Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KKNPPQIYPWMKRVHLRQRTSYTRYQTLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIAHALSLTERQIKIWFQNRRMKWKKEHK

The query sequence (length=75) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2r5z:A 75 75 1.0000 1.0000 1.0000 2.32e-50 9ant:A, 9ant:B, 5jlw:A, 5jlw:D, 5jlx:A, 5jlx:D, 2r5y:A, 4xic:A, 4xic:D, 4xid:A, 4xid:D
2 1ahd:P 68 59 0.7333 0.8088 0.9322 4.49e-34
3 4cyc:A 66 67 0.6933 0.7879 0.7761 1.10e-29 1b8i:A
4 4uus:A 67 55 0.6533 0.7313 0.8909 3.92e-29 4uus:E
5 2h1k:B 60 58 0.5600 0.7000 0.7241 3.94e-24 2h1k:A
6 1puf:A 77 59 0.5467 0.5325 0.6949 2.78e-22 2lp0:A
7 1b72:A 68 68 0.5333 0.5882 0.5882 1.67e-21
8 2me6:A 71 56 0.4667 0.4930 0.6250 1.14e-19
9 8eml:A 58 57 0.4933 0.6379 0.6491 1.67e-19 8eml:B
10 5zjr:A 64 56 0.4667 0.5469 0.6250 6.13e-19 5zjq:A, 5zjs:A, 5zjt:A, 5zjt:E
11 6es3:K 72 57 0.4667 0.4861 0.6140 9.45e-19 6es2:K, 6es2:L, 6es3:M, 5lty:K, 5lty:M, 5lux:K, 5lux:L, 7q3o:K, 7q3o:C, 7q3o:E, 7q3o:G, 7q4n:K, 7q4n:C
12 6m3d:C 108 70 0.4400 0.3056 0.4714 4.07e-15 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
13 6m3d:C 108 48 0.3200 0.2222 0.5000 2.09e-10 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
14 3a01:A 78 55 0.3733 0.3590 0.5091 5.19e-15 3a01:E
15 1jgg:A 57 57 0.4133 0.5439 0.5439 3.61e-14 1jgg:B
16 5eea:G 63 56 0.3733 0.4444 0.5000 1.33e-13 8byx:B, 8byx:J, 8byx:A, 8byx:K, 8byx:G, 8byx:L, 5edn:A, 5edn:B, 5edn:G, 5edn:J, 5eea:B, 5eea:A, 5eea:J, 5ef6:A, 5ef6:J, 5ef6:B, 5ef6:G, 5eg0:B, 5ego:B, 5no6:A, 5no6:B, 7psx:A, 7psx:B, 7psx:G, 7psx:J
17 8pna:A 67 55 0.3200 0.3582 0.4364 5.32e-13 8pm5:A, 8pm5:D, 8pm5:G, 8pm5:M, 8pm5:J, 8pm7:A, 8pm7:C, 8pm7:E, 8pm7:G, 8pmc:A, 8pmc:C, 8pmc:E, 8pmc:G, 8pmf:A, 8pmn:A, 8pmv:A, 8pmv:D, 8pmv:G, 8pmv:J, 8pn4:A, 8pn4:D, 8pn4:G, 8pn4:M, 8pn4:J, 8pnc:A, 8pnc:K, 8pnc:E, 8pnc:H
18 2ld5:A 67 56 0.3467 0.3881 0.4643 1.71e-12
19 1ig7:A 58 54 0.3733 0.4828 0.5185 2.88e-12
20 3a01:F 61 59 0.3733 0.4590 0.4746 2.16e-11 3a01:B, 3lnq:A
21 4rdu:D 62 57 0.3467 0.4194 0.4561 3.91e-11 4rdu:A, 4xrs:I, 4xrs:G
22 2lkx:A 68 56 0.3733 0.4118 0.5000 1.37e-10
23 8osb:E 62 56 0.3467 0.4194 0.4643 6.20e-10
24 4qtr:C 57 54 0.3467 0.4561 0.4815 9.77e-10 4qtr:A, 4qtr:B, 4qtr:D
25 3rkq:A 58 53 0.3333 0.4310 0.4717 1.14e-09 3rkq:B
26 1zq3:P 68 55 0.3333 0.3676 0.4545 1.23e-09
27 5flv:M 229 52 0.3200 0.1048 0.4615 1.73e-08 5flv:A, 5flv:E, 5flv:I, 4s0h:A, 4s0h:B, 4s0h:E, 4s0h:F, 6wc2:N, 6wc2:M, 6wc2:O, 6wc5:I, 6wc5:N, 2x6u:A, 2x6v:A, 2x6v:B
28 1nk2:P 77 56 0.3333 0.3247 0.4464 2.03e-08 1nk3:P
29 1fjl:A 65 58 0.3200 0.3692 0.4138 2.83e-08 1fjl:B, 1fjl:C
30 3cmy:A 60 57 0.3067 0.3833 0.4035 1.34e-07
31 4rbo:A 55 53 0.2533 0.3455 0.3585 2.90e-06 4rbo:D
32 6e8c:A 135 53 0.2933 0.1630 0.4151 5.98e-06 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
33 6e8c:A 135 54 0.2267 0.1259 0.3148 0.003 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
34 9b8u:B 66 49 0.2533 0.2879 0.3878 4.39e-05 9b8u:A, 9b8u:C, 9b8u:D
35 8ejo:A 56 53 0.2400 0.3214 0.3396 5.94e-04 8ejo:B, 8ejp:A, 8ejp:B
36 8ik5:C 67 56 0.2533 0.2836 0.3393 0.002 8ike:C, 8ilw:C
37 1le8:A 53 42 0.1867 0.2642 0.3333 0.006 1akh:A, 1yrn:A
38 4egc:A 539 40 0.2000 0.0278 0.3750 0.008
39 1gt0:C 137 56 0.2667 0.1460 0.3571 0.013 1cqt:A, 1cqt:B, 1e3o:C, 1hf0:A, 1hf0:B, 1o4x:A, 1oct:C
40 5hod:A 61 56 0.2400 0.2951 0.3214 0.020 5hod:D
41 1lfu:P 82 51 0.2000 0.1829 0.2941 0.083 1b72:B, 1b8i:B, 4cyc:B, 1puf:B, 2r5y:B, 2r5z:B, 4uus:B, 4uus:F, 5zjq:B, 5zjr:B, 5zjs:B, 5zjt:B
42 3d1n:I 150 55 0.2267 0.1133 0.3091 0.21 3d1n:K, 3d1n:J, 3d1n:L, 3d1n:M, 3d1n:N, 3d1n:O, 3d1n:P
43 3l1p:A 147 25 0.1467 0.0748 0.4400 0.52 8bx2:A, 6ht5:E, 3l1p:B, 8sps:L, 8spu:L, 6t90:K, 7u0g:M, 7u0g:L, 7u0i:L, 7u0i:M
44 8bx1:A 127 24 0.1467 0.0866 0.4583 0.67
45 7alp:U 1935 45 0.1867 0.0072 0.3111 0.83
46 8r6y:A 1991 45 0.1867 0.0070 0.3111 0.84 8as7:A, 8r6w:A, 6xya:B
47 8g8e:X 140 25 0.1467 0.0786 0.4400 0.85 8g87:X, 8g88:X, 8g8b:X, 8g8g:X, 8sps:M, 7u0g:K
48 5wc9:A 136 61 0.2000 0.1103 0.2459 2.3 1au7:A, 1au7:B, 5wc9:B, 5wc9:E, 5wc9:F
49 7xrc:C 134 25 0.1333 0.0746 0.4000 2.9 2xsd:C
50 6x1j:A 226 71 0.2667 0.0885 0.2817 3.8
51 8asb:A 1715 45 0.1867 0.0082 0.3111 4.1 8as6:A, 8asg:A, 8r6u:A
52 8asd:A 1826 45 0.1867 0.0077 0.3111 4.3
53 8a1l:A 354 13 0.0800 0.0169 0.4615 5.0 7a0z:A, 7a0z:B, 7a10:A, 7a10:B, 7a11:A, 7a1e:A, 8a1j:A, 8a1j:B, 8a1k:A, 8a1k:B, 8a1l:B, 8a1m:A, 8a1m:B, 8a1n:A, 8a1o:A, 8bk3:A, 6boi:A, 6boi:B, 5dc2:A, 5dc2:B, 5dcc:A, 5dcc:B, 5duj:A, 5duj:B, 5dvp:A, 5dvp:B, 5dzj:A, 5dzj:B, 5dzp:A, 5e1g:A, 5e1i:A, 7f71:A, 7f71:B, 7f8p:A, 4gsq:A, 4gsr:A, 4gsu:A, 4gsu:B, 6iyv:B, 6iyv:A, 6iyw:A, 6iyw:B, 6iyw:C, 6iyw:D, 6iyw:E, 6iyw:F, 5k69:A, 5k69:B, 7kem:A, 7kem:B, 5lb1:A, 5lb1:B, 5lbg:B, 6lqb:A, 6lqb:B, 8pxy:A, 8pxz:A, 4qr7:A, 4qrb:A, 4qtf:A, 6rrm:A, 6rrm:B, 3tur:A, 3tur:B, 3vyp:A, 3vyp:B
54 3f98:A 377 34 0.1733 0.0345 0.3824 7.3 3f97:A, 3f97:B, 3f98:B, 3f98:C, 3f9c:A, 3f9c:B, 5i8p:A, 5i8p:B, 5i9i:A, 5i9i:B, 5jad:A, 5jah:A, 5jal:A, 5jan:A, 5jao:A, 5jap:A, 5jar:A, 5jas:A, 5jat:A, 5jau:A, 5lp1:A, 5lyy:A, 5lz2:A, 5lz4:A, 5lz5:A, 5lz7:A, 5lz8:A, 5lz9:A, 6m06:A, 6m06:B, 6m07:A, 6m07:B, 6m08:B, 5ye7:B, 5ye7:A, 5ye8:B, 5ye8:A, 5ye9:A, 5ye9:B, 5yea:A, 5yea:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218