BioLiP

>protein
KKWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEIVLGNVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLW
DQSLKPCVKLTPLNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCNSKTFNGSGPCTNVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNG
SLAEEEIVIRSENITDNAKTIIVQLNEAVEINCTRPNNNTRKSNIRQAHCNISKARWNETLGQIVAKLEEQFPNKTFNHS
SGGDPEIVTHSFNCGGEFFYCNTTPLFNQNITLQCRIKQIINMWQGVGKAMYAPPIRGQIRCSSNITGLLLTRDGTFRPG
GGNMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGIAPTACKRR

The query sequence (length=353) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6x5b:A	353	353	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
2	6opp:A	389	387	1.0000	0.9075	0.9121	0.0	6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
3	6edu:D	401	415	0.9518	0.8379	0.8096	0.0	6edu:E, 6edu:F
4	6meo:G	398	395	0.8470	0.7513	0.7570	0.0	6met:G
5	7txd:A	397	395	0.8329	0.7406	0.7443	0.0	7txd:E
6	6cm3:D	372	374	0.8074	0.7661	0.7620	0.0	6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
7	4laj:A	343	349	0.8187	0.8426	0.8281	0.0	4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
8	6ch9:G	448	447	0.8612	0.6786	0.6801	0.0	6mug:G
9	8d53:G	446	440	0.8017	0.6345	0.6432	0.0
10	5w4l:G	357	358	0.7450	0.7367	0.7346	0.0	6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
11	3tgs:A	345	353	0.7450	0.7623	0.7450	0.0	5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
12	8tgw:A	387	411	0.7875	0.7183	0.6764	0.0
13	4r4n:B	342	346	0.7365	0.7602	0.7514	0.0	4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
14	4xmp:G	337	346	0.7450	0.7804	0.7601	0.0
15	5fa2:A	336	342	0.7110	0.7470	0.7339	0.0
16	4j6r:G	343	353	0.7224	0.7434	0.7224	1.15e-180
17	5te4:G	341	350	0.7025	0.7273	0.7086	1.06e-175
18	1gc1:G	297	308	0.6827	0.8114	0.7825	1.72e-168
19	7n6u:B	595	447	0.7479	0.4437	0.5906	6.93e-166	5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
20	8d0y:G	455	449	0.7224	0.5604	0.5679	1.55e-159	5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
21	8czz:A	440	439	0.6827	0.5477	0.5490	3.99e-153	8czz:E, 8czz:I
22	8fae:A	468	314	0.6261	0.4722	0.7038	1.68e-150	8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
23	8fae:A	468	93	0.2521	0.1902	0.9570	5.74e-58	8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
24	7lu9:e	461	323	0.6062	0.4642	0.6625	8.69e-144	7lu9:f
25	7lu9:e	461	91	0.2351	0.1800	0.9121	5.71e-55	7lu9:f
26	5fyj:G	479	464	0.6714	0.4948	0.5108	6.37e-142
27	7mxd:A	472	308	0.5751	0.4301	0.6591	4.37e-138	7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
28	7mxd:A	472	105	0.2380	0.1780	0.8000	3.77e-53	7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
29	6pwu:A	615	306	0.5807	0.3333	0.6699	3.01e-136	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
30	6pwu:A	615	91	0.2351	0.1350	0.9121	3.82e-53	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
31	6tyb:G	345	360	0.3286	0.3362	0.3222	1.28e-48	3fus:A
32	7t4g:A	493	306	0.2663	0.1907	0.3072	3.11e-34	7t4g:C, 7t4g:E
33	7t4g:A	493	102	0.1303	0.0933	0.4510	3.24e-18	7t4g:C, 7t4g:E
34	7dia:A	1072	58	0.0538	0.0177	0.3276	0.19	3s5k:A, 8wyt:A, 8wyx:A, 8wyy:A
35	3s5m:A	1094	58	0.0538	0.0174	0.3276	0.21	7di7:A, 7dij:A, 8ho4:A, 8ho5:A, 3s5h:A, 7vpe:A, 8wxw:A, 8wxz:A, 8wyu:A
36	2b33:B	126	65	0.0538	0.1508	0.2923	1.6
37	8p5d:SE0	260	72	0.0623	0.0846	0.3056	2.6	8p60:SE0, 8p60:RE0, 7qca:SE0
38	2zpu:A	319	59	0.0340	0.0376	0.2034	3.5	1v71:A, 1wtc:A, 2zr8:A
39	7rsw:B	125	28	0.0340	0.0960	0.4286	3.6
40	2f9w:A	249	33	0.0340	0.0482	0.3636	4.2	2f9w:B
41	8hud:A	767	50	0.0312	0.0143	0.2200	6.2
42	4z67:A	309	64	0.0510	0.0583	0.2812	7.1	6e13:A, 3jxp:A, 1xto:A, 4z5y:A, 4z5z:A, 4z60:A, 4z6x:A
43	3atp:A	151	34	0.0227	0.0530	0.2353	8.1	3atp:B

[Back]