BioLiP

>protein
KKTIVWFRRDLRIEDNPALAAAAHEGSVFPVFIWCPEEEGQFYPGRASRWWMKQSLAHLSQSLKALGSDLTLIKTHNTIS
AILDCIRVTGATKVVFNHLYDPVSLVRDHTVKEKLVERGISVQSYNGDLLYEPWEIYCEKGKPFTSFNSYWKKCLDMSIE
SVMLPPPWRLMPITAAAEAIWACSIEELGLENEAEKPSNALLTRAWSPGWSNADKLLNEFIEKQLIDYAKNSKKVVGNST
SLLSPYLHFGEISVRHVFQCARMKQIIWARDKNSEGEESADLFLRGIGLREYSRYICFNFPFTHEQSLLSHLRFFPWDAD
VDKFKAWRQGRTGYPLVDAGMRELWATGWMHNRIRVIVSSFAVKFLLLPAKWGMKYFWDTLLDADLECDILGWQYISGDN
PALQGAKYDPEGEYIRQWLPELARLPTEWIHHPWDAPLTVLKASGVELGTNYAKPIVDIDTA

The query sequence (length=462) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6k8k:G	490	473	0.9805	0.9245	0.9577	0.0	6k8i:A, 6k8i:B, 6k8k:A, 6k8k:B, 6k8k:D, 6m79:A, 6m79:B, 6m79:C, 6m79:D, 7x0x:D, 7x0x:B, 7x0x:C, 7x0x:A, 7x0y:B, 7x0y:D, 7x0y:C, 7x0y:A, 6x24:A, 6x24:B, 6x24:C, 6x24:D
2	6lz3:A	486	474	0.6169	0.5864	0.6013	0.0	6lz3:B, 6lz3:C, 6lz3:D
3	1u3c:A	485	473	0.6017	0.5732	0.5877	0.0	1u3d:A
4	6lz7:A	492	474	0.6320	0.5935	0.6160	0.0
5	4u63:A	482	470	0.3874	0.3714	0.3809	6.00e-93
6	1qnf:A	475	486	0.3030	0.2947	0.2881	3.58e-50	1owl:A, 1owm:A, 1own:A, 1owo:A, 1owp:A, 1tez:A, 1tez:B, 1tez:C, 1tez:D
7	3fy4:A	522	497	0.3247	0.2874	0.3018	8.95e-50	3fy4:B, 3fy4:C
8	1dnp:A	469	480	0.3030	0.2985	0.2917	2.09e-48	1dnp:B
9	1np7:A	483	490	0.3030	0.2899	0.2857	2.72e-45	1np7:B
10	6kii:A	485	484	0.2965	0.2825	0.2831	6.44e-45
11	6fn0:A	496	489	0.3160	0.2944	0.2986	9.43e-44	6fn2:A, 6fn3:A, 5zm0:A
12	3cvv:A	519	492	0.3052	0.2717	0.2866	5.08e-42	7ayv:A, 7azt:A, 8c1u:A, 8c69:A, 8c6a:A, 8c6b:A, 8c6c:A, 8c6f:A, 8c6h:A, 3cvu:A, 3cvw:A, 3cvx:A, 3cvy:A, 7qut:A, 2wb2:A, 2wq6:A, 2wq7:A
13	4mlp:C	492	491	0.2944	0.2764	0.2770	1.36e-40	7ej9:A, 7ej9:B, 4i6g:A, 4i6g:B, 6kx8:A, 6kx8:B, 4mlp:A, 4mlp:B, 4mlp:D, 4u8h:A, 4u8h:C, 7v8y:A, 7v8z:A
14	2e0i:B	431	441	0.2597	0.2784	0.2721	1.37e-40	2e0i:A, 2e0i:C, 2e0i:D
15	8p4x:A	526	491	0.2814	0.2471	0.2648	1.17e-39	8p4x:B
16	7d1c:A	491	487	0.2900	0.2729	0.2752	1.25e-38	4ct0:A, 7d19:A, 7d19:B, 7dli:A, 7dli:B, 7dli:C, 6kx5:A, 6kx6:A, 6kx6:B, 6kx7:A, 6lue:A, 6lue:B, 7wva:A
17	2j07:A	419	226	0.1797	0.1981	0.3673	9.67e-37	1iqr:A, 1iqu:A, 2j08:A, 2j09:A
18	2j07:A	419	112	0.0671	0.0740	0.2768	0.029	1iqr:A, 1iqu:A, 2j08:A, 2j09:A
19	6pu0:A	480	482	0.2922	0.2812	0.2801	9.97e-35	6ptz:A
20	2vtb:A	500	464	0.2814	0.2600	0.2802	5.04e-29	2ijg:X, 2j4d:A, 2j4d:B, 2vtb:B, 2vtb:C, 2vtb:D, 2vtb:E, 2vtb:F
21	6wtb:B	547	510	0.2554	0.2157	0.2314	7.50e-28	8dd7:A, 4gu5:A, 4gu5:B, 4jzy:A, 4jzy:B, 4k03:A, 4k03:B, 7ud0:A, 7ud0:B, 6wtb:A
22	7pua:Ff	623	249	0.1320	0.0979	0.2450	2.20e-09	7pub:Ff
23	4cdn:A	463	384	0.2035	0.2030	0.2448	1.44e-07	4cdm:A, 7f8t:A, 8kcm:A, 5o86:A, 5o8d:A, 5o8e:A, 8oet:A, 8oy3:A, 8oy4:A, 8oy5:A, 8oy6:A, 8oy7:A, 8oy8:A, 8oy9:A, 8oya:A, 8oyb:A, 8oyc:A, 7viw:A, 7vix:A, 7viy:A, 7viz:A, 7vj0:A, 7vj1:A, 7vj2:A, 7vj3:A, 7vj4:A, 7vj5:A, 7vj6:A, 7vj7:A, 7vj8:A, 7vj9:A, 7vja:A, 7vjb:A, 7vjc:A, 7vje:A, 7vjg:A, 7vjh:A, 7vji:A, 7vjj:A, 7vjk:A, 2xry:A, 2xrz:A, 7yc7:A, 7ycm:A, 7ycp:A, 7ycr:A, 7yd6:A, 7yd7:A, 7yd8:A, 7ydz:A, 7ye0:A, 7yeb:A, 7yec:A, 7yee:A, 7yei:A, 7yej:A, 7yek:A, 7yel:A, 7yem:A, 5zcw:A
24	4cdn:B	438	161	0.0974	0.1027	0.2795	5.21e-07	8kcm:B, 8oet:B, 8oy3:B, 8oy4:B, 8oy5:B, 8oy6:B, 8oy7:B, 8oy8:B, 8oy9:B, 8oya:B, 8oyb:B, 8oyc:B, 2xrz:B, 7yc7:B, 7ycm:B, 7ycp:B, 7ycr:B, 7yd6:B, 7yd7:B, 7yd8:B, 7ydz:B, 7ye0:B, 7yeb:B, 7yec:B, 7yee:B, 7yei:B, 7yej:B, 7yek:B, 7yel:B, 7yem:B, 5zcw:B
25	9fgp:A	140	69	0.0411	0.1357	0.2754	0.39	9fgp:B
26	3vr1:A	516	55	0.0390	0.0349	0.3273	2.1	3vqt:A, 3vqt:B, 3vqt:C, 3vqt:D, 3vr1:B, 3vr1:C, 3vr1:D
27	3umv:A	472	84	0.0541	0.0530	0.2976	2.9	3umv:B
28	5nx7:A	308	58	0.0411	0.0617	0.3276	5.3	5nx6:A, 5nx6:B, 5nx7:B
29	8khv:A	579	93	0.0541	0.0432	0.2688	6.2
30	8dy9:B	319	46	0.0325	0.0470	0.3261	6.3

[Back]