Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KLLYTSANFLGIPTNRGQPKIGTYQGPELIRKSNFFQLVAEDGIQLTDCGDIIPVELNEAEDPQRFGMKWSRSFSLTTLR
IAERVEELMKQSKSTPLVIVGGDHSMATGTILGHAEAKPDLCVLWIDAHGDINTPLNSASGNMHGMPLSFLVKELQDQIP
WLDDFEGIKPCLNASNIAYIGLRDLDAHETHDIRKHGIAYFTMLDVDRMGIEAVIKEALLAVNPRLEKAIHLSFDIDALD
PLVAPSTGTAVPGGLTLREGLRICEEVSATGKLSVVELAELNPLLGSQEDVLKTQSSAVHILRACLGHCRSGHLPFKVRN
LTDQGIMSRAAHM

The query sequence (length=333) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4q3v:C 339 335 1.0000 0.9823 0.9940 0.0 4q3p:A, 4q3p:B, 4q3p:C, 4q3p:D, 4q3q:A, 4q3q:B, 4q3q:C, 4q3q:D, 4q3r:A, 4q3r:B, 4q3r:C, 4q3r:D, 4q3s:A, 4q3s:B, 4q3s:C, 4q3s:D, 4q3t:A, 4q3t:B, 4q3t:C, 4q3t:D, 4q3u:A, 4q3u:B, 4q3u:C, 4q3u:D, 4q3v:A, 4q3v:B, 4q3v:D, 4q40:A, 4q40:B, 4q40:C, 4q40:D, 4q41:A, 4q41:B, 4q41:C, 4q41:D, 4q42:A, 4q42:B, 4q42:C, 4q42:D
2 7k4g:E 319 317 0.4144 0.4326 0.4353 3.70e-86 2aeb:A, 2aeb:B, 8aup:A, 8aup:B, 8aup:C, 8aup:D, 8aup:E, 8aup:F, 3dj8:A, 3dj8:B, 8e5m:A, 8e5m:B, 8e5m:C, 8e5m:D, 8e5m:E, 8e5m:F, 8e5n:A, 8e5n:B, 8e5n:C, 8e5n:D, 8e5n:E, 8e5n:F, 3e6k:A, 3e6k:B, 3e6v:A, 3e6v:B, 3f80:A, 3f80:B, 4fci:A, 4fci:B, 4fck:A, 4fck:B, 3gmz:A, 3gmz:B, 3gn0:A, 3gn0:B, 4gsv:A, 4gsv:B, 4gsz:A, 4gsz:B, 4gwc:A, 4gwc:B, 4gwd:A, 4gwd:B, 4hww:A, 4hww:B, 4hxq:A, 4hxq:B, 4ie1:A, 4ie1:B, 7k4g:A, 7k4g:B, 7k4g:C, 7k4g:D, 7k4g:F, 7k4h:A, 7k4h:B, 7k4h:C, 7k4h:D, 7k4h:E, 7k4h:F, 7k4i:A, 7k4i:B, 7k4i:C, 7k4i:D, 7k4i:E, 7k4i:F, 7k4j:A, 7k4j:B, 7k4j:C, 7k4j:D, 7k4j:E, 7k4j:F, 7k4k:A, 7k4k:B, 7k4k:C, 7k4k:D, 7k4k:E, 7k4k:F, 7klk:A, 7klk:B, 7klk:C, 7klk:D, 7klk:E, 7klk:F, 7kll:A, 7kll:B, 7kll:C, 7kll:D, 7kll:E, 7kll:F, 7klm:A, 7klm:B, 7klm:C, 7klm:D, 7klm:E, 7klm:F, 3kv2:A, 3kv2:B, 7ley:A, 7ley:B, 7ley:C, 7lez:A, 7lez:B, 7lez:C, 7lez:M, 7lez:N, 7lez:J, 7lf1:A, 7lf1:B, 7lf1:C, 7lf1:J, 7lf1:M, 7lf1:N, 7lf2:A, 7lf2:B, 7lf2:C, 7lf2:J, 7lf2:Q, 7lf2:R, 3lp4:A, 3lp4:B, 3lp7:A, 3lp7:B, 3mfv:A, 3mfv:B, 3mfw:A, 3mfw:B, 3mjl:A, 3mjl:B, 2pha:A, 2pha:B, 2pho:A, 2pho:B, 2pll:A, 2pll:B, 6q92:A, 6q92:B, 6q9p:A, 6q9p:B, 6qaf:A, 6qaf:B, 3sjt:A, 3sjt:B, 3skk:A, 3skk:B, 3th7:A, 3th7:B, 3the:A, 3the:B, 3thh:A, 3thh:B, 3thj:A, 3thj:B, 6v7c:A, 6v7c:B, 6v7c:C, 6v7c:D, 6v7c:E, 6v7c:F, 6v7d:A, 6v7d:B, 6v7d:C, 6v7d:D, 6v7d:E, 6v7d:F, 6v7e:A, 6v7e:B, 6v7e:C, 6v7e:D, 6v7e:E, 6v7e:F, 6v7f:A, 6v7f:B, 6v7f:C, 6v7f:D, 6v7f:E, 6v7f:F, 1wva:A, 1wva:B, 1wvb:A, 1wvb:B, 2zav:A, 2zav:B
3 6ss2:AAA 320 310 0.4084 0.4250 0.4387 3.81e-85 4hze:A, 4hze:B, 4hze:C, 4i06:A, 4i06:B, 4i06:C, 4ie2:A, 4ie2:B, 4ie2:C, 4ie3:A, 4ie3:B, 4ie3:C, 4ixu:A, 4ixu:B, 4ixu:C, 4ixv:A, 4ixv:B, 4ixv:C, 1pq3:A, 1pq3:B, 1pq3:C, 1pq3:D, 1pq3:E, 1pq3:F, 6q37:A, 6q37:B, 6q37:C, 6q39:A, 6q39:B, 6q39:C, 6ss4:AAA, 6ss6:AAA, 6ss6:BBB, 6ss6:CCC
4 1hqf:A 314 306 0.3994 0.4236 0.4346 6.82e-85 1d3v:A, 1d3v:B, 3e8q:A, 3e8q:B, 3e8q:C, 3e8z:A, 3e8z:B, 3e8z:C, 3e9b:A, 3e9b:B, 3e9b:C, 1hq5:A, 1hq5:B, 1hqf:B, 1hqf:C, 1hqg:A, 1hqg:B, 1hqg:C, 1hqh:A, 1hqh:B, 1hqh:C, 1hqx:A, 1hqx:B, 1hqx:C, 1p8m:A, 1p8m:B, 1p8m:C, 1p8n:A, 1p8n:B, 1p8n:C, 1p8o:A, 1p8o:B, 1p8o:C, 1p8p:A, 1p8p:B, 1p8p:C, 1p8q:A, 1p8q:B, 1p8q:C, 1p8r:A, 1p8r:B, 1p8s:A, 1p8s:B, 1p8s:C, 1r1o:A, 1r1o:B, 1r1o:C, 1rla:A, 1rla:B, 1rla:C, 2rla:A, 2rla:B, 2rla:C, 3rla:A, 3rla:B, 3rla:C, 4rla:A, 4rla:B, 4rla:C, 5rla:A, 5rla:B, 5rla:C, 1t4p:A, 1t4p:B, 1t4p:C, 1t4r:A, 1t4r:B, 1t4r:C, 1t4s:A, 1t4s:B, 1t4s:C, 1t4t:A, 1t4t:B, 1t4t:C, 1t5f:A, 1t5f:B, 1t5f:C, 1t5g:A, 1t5g:B, 1t5g:C, 1ta1:A, 1ta1:B, 1ta1:C, 1tbh:A, 1tbh:B, 1tbh:C, 1tbj:A, 1tbj:B, 1tbj:C, 1tbl:A, 1tbl:B, 1tbl:C, 1zpe:A, 1zpe:B, 1zpe:C, 1zpg:A, 1zpg:B, 1zpg:C
5 5hj9:A 311 300 0.3483 0.3730 0.3867 1.83e-54 5hja:A, 4ity:A, 4iu0:A, 4iu1:A, 4iu4:A, 4iu5:A
6 6nfp:A 292 302 0.3123 0.3562 0.3444 8.01e-50 6dkt:A, 6dkt:B, 6dkt:C, 6dkt:D, 6dkt:F, 6nfp:B, 6nfp:C, 6nfp:D, 6nfp:E, 6nfp:F
7 1cev:A 299 304 0.3153 0.3512 0.3454 2.89e-48 1cev:B, 1cev:C, 1cev:D, 1cev:E, 1cev:F, 2cev:A, 2cev:C, 2cev:B, 2cev:D, 2cev:E, 2cev:F, 3cev:A, 3cev:B, 3cev:C, 3cev:D, 3cev:E, 3cev:F, 4cev:A, 4cev:B, 4cev:C, 4cev:D, 4cev:E, 4cev:F, 5cev:A, 5cev:B, 5cev:C, 5cev:D, 5cev:F, 5cev:E
8 6nbk:A 289 300 0.3063 0.3529 0.3400 8.81e-46 6nbk:B, 6nbk:C, 6nbk:D, 6nbk:E, 6nbk:F
9 5zee:B 297 309 0.3003 0.3367 0.3236 4.04e-44 5zee:A, 5zef:A, 5zef:B, 5zeh:A, 5zeh:B
10 6dkt:E 268 302 0.2913 0.3619 0.3212 4.03e-42
11 3mmr:A 308 283 0.2733 0.2955 0.3216 6.19e-42 3sl0:A, 3sl1:A
12 2ef5:A 273 277 0.2583 0.3150 0.3105 2.58e-38 2ef5:B, 2ef5:D, 2ef5:E, 2ef5:F, 2ef5:G
13 4g3h:C 310 326 0.2372 0.2548 0.2423 3.58e-14 4g3h:A, 4g3h:B, 4g3h:D
14 9fek:G 377 318 0.2583 0.2281 0.2704 4.03e-14 9fek:A, 9fek:B, 9fek:C, 9fek:D, 9fek:E, 9fek:F, 9fek:H, 9fek:I, 9fek:J, 9fek:K, 9fek:L
15 1gq6:B 301 309 0.2432 0.2691 0.2621 1.33e-11 1gq6:A, 1gq6:C, 1gq7:A, 1gq7:B, 1gq7:C, 1gq7:D, 1gq7:E, 1gq7:F
16 3m1r:D 321 211 0.1622 0.1682 0.2559 1.60e-11 3m1r:A, 3m1r:B, 3m1r:C, 3m1r:E, 3m1r:F
17 3pzl:B 293 287 0.2102 0.2389 0.2439 1.38e-10 3pzl:A, 3pzl:C
18 1wog:A 303 244 0.1922 0.2112 0.2623 6.21e-10 1wog:B, 1wog:C, 1wog:D, 1wog:E, 1wog:F, 1woi:A, 1woi:B, 1woi:C, 1woi:D, 1woi:E, 1woi:F
19 9iq9:B 275 206 0.1862 0.2255 0.3010 7.11e-10 7euk:A, 7euk:B, 7eul:A, 7eun:A, 7eun:B, 7euq:A, 7euq:B, 9iq9:A, 8ius:A, 8ius:B, 8iut:A, 8iut:B, 8iuu:A, 8iuu:B, 8iuv:A, 8iuv:B, 8iuw:A, 8iuw:B, 6lug:A, 6lug:B, 6luh:A, 6luh:B
20 3nip:B 316 279 0.2252 0.2373 0.2688 1.62e-09 3nip:C, 3nip:E, 3nip:D, 3nip:F, 3niq:A, 3niq:B
21 4dz4:B 323 211 0.1832 0.1889 0.2891 8.58e-09 4dz4:A, 4dz4:C, 4dz4:D, 4dz4:E, 4dz4:F
22 6vsu:E 318 242 0.1832 0.1918 0.2521 1.92e-08 6vsu:A, 6vsu:B, 6vsu:C, 6vsu:D, 6vsu:F, 6vsu:G, 6vsu:I, 6vsu:H, 6vsu:J, 6vsu:K, 6vsu:L, 6vsu:M, 6vsu:N, 6vsu:O, 6vsu:P, 6vsu:Q, 6vsu:R, 6vsu:S, 6vsu:T, 6vsu:U, 6vsu:V, 6vsu:W, 6vsu:X
23 3nio:A 316 291 0.2162 0.2278 0.2474 2.87e-08 3nio:B, 3nio:C, 3nio:D, 3nio:E, 3nio:F
24 6vst:D 320 209 0.1652 0.1719 0.2632 1.60e-07 6vss:A, 6vss:B, 6vss:C, 6vss:D, 6vss:E, 6vss:F, 6vst:A, 6vst:B, 6vst:C, 6vst:E, 6vst:F, 6vst:G, 6vst:H, 6vst:I, 6vst:J, 6vst:K, 6vst:L
25 4myn:A 298 291 0.2102 0.2349 0.2405 4.56e-07 4mxr:A, 4mxr:B, 4myf:A, 4myk:A
26 7esr:A 378 284 0.2102 0.1852 0.2465 9.36e-07
27 7lba:B 310 283 0.1952 0.2097 0.2297 1.31e-06 7lba:A, 7lba:C, 7lba:D, 7lba:E, 7lba:F, 7lba:G, 7lba:H, 7lba:I, 7lba:J, 7lba:K, 7lba:L, 7lba:M, 7lba:P, 7lba:Q, 7lol:A, 7lox:A, 7lox:B, 7lox:C
28 3lhl:A 276 206 0.1562 0.1884 0.2524 7.13e-06
29 6ksy:B 289 239 0.1982 0.2284 0.2762 4.63e-05 6ksy:A, 6ksy:C, 6ksy:D
30 4rhm:A 308 191 0.1321 0.1429 0.2304 3.54e-04 4rhl:A, 4rhl:B, 4rhm:B, 4rhm:C
31 2fuv:A 545 101 0.0781 0.0477 0.2574 0.92 2fuv:B, 3na5:A, 3na5:B, 3olp:A, 3olp:B
32 1q17:C 295 147 0.1171 0.1322 0.2653 1.1 7f4e:A, 7f51:A, 2od2:A, 2od7:A, 2od9:A, 1q14:A, 1q17:A, 1q17:B, 1q1a:A, 2qqf:A, 2qqg:A, 1szc:A, 1szd:A
33 5xdh:A 86 52 0.0511 0.1977 0.3269 2.3 5xdh:B, 5xdh:C, 5xdh:D
34 5hwg:A 175 78 0.0721 0.1371 0.3077 4.1 5hwh:A
35 8em7:A 4378 81 0.0721 0.0055 0.2963 4.2 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
36 7kpf:F 135 99 0.0811 0.2000 0.2727 4.8
37 8em4:A 3818 81 0.0721 0.0063 0.2963 4.9 8em4:B
38 4v9g:AU 48 34 0.0300 0.2083 0.2941 9.1 7f0l:B, 7f0l:E, 7f0l:G, 7f0l:J, 7f0l:N, 7f0l:P, 7f0l:R, 7f0l:T, 7f0l:W, 7f0l:Z, 7f0l:2, 7f0l:4, 7f0l:6, 7f0l:8, 7pil:BA, 7pil:BB, 7pil:BC, 7pil:BD, 7pil:BE, 7pil:BF, 7pil:BG, 7pil:BH, 7pil:BI, 7pil:BJ, 7pil:BK, 7pil:BL, 7pil:BM, 7pil:BN, 7pqd:BA, 7pqd:BB, 7pqd:BC, 7pqd:BD, 7pqd:BE, 7pqd:BF, 7pqd:BG, 7pqd:BH, 7pqd:BI, 7pqd:BJ, 7pqd:BK, 7pqd:BL, 7pqd:BM, 7pqd:BN, 7pqd:ba, 7pqd:bb, 7pqd:bc, 7pqd:bd, 7pqd:be, 7pqd:bf, 7pqd:bg, 7pqd:bh, 7pqd:bi, 7pqd:bj, 7pqd:bk, 7pqd:bl, 7pqd:bm, 7pqd:bn, 4v9g:A4, 4v9g:A8, 4v9g:AE, 4v9g:AI, 4v9g:AK, 4v9g:AO, 4v9g:AQ, 4v9g:AS, 4v9g:A9, 4v9g:A6, 4v9g:AW, 4v9g:AY, 4v9g:AG, 4v9g:B6, 4v9g:BU, 4v9g:BW, 4v9g:B4, 4v9g:B8, 4v9g:BE, 4v9g:BG, 4v9g:BI, 4v9g:BQ, 4v9g:BS, 4v9g:B9, 4v9g:BO, 4v9g:BY, 4v9g:BK, 7va9:B, 7va9:E, 7va9:G, 7va9:J, 7va9:N, 7va9:P, 7va9:R, 7va9:T, 7va9:V, 7va9:X, 7va9:Z, 7va9:2, 7va9:8, 7va9:0, 7va9:b, 7va9:e, 7va9:g, 7va9:j, 7va9:n, 7va9:p, 7va9:r, 7va9:t, 7va9:v, 7va9:x, 7va9:z, 7va9:4, 7va9:aa, 7va9:ab, 7vb9:B, 7vb9:E, 7vb9:G, 7vb9:J, 7vb9:N, 7vb9:8, 7vb9:0, 7vb9:b, 7vb9:e, 7vb9:g, 7vb9:j, 7vb9:n, 7vb9:p, 7vb9:r, 7vb9:t, 7vb9:v, 7vb9:x, 7vb9:z, 7vb9:4, 7vb9:aa, 7vb9:ab, 7vnm:B, 7vnm:E, 7vnm:G, 7vnm:J, 7vnm:N, 7vnm:P, 7vnm:R, 7vnm:T, 7vnm:V, 7vnm:C, 7vnm:8, 7vnm:0, 7vnm:2, 7vny:B, 7vny:E, 7vny:G, 7vny:J, 7vny:N, 7vny:P, 7vny:R, 7vny:T, 7vny:V, 7vny:C, 7vny:Z, 7vny:2, 7vny:8, 7vny:0, 7vor:B, 7vor:0, 7vor:E, 7vor:G, 7vor:J, 7vor:N, 7vor:P, 7vor:R, 7vor:T, 7vor:V, 7vor:C, 7vor:Z, 7vor:2, 7vor:8, 7vor:b, 7vor:b0, 7vor:e, 7vor:g, 7vor:j, 7vor:n, 7vor:p, 7vor:r, 7vor:t, 7vor:v, 7vor:c, 7vor:z, 7vor:4, 7vor:b8, 7vot:B, 7vot:0, 7vot:E, 7vot:G, 7vot:J, 7vot:N, 7vot:P, 7vot:R, 7vot:T, 7vot:V, 7vot:C, 7vot:Z, 7vot:2, 7vot:8, 7vot:b, 7vot:b0, 7vot:e, 7vot:g, 7vot:j, 7vot:n, 7vot:p, 7vot:r, 7vot:t, 7vot:v, 7vot:c, 7vot:z, 7vot:4, 7vot:b8, 7voy:B, 7voy:E, 7voy:G, 7voy:J, 7voy:N, 7voy:P, 7voy:R, 7voy:T, 7voy:V, 7voy:X, 7voy:Z, 7voy:2, 7voy:8, 7voy:0, 7voy:t, 7voy:5, 7voy:3, 7vy2:B, 7vy2:E, 7vy2:G, 7vy2:J, 7vy2:N, 7vy2:P, 7vy2:R, 7vy2:T, 7vy2:W, 7vy2:Z, 7vy2:2, 7vy2:4, 7vy2:6, 7vy2:8, 7vy2:b, 7vy2:e, 7vy2:g, 7vy2:j, 7vy2:n, 7vy2:p, 7vy2:r, 7vy2:t, 7vy2:w, 7vy2:z, 7vy2:02, 7vy2:04, 7vy2:06, 7vy2:08, 7vy3:B, 7vy3:E, 7vy3:G, 7vy3:J, 7vy3:N, 7vy3:P, 7vy3:R, 7vy3:T, 7vy3:W, 7vy3:Z

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218