Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KLPASFDAREQWPQCPTIKEIRDQGSCGSCWAFGAVEAISDRICIHTNAHVSVEVSAEDLLTCCGSMCGDGCNGGYPAEA
WNFWTRKGLVSGGLYESHVGCRPYSIPPCEHHVNGSRPPCTGEGDTPKCSKICEPGYSPTYKQDKHYGYNSYSVSNSEKD
IMAEIYKNGPVEGAFSVYSDFLLYKSGVYQHVTGEMMGGHAIRILGWGVENGTPYWLVANSWNTDWGDNGFFKILRGQDH
CGIESEVVAGIPRTD

The query sequence (length=255) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3ai8:B 256 255 1.0000 0.9961 1.0000 0.0 3ai8:A, 6ay2:A, 6ay2:B, 8b4t:A, 8b5f:A, 1csb:A, 1csb:B, 1csb:D, 1csb:E, 1gmy:A, 1gmy:B, 1gmy:C, 8he9:A, 8hei:A, 8hen:A, 2ipp:A, 1sp4:A
2 1cte:A 253 253 0.8275 0.8340 0.8340 6.73e-166 1cte:B, 1the:A, 1the:B
3 2dc6:A 251 253 0.8784 0.8924 0.8854 1.70e-159 2dc7:A, 2dc8:A, 2dc9:A, 2dca:A, 2dcb:A, 2dcc:A, 2dcd:A, 1ito:A, 1qdq:A, 1sp4:B
4 8cc2:AAA 254 251 0.5765 0.5787 0.5857 7.97e-112 8ccu:AAA, 8cd9:AAA, 5ogq:A, 5ogq:B, 5ogq:C, 5ogr:A, 5ogr:B, 5ogr:C, 3qsd:A, 3s3q:A, 3s3r:A, 3s3r:C, 3s3r:B, 6yi7:A
5 3hhi:B 260 254 0.4941 0.4846 0.4961 4.23e-80 3hhi:A
6 3pdf:A 351 256 0.3490 0.2536 0.3477 4.18e-33 4cdc:B, 4cdc:E, 4cdc:F, 4cdc:H, 4cdc:K, 4cdd:A, 4cdd:B, 4cdd:D, 4cdd:E, 4cde:B, 4cde:C, 4cde:E, 4cde:F, 4cdf:A, 4cdf:B, 4cdf:C, 4cdf:D, 4cdf:E, 4cdf:F, 2djf:B, 2djf:C, 6ic5:A, 6ic5:B, 6ic5:C, 6ic6:A, 6ic6:B, 6ic7:A, 6ic7:B, 6ic7:C, 4oel:A, 4oem:A, 6rn6:E, 6rn6:F, 6rn7:A, 6rn7:B, 6rn7:C, 6rn9:A, 6rn9:B, 6rn9:C, 6rne:B, 6rne:C, 6rni:A, 6rni:B
7 6p4e:B 217 240 0.2824 0.3318 0.3000 5.50e-26 6p4e:A
8 6czs:A 312 255 0.2902 0.2372 0.2902 1.26e-25 1nb3:A, 1nb3:B, 1nb3:C, 1nb3:D, 1nb5:A, 1nb5:B, 1nb5:C, 1nb5:D, 8pch:A
9 4bpv:A 219 248 0.2863 0.3333 0.2944 3.93e-25 4bpv:B, 4bpv:C, 4bpv:D, 4bpv:E, 4bqv:A, 4bqv:B, 4bqv:C, 4bqv:D, 4bqv:E, 4bqv:F, 4bqv:G, 4bqv:H, 4bs5:A, 4bs6:A, 4bs6:B, 4bsq:A, 4mzo:A, 4mzo:B, 4mzo:C, 4mzo:D, 4mzo:E, 4mzo:F, 4mzo:G, 4mzo:H, 4mzs:A, 4mzs:B
10 5qcd:A 223 249 0.3059 0.3498 0.3133 4.57e-25 2f1g:A, 2f1g:B, 2fq9:A, 2fq9:B, 2fra:A, 2fra:B, 2frq:A, 2frq:B, 2ft2:A, 2ft2:B, 2fud:A, 2fud:B, 2fye:A, 2g6d:A, 2g7y:A, 2g7y:B, 9gj2:A, 9gj2:B, 2h7j:A, 2h7j:B, 2hh5:B, 2hh5:A, 2hhn:B, 2hxz:A, 2hxz:B, 2hxz:C, 3iej:A, 3iej:B, 1ms6:A, 3n3g:A, 3n3g:B, 3n4c:A, 3n4c:B, 1npz:A, 1npz:B, 1nqc:A, 2op3:A, 2op3:B, 3ovx:A, 3ovx:B, 4p6e:A, 4p6e:B, 4p6g:A, 4p6g:B, 4p6g:C, 4p6g:D, 8pi3:A, 5qbu:A, 5qbu:B, 5qbv:A, 5qbv:B, 5qbw:A, 5qbx:A, 5qbx:B, 5qby:A, 5qby:B, 5qbz:A, 5qc0:A, 5qc0:B, 5qc1:A, 5qc1:B, 5qc2:A, 5qc2:B, 5qc3:A, 5qc3:B, 5qc4:A, 5qc4:B, 5qc5:A, 5qc5:B, 5qc6:A, 5qc6:B, 5qc7:A, 5qc7:B, 5qc8:A, 5qc8:B, 5qc9:A, 5qc9:B, 5qca:A, 5qca:B, 5qcb:A, 5qcb:B, 5qcc:A, 5qcc:B, 5qce:A, 5qce:B, 5qcf:A, 5qcg:A, 5qcg:B, 5qch:A, 5qch:B, 5qch:D, 5qch:C, 5qci:A, 5qcj:A, 5qcj:B, 5qcj:C, 2r9m:A, 2r9m:B, 2r9n:A, 2r9n:B, 2r9o:A, 2r9o:B, 8rnd:A, 6yyn:AAA, 6yyn:BBB, 6yyo:AAA, 6yyo:BBB, 6yyp:AAA, 6yyq:AAA, 6yyq:BBB, 6yyq:CCC, 6yyr:AAA, 6yyr:BBB
11 6ex8:A 217 250 0.2667 0.3134 0.2720 2.60e-21 6ex8:B, 6exo:A, 6exo:B, 6exq:A, 6exq:B, 2p7u:A, 2p86:A
12 8jcq:A 214 246 0.2667 0.3178 0.2764 3.47e-21 8jcr:A
13 1aec:A 218 249 0.2706 0.3165 0.2771 4.14e-21
14 1s4v:B 226 259 0.2941 0.3319 0.2896 4.29e-21 1s4v:A
15 6jd0:A 314 250 0.2784 0.2261 0.2840 4.92e-21 8a4u:A, 8a4u:B, 8a4u:C, 8a4u:D, 8a4v:A, 8a4v:B, 8a4v:C, 8a4v:D, 8a4w:A, 8a4w:B, 8a4w:C, 8a4w:D, 8a4x:A, 8a4x:B, 8a4x:C, 8a4x:D, 8a5b:A, 8a5b:B, 8a5b:C, 8a5b:D, 8ahv:A, 8ahv:B, 8ahv:C, 8ahv:D, 4axl:A, 4axm:A, 4axm:B, 4axm:F, 4axm:I, 4axm:L, 4axm:O, 8b4f:A, 8b4f:B, 8b4f:C, 8b4f:D, 3bc3:A, 3bc3:B, 8c77:A, 8c77:B, 8c77:C, 8c77:D, 6ezp:A, 6ezx:A, 6ezx:B, 5f02:A, 6f06:A, 6f06:B, 8gx2:A, 8gx2:B, 3h89:A, 3h89:B, 3h89:C, 3h89:D, 3h89:E, 3h89:F, 3h8b:A, 3h8b:B, 3h8b:C, 3h8b:F, 3h8b:D, 3h8b:E, 3h8c:A, 3h8c:B, 8het:A, 8hfv:A, 8hfv:B, 8hfv:C, 8hfv:D, 3hha:A, 3hha:B, 3hha:C, 3hha:D, 3hwn:A, 3hwn:B, 3hwn:C, 3hwn:D, 3k24:B, 3k24:A, 5mae:A, 5maj:A, 1mhw:A, 1mhw:B, 1mhw:C, 1mhw:D, 5mqy:A, 3of8:A, 3of9:A, 8ofa:A, 8ofa:B, 8ofa:C, 8ofa:D, 8oza:A, 8oza:B, 8oza:C, 8oza:D, 8prx:A, 8prx:B, 8prx:C, 8prx:D, 7qkb:A, 7qkb:B, 7qkb:C, 7qkb:D, 7qkc:A, 7qkc:B, 7qkc:C, 7qkc:D, 7qkd:A, 7qkd:B, 7qkd:C, 7qkd:D, 8qkb:A, 8qkb:B, 8qkb:C, 8qkb:D, 8uac:A, 8uac:B, 7w33:A, 7w34:A, 2xu1:A, 2xu1:B, 2xu1:C, 2xu1:D, 2xu3:A, 2xu4:A, 2xu5:A, 2yj2:A, 2yj8:A, 2yj9:A, 2yjb:A, 2yjc:A, 7z58:A, 7z58:B, 7z58:C, 7z58:D, 7zs7:A, 7zs7:B, 7zs7:C, 7zs7:D, 7zvf:A, 7zvf:B, 7zvf:C, 7zvf:D, 7zxa:A, 7zxa:B, 7zxa:C, 7zxa:D
16 1aim:A 215 249 0.2510 0.2977 0.2570 1.28e-20 2aim:A, 1ewl:A, 1ewm:A, 1ewo:A, 1ewp:A, 1f29:A, 1f29:B, 1f29:C, 1f2a:A, 1f2b:A, 1f2c:A, 3hd3:A, 3hd3:B, 3i06:A, 3iut:A, 7juj:A, 7juj:B, 7juj:C, 7juj:D, 7juj:E, 7juj:F, 3kku:A, 4klb:A, 4klb:B, 4klb:C, 3lxs:A, 3lxs:C, 1me3:A, 1me4:A, 2oz2:A, 2oz2:C, 4pi3:A, 4pi3:B, 4qh6:A, 7s18:A, 7s19:A, 1u9q:X, 6ux6:A, 4w5b:A, 4w5b:B, 4w5b:C, 4w5c:A, 4w5c:B, 4w5c:C, 4w5c:D, 4xui:A, 4xui:B, 4xui:C
17 7q8g:AA 222 251 0.2784 0.3198 0.2829 1.72e-20 1fh0:A, 1fh0:B, 7q8d:AA, 7q8d:BA, 7q8f:BA, 7q8f:AA, 7q8g:BA, 7q8h:AA, 7q8h:BA, 7q8i:AA, 7q8i:BA, 7q8j:AA, 7q8j:BA, 7q8k:AA, 7q8k:BA, 7q8l:AA, 7q8l:BA, 7q8m:AA, 7q8m:BA, 7q8n:AA, 7q8n:BA, 7q8o:BA, 7q8o:AA, 7q8p:AA, 7q8p:BA, 7q8q:AA, 7q8q:BA, 7q9c:AA, 7q9c:BA, 7q9h:AA, 7q9h:BA, 7qff:AA, 7qff:BA, 7qfh:AA, 7qfh:BA, 7qgw:A, 7qgw:B, 7qhj:AA, 7qhj:BA, 7qhk:AA, 7qhk:BA, 7qns:AA, 7qns:BA, 7qo2:AA, 7qo2:BA
18 8iui:A 218 248 0.2784 0.3257 0.2863 4.47e-20 8iui:B
19 6mis:A 215 237 0.2510 0.2977 0.2700 4.53e-20 6mis:B, 6ycc:A, 6ycc:B, 6ycd:A, 6ycd:B
20 2fo5:A 224 258 0.2824 0.3214 0.2791 2.35e-19 2fo5:B, 2fo5:C, 2fo5:D
21 5j94:A 223 258 0.2745 0.3139 0.2713 3.56e-19 6ash:A, 1atk:A, 2ato:A, 1au0:A, 1au2:A, 1au3:A, 1au4:A, 2aux:A, 2auz:A, 1ayu:A, 1ayv:A, 1ayw:A, 2bdl:A, 1bgo:A, 8c3d:A, 3c9e:A, 4dmx:A, 4dmy:A, 4dmy:B, 2f7d:A, 2ftd:A, 2ftd:B, 3h7d:A, 3h7d:E, 6hgy:A, 5ja7:A, 5ja7:B, 3kw9:A, 3kwb:X, 3kwb:Y, 3kwz:A, 3kx1:A, 1mem:A, 1nl6:A, 1nl6:B, 1nlj:A, 1nlj:B, 7nxl:AAA, 7nxm:A, 3o0u:A, 3o1g:A, 3ovz:A, 6pxf:A, 1q6k:A, 6qbs:A, 6qbs:B, 7qbl:A, 7qbm:A, 7qbn:A, 7qbo:A, 6ql8:A, 6qlm:A, 6qlm:B, 6qlw:A, 6qlw:B, 6qlw:C, 6qlw:D, 6qlx:A, 6qm0:A, 6qm0:B, 2r6n:A, 1snk:A, 5tdi:A, 1tu6:A, 1tu6:B, 1u9v:A, 1u9w:A, 1u9x:A, 1vsn:A, 4x6h:A, 4x6i:A, 4x6j:A, 1yk7:A, 1yk8:A, 1yt7:A, 4yv8:A
22 3p5u:A 220 240 0.2510 0.2909 0.2667 4.21e-19 3p5v:A, 3p5x:A
23 6ycf:A 215 239 0.2510 0.2977 0.2678 3.34e-18 6ycf:B, 6ycg:B
24 1bp4:A 212 226 0.2627 0.3160 0.2965 2.86e-17 1bqi:A, 2cio:A, 1cvz:A, 6h8t:A, 6h8t:J, 1khp:A, 1khq:A, 3lfy:C, 1pad:A, 2pad:A, 4pad:A, 5pad:A, 6pad:A, 1pe6:A, 1pip:A, 1pop:A, 1ppp:A, 6tcx:AAA
25 5vpl:A 223 248 0.2549 0.2915 0.2621 3.21e-16
26 1m6d:A 214 243 0.2314 0.2757 0.2428 1.12e-15 1m6d:B
27 7ei0:A 241 241 0.2275 0.2407 0.2407 4.74e-14 3bpf:A, 3bpf:B, 3bpf:C, 3bpf:D, 8gt7:C, 6jw9:A
28 2as8:A 222 246 0.2471 0.2838 0.2561 5.69e-14 2as8:B, 3f5v:A, 3f5v:B, 5vcn:A, 5vcn:B, 5vco:E, 5vco:F, 5vpg:A, 5vph:A
29 1meg:A 216 238 0.2784 0.3287 0.2983 9.19e-14
30 1iwd:A 215 235 0.2314 0.2744 0.2511 1.25e-13
31 5a24:A 222 255 0.2667 0.3063 0.2667 3.07e-13
32 2bdz:A 212 239 0.2588 0.3113 0.2762 2.63e-12 2bdz:D, 2bdz:B, 2bdz:C
33 3bpm:A 243 227 0.2157 0.2263 0.2423 5.06e-11 3bpm:B, 3bwk:A, 3bwk:B, 3bwk:C, 3bwk:D
34 3bcn:A 209 246 0.2510 0.3062 0.2602 2.04e-10 3bcn:B
35 2b1n:A 227 238 0.2392 0.2687 0.2563 4.13e-10
36 3ioq:A 213 258 0.2627 0.3146 0.2597 9.59e-10
37 1gec:E 216 238 0.2431 0.2870 0.2605 1.17e-09
38 2pre:A 208 246 0.2353 0.2885 0.2439 5.27e-09 2pre:B
39 2wbf:X 265 243 0.2157 0.2075 0.2263 3.77e-05 3ch3:X, 6x42:X
40 2ekl:A 312 52 0.0627 0.0513 0.3077 0.060
41 3ois:A 268 97 0.0941 0.0896 0.2474 2.5 3ois:B, 3ois:C, 3ois:D
42 6fhw:B 587 159 0.1412 0.0613 0.2264 6.8 6fhw:A
43 6y66:GGG 268 82 0.1020 0.0970 0.3171 8.0 6y66:AAA, 6y66:BBB, 6y66:CCC, 6y66:DDD, 6y66:EEE, 6y66:FFF, 6y66:HHH, 6y66:III, 6y66:JJJ

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218