Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KKVLTLEGDLVLGGLFPVHQKGGPAEDCGPVNEHRGIQRLEAMLFALDRINRDPHLLPGVRLGAHILDSCSKDTHALEQA
LDFVRASTAITGVIGGSYSDVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSDKSRYDYFARTVPPDFFQAKAMAEILRFFNWTY
VSTVASEGDYGETGIEAFELEARARNICVATSEKVGRAMSRAAFEGVVRALLQKPSARVAVLFTRSEDARELLAASQRLN
ASFTWVASDGWGALESVVAGSEGAAEGAITIELASYPISDFASYFQSLDPWNNSRNPWFREFWEQRFRCSFRQRDCAAHS
LRAVPFEQESKIMFVVNAVYAMAHALHNMHRALCPNTTRLCDAMRPVNGRRLYKDFVLNVKFDAPFRPADTHNEVRFDRF
GDGIGRYNIFTYLRAGGRYRYQKVGYWAEGLTLDTSLIPWASPSAGPLPASRCSEPCLQNEVKSVQPGEVCCWLCIPCQP
YEYRLDEFTCADCGLGYWPNASLTGCFELPQEYIRWGDAWAVGPVTIACLGALATLFVLGVFVRHNATPVVKASGRELCY
ILLGGVFLCYCMTFIFIAKPSTAVCTLRRLGLGTAFSVCYSALLTKTNRIARIRFISPASQVAICLALISGQLLIVVAWL
VVEAPGTGKETAPERREVVTLRCNHRDASMLGSLAYNVLLIALCTLYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTMYTTCIIWLAFLP
IFYVTSSDYRVQTTTMCVSVSLSGSVVLGCLFAPKLHIILFQPQ

The query sequence (length=764) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8jd5:2 785 776 0.9987 0.9720 0.9832 0.0 5cni:A, 5cni:B, 5cnj:A, 5cnj:B, 7e9g:R, 7e9g:S, 8jcu:2, 8jcv:2, 8jcw:2, 8jcx:2, 8jcy:2, 8jcz:2, 8jd0:2, 8jd1:2, 8jd2:2, 8jd3:2, 5kzn:A, 5kzq:A, 7mtr:B, 7mtr:A, 7mts:A, 7mts:B, 4xaq:A, 4xaq:B, 4xas:A, 4xas:B
2 7epb:A 779 784 0.9843 0.9653 0.9592 0.0 7epb:B, 7mtq:A
3 7mtq:B 744 762 0.9686 0.9946 0.9711 0.0 8jd4:2
4 8jcu:3 765 773 0.7003 0.6993 0.6921 0.0 6b7h:A, 5cnk:A, 5cnm:A, 8jcv:3, 8jcw:3, 8jcx:3, 8jcy:3, 8jcz:3, 8jd0:3, 8jd1:3, 8jd2:3, 8jd3:3, 3sm9:A, 8tr0:A, 7wih:A, 7wih:B, 4xar:A
5 8tr2:A 745 772 0.6819 0.6993 0.6749 0.0 2e4u:A, 2e4u:B, 2e4v:A, 2e4v:B, 2e4w:A, 2e4w:B, 2e4x:A, 2e4x:B, 2e4y:A, 2e4y:B, 8tqb:A, 8tqb:B, 8tr0:B, 8tr2:B, 8trc:A, 8trc:B, 8trd:A, 8trd:B, 7wi6:A, 7wi6:B, 7wi8:A, 7wi8:B
6 8jd6:R 774 786 0.5000 0.4935 0.4860 0.0 7e9h:R, 7e9h:S, 8jd4:4, 8jd5:4, 8jd6:S
7 7dge:A 784 799 0.4791 0.4668 0.4581 0.0 1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
8 8tao:B 771 785 0.4725 0.4682 0.4599 0.0 7fd8:A, 7fd8:B, 7fd9:A, 7fd9:B, 3lmk:A, 3lmk:B, 8t8m:A
9 6n51:B 793 805 0.4738 0.4565 0.4497 0.0 6n4x:B, 6n4y:C, 6n50:A, 6n50:B, 6n50:C, 6n51:A, 8t6j:B, 8t6j:A, 8t7h:A, 8t7h:B, 8t8m:B, 8tao:A
10 6e5v:B 447 453 0.2657 0.4541 0.4481 8.96e-129 6bsz:A, 6bsz:B, 6bt5:A, 6bt5:B, 6e5v:A
11 8szi:B 802 797 0.3521 0.3354 0.3375 1.55e-127 9avg:Q, 9axf:Q, 9ayf:Q, 7dd6:A, 7dd6:B, 7dd7:A, 7dd7:B, 7m3j:A, 7m3j:B, 7sil:A, 7sil:B, 7sim:A, 7sim:B, 7sin:A, 7sin:B, 8szf:A, 8szf:B, 8szg:B
12 5c5c:A 432 447 0.2657 0.4699 0.4541 1.23e-126
13 8szh:A 835 818 0.3521 0.3222 0.3289 1.78e-122 9asb:Q, 9asb:R, 9avg:R, 9avl:Q, 9avl:R, 9axf:R, 9ayf:R, 7dd5:A, 7dd5:B, 7e6t:B, 7e6t:A, 5fbh:B, 5fbh:A, 5fbk:A, 5fbk:B, 5k5s:A, 5k5s:B, 7m3e:A, 7m3e:B, 7m3f:A, 7m3f:B, 7m3g:A, 7m3g:B, 8szg:A, 8szh:B, 8szi:A, 8wpg:B, 8wpg:A, 8wpu:B, 8wpu:A
14 7dtv:A 779 807 0.3312 0.3248 0.3135 1.63e-112 7dtu:A, 7dtu:B, 7dtv:B
15 3mq4:A 386 440 0.2448 0.4845 0.4250 5.74e-105
16 7epe:A 389 151 0.1806 0.3548 0.9139 1.23e-84 7epf:A
17 7epe:A 389 97 0.1257 0.2468 0.9897 7.47e-55 7epf:A
18 4or2:B 366 266 0.1728 0.3607 0.4962 4.28e-75 4or2:A
19 5k5t:A 578 577 0.2343 0.3097 0.3102 6.64e-70
20 5x2n:B 459 476 0.1688 0.2810 0.2710 9.25e-37 5x2m:B, 5x2n:D, 5x2o:B, 5x2o:D, 5x2p:B, 5x2q:B, 5x2q:D
21 6ffh:A 414 149 0.1008 0.1860 0.5168 1.09e-36 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
22 6ffh:A 414 108 0.0759 0.1401 0.5370 5.18e-27 5cgc:A, 5cgd:A, 6ffi:A, 4oo9:A, 7p2l:A
23 5x2m:D 422 468 0.1518 0.2749 0.2479 5.99e-28 5x2p:D
24 5x2n:C 433 464 0.1466 0.2587 0.2414 1.11e-24 5x2m:A, 5x2m:C, 5x2n:A, 5x2o:A, 5x2o:C, 5x2p:A, 5x2p:C, 5x2q:A, 5x2q:C
25 7cum:B 675 176 0.0615 0.0696 0.2670 8.79e-09 7c7q:B, 6w2x:B, 6wiv:B
26 6uo8:B 696 176 0.0615 0.0675 0.2670 1.14e-08 7ca3:B, 7eb2:D
27 7lzh:A 798 211 0.0654 0.0627 0.2370 1.35e-08 7lzh:B, 7lzh:C, 7lzh:D, 7lzi:A, 7lzi:B, 7lzi:C, 7lzi:D
28 4tlm:C 750 174 0.0602 0.0613 0.2644 1.75e-06 4tll:C
29 4tlm:A 796 202 0.0641 0.0616 0.2426 2.52e-06 6e7r:A, 6e7r:C, 6e7s:A, 6e7s:C, 6e7t:A, 6e7t:C, 6e7u:A, 6e7u:C, 6e7v:A, 6e7v:C, 6e7w:A, 6e7w:C, 6e7x:A, 6e7x:C, 5ewj:A, 5ewj:C, 5ewl:A, 5ewl:C, 5ewm:A, 5ewm:C, 8g18:A, 8g18:C, 3qel:A, 3qem:A, 3qem:C, 4tll:A, 5tq2:A, 5un1:G, 5un1:A, 5un1:C
30 7yfr:A 691 148 0.0537 0.0593 0.2770 2.52e-05 7yfr:C
31 7she:A 541 298 0.0903 0.1275 0.2315 3.21e-05 7she:B, 7shf:B
32 9arh:A 802 147 0.0510 0.0486 0.2653 3.42e-05 9are:A, 9are:C, 9arf:A, 9arf:C, 9arh:C, 9bib:A, 9bib:C, 7eot:B, 7eot:D, 7eou:B, 7eou:D, 7eu7:A, 7eu7:C, 7saa:A, 7saa:C, 7sac:A, 7sac:C, 5uow:C, 6whu:A, 6whu:C, 6whv:C, 6why:A, 6why:C, 6wi0:A, 6wi0:C, 7yff:A, 7yff:C, 7yfi:A, 7yfi:C
33 7yfg:C 659 147 0.0497 0.0577 0.2585 3.74e-05 2a5t:A, 5dex:A, 5h8f:B, 5h8h:B, 5h8n:B, 5h8q:B, 5i2k:B, 5i2n:B, 5i56:A, 5i57:A, 5i59:A, 5kcj:B, 5kdt:B, 4kfq:A, 4kfq:B, 4nf4:A, 4nf5:A, 4nf6:A, 4nf8:A, 6ovd:A, 6ove:A, 1pb7:A, 1pb8:A, 1pb9:A, 1pbq:A, 5tp9:B, 5tpa:B, 5u8c:A, 6usu:A, 6usv:A, 6uz6:A, 6uzg:A, 6uzr:A, 6uzw:A, 6uzx:A, 5vih:A, 5vii:A, 5vij:A, 1y1m:A, 1y1z:A, 1y20:A, 7yfg:A, 7yfh:A, 7yfh:C
34 6uo8:A 689 432 0.1217 0.1350 0.2153 5.40e-05 7c7q:A, 7c7s:A, 7ca3:A, 7cum:A, 7eb2:C, 4mqf:A, 4mr7:A, 4mr8:A, 4mr9:A, 4mrm:A, 4ms1:A, 4ms3:A, 4ms4:A, 6uo9:A, 6w2x:A, 6w2y:A, 6w2y:B, 6wiv:A
35 6uo8:A 689 196 0.0589 0.0653 0.2296 0.010 7c7q:A, 7c7s:A, 7ca3:A, 7cum:A, 7eb2:C, 4mqf:A, 4mr7:A, 4mr8:A, 4mr9:A, 4mrm:A, 4ms1:A, 4ms3:A, 4ms4:A, 6uo9:A, 6w2x:A, 6w2y:A, 6w2y:B, 6wiv:A
36 7eor:B 770 145 0.0445 0.0442 0.2345 1.12e-04 8e96:A, 8e96:C, 7eor:D, 4pe5:A, 4pe5:C, 8usw:A, 8usw:C
37 7yfl:A 708 145 0.0445 0.0480 0.2345 1.21e-04 7yfl:C
38 7shf:A 296 277 0.0851 0.2196 0.2347 8.98e-04
39 9b36:A 842 147 0.0497 0.0451 0.2585 0.004 9b35:A, 9b35:B, 9b35:C, 9b35:D, 9b36:C, 9b36:D, 9b36:B, 9b37:A, 9b37:D, 9b37:B, 9b37:C, 9b39:A, 9b39:B, 9b39:C, 9b39:D, 8fwq:A, 8fwq:D, 8fwq:B, 8fwq:C, 8fws:A, 8fws:D, 8fws:B, 8fws:C, 8fwu:A, 8fwu:B, 8fwu:C, 8fwu:D, 8fww:A, 8fww:D, 8fww:B, 8fww:C, 3h6g:A, 3h6g:B, 3h6h:A, 3h6h:B
40 4uqq:A 693 164 0.0550 0.0606 0.2561 0.005 9b38:A, 9b38:B, 9b38:C, 9b38:D, 4uqq:B, 4uqq:C, 4uqq:D
41 8gc2:D 760 147 0.0497 0.0500 0.2585 0.006 8f0o:B, 8gc2:A, 8gc2:B, 8gc2:C, 8gc3:B, 8gc3:C, 8gc3:D, 8gc3:A, 8gc4:A, 8gc4:B, 8gc4:C, 8gc4:D, 8gc5:A, 8gc5:B, 8gc5:C, 8gc5:D, 5kuf:A, 5kuf:B, 5kuf:C, 5kuf:D
42 5kuh:A 636 147 0.0497 0.0597 0.2585 0.008 4bdl:A, 4bdl:B, 4bdm:A, 4bdm:B, 4bdm:C, 4bdm:D, 4bdn:A, 4bdn:B, 4bdn:C, 4bdn:D, 4bdo:A, 4bdo:B, 4bdo:C, 4bdo:D, 4bdq:A, 4bdq:B, 4bdr:A, 4bdr:B, 5cmk:A, 5cmk:B, 5cmm:A, 3g3f:A, 3g3f:B, 3g3g:A, 3g3g:B, 3g3h:A, 3g3h:B, 3g3i:A, 3g3i:B, 3g3j:A, 3g3j:B, 3g3k:A, 3g3k:B, 4h8i:A, 2i0b:A, 2i0b:B, 2i0b:C, 2i0c:A, 2i0c:B, 5kuh:B, 5kuh:C, 5kuh:D, 3qxm:A, 3qxm:B, 8r32:A, 8r32:B, 1s50:A, 1s7y:A, 1s7y:B, 1s9t:A, 1s9t:B, 1sd3:A, 1sd3:B, 1tt1:A, 1tt1:B, 2xxr:A, 2xxr:B, 2xxt:A, 2xxt:B, 2xxu:A, 2xxu:B, 2xxv:A, 2xxv:B, 2xxw:A, 2xxw:B, 2xxx:A, 2xxx:B, 2xxx:C, 2xxx:D, 2xxy:A, 2xxy:B, 2xxy:C, 2xxy:D, 1yae:A, 1yae:B, 1yae:C, 1yae:D, 1yae:E
43 4mlc:A 336 122 0.0471 0.1071 0.2951 0.024 4q6b:A
44 7k71:A 843 84 0.0340 0.0308 0.3095 0.073 8gud:A
45 5dxh:D 981 86 0.0353 0.0275 0.3140 0.16 8gua:A, 6oac:A
46 5iov:B 798 184 0.0563 0.0539 0.2337 0.22 5iou:B, 5iou:D, 5iov:D, 5un1:D, 5un1:H
47 4tll:D 757 184 0.0563 0.0568 0.2337 1.2 4tll:B, 4tlm:B, 5un1:B
48 4tlm:D 753 184 0.0563 0.0571 0.2337 1.3
49 8wch:A 396 163 0.0524 0.1010 0.2454 1.3 8wch:B
50 2bsl:A 311 61 0.0262 0.0643 0.3279 2.0 2bsl:B, 2bx7:A, 2bx7:B, 1dor:A, 1dor:B, 2dor:A, 2dor:B, 1jqv:A, 1jqv:B, 1jqx:A, 1jqx:B, 1jrb:A, 1jrb:B, 1jrc:A, 1jrc:B, 1jub:A, 1jub:B, 1jue:A, 1jue:B, 1ovd:A, 1ovd:B
51 4ajw:A 765 57 0.0209 0.0209 0.2807 2.2 4v0i:A
52 4rul:A 823 108 0.0380 0.0352 0.2685 2.2 1cy1:A, 1cy2:A, 1cy4:A, 1cy6:A, 1cy7:A, 1cy8:A, 1mw8:X, 3px7:A
53 4bfr:A 855 61 0.0249 0.0222 0.3115 2.2 4bfr:B
54 3i45:A 378 93 0.0340 0.0688 0.2796 2.9
55 4ykn:A 1205 94 0.0327 0.0207 0.2660 3.9 4a55:A, 8am0:A, 8exl:A, 8exo:A, 8exu:A, 8exv:A, 5fi4:A, 8gub:A, 6gvf:A, 6gvg:A, 6gvi:A, 3hhm:A, 7jiu:A, 4jps:A, 4l23:A, 4l2y:A, 7mlk:A, 7myo:A, 4ovv:A, 8ow2:A, 7pg6:A, 6pys:A, 5sx9:A, 5sxj:A, 8tdu:A, 8tdu:C, 8tgd:A, 8tgd:C, 8ts9:A, 8tsa:A, 8tsb:A, 8tsc:A, 8tsd:A, 4tv3:A, 5uk8:A, 5ukj:A, 5ul1:A, 8v8h:A, 8v8h:C, 8v8i:A, 8v8i:C, 8v8j:A, 8v8j:C, 8v8v:A, 8v8v:C, 8w9a:A, 8w9b:A, 4waf:A, 5xgh:A, 5xgi:A, 3zim:A, 4zop:A
56 4jb0:A 367 182 0.0510 0.1063 0.2143 4.2 4eyq:A, 4fb4:A, 3tx6:A, 3uk0:A, 3ukj:A
57 3bvo:A 197 136 0.0497 0.1929 0.2794 4.7 3bvo:B
58 5ubr:A 887 93 0.0327 0.0282 0.2688 4.8 5dxt:A, 7k6n:A
59 5itd:A 995 36 0.0170 0.0131 0.3611 6.2 5dxh:A, 8ilr:A, 8ils:A, 8ilv:A, 7k6m:A, 7k6o:A, 7r9v:A, 7r9y:A, 8sbc:A, 8sbj:A, 8twy:A, 7tz7:A, 5xgj:A
60 5swp:A 1060 36 0.0170 0.0123 0.3611 6.3 6gvh:A, 5swt:A, 8v8u:A, 8v8u:C
61 5dzk:B 200 45 0.0183 0.0700 0.3111 7.0 5dzk:A, 5dzk:C, 5dzk:D, 5dzk:E, 5dzk:F, 5dzk:G, 5dzk:a, 5dzk:b, 5dzk:c, 5dzk:d, 5dzk:e, 5dzk:f, 5dzk:g, 6iw7:A, 6iw7:C, 6iw7:F, 6iw7:H, 6iw7:J, 6iw7:L, 6iw7:E, 4u0g:A, 4u0g:B, 4u0g:G, 4u0g:C, 4u0g:D, 4u0g:E, 4u0g:F, 4u0g:O, 4u0g:P, 4u0g:Q, 4u0g:R, 4u0g:S, 4u0g:T, 4u0g:U, 6vgn:A, 6vgn:B, 6vgn:G, 6vgn:F, 6vgn:E, 6vgn:D, 6vgn:C, 7x8x:J, 7x8x:A, 7x8x:F, 7x8x:C, 7x8x:H, 7x8x:E, 7x8x:L, 7x8x:V, 7x8x:O, 7x8x:S, 7x8x:Q, 7x8x:T, 7x8x:a, 7x8x:X
62 8duz:A 209 48 0.0236 0.0861 0.3750 7.5 8duz:C
63 2wxl:A 823 61 0.0223 0.0207 0.2787 7.7 6gy0:A, 5i4u:A, 5i6u:A, 6mul:A, 6mul:B, 6mum:B, 5ngb:A, 7r26:A, 5t27:A, 5t28:A, 5t2b:A, 5t2d:A, 5t2g:A, 5t2i:A, 5t2m:A, 5t7f:A, 5t7f:B, 5t8i:A, 2wxf:A, 2wxh:A, 2wxi:A, 2wxj:A, 2wxm:A, 2wxn:A, 2wxo:A, 2wxp:A, 2wxq:A, 2x38:A, 4xe0:A
64 4um9:D 455 51 0.0236 0.0396 0.3529 8.1 5ffg:B, 5ffo:B, 5ffo:F, 5neu:B, 8tcg:B, 4um8:B, 4um8:D, 4um9:B
65 7jx0:A 801 59 0.0236 0.0225 0.3051 8.3 3qjz:A
66 6pyu:A 930 61 0.0223 0.0183 0.2787 9.3 8bcy:A, 5dxu:A, 6ftn:A, 7jis:A, 5m6u:A, 6mum:A, 5ncy:A, 5ncz:A, 6ocu:A, 7oi4:AAA, 7oij:AAA, 7oil:AAA, 7ois:AAA, 8s3r:A, 5t2l:A, 5t8f:A, 5ubt:A, 2wxg:A, 2wxk:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218