Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KKWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEIVLGNVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLW
DQSLKPCVKLTPLNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCNSKTFNGSGPCTNVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNG
SLAEEEIVIRSENITDNAKTIIVQLNEAVEINCTRPNNNTRKSNIRQAHCNISKARWNETLGQIVAKLEEQFPFNHSSGG
DPEIVTHSFNCGGEFFYCNTTPLFNQNITLQCRIKQIINMWQGVGKAMYAPPIRGQIRCSSNITGLLLTRDGTFRPGGGN
MRDNWRSELYKYKVVKIEPLGIAPTACKRR

The query sequence (length=350) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6x5b:A 353 353 1.0000 0.9915 0.9915 0.0 6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
2 6opp:A 389 387 1.0000 0.8997 0.9044 0.0 6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
3 6edu:D 401 415 0.9514 0.8304 0.8024 0.0 6edu:E, 6edu:F
4 6meo:G 398 395 0.8457 0.7437 0.7494 0.0 6met:G
5 7txd:A 397 395 0.8343 0.7355 0.7392 0.0 7txd:E
6 6cm3:D 372 374 0.8086 0.7608 0.7567 0.0 6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
7 4laj:A 343 349 0.8229 0.8397 0.8252 0.0 4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
8 6ch9:G 448 446 0.8629 0.6741 0.6771 0.0 6mug:G
9 8d53:G 446 439 0.8000 0.6278 0.6378 0.0
10 5w4l:G 357 358 0.7429 0.7283 0.7263 0.0 6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
11 3tgs:A 345 353 0.7457 0.7565 0.7394 0.0 5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
12 4r4n:B 342 346 0.7371 0.7544 0.7457 0.0 4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
13 8tgw:A 387 413 0.7943 0.7183 0.6731 0.0
14 4xmp:G 337 345 0.7429 0.7715 0.7536 0.0
15 5fa2:A 336 342 0.7143 0.7440 0.7310 0.0
16 4j6r:G 343 353 0.7200 0.7347 0.7139 5.48e-178
17 5te4:G 341 350 0.6971 0.7155 0.6971 4.36e-174
18 1gc1:G 297 308 0.6857 0.8081 0.7792 2.36e-167
19 7n6u:B 595 447 0.7457 0.4387 0.5839 2.81e-163 5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
20 8d0y:G 455 449 0.7229 0.5560 0.5635 8.93e-158 5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
21 8czz:A 440 439 0.6800 0.5409 0.5421 1.52e-150 8czz:E, 8czz:I
22 8fae:A 468 314 0.6286 0.4701 0.7006 1.38e-149 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
23 8fae:A 468 93 0.2543 0.1902 0.9570 5.60e-58 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
24 7lu9:e 461 323 0.6057 0.4599 0.6563 6.41e-142 7lu9:f
25 7lu9:e 461 91 0.2371 0.1800 0.9121 6.00e-55 7lu9:f
26 5fyj:G 479 464 0.6686 0.4885 0.5043 1.75e-139
27 6pwu:A 615 305 0.5800 0.3301 0.6656 3.65e-136 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
28 6pwu:A 615 91 0.2371 0.1350 0.9121 3.29e-53 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
29 7mxd:A 472 322 0.5800 0.4301 0.6304 1.34e-135 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
30 7mxd:A 472 105 0.2400 0.1780 0.8000 3.93e-53 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
31 6tyb:G 345 359 0.3257 0.3304 0.3175 1.12e-48 3fus:A
32 7t4g:A 493 305 0.2629 0.1866 0.3016 2.01e-34 7t4g:C, 7t4g:E
33 7t4g:A 493 102 0.1314 0.0933 0.4510 3.08e-18 7t4g:C, 7t4g:E
34 2b33:B 126 65 0.0543 0.1508 0.2923 1.6
35 8p5d:SE0 260 72 0.0629 0.0846 0.3056 2.6 8p60:SE0, 8p60:RE0, 7qca:SE0
36 7rsw:B 125 28 0.0343 0.0960 0.4286 3.6
37 2zpu:A 319 59 0.0343 0.0376 0.2034 3.6 1v71:A, 1wtc:A, 2zr8:A
38 7dia:A 1072 58 0.0629 0.0205 0.3793 4.9 3s5k:A, 8wyt:A, 8wyx:A, 8wyy:A
39 3s5m:A 1094 58 0.0629 0.0201 0.3793 5.0 7di7:A, 7dij:A, 8ho4:A, 8ho5:A, 3s5h:A, 7vpe:A, 8wxw:A, 8wxz:A, 8wyu:A
40 1bzw:A 232 77 0.0657 0.0991 0.2987 5.8 1bzw:B, 1bzw:C, 1bzw:D, 1ciw:A, 1ciw:B, 1ciw:C, 1ciw:D, 1cq9:A, 1cq9:B, 1cq9:C, 1cq9:D, 1cr7:A, 1cr7:B, 1cr7:E, 1cr7:C, 1cr7:D, 1cr7:F, 1cr7:G, 1cr7:H, 2dv9:A, 2dv9:B, 2dv9:C, 2dv9:D, 2dva:A, 2dva:B, 2dva:C, 2dva:D, 2dvb:A, 2dvb:B, 2dvb:C, 2dvb:D, 2dvd:A, 2dvd:B, 2dvd:C, 2dvd:D, 2dvf:A, 2dvf:B, 2dvf:C, 2dvf:D, 2dvg:D, 2dvg:A, 2dvg:B, 2dvg:C, 2pel:A, 2pel:B, 2pel:C, 2pel:D, 1qf3:A, 1qf3:B, 1qf3:C, 1qf3:D, 1rir:A, 1rir:B, 1rir:C, 1rir:D, 1rit:C, 1rit:D, 1rit:A, 1rit:B, 2tep:A, 2tep:B, 2tep:C, 2tep:D, 1v6i:A, 1v6i:B, 1v6i:C, 1v6i:D, 1v6j:A, 1v6j:B, 1v6j:C, 1v6j:D, 1v6k:A, 1v6k:B, 1v6k:C, 1v6k:D, 1v6l:A, 1v6l:B, 1v6l:C, 1v6l:D, 1v6m:A, 1v6m:B, 1v6m:C, 1v6m:D, 1v6m:E, 1v6m:F, 1v6m:G, 1v6m:H, 1v6n:A, 1v6n:B, 1v6n:C, 1v6n:D, 1v6n:E, 1v6n:F, 1v6n:G, 1v6n:H, 1v6o:A, 1v6o:B, 1v6o:C, 1v6o:D, 1v6o:E, 1v6o:F, 1v6o:G, 1v6o:H, 6v95:A, 6v95:B, 6v95:C, 6v95:D, 6vav:A, 6vav:B, 6vav:C, 6vav:D, 6vaw:A, 6vaw:B, 6vaw:C, 6vaw:D, 6vc3:A, 6vc3:B, 6vc3:C, 6vc3:D, 6vc4:A, 6vc4:B, 6vc4:C, 6vc4:D, 6vgf:A, 6vgf:B, 6vgf:C, 6vgf:D
41 8hud:A 767 50 0.0314 0.0143 0.2200 5.8
42 4z67:A 309 64 0.0514 0.0583 0.2812 7.5 6e13:A, 3jxp:A, 1xto:A, 4z5y:A, 4z5z:A, 4z60:A, 4z6x:A
43 3atp:A 151 34 0.0229 0.0530 0.2353 8.3 3atp:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218