Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KKVERFEVPRTIIFGPGALEKTPEVIPPSGRVLIITGKSSTRKYAERVAELLKQNCEIISYDQVELEKPGFDLVIGIGGG
RPLDMAKVYSYIHKKPFVAIPTSASHDGIASPYVSFSLTQRFSKYGKISSSPVAIIADTSIILSAPSRLLKAGIGDLLGK
IIAVRDWQLAHRLKGEEYSEYAAHLSLTSYKIAVGNAQKIKNFIREEDVRVLVKALIGCGVAMGIAGSSRPCSGSEHLFA
HAIEVRVEKEDEVVHGELVALGTIIMAYLHGINWRRIKRIADIIGLPTSLRQANIDVDLALEALTTAHTLRPDRYTILGD
GLSREAAKRALEDVELI

The query sequence (length=337) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5fb3:F 337 337 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 5fb3:A, 5fb3:B, 5fb3:C, 5fb3:D, 5fb3:E
2 4rgq:B 333 351 0.4184 0.4234 0.4017 7.31e-71 4rfl:A, 4rfl:B, 4rfl:C, 4rfl:D, 4rgq:A, 4rgq:C, 4rgq:D, 4rgv:A, 4rgv:B
3 3ce9:A 349 270 0.2641 0.2550 0.3296 3.43e-38 3ce9:B, 3ce9:C, 3ce9:D
4 1kq3:A 364 231 0.1929 0.1786 0.2814 3.44e-19
5 8goa:A 367 232 0.1869 0.1717 0.2716 2.29e-15 8goa:B, 8goa:C, 8goa:D, 8gob:A, 8gob:B, 8x6m:A, 8x6m:B, 5zxl:A, 5zxl:B, 5zxl:C, 5zxl:D
6 4mca:A 367 241 0.2107 0.1935 0.2946 2.93e-15 4mca:B
7 8k1g:A 367 232 0.1899 0.1744 0.2759 4.55e-15 8k1h:A
8 3uhj:A 357 321 0.2433 0.2297 0.2555 2.19e-12 3uhj:B, 3uhj:C, 3uhj:D, 3uhj:E, 3uhj:F, 3uhj:G, 3uhj:H
9 5xn8:A 365 223 0.1810 0.1671 0.2735 1.10e-11 5xn8:B, 5xn8:C, 5xn8:D
10 1ta9:B 394 132 0.1157 0.0990 0.2955 2.67e-10 1ta9:A
11 1jq5:A 366 233 0.1869 0.1721 0.2704 3.83e-09 1jpu:A, 1jqa:A
12 1vhd:A 361 145 0.1276 0.1191 0.2966 2.28e-08 1o2d:A, 1o2d:B, 1vhd:B
13 5yvm:A 403 195 0.1484 0.1241 0.2564 4.16e-04 5yvr:A, 5yvs:A
14 3okf:A 360 224 0.1662 0.1556 0.2500 0.005 3okf:B
15 8uhw:F 293 96 0.0890 0.1024 0.3125 0.009
16 1nvb:B 391 66 0.0682 0.0588 0.3485 0.064 1dqs:A, 1dqs:B, 1nr5:A, 1nr5:B, 1nrx:A, 1nrx:B, 1nua:A, 1nua:B, 1nva:A, 1nva:B, 1nvb:A, 1nvd:A, 1nvd:B, 1nve:A, 1nve:B, 1nve:C, 1nve:D, 1nvf:A, 1nvf:B, 1nvf:C, 1sg6:A, 1sg6:B
17 1oj7:A 390 100 0.0801 0.0692 0.2700 0.082 1oj7:B, 1oj7:C, 1oj7:D, 4qgs:A
18 3owo:A 382 185 0.1306 0.1152 0.2378 0.20 3owo:B, 3owo:C, 3owo:D, 3ox4:A, 3ox4:B, 3ox4:C, 3ox4:D
19 7bvp:A 869 110 0.0861 0.0334 0.2636 0.20 7bvp:B, 7bvp:C, 7bvp:D, 7bvp:E, 7bvp:F, 6scg:A, 6scg:B, 6sci:A, 6sci:B, 6tqh:A, 6tqh:B, 6tqm:B, 6tqm:A
20 5eks:A 355 252 0.1840 0.1746 0.2460 0.21 5eks:B
21 2gru:A 367 202 0.1395 0.1281 0.2327 0.38 2d2x:A, 2d2x:B, 2gru:B
22 7w9y:A 389 125 0.0920 0.0797 0.2480 0.43 7w9y:B, 7w9y:C, 7w9y:D, 7w9z:A, 7w9z:B
23 8uhw:B 859 118 0.0831 0.0326 0.2373 0.53 8uhw:C, 8uhw:D, 8uhw:E
24 3zdr:A 403 215 0.1513 0.1266 0.2372 0.62
25 8a3l:i 142 45 0.0504 0.1197 0.3778 1.7 7abz:J, 7ac7:J, 7acj:J, 7acr:J, 5ady:J, 5afi:J, 5aka:J, 8akn:i, 8am9:i, 8ana:i, 8ap4:i, 9ax7:i, 9ax8:J, 8aye:i, 8b0x:i, 7b5k:J, 8b7y:R, 3bbx:J, 8bf7:G, 8bge:G, 8bgh:G, 8bh4:G, 8bhj:G, 8bhl:G, 8bhn:G, 8bhp:G, 8bil:G, 8bim:G, 7bl2:J, 7bl3:J, 7bl4:J, 7bl5:J, 7bl6:J, 6bu8:12, 7bv8:K, 6by1:CJ, 6by1:DJ, 6c4i:K, 8c8x:J, 8c8y:J, 8c8z:J, 8c90:J, 8c91:J, 8c92:J, 8c93:J, 8c94:J, 8c95:J, 8c96:J, 8c98:J, 8c99:J, 8cam:i, 8ceu:i, 8cgd:i, 8cgk:i, 8cgv:i, 9cg5:i, 9cg6:i, 9cg7:i, 9cl9:J, 7cpj:J, 4csu:J, 7d6z:J, 7d80:i, 6dnc:N, 8e30:O, 8e32:O, 8e33:O, 8e35:O, 8e36:O, 8e3l:O, 8e3m:O, 8e3o:O, 8e41:O, 8e42:O, 8e43:O, 8e44:O, 8e45:O, 8e46:O, 8e47:O, 8e48:O, 8e49:O, 8eiu:i, 8ekc:L, 8emm:i, 6enf:J, 6enj:J, 6enu:J, 9fbv:i, 8fiz:BR, 8fto:i, 8fzd:L, 8fze:L, 8fzf:L, 8fzg:L, 8fzh:L, 8fzi:L, 8fzj:L, 8g2u:J, 8g31:J, 8g34:J, 8g38:J, 8g6w:i, 8g6x:i, 8g6y:i, 8g7p:L, 8g7q:L, 8g7r:L, 8g7s:L, 5gad:K, 5gae:K, 5gaf:K, 5gag:K, 5gah:K, 6gbz:J, 6gc0:J, 6gc4:J, 6gc6:J, 6gc7:J, 6gc8:J, 6gwt:J, 6gxm:J, 6gxn:J, 6gxo:J, 6gxp:J, 6h4n:J, 5h5u:K, 6h58:J, 6h58:JJ, 6hrm:J, 8hsp:i, 8htz:i, 8hu1:i, 6i0y:J, 6i7v:DK, 6i7v:CK, 8ifb:i, 8ifc:i, 5iqr:J, 5it8:CK, 5it8:DK, 8j1z:i, 2j28:J, 3j5l:J, 5j5b:CK, 5j5b:DK, 3j7z:J, 5j7l:CK, 5j7l:DK, 3j8g:J, 5j88:CK, 5j88:DK, 5j8a:CK, 5j8a:DK, 3j9y:J, 3j9z:LF, 5j91:CK, 5j91:DK, 3ja1:LL, 3jbu:j, 3jbv:j, 3jcd:J, 3jce:J, 3jcj:I, 3jcn:J, 5jc9:CK, 5jc9:DK, 7jss:j, 7jsw:j, 7jsz:j, 5jte:BJ, 7jt1:j, 7jt2:j, 7jt3:j, 5ju8:BJ, 7k00:i, 7k50:j, 7k51:j, 7k52:j, 7k53:j, 7k54:j, 7k55:j, 5kcr:1N, 5kcs:1N, 5kps:J, 5kpv:I, 5kpw:I, 5kpx:I, 5l3p:N, 6lkq:0, 7lv0:j, 7lvk:R, 5lza:J, 5lzb:J, 5lzc:J, 5lzd:J, 5lze:J, 5lzf:J, 7m5d:J, 5mdv:J, 5mdw:J, 5mdy:J, 5mdz:J, 5mgp:J, 7n1p:LM, 7n2c:LM, 7n2u:LM, 7n2v:LM, 7n30:LM, 7n31:LM, 7nbu:i, 5nco:K, 5np6:h, 7nso:J, 7nsp:J, 7nsq:J, 5nwy:W, 7nwt:J, 7nww:I, 7o19:BJ, 7o1a:BJ, 7o1c:BJ, 5o2r:J, 6o9j:J, 6o9k:J, 7ode:R, 6ofx:j, 6og7:j, 6ogf:j, 6ogg:j, 6ogi:j, 7oif:I, 7oig:I, 7oii:I, 7oiz:i, 7oj0:i, 6om6:J, 6ore:J, 6orl:J, 6osk:J, 6osq:J, 6ost:J, 6ot3:J, 7ot5:I, 7otc:J, 6ouo:J, 8p16:J, 8p17:J, 8p18:J, 7p3k:i, 6pc5:O, 6pc6:O, 6pc7:O, 6pc8:O, 6pch:O, 6pcq:O, 6pcr:O, 6pcs:O, 6pct:O, 8peg:m, 8phj:i, 6pj6:R, 7pjs:J, 7pjt:J, 7pju:J, 7pjv:J, 7pjw:J, 7pjx:J, 7pjy:J, 7pjz:J, 8pkl:m, 8pva:i, 7q4k:BJ, 8q4f:i, 6q97:J, 6q98:J, 6q9a:J, 8qbt:J, 6qdw:j, 7qg8:W, 7qgh:W, 7qgn:W, 7qgr:W, 8qk7:J, 8qoa:i, 7qq3:R, 6qul:K, 8r6c:i, 8r8m:i, 8rpy:J, 8rpz:J, 8rq0:J, 8rq2:J, 6s0k:K, 7s1g:R, 7s1h:R, 7s1i:R, 7s1j:R, 7s1k:R, 7sa4:J, 7ss9:j, 7ssd:j, 7ssl:j, 7ssn:j, 7sso:j, 7ssw:j, 7st2:j, 7st6:j, 7st7:j, 8syl:L, 6szs:J, 8t5d:J, 8t5h:J, 6tbv:L131, 6tc3:L131, 7tos:L13, 4u1u:BJ, 4u1u:DJ, 4u1v:BJ, 4u1v:DJ, 4u20:BJ, 4u20:DJ, 4u24:BJ, 4u24:DJ, 4u25:BJ, 4u25:DJ, 4u26:BJ, 4u26:DJ, 4u27:BJ, 4u27:DJ, 5u4i:K, 6u48:CK, 5u9f:12, 5u9g:12, 7ug7:LM, 7uph:R, 8upo:s, 8upr:s, 8uql:s, 8uqm:s, 8uqp:s, 8ur0:s, 8urh:s, 8uri:s, 8urx:s, 8ury:s, 4uy8:J, 5uyk:12, 5uyl:12, 5uym:12, 5uyn:12, 5uyp:12, 5uyq:12, 4v4h:BJ, 4v4h:DJ, 4v4q:BJ, 4v4q:DJ, 4v4v:BH, 4v4w:BH, 4v50:BJ, 4v50:DJ, 4v52:BJ, 4v52:DJ, 4v53:BJ, 4v53:DJ, 4v54:BJ, 4v54:DJ, 4v55:BJ, 4v55:DJ, 4v56:BJ, 4v56:DJ, 4v57:BJ, 4v57:DJ, 4v5b:AJ, 4v5b:CJ, 4v5h:BJ, 4v5y:BJ, 4v5y:DJ, 4v64:BJ, 4v64:DJ, 4v65:B6, 4v66:B6, 4v69:BJ, 4v6c:BJ, 4v6c:DJ, 4v6d:BJ, 4v6d:DJ, 4v6e:BJ, 4v6e:DJ, 4v6k:AK, 4v6l:BK, 4v6m:BJ, 4v6n:AL, 4v6o:BL, 4v6p:BL, 4v6q:BL, 4v6r:BL, 4v6s:AL, 4v6t:BJ, 4v6v:BN, 4v6y:BJ, 4v6z:BJ, 4v70:BJ, 4v71:BJ, 4v72:BJ, 4v73:BJ, 4v74:BJ, 4v75:BJ, 4v76:BJ, 4v77:BJ, 4v78:BJ, 4v79:BJ, 4v7a:BJ, 4v7b:BJ, 4v7c:BL, 4v7d:AM, 4v7i:AJ, 4v7s:BJ, 4v7s:DJ, 4v7t:BJ, 4v7t:DJ, 4v7u:BJ, 4v7u:DJ, 4v7v:BJ, 4v7v:DJ, 4v85:BN, 4v89:BN, 4v9c:BJ, 4v9c:DJ, 4v9d:CJ, 4v9d:DJ, 4v9o:AJ, 4v9o:CJ, 4v9o:EJ, 4v9o:GJ, 4v9p:AJ, 4v9p:CJ, 4v9p:EJ, 4v9p:GJ, 8vs9:L13, 8vsa:L13, 6vu3:s, 6vwl:G, 6vwm:H, 6vwn:G, 6vyq:s, 6vyr:s, 6vys:s, 6vyt:s, 6vyu:s, 6vyw:s, 6vyx:s, 6vyy:s, 6vyz:s, 6vz2:s, 6vz3:s, 6vz5:s, 6vz7:s, 6vzj:s, 8w51:K, 5wdt:J, 6wd0:j, 6wd1:j, 6wd2:j, 6wd3:j, 6wd4:j, 6wd5:j, 6wd6:j, 6wd7:j, 6wd8:j, 6wd9:j, 6wda:j, 6wdb:j, 6wdc:j, 6wdd:j, 6wde:j, 6wdf:j, 6wdg:j, 6wdh:j, 6wdi:j, 6wdj:j, 6wdk:j, 6wdl:j, 6wdm:j, 5we4:J, 5we6:J, 4wf1:BJ, 4wf1:DJ, 5wf0:J, 5wfk:J, 5wfs:J, 6wnt:j, 6wnv:j, 6wnw:j, 4woi:BJ, 4woi:CJ, 4www:RJ, 4www:YJ, 6wyv:O, 6x6t:s, 6x7f:s, 6x7k:s, 6x9q:s, 6xdq:s, 6xdr:s, 6xgf:s, 6xii:s, 6xij:s, 6xz7:J, 6xza:J2, 6xzb:J2, 6y69:J, 7y7c:i, 7y7d:i, 7y7e:i, 7y7f:i, 7y7g:i, 7y7h:i, 4ybb:CK, 4ybb:DK, 7yla:R, 6ys3:j, 6ysr:J, 6yss:J, 6yst:J, 6ysu:J, 7z20:j, 7zod:j, 7zp8:j, 7zq5:j, 7zq6:j, 6ztj:BK, 6ztl:BK, 6ztm:BK, 6ztn:BK, 6zto:BK, 6ztp:BK, 7zta:L131, 6zu1:BK
26 8ink:W 388 65 0.0653 0.0567 0.3385 3.7 8fl2:NJ, 8fl3:NJ, 8fl4:NJ, 8ipx:W, 8ipy:W
27 3zok:A 365 226 0.1602 0.1479 0.2389 4.3 3zok:B, 3zok:C, 3zok:D
28 3cqz:A 1349 69 0.0623 0.0156 0.3043 5.2
29 1k83:A 1366 69 0.0623 0.0154 0.3043 5.3 1twa:A, 1twc:A, 1twg:A, 1twh:A
30 5vvs:A 1455 69 0.0623 0.0144 0.3043 5.4 5c4j:A, 3gtg:A, 3gtk:A, 8tvy:A, 5vvr:A
31 8u9x:A 1398 69 0.0623 0.0150 0.3043 5.6 6blo:A, 6blp:A, 6bm2:A, 6bm4:A, 6bqf:A, 1i6h:A, 7ked:A, 1nik:A, 1r5u:A, 1r9s:A, 7rim:A, 7rip:A, 7riw:A, 7rix:A, 7riy:A, 8u9r:A, 8ukq:A, 8ukr:A, 8uks:A, 8ukt:A, 8uku:A, 6upx:A, 6upy:A, 6upz:A, 6uq0:A, 6uq1:A, 6uq2:A, 6uq3:A, 5w4u:A, 5w51:A
32 8cen:A 1508 69 0.0623 0.0139 0.3043 5.9 4a3b:A, 4a3c:A, 4a3d:A, 4a3e:A, 4a3f:A, 4a3g:A, 4a3i:A, 4a3j:A, 4a3k:A, 4a3l:A, 4a3m:A, 4a93:A, 2b63:A, 2b8k:A, 4bbr:A, 4bbs:A, 4bxx:A, 4bxz:A, 4by1:A, 4by7:A, 5c3e:A, 5c44:A, 5c4a:A, 5c4x:A, 8ceo:A, 2e2h:A, 2e2i:A, 2e2j:A, 3fki:A, 5fmf:A, 5fyw:A, 5fz5:A, 3gtj:A, 3gtl:A, 3gtm:A, 3gto:A, 3gtp:A, 3gtq:A, 6gyk:A, 6gyl:A, 6gym:A, 3h3v:B, 3hou:A, 3hou:M, 3hov:A, 3how:A, 3hox:A, 3hoy:A, 3hoz:A, 1i3q:A, 3i4m:A, 3i4n:A, 1i50:A, 6i84:A, 5ip7:A, 5ip9:A, 3j0k:A, 2ja5:A, 2ja6:A, 2ja7:A, 2ja7:M, 2ja8:A, 8jch:A, 3k1f:A, 8k5p:A, 3k7a:A, 7kee:A, 7kef:A, 3m3y:A, 3m4o:A, 7mei:a, 7mei:A, 7mk9:A, 7mka:a, 7ml0:A, 7ml1:A, 7ml2:A, 7ml4:A, 7nkx:A, 7nky:A, 2nvq:A, 2nvt:A, 2nvx:A, 2nvy:A, 2nvz:A, 7o4i:A, 7o4j:A, 6o6c:A, 7o72:A, 7o73:A, 7o75:A, 5oqj:A, 5oqm:A, 5ot2:A, 3po2:A, 3po3:A, 3qt1:A, 2r7z:A, 1r9t:A, 2r92:A, 2r93:A, 7riq:A, 3rzd:A, 3rzo:A, 3s14:A, 3s15:A, 3s16:A, 3s17:A, 3s1m:A, 3s1n:A, 3s1q:A, 3s1r:A, 3s2d:A, 3s2h:A, 1sfo:A, 5sva:A, 1twf:A, 5u5q:A, 4v1m:A, 4v1n:A, 4v1o:A, 2vum:A, 1wcm:A, 4x67:A, 4x6a:A, 1y1v:A, 1y1w:A, 4y52:A, 1y77:A, 4y7n:A, 2yu9:A, 7zs9:A, 7zsa:A, 7zsb:A
33 8tug:A 1367 69 0.0623 0.0154 0.3043 5.9 8tvp:A, 8tvq:A, 8tvv:A, 8tvw:A, 8tvx:A
34 4utu:A 229 98 0.0861 0.1266 0.2959 6.2 4utu:B, 4utw:A, 4utw:B, 4utw:C, 4utw:D
35 3ocu:A 247 77 0.0653 0.0891 0.2857 6.2 3et4:A, 3et5:A, 3ocv:A, 3ocw:A, 3ocx:A, 3ocy:A, 3ocz:A, 3sf0:A
36 8tvs:A 1316 69 0.0623 0.0160 0.3043 6.3
37 9ja1:A 1286 69 0.0623 0.0163 0.3043 6.6
38 3jzd:A 354 149 0.0950 0.0904 0.2148 6.8 3jzd:B, 3jzd:C, 3jzd:D
39 3bfj:A 382 191 0.1246 0.1099 0.2199 8.0 3bfj:B, 3bfj:C, 3bfj:D, 3bfj:E, 3bfj:F, 3bfj:G, 3bfj:H, 3bfj:I, 3bfj:J, 3bfj:K, 3bfj:L, 3bfj:M, 3bfj:N, 3bfj:O, 3bfj:P, 3bfj:Q, 3bfj:R, 3bfj:S, 3bfj:T
40 5br4:A 385 31 0.0356 0.0312 0.3871 8.0 2bi4:A, 2bi4:B, 2bl4:A, 2bl4:B, 5br4:B, 7qlg:AAA, 7qlg:BBB, 7qlq:AAA, 7qlq:BBB, 7qls:AAA, 7qls:BBB, 7qnf:AAA, 7qnf:BBB, 7qnh:AAA, 7qnh:BBB, 7qnj:AAA, 7qnj:BBB, 7r0p:AAA, 7r0p:BBB, 7r3d:AAA, 7r3d:BBB, 7r5t:AAA, 7r5t:BBB, 1rrm:A, 1rrm:B
41 8wa1:c 1176 80 0.0712 0.0204 0.3000 8.0
42 8rd8:IX 142 45 0.0475 0.1127 0.3556 9.7 8rdv:IX, 8rdw:IX

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218