 1jry:A, 1jry:B, 1jrz:A, 1jrz:B, 1kss:A, 1ksu:A, 1ksu:B, 1lj1:A, 1lj1:B, 1m64:A, 1m64:B, 1p2e:A, 1p2h:A, 1q9i:A, 1qjd:A, 1y0p:A
42 1d4c:A 570 278 0.1681 0.1386 0.2842 6.19e-07 1d4c:C, 1d4c:B, 1d4c:D, 1d4d:A, 1d4e:A
43 1d4c:A 570 66 0.0596 0.0491 0.4242 7.31e-07 1d4c:C, 1d4c:B, 1d4c:D, 1d4d:A, 1d4e:A
44 2fja:A 642 252 0.1362 0.0997 0.2540 7.10e-06 2fja:C, 2fjb:A, 2fjb:C, 2fjd:A, 2fjd:C, 2fje:A, 2fje:C, 1jnr:A, 1jnr:C, 1jnz:A, 1jnz:C
45 2fja:A 642 215 0.1106 0.0810 0.2419 4.11e-04 2fja:C, 2fjb:A, 2fjb:C, 2fjd:A, 2fjd:C, 2fje:A, 2fje:C, 1jnr:A, 1jnr:C, 1jnz:A, 1jnz:C
46 8a8o:A 556 141 0.0787 0.0665 0.2624 1.01e-05 8a8o:B
47 5oet:B 420 81 0.0489 0.0548 0.2840 0.037
48 3gyx:A 662 247 0.1319 0.0937 0.2510 0.072 3gyx:C, 3gyx:E, 3gyx:G, 3gyx:I, 3gyx:K
49 5dbj:E 437 40 0.0298 0.0320 0.3500 0.34 5dbj:A, 5dbj:B, 5dbj:C, 5dbj:D
50 7aaw:A 315 70 0.0489 0.0730 0.3286 0.48 7aaw:B
51 3cp8:A 611 30 0.0277 0.0213 0.4333 0.49 3cp8:B, 3cp8:C, 3cp8:D
52 4cnj:A 391 34 0.0319 0.0384 0.4412 0.57 4cnj:B, 4cnj:C, 4cnj:D, 4cnk:A, 4cnk:B
53 2gb0:B 389 60 0.0383 0.0463 0.3000 0.74 2a89:A, 2a89:B, 3bhf:A, 3bhf:B, 3bhk:A, 3bhk:B, 1el5:A, 1el5:B, 1el7:A, 1el7:B, 1el8:A, 1el8:B, 1el9:A, 1el9:B, 1eli:A, 1eli:B, 2gb0:A, 2gf3:A, 2gf3:B, 1l9c:A, 1l9c:B, 1l9d:A, 1l9d:B, 1l9e:A, 1l9e:B, 3m0o:A, 3m0o:B, 3m12:A, 3m12:B, 3m13:A, 3m13:B, 3m13:C, 3m13:D, 3qse:A, 3qse:B, 3qsm:A, 3qsm:B, 3qss:A, 3qss:B
54 1zdl:A 484 53 0.0383 0.0372 0.3396 0.83 3dgz:A, 1zkq:A
55 7koe:C 438 32 0.0277 0.0297 0.4062 0.86 7koe:G
56 3lad:A 472 33 0.0319 0.0318 0.4545 1.1 3lad:B
57 4j56:A 504 52 0.0383 0.0357 0.3462 1.2 4b1b:A, 4b1b:B, 4j56:B, 4j56:C, 4j56:D, 4j57:A, 4j57:B
58 5mh4:A 303 35 0.0298 0.0462 0.4000 1.6 5mip:A, 5miq:A, 5mir:A, 5mis:A, 5mit:A, 5mjk:A, 5mjk:B, 5mjk:C, 5mjk:D
59 5k0a:D 322 31 0.0234 0.0342 0.3548 1.9 5jri:A, 5jri:B, 5k0a:A, 5k0a:B, 5k0a:C
60 6aon:A 473 31 0.0298 0.0296 0.4516 2.1 6aon:B
61 7jyp:A 305 48 0.0319 0.0492 0.3125 2.7
62 6awa:A 475 33 0.0319 0.0316 0.4545 3.0 6awa:B, 5tr3:A, 5tr3:B
63 5uwy:A 306 34 0.0277 0.0425 0.3824 3.1
64 5u8u:D 477 33 0.0319 0.0314 0.4545 3.3 1lpf:A, 1lpf:B, 5u8u:A, 5u8u:B, 5u8u:C, 5u8v:A, 5u8v:B, 5u8v:C, 5u8v:D, 5u8w:A, 5u8w:B, 5u8w:C, 5u8w:D
65 6cr0:A 430 46 0.0319 0.0349 0.3261 3.5
66 5d8f:B 108 35 0.0277 0.1204 0.3714 3.6 4oww:B, 4owx:B
67 3ng7:X 427 29 0.0234 0.0258 0.3793 3.7 3k7m:X, 3k7q:X, 3k7t:A, 3k7t:B, 3ngc:X, 3nh3:X, 3nho:X, 3nk0:X, 3nk1:X, 3nk2:X, 3nn0:X, 3nn6:X
68 4gcm:B 309 35 0.0277 0.0421 0.3714 3.7 4gcm:A
69 6hbd:A 305 55 0.0404 0.0623 0.3455 4.0 6hb0:A, 6hb0:B, 6hbd:B, 6hbm:A, 6hbm:B, 6hyh:A, 6hyh:B
70 4jn9:A 299 50 0.0383 0.0602 0.3600 4.1 4jn9:B, 4jna:A, 4jna:B, 4nte:A, 4nte:B
71 7fco:A 433 40 0.0319 0.0346 0.3750 4.3 7fco:B
72 3rp6:A 392 30 0.0298 0.0357 0.4667 4.5 3rp7:A, 3rp8:A
73 1zov:A 381 60 0.0362 0.0446 0.2833 4.6 1zov:B
74 2yaj:C 871 41 0.0362 0.0195 0.4146 4.7 2y8n:A, 2yaj:A
75 1jx0:A 217 73 0.0404 0.0876 0.2603 5.2 1eyq:A, 1eyq:B, 1fm7:A, 1fm7:B, 1fm8:A, 1jep:A, 1jep:B, 1jx1:C
76 1rp0:A 278 23 0.0277 0.0468 0.5652 5.5 1rp0:B
77 7bkd:A 664 95 0.0660 0.0467 0.3263 5.5 7bkb:A, 7bkb:a, 7bkc:A, 7bkc:a, 7bkd:a, 7bke:A, 7bke:a
78 5w1j:A 584 52 0.0426 0.0342 0.3846 5.7 5w1j:B, 5w1l:A, 5w1l:B
79 4uqv:G 429 64 0.0319 0.0350 0.2344 6.6 4uqv:A, 4uqv:B, 4uqv:C, 4uqv:D, 4uqv:E, 4uqv:F, 4uqv:H, 4uqv:I, 4uqv:J, 4uqv:K, 4uqv:L
80 4bhd:B 395 64 0.0319 0.0380 0.2344 7.1
81 7u6l:D 436 29 0.0277 0.0298 0.4483 7.8 7e7h:A, 7e7h:B, 7u6l:A, 7u6l:B, 7u6l:C
82 6bz0:A 469 32 0.0298 0.0299 0.4375 9.5 6bz0:B, 6bz0:C, 6bz0:D
83 3n4e:A 368 36 0.0298 0.0380 0.3889 9.7 3n4e:B
84 4rdv:B 451 168 0.0979 0.1020 0.2738 9.9 3mdu:A, 3mdw:A, 3mdw:B, 3mdw:C, 3mdw:D, 4rdv:A, 4rdv:C, 4rdv:D, 4rdw:A, 4rzb:A, 4rzb:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218