BioLiP

>protein
KKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPYLRSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPG

The query sequence (length=76) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6a6j:A	90	77	0.9868	0.8333	0.9740	3.17e-48	6a6j:C, 6a6l:A, 6ktc:A, 6kug:A, 6lmr:A, 5yts:A, 5ytt:A, 5ytv:A, 5ytx:A
2	7f3i:A	93	78	0.9342	0.7634	0.9103	5.07e-46	7f3i:C, 7f3i:E, 7f3j:A, 7f3j:C, 7f3j:E, 7f3j:G, 7f3k:A, 7f3l:A
3	5udz:A	139	74	0.4211	0.2302	0.4324	9.64e-14	8ops:B, 8opt:B, 8ost:B, 3trz:A, 3trz:B, 3trz:C, 3trz:D, 3trz:E, 3trz:F, 3ts0:A, 3ts0:B, 3ts2:A, 3ts2:B, 5udz:B
4	4a75:A	89	74	0.4211	0.3596	0.4324	8.32e-13	4a75:C, 4a75:E, 4a75:G, 4a76:A, 4a76:G, 4a76:C, 4a76:E, 4alp:A, 4alp:D
5	2es2:A	67	64	0.3816	0.4328	0.4531	9.53e-13	3pf4:B, 3pf5:B, 3pf5:A
6	7ot5:B	66	66	0.3947	0.4545	0.4545	4.30e-12
7	1c9o:A	66	64	0.3816	0.4394	0.4531	2.67e-11	1c9o:B, 2hax:A, 2hax:B
8	7oii:B	39	34	0.2237	0.4359	0.5000	1.49e-06
9	6ybu:E	168	46	0.1974	0.0893	0.3261	1.6	6ybu:F, 6ybu:K, 6ybu:L
10	6oiu:C	900	53	0.2632	0.0222	0.3774	2.5	6oiu:A, 6oiu:B, 6oiu:D
11	4xcq:A	303	70	0.2105	0.0528	0.2286	3.1
12	7zhh:A	219	60	0.2237	0.0776	0.2833	3.9
13	7d4c:A	595	28	0.1842	0.0235	0.5000	4.1	7c3h:A, 7c3h:B, 7c3i:A, 7c3i:B, 7c3j:A, 7c3j:B, 7c3l:A, 7c3l:B, 7d4d:A, 7d4e:A, 3x0v:A, 3x0v:B
14	5azi:A	513	38	0.1842	0.0273	0.3684	4.9	5azi:B, 5azi:C, 5azi:D, 5azj:A, 5azj:B, 5azj:C, 5azj:D, 5gn5:A, 5gn5:B, 5gn5:C, 5gn5:D, 5gn6:A, 5gn6:B, 5gn6:C, 5gn6:D, 6j9q:A, 6j9q:B, 6j9q:C, 6j9q:D, 6j9v:A, 6j9v:B, 6jaf:A, 3wxj:A, 3wxj:B, 3wxj:C, 3wxj:D, 3wxk:A, 3wxk:B, 3wxk:C, 3wxk:D, 3wxl:A, 3wxl:B, 3wxl:C, 3wxl:D
15	8fqc:A	168	30	0.1316	0.0595	0.3333	7.8

[Back]