Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KLFCEPSGQPASTAYGPALTGRPAPLGASIDADTGAINFSVFSSSAESVSLVLFTEADLNAGRATFEIPLDPYVNRTGDV
WHIMLPDLRDDLLYGYRVEGVHQEEDKDYPGMRHDKRRVVLDPYAVAVLNRRRWGQMGPNLPYGEEGVLGVMPTWPQAAA
ALPAARGSAFDWEGDTPLNLPMESLVIYEAHVRGFTAHASSGVAAPGTYAGMVERLDYLKSLGVNAIELLPVFEFNELEY
YSQIPGSDQYRFNFWGYSTVNYFSPMGRFSAAVGQGAPARASCDEFKQLVKECHRRGIEVILDVVFNHTAEGNERGPTIS
FRGLDNRVYYMLAPGGEYYNYSGCGNTLNCNQPVVRQFILDCLKHWVTEYHVDGFRFDLASILTRAHSAWHPQQYDQETG
QRVAMSSGGAIVTAEGIMTDGAGVPTGYPLADPPLVESISEDPVLRNTKMIAEAWDCDGLNQVGAFPHYGGRWSEWNGKF
RDVVRNFIKGTDGPWAGDFASAICGSPNIYANNTPHETDWWANNGGRQWKGGRGPHASINFVAAHDGFTLADMVAYNNKH
NEANGENNRDGEQHNNSWNCGEEGPTTKWEVNRLRQRQMRNLTGALLLSCGVPMINMGDEYGHSKNGNNNTYCHDSELNY
LRWDQLAEDPHGFNRFVRLLIHFRRATPALQRTTFVNDKDIQWHGELPNTPDWTDTSRLVAFTLHDGKGGGLYVAFNTSH
LPKLLQLPKWGGRVWQPLVDTSKVAPYDFLAVDGVLSAEDVAAARRQMAMWTADHTYPVLPWSCIVLQSAPEDPAATSMI
K

The query sequence (length=801) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4okd:A 801 801 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 4okd:B
2 2vr5:A 715 718 0.3346 0.3748 0.3733 5.99e-144 2vr5:B
3 7u3b:C 696 747 0.3433 0.3951 0.3681 2.94e-131 7u3a:A, 7u3a:B, 7u3a:C, 7u3a:D, 7u3b:H, 7u3b:D, 7u3b:F, 7u3b:E, 7u3b:I, 7u3b:G, 7u3b:J, 7u3d:B, 7u3d:F, 7u3d:A
4 7u3d:C 677 746 0.3321 0.3929 0.3566 2.50e-126
5 1bf2:A 750 769 0.2996 0.3200 0.3121 2.40e-72
6 6jhf:A 653 734 0.2422 0.2971 0.2643 1.26e-43 6jeq:A, 6jfj:A, 6jfx:A, 6jhg:A, 6jhh:A, 6jhi:A
7 2e8y:A 712 549 0.1935 0.2177 0.2823 7.03e-39 2e8y:B, 2e8z:A, 2e8z:B, 2e9b:A, 2e9b:B
8 3wdh:A 698 533 0.1735 0.1991 0.2608 6.44e-38 3wdi:A, 3wdj:A
9 2ya1:A 981 624 0.2072 0.1692 0.2660 5.55e-34 2j44:A, 2ya0:A, 2ya2:A
10 7lsu:A 765 499 0.1623 0.1699 0.2605 6.24e-33 7lsa:A, 7lsr:A, 7lst:A
11 3faw:A 775 631 0.2110 0.2181 0.2678 1.02e-31 3fax:A
12 8xx9:A 620 270 0.1024 0.1323 0.3037 9.48e-23 8xxa:A
13 3vgf:A 555 202 0.0849 0.1225 0.3366 4.25e-22 3vgg:A, 3vgh:A
14 8dl1:A 713 248 0.0949 0.1066 0.3065 5.52e-20 8dge:A, 8dge:B, 8dge:C, 8dge:D, 8dl1:B, 8dl1:C, 8dl1:D, 8dl2:A, 8dl2:B, 8dl2:C, 8dl2:D
15 3m07:A 584 452 0.1323 0.1815 0.2345 6.82e-18
16 4aio:A 883 522 0.1548 0.1404 0.2375 3.56e-16 4cvw:A, 4cvw:B, 4j3s:A, 4j3t:A, 4j3u:A, 4j3u:B, 4j3v:A, 4j3w:A, 4j3x:A, 2y4s:A, 2y5e:A
17 2bhz:A 589 218 0.0749 0.1019 0.2752 1.89e-14 2bhy:A, 2bxy:A, 2bxz:A, 2by0:A, 2by1:A, 2by2:A, 2by3:A
18 1wza:A 488 240 0.0861 0.1414 0.2875 2.99e-14
19 7p43:B 690 217 0.0774 0.0899 0.2857 1.18e-13 7p43:A
20 5clt:A 646 216 0.0774 0.0960 0.2870 4.76e-13 5clt:B, 5clt:C, 5clw:A, 5clw:C, 5clw:B
21 1gvi:B 588 197 0.0674 0.0918 0.2741 1.21e-12 1gvi:A
22 5ot1:A 572 184 0.0662 0.0927 0.2880 3.13e-12
23 5brp:A 555 228 0.0712 0.1027 0.2500 3.78e-12 5brp:B, 5brp:C, 5brp:D, 5brq:A, 5brq:B, 5brq:C, 5brq:D
24 5jy7:B 571 226 0.0737 0.1033 0.2611 7.90e-12 5jy7:A, 5jy7:C, 5jy7:D, 5jy7:E, 5jy7:F, 5jy7:G, 5jy7:H, 3zo9:A, 3zo9:B, 3zoa:B, 3zoa:A
25 5yna:A 1055 357 0.1049 0.0796 0.2353 1.17e-11 2fgz:A, 2fh6:A, 2fh8:A, 2fhb:A, 2fhc:A, 2fhf:A, 6j33:A, 6j33:B, 6j34:A, 6j35:A, 6j35:B, 6j4h:A, 5yn2:A, 5yn7:A, 5ync:A, 5ynd:A, 5yne:A, 5ynh:A, 2yoc:A, 2yoc:B
26 2ze0:A 531 227 0.0724 0.1092 0.2555 1.22e-11
27 1j0h:A 588 204 0.0637 0.0867 0.2500 1.37e-11 1j0h:B, 1j0i:A, 1j0i:B, 1j0j:B, 1j0j:A, 1j0k:A, 1j0k:B
28 7d9b:A 588 201 0.0649 0.0884 0.2587 1.42e-11 7d9c:A, 7dcg:A, 7dch:A, 7ehh:A, 7ehi:A
29 5x7u:A 546 226 0.0799 0.1172 0.2832 2.58e-11
30 5ykb:D 523 217 0.0799 0.1224 0.2949 2.77e-11 5ykb:B
31 4lxf:B 546 226 0.0724 0.1062 0.2566 3.35e-11
32 8uzh:B 626 226 0.0724 0.0927 0.2566 3.60e-11 4lxf:A, 8uqv:A, 8uqv:B, 8uqv:C, 8uqv:D, 8uzh:A
33 5do8:B 553 225 0.0749 0.1085 0.2667 4.44e-11 5do8:A, 5do8:C
34 2z1k:A 474 185 0.0712 0.1203 0.3081 8.67e-11 2z1k:B, 2z1k:C, 2z1k:D
35 5a2a:A 452 175 0.0612 0.1084 0.2800 1.02e-10 5a2b:A, 5a2c:A
36 4how:A 559 228 0.0712 0.1020 0.2500 1.60e-10 4hox:A, 4hoz:A, 4hp5:A, 4hph:A
37 3gbe:A 558 228 0.0724 0.1039 0.2544 1.66e-10
38 5h06:B 499 259 0.0849 0.1363 0.2625 2.01e-10 5h05:A, 5h05:B, 5h05:C, 5h05:D, 5h06:A, 5h06:C, 5h06:D
39 4h8v:A 557 232 0.0749 0.1077 0.2586 2.03e-10 4gi6:A, 4gi6:B, 4gi8:A, 4gi8:B, 4gi9:A, 4gi9:B, 4gia:A, 4gia:B, 4gin:A, 4go8:A, 4go8:B, 4go9:A, 4go9:B, 4h2c:A, 4h7v:A, 4h7v:B, 4h8h:A, 4h8h:B, 4h8u:A, 4h8u:B, 4h8v:B, 4ha1:A, 4ha1:B, 2pwd:A, 2pwd:B, 2pwe:A, 2pwe:B, 2pwf:A, 2pwf:B, 2pwf:C, 2pwf:D, 2pwg:A, 2pwg:B, 2pwh:A, 2pwh:B, 1zja:A, 1zja:B, 1zjb:A, 1zjb:B
40 7jjt:A 513 230 0.0699 0.1092 0.2435 3.96e-10
41 6a0k:A 450 195 0.0624 0.1111 0.2564 6.32e-10 6a0j:A, 6a0k:B, 6a0l:A, 5zxg:A
42 5gqv:A 755 208 0.0762 0.0808 0.2933 7.23e-10 5gqx:A, 5gqy:A, 5gr1:A, 5gr4:A
43 7lv6:B 559 229 0.0699 0.1002 0.2445 9.53e-10 4m56:A, 4m56:B, 4m8u:A, 4maz:A, 4mb1:A, 5wcz:A, 5wcz:B
44 9ezl:A 548 236 0.0824 0.1204 0.2797 4.04e-09 9ezl:B, 9ezl:C, 9ezl:D, 9ezl:E, 9ezl:F, 9ezl:G, 9ezl:H, 5gtw:A, 5gtw:B, 5gtw:C, 5gtw:D, 4tvu:A, 4tvu:B, 4tvu:C, 4tvu:D, 4tvu:E, 4tvu:F, 4tvu:G, 4tvu:H, 4wf7:A, 4wf7:B, 4wf7:C, 4wf7:D, 5ykb:A, 5ykb:C
45 4e2o:A 445 184 0.0587 0.1056 0.2554 4.97e-09
46 6y9t:A 536 225 0.0674 0.1007 0.2400 7.02e-09 6y9t:B
47 8ibk:A 546 228 0.0687 0.1007 0.2412 7.18e-09 8ids:A, 5zcb:A, 5zcc:A, 5zcd:A, 5zce:A
48 7jjn:A 514 123 0.0412 0.0642 0.2683 7.79e-09 7jjn:B
49 7jjn:A 514 49 0.0200 0.0311 0.3265 0.40 7jjn:B
50 3a6o:A 585 196 0.0624 0.0855 0.2551 1.22e-08 3a6o:B, 2d2o:A, 2d2o:B, 1g1y:A, 1g1y:B, 1jf5:A, 1jf5:B, 1jf6:A, 1jf6:B, 1ji2:A, 1ji2:B, 1jib:A, 1jib:B, 1jl8:A, 1jl8:B, 1vb9:A, 1vb9:B, 1vfm:A, 1vfm:B, 1vfo:A, 1vfo:B, 1vfu:A, 1vfu:B, 1wzk:A, 1wzk:B, 1wzl:A, 1wzl:B, 1wzm:A, 1wzm:B
51 4aie:A 537 228 0.0712 0.1061 0.2500 1.95e-08
52 3wy1:A 535 225 0.0699 0.1047 0.2489 3.77e-08 3wy1:B, 3wy2:A, 3wy2:B, 3wy3:A, 3wy3:B, 3wy4:A
53 6sau:B 442 182 0.0599 0.1086 0.2637 8.58e-08 6sau:A
54 5m99:A 506 217 0.0624 0.0988 0.2304 1.88e-07 5m99:B
55 4wlc:A 536 224 0.0674 0.1007 0.2411 3.74e-07 4xb3:A, 2zic:A, 2zid:A
56 7p01:A 572 170 0.0512 0.0717 0.2412 6.03e-07 7p01:B, 7p07:A, 7p07:B
57 1lwh:A 441 126 0.0462 0.0839 0.2937 6.26e-07 1lwh:B, 1lwj:A, 1lwj:B
58 3vu2:A 692 202 0.0674 0.0780 0.2673 9.38e-07 7ml5:A, 3vu2:B
59 6k5p:A 531 220 0.0624 0.0942 0.2273 3.18e-06 6k5p:B, 6k5p:C, 6k5p:D
60 1cyg:A 680 195 0.0612 0.0721 0.2513 3.31e-06
61 2taa:A 478 189 0.0562 0.0941 0.2381 6.88e-06 2guy:A, 2gvy:A, 2gvy:B, 3kwx:A, 7p4w:A, 2taa:B, 2taa:C, 6taa:A, 7taa:A, 3vx0:A, 3vx1:A, 6xsj:A, 6xsj:B, 6xsv:A, 6yq7:A, 6yq7:B, 6yq9:AAA, 6yq9:BBB, 6yqa:AAA, 6yqa:BBB, 6yqb:AAA, 6yqb:BBB, 6yqc:AAA, 6yqc:BBB
62 8im8:A 557 111 0.0424 0.0610 0.3063 7.19e-06 8im8:B, 8im8:C, 8im8:D
63 6wni:A 494 197 0.0574 0.0931 0.2335 7.39e-06 6wni:B, 6wnu:A
64 8sdb:C 604 420 0.1223 0.1623 0.2333 1.34e-05 5e6y:A, 5e6y:B, 5e6y:D, 5e6z:A, 5e6z:B, 5e6z:D, 5e70:A, 5e70:B, 5e70:D, 4lpc:A, 4lpc:B, 4lpc:D, 4lq1:B, 4lq1:C, 4lq1:D, 4lq1:A, 8sdb:A, 8sdb:B
65 3uer:A 651 128 0.0449 0.0553 0.2812 1.49e-05
66 3uer:A 651 88 0.0262 0.0323 0.2386 8.7
67 3k8k:A 650 103 0.0387 0.0477 0.3010 1.62e-05 6bs6:A, 6bs6:B, 3k8k:B, 3k8l:A, 3k8l:B, 3k8m:A, 3k8m:B
68 6lga:A 570 246 0.0624 0.0877 0.2033 2.02e-05 6lga:B, 6lgb:A, 6lgb:B, 6lgc:A, 6lgc:B, 6lgd:A, 6lgd:B, 6lge:A, 6lge:B, 6lgf:A, 6lgf:B, 6lgg:A, 6lgg:B, 6lgh:A, 6lgh:B, 6lgi:A, 6lgi:B
69 5e6y:C 584 402 0.1111 0.1524 0.2214 2.73e-05 5e6z:C, 5e70:C, 4lpc:C
70 1d7f:A 686 197 0.0599 0.0700 0.2437 3.64e-05 1d7f:B, 1ded:A, 1ded:B, 1i75:A, 1i75:B, 1pam:A, 1pam:B, 1ukq:A, 1ukq:B, 1uks:A, 1uks:B, 1ukt:A, 1ukt:B, 1v3j:A, 1v3j:B, 1v3k:A, 1v3k:B, 1v3l:A, 1v3l:B, 1v3m:A, 1v3m:B
71 1cdg:A 686 198 0.0587 0.0685 0.2374 4.47e-05 1cgv:A, 1cgw:A, 1cgx:A, 1cgy:A, 1cxe:A, 1cxf:A, 1cxh:A, 1cxi:A, 1cxk:A, 1cxl:A, 2cxg:A, 1d3c:A, 2dij:A, 1dtu:A, 1eo5:A, 1eo7:A, 1kck:A, 1kcl:A, 1ot1:A, 1ot2:A, 1pez:A, 1pj9:A, 1tcm:A, 1tcm:B
72 2aaa:A 476 198 0.0574 0.0966 0.2323 5.93e-05
73 3wy4:B 421 221 0.0662 0.1259 0.2398 9.16e-05
74 3czk:A 618 123 0.0424 0.0550 0.2764 1.20e-04 3czg:A, 3czl:A
75 1gjw:A 636 104 0.0424 0.0535 0.3269 1.74e-04
76 8yif:A 537 230 0.0599 0.0894 0.2087 2.16e-04 8yie:A, 8yie:B
77 1qho:A 686 139 0.0487 0.0569 0.2806 3.08e-04 1qhp:A
78 1a47:A 683 207 0.0612 0.0717 0.2367 4.56e-04 3bmv:A, 3bmw:A, 1ciu:A
79 6sao:A 438 180 0.0549 0.1005 0.2444 6.13e-04
80 8slv:A 562 203 0.0549 0.0783 0.2167 6.83e-04
81 3ueq:A 632 108 0.0300 0.0380 0.2222 0.002 4fls:A, 1jg9:A, 1jgi:A, 1mvy:A, 1mw0:A, 1mw1:A, 1mw2:A, 1mw3:A, 5n6v:A, 5n7j:A, 1s46:A, 1zs2:A
82 3vm7:A 470 185 0.0524 0.0894 0.2270 0.003
83 5zcr:A 725 103 0.0387 0.0428 0.3010 0.005 5zcr:B
84 6sav:A 438 102 0.0325 0.0594 0.2549 0.010 6sav:B
85 6li9:A 623 238 0.0562 0.0722 0.1891 0.011 6li9:C, 6lid:A, 6lid:C, 6yup:A, 6yup:C, 6yuz:A, 6yuz:C
86 3a47:A 586 213 0.0562 0.0768 0.2113 0.017 3a4a:A, 3aj7:A, 3axh:A, 3axi:A
87 4jcm:A 669 188 0.0437 0.0523 0.1862 0.022
88 1cgt:A 684 197 0.0524 0.0614 0.2132 0.024 1cgu:A, 3cgt:A, 4cgt:A, 5cgt:A, 6cgt:A, 7cgt:A, 8cgt:A, 9cgt:A
89 1clv:A 471 116 0.0387 0.0658 0.2672 0.076 1jae:A, 1tmq:A, 1viw:A
90 7nf6:A 623 233 0.0574 0.0738 0.1974 0.079 7nf7:A, 7nf8:A
91 8orp:A 476 121 0.0387 0.0651 0.2562 0.11 8orp:B
92 1mxd:A 435 58 0.0262 0.0483 0.3621 0.16 1mwo:A, 1mxg:A
93 1b2y:A 496 148 0.0412 0.0665 0.2230 0.17 3bai:A, 3baj:A, 3bak:A, 3baw:A, 3bax:A, 3bay:A, 3blk:A, 3blp:X, 1bsi:A, 1c8q:A, 1cpu:A, 2cpu:A, 3cpu:A, 3dhp:A, 5e0f:A, 5emy:A, 4gqq:A, 4gqr:A, 1hny:A, 3ij7:A, 3ij8:A, 3ij9:A, 1jxj:A, 1jxk:A, 1kb3:A, 1kbb:A, 1kbk:A, 5kez:A, 1kgu:A, 1kgw:A, 1kgx:A, 1mfu:A, 1mfv:A, 1nm9:A, 6obx:A, 6ocn:A, 3old:A, 3ole:A, 3olg:A, 3oli:A, 1q4n:X, 2qmk:A, 2qv4:A, 1smd:A, 5td4:A, 1u2y:A, 1u30:A, 1u33:A, 5u3a:A, 5va9:A, 5va9:B, 4w93:A, 4x9y:A, 1xcw:A, 1xcx:A, 1xd0:A, 1xd1:A, 1xgz:A, 1xh0:A, 1xh1:A, 1xh2:A, 1xv8:A, 1xv8:B, 1z32:X, 6z8l:A
94 3edd:B 597 100 0.0300 0.0402 0.2400 0.20 3edd:A, 3ede:A, 3ede:B, 3edf:A, 3edf:B, 3edj:A, 3edj:B, 3edk:A, 3edk:B, 1h3g:A, 1h3g:B
95 1bcs:B 153 96 0.0275 0.1438 0.2292 0.22 1wht:B
96 7dsn:A 471 107 0.0337 0.0573 0.2523 0.61 2dh3:A, 6jmq:B
97 3wn6:A 404 116 0.0437 0.0866 0.3017 0.71 3wn6:B, 3wn6:C, 3wn6:D
98 6aij:A 687 119 0.0362 0.0422 0.2437 0.73 4jcl:A, 6l2h:A, 3wms:A
99 4ege:A 371 94 0.0400 0.0863 0.3404 1.2
100 1bag:A 425 109 0.0362 0.0682 0.2661 1.4 3dc0:A, 1ua7:A
101 7zc0:AAA 710 109 0.0337 0.0380 0.2477 1.8
102 1aqh:A 448 111 0.0275 0.0491 0.1982 2.0 1aqm:A, 1b0i:A, 8cqf:A, 8cqg:A, 1g94:A, 1g9h:A, 1jd7:A, 1jd9:A, 1kxh:A, 1l0p:A
103 7usn:A 168 43 0.0187 0.0893 0.3488 3.1 7usn:B, 7usn:C, 7usn:D, 7usn:E, 7usn:F, 7usn:G, 7usn:O, 7usn:H, 7usn:I, 7usn:J, 7usn:K, 7usn:L, 7usn:M, 7usn:N, 7usn:P
104 1bli:A 481 176 0.0524 0.0873 0.2386 3.2 1ob0:A, 6toy:A, 6toz:A, 6tp0:A, 6tp1:A, 6tp2:A
105 3bsg:A 404 41 0.0175 0.0347 0.3415 4.1 3bsh:A, 1ht6:A, 1p6w:A, 2qps:A, 2qpu:B, 2qpu:A, 2qpu:C, 1rp8:A, 1rp9:A, 1rpk:A
106 6je8:A 469 80 0.0262 0.0448 0.2625 4.1 6jea:A, 6jeb:A
107 3qgv:A 435 40 0.0175 0.0322 0.3500 6.1
108 1amy:A 403 41 0.0200 0.0397 0.3902 6.7 1ava:A, 1ava:B, 1bg9:A
109 6ag0:C 483 98 0.0337 0.0559 0.2755 9.1 6ag0:A, 1hvx:A, 4uzu:A
110 1bvn:P 496 171 0.0487 0.0786 0.2281 9.4 1dhk:A, 1hx0:A, 1jfh:A, 1kxq:A, 1kxq:B, 1kxq:C, 1kxq:D, 1kxt:A, 1kxt:C, 1kxt:E, 3l2l:A, 3l2m:A, 1ose:A, 1pif:A, 1pig:A, 1ppi:A, 1ua3:A, 1vah:A, 1wo2:A, 4x0n:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218