Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGFSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGVEYGDKERKTDSKMVCDVVSRM
EDTEPFSAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAGDYQPTEQDILRTRVKTTGIVETHFTFKN
LHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDETTNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDL
FGEKIKKSPLTICFPEYPGSNTYEDAAAYIQTQFESKNRSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIA

The query sequence (length=311) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3c7k:C 311 311 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 3c7k:A
2 1agr:A 350 311 0.7299 0.6486 0.7299 4.14e-167 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
3 3v00:C 353 312 0.6752 0.5949 0.6731 7.75e-152 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
4 3ffb:A 327 311 0.6624 0.6300 0.6624 6.45e-143 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
5 1shz:D 327 318 0.6367 0.6055 0.6226 1.13e-139 1shz:A
6 7rkf:A 350 311 0.5177 0.4600 0.5177 3.23e-107
7 8iys:A 355 300 0.5016 0.4394 0.5200 9.24e-104 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
8 8fn0:B 212 163 0.4662 0.6840 0.8896 2.10e-102
9 8fn0:B 212 22 0.0643 0.0943 0.9091 6.14e-04
10 8pjk:A 222 165 0.4180 0.5856 0.7879 1.63e-92 7e2x:A, 7e2z:A
11 8pjk:A 222 32 0.0707 0.0991 0.6875 8.27e-05 7e2x:A, 7e2z:A
12 1zca:A 318 313 0.4469 0.4371 0.4441 1.55e-90 1zca:B
13 3ab3:A 322 318 0.4566 0.4410 0.4465 5.06e-89 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
14 8htg:B 334 329 0.4727 0.4401 0.4468 1.05e-85 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
15 6eg8:I 372 330 0.4791 0.4005 0.4515 2.83e-84 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
16 4fid:A 318 314 0.4051 0.3962 0.4013 3.93e-71 4fid:B
17 2xtz:A 343 329 0.4051 0.3673 0.3830 2.36e-68
18 8uo1:A 334 327 0.4373 0.4072 0.4159 1.49e-65 8gga:A
19 8ggb:A 310 326 0.4277 0.4290 0.4080 1.61e-65 8gg9:A, 8ggc:A
20 2xtz:B 291 321 0.3923 0.4192 0.3801 3.74e-62
21 2xtz:C 270 323 0.3730 0.4296 0.3591 2.33e-54
22 8uo4:A 292 324 0.3698 0.3938 0.3549 8.02e-48 8uo2:A
23 8unx:A 244 178 0.2669 0.3402 0.4663 6.08e-43 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
24 8unx:A 244 33 0.0740 0.0943 0.6970 1.01e-04 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
25 8xql:A 240 180 0.2605 0.3375 0.4500 2.24e-38
26 8xql:A 240 29 0.0643 0.0833 0.6897 1.49e-04
27 3lvq:E 420 97 0.0997 0.0738 0.3196 4.51e-08 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28 6a8d:A 181 99 0.0900 0.1547 0.2828 9.43e-08
29 6bbp:A 520 97 0.0965 0.0577 0.3093 8.35e-07 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
30 8d4c:C 180 97 0.0932 0.1611 0.2990 8.98e-06 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
31 3lrp:A 181 97 0.0900 0.1547 0.2887 1.91e-05
32 1z6x:A 175 97 0.0900 0.1600 0.2887 2.51e-05 1z6x:B
33 2k5u:A 181 97 0.0804 0.1381 0.2577 4.42e-05 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
34 5di3:B 204 101 0.0868 0.1324 0.2673 1.09e-04 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
35 5de3:A 166 106 0.0804 0.1506 0.2358 2.23e-04 5di3:A
36 4y0v:A 165 164 0.1222 0.2303 0.2317 3.02e-04 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
37 7rll:B 177 97 0.0900 0.1582 0.2887 5.19e-04 7rll:A
38 1yzg:A 168 131 0.1125 0.2083 0.2672 0.001
39 2x77:A 181 85 0.0804 0.1381 0.2941 0.004 2x77:B
40 3aq4:A 170 97 0.0836 0.1529 0.2680 0.004 3aq4:B
41 8oun:A 181 166 0.1125 0.1934 0.2108 0.005 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
42 2h57:B 167 143 0.1093 0.2036 0.2378 0.005 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
43 6pta:A 165 97 0.0804 0.1515 0.2577 0.005 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
44 3doe:A 189 92 0.0804 0.1323 0.2717 0.006 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
45 3doe:A 189 42 0.0482 0.0794 0.3571 2.1 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
46 3o47:A 289 97 0.0868 0.0934 0.2784 0.006 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
47 1upt:G 170 97 0.0836 0.1529 0.2680 0.006 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
48 5uf8:D 160 97 0.0836 0.1625 0.2680 0.006
49 8e0c:A 185 100 0.0740 0.1243 0.2300 0.015 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
50 6zga:C 168 102 0.0804 0.1488 0.2451 0.028 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
51 2b6h:A 171 97 0.0772 0.1404 0.2474 0.034
52 4ile:A 176 97 0.0707 0.1250 0.2268 0.042 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
53 8oul:A 185 96 0.0804 0.1351 0.2604 0.32 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
54 6h57:A 795 83 0.0804 0.0314 0.3012 0.83
55 7d63:RZ 839 83 0.0804 0.0298 0.3012 0.85 7d4i:RZ, 7d5t:RZ, 7mqj:A
56 6zqg:JD 829 83 0.0804 0.0302 0.3012 0.89
57 4v0l:A 168 81 0.0707 0.1310 0.2716 0.91 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
58 7aju:JD 811 83 0.0804 0.0308 0.3012 0.96 6zqd:JD, 6zqe:JD, 6zqf:JD
59 2q1z:B 185 140 0.0997 0.1676 0.2214 1.2 2q1z:D, 2z2s:B, 2z2s:D, 2z2s:F, 2z2s:H
60 4bas:A 172 41 0.0482 0.0872 0.3659 1.9
61 5qgg:A 186 68 0.0579 0.0968 0.2647 2.3 5qgh:A, 5qgi:A, 5qgj:A, 5qgk:A, 5qgl:A, 5qgm:A, 5qgn:A, 5qgo:A, 5qgp:A, 5qgq:A, 5qgr:A, 5qgs:A, 5qgt:A, 5qgu:A, 5qgv:A, 5qgw:A, 5qgx:A, 5qgy:A, 5qgz:A, 5qh0:A, 5qh1:A, 5qh2:A, 5qh3:A, 5qh4:A, 5qh5:A, 5qh6:A, 5qh7:A, 5qh8:A, 5qh9:A, 5qha:A, 5qhb:A, 5qhc:A, 5qhe:A, 5qhf:A, 5qhg:A, 5qhh:A
62 4q66:C 134 44 0.0482 0.1119 0.3409 2.4
63 4j7g:A 448 70 0.0611 0.0424 0.2714 3.9 4j7g:B, 4j7h:A, 4j7h:B
64 7am2:BT 300 34 0.0354 0.0367 0.3235 4.1
65 6yxy:EM 330 34 0.0354 0.0333 0.3235 4.1
66 6vs4:A 223 83 0.0675 0.0942 0.2530 4.2 6vs4:B
67 4zi2:A 185 30 0.0322 0.0541 0.3333 4.7 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
68 3p27:B 444 86 0.0804 0.0563 0.2907 6.1 3p27:A
69 5jbj:A 627 82 0.0836 0.0415 0.3171 6.3
70 2h6e:A 323 67 0.0611 0.0588 0.2836 7.0
71 7opr:A 218 110 0.0836 0.1193 0.2364 7.8 3bc1:A, 3bc1:E, 6huf:A, 6huf:O, 6huf:N, 6huf:B, 6huf:E, 6huf:C, 6huf:K, 6huf:M, 6huf:D, 6huf:P, 6huf:F, 6huf:J, 6huf:G, 6huf:I, 6huf:H, 6huf:L, 7opp:A, 7opp:C, 7opq:A, 7opq:B, 7opr:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218