BioLiP

>protein
KKNNQDELKKLAATEAAKSITTEITLGVGTGSTVGFLIEELVNYRDKIKTVVSSSEDSTRKLKALGFDVVDLNYAGEIDL
YIDGADECNNHKELIKGGGAALTREKICVAAAKKFICIIDESKKVNTLGNFPLPIEVIPMARSYIARQIVKLGGQPVYRE
QTITDNGNVILDVYNLKIDNPLKLETELNQITGVVTNGIFALKPADTVIMATKDSNIVVL

The query sequence (length=220) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4m8l:A	220	220	1.0000	1.0000	1.0000	6.67e-160	3kwm:D, 4m8l:B, 4m8l:D, 4m8l:C
2	3env:A	217	211	0.5636	0.5714	0.5877	2.22e-83	3enw:A, 3enw:B
3	1o8b:B	212	211	0.5273	0.5472	0.5498	9.03e-75	1o8b:A
4	6mc0:A	218	210	0.5182	0.5229	0.5429	1.37e-73	6mc0:B
5	3uw1:A	232	219	0.4682	0.4440	0.4703	1.77e-64
6	4gmk:A	227	220	0.3955	0.3833	0.3955	1.41e-40	4gmk:B
7	1lk7:A	229	222	0.4182	0.4017	0.4144	4.13e-40	1lk7:B, 1lk7:C, 1lk7:D
8	1uj5:A	225	213	0.3864	0.3778	0.3991	6.16e-33	1uj6:A
9	3hhe:A	233	230	0.4045	0.3820	0.3870	4.65e-32	3hhe:B
10	2f8m:A	237	236	0.3545	0.3291	0.3305	2.80e-23	2f8m:B
11	8asw:A	1255	63	0.0955	0.0167	0.3333	1.3
12	6v1s:E	276	52	0.0818	0.0652	0.3462	1.4	6v1s:A, 6v1s:B, 6v1s:C, 6v1s:D, 6v1s:F, 6v1s:G
13	8ekk:A	533	52	0.0818	0.0338	0.3462	1.6	8ekk:B, 8ekk:C, 8ekk:D, 8ekk:E, 8ekk:F, 8ekk:G, 8ekl:A, 8ekl:B, 8ekl:C, 8ekl:D, 8ekl:E, 8ekl:F, 8ekl:G
14	8dcm:C	695	52	0.0818	0.0259	0.3462	1.8
15	7vnn:D	641	52	0.0818	0.0281	0.3462	1.9	8ekm:A, 8ekm:B, 8ekm:C, 8ekm:D, 8ekm:E, 8ekm:F, 8ekm:G, 7vnj:A, 7vnj:B, 7vnj:C, 7vnj:D, 7vnj:E, 7vnj:F, 7vnj:G, 7vnn:A, 7vnn:B, 7vnn:C, 7vnn:E, 7vnn:F, 7vnn:G, 7yvq:A, 7yvq:B, 7yvq:C, 7yvq:D, 7yvq:E, 7yvq:F, 7yvq:G, 7yvs:A, 7yvs:B, 7yvs:C, 7yvs:D, 7yvs:E, 7yvs:F, 7yvs:G
16	6uwr:A	660	52	0.0818	0.0273	0.3462	1.9	6uwi:A, 6uwi:h, 6uwi:G, 6uwi:n, 6uwi:F, 6uwi:m, 6uwi:E, 6uwi:l, 6uwi:D, 6uwi:k, 6uwi:C, 6uwi:j, 6uwi:B, 6uwi:i, 6uwi:H, 6uwi:a, 6uwi:I, 6uwi:b, 6uwi:J, 6uwi:c, 6uwi:K, 6uwi:d, 6uwi:L, 6uwi:e, 6uwi:M, 6uwi:f, 6uwi:N, 6uwi:g, 6uwr:B, 6uwr:C, 6uwr:D, 6uwr:E, 6uwr:F, 6uwr:G, 6uwr:H, 6uwr:I, 6uwr:J, 6uwr:K, 6uwr:L, 6uwr:M, 6uwr:N, 6uwt:H, 6uwt:I, 6uwt:J, 6uwt:K, 6uwt:L, 6uwt:M, 6uwt:N, 6uwt:A, 6uwt:B, 6uwt:C, 6uwt:D, 6uwt:E, 6uwt:F, 6uwt:G
17	7nqf:B	219	40	0.0727	0.0731	0.4000	2.3	7nqe:A, 7nqf:A, 7p9j:B, 7p9j:A, 7p9j:C, 7qaz:B, 7qaz:A, 7qaz:C
18	2y9z:B	595	39	0.0636	0.0235	0.3590	2.6
19	6klo:A	368	54	0.0864	0.0516	0.3519	3.2	6klo:B, 6klo:C, 6klo:D, 6klo:E, 6klo:F, 6klo:G, 6klx:A, 6klx:B, 6klx:C, 6klx:D, 6klx:E, 6klx:F, 6klx:G
20	6klw:A	406	54	0.0864	0.0468	0.3519	4.0	6klw:B, 6klw:C, 6klw:D, 6klw:E, 6klw:F, 6klw:G
21	2xze:A	141	34	0.0500	0.0780	0.3235	5.5	2xze:B
22	8adb:A	209	81	0.1045	0.1100	0.2840	5.9

[Back]