BioLiP

>protein
KLLKDDFFASDQQAVAVADRYPQDVFAEHTHDFCELVIVWRGNGLHVLNDRPYRITRGDLFYIHADDKHSYASVNDLVLQ
NIIYCPERLKLNLDWQGAIPGFNASAGQPHWRLGSMGMAQARQVIGQLEHESSQHVPFANEMAELLFGQLVMLLNRHRYT

The query sequence (length=160) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5u93:B	161	160	1.0000	0.9938	1.0000	2.08e-120	5u93:A, 5u9e:A, 5u9e:B
2	5tg0:A	137	69	0.1125	0.1314	0.2609	0.020	6a53:A, 6a53:B, 6a54:A, 6a54:B, 6a55:A, 6a55:B, 8hlf:A, 8hlf:B, 5tfz:A, 5tfz:B
3	4rdr:A	706	98	0.1562	0.0354	0.2551	0.33
4	6akn:A	124	88	0.1062	0.1371	0.1932	1.5	6akn:B, 1bqk:A, 1bqr:A, 8hm9:A, 8hm9:B, 6ifp:A, 6ifp:C, 2jkw:A, 2jkw:B, 2ux6:A, 2ux7:A, 2uxf:A, 2uxg:A, 5wv4:A, 5wv4:B, 5xmo:A, 5y23:A, 5y23:B, 4yl4:A, 5ysg:A, 5ysg:B, 5ysg:C, 5ysg:D, 5yw3:A, 5yw3:B, 5yw3:C, 5yw3:D, 5z0x:A, 5z0x:B, 1zia:A, 1zib:A, 5ztd:A, 5ztd:B
5	3nl1:A	366	41	0.0938	0.0410	0.3659	1.6	4fag:A, 4fah:A, 4fbf:A, 3njz:A, 3nkt:A, 3nst:A, 3nvc:A, 3nw4:A, 2phd:A, 2phd:B, 2phd:C, 2phd:D
6	1adw:A	123	85	0.0875	0.1138	0.1647	1.7	1adw:B, 4bwt:A, 4bwt:B, 4bwu:A, 4bwu:B, 4bxv:A, 4bxv:B, 3erx:A, 3erx:B
7	5ynv:B	313	73	0.1062	0.0543	0.2329	2.8	5y72:A, 5y72:B, 5y7c:A, 5y7c:B, 5y84:A, 5y84:B, 5ynt:A, 5ynt:B, 5ynu:A, 5ynu:B, 5ynv:A, 5ynw:A, 5ynw:B
8	3pya:A	688	27	0.0688	0.0160	0.4074	7.5	4lix:A, 3pyb:A
9	8jhz:A	2615	61	0.1000	0.0061	0.2623	8.3

[Back]