BioLiP

>protein
KKKKKKKNKKKKKKPTQQSDPPRVLISHLFPDGKYPAGEEVEYVNENRYRTTSEEKRYLDNMQSEFLNDYRQAAEVHRQV
RKWAQGFVKPGKSLIEISEGIEDSVRALVGHPGLEEGDALKAGMGFPVGLSINHCAAHYNPNSGNKIVLQQDDVIKIDIG
VHVNGRIVDSAFTMAWNDQFNPLLEAVRAATNAGIREAGIDARVGEIGGVIQEVMESYEVEINGKTYPVKPIRNLNGHNI
LPYSIHGTKSVPIVKTHDQTKMEEGDVFAIETFGSTGKGYVIESGEVSHYALRGDAPKVDLRLSSAKSLLNVIKRHFGTL
PFCRRFLDRLGQEKYLLGLNNLVSNGIVEDYPPLVDEKGSYTAQFEHTILIRPTVKEVISRGDDY

The query sequence (length=385) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8onz:A	385	385	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	8onx:A, 8oo0:D
2	8ony:A	371	376	0.5688	0.5903	0.5824	5.95e-159	7a12:A, 7a13:A, 7a14:A, 7a15:A, 7a16:A, 2adu:A, 1b59:A, 1b6a:A, 1bn5:A, 1boa:A, 5cls:A, 5d6e:A, 5d6f:A, 2ea2:A, 2ea4:A, 9fpz:A, 2ga2:A, 5jfr:A, 5jhu:A, 5ji6:A, 1kq0:A, 1kq9:A, 5lyw:A, 5lyx:A, 2oaz:A, 8oxg:A, 8oxg:B, 6qed:A, 6qef:A, 6qeg:A, 6qeh:A, 6qei:A, 6qej:A, 1qzy:A, 1r58:A, 1r5g:A, 1r5h:A, 1yw7:A, 1yw8:A, 1yw9:A
3	3fm3:A	356	329	0.3818	0.4129	0.4468	2.42e-79	3fm3:B, 3fmq:A, 3fmq:B, 3fmr:A, 3fmr:B
4	2dfi:A	301	302	0.3039	0.3887	0.3874	3.55e-57	2dfi:B, 6m00:A, 1wkm:A, 1wkm:B, 1xgm:A, 1xgm:B, 1xgn:A, 1xgn:B, 1xgs:A, 1xgs:B
5	6sxo:A	375	262	0.1636	0.1680	0.2405	4.48e-24	8k2c:CA, 6swa:t, 8xsx:CA, 8xsy:CA, 8xsz:CA, 6z6l:CA, 6z6m:CA, 6z6n:CA, 6zm7:CA, 6zme:CA, 6zmi:CA, 6zmo:CA
6	7bhp:A	322	256	0.1584	0.1894	0.2383	3.74e-18
7	1qxw:A	249	230	0.1429	0.2209	0.2391	1.84e-05	1qxy:A, 1qxz:A
8	8p2k:MA	315	222	0.1351	0.1651	0.2342	0.001	2b3h:A, 2b3k:A, 9f1d:EA, 4fli:A, 4flj:A, 4flk:A, 4fll:A, 2g6p:A, 2gz5:A, 4hxx:A, 4ikr:A, 4iks:A, 4ikt:A, 4iku:A, 4iu6:A, 6lzb:A, 6lzc:A, 2nq6:A, 2nq7:A, 4u1b:A, 4u69:A, 4u6c:A, 4u6e:A, 4u6j:A, 4u6w:A, 4u6z:A, 4u70:A, 4u71:A, 4u73:A, 4u75:A, 4u76:A, 5ykp:A, 5yr4:A, 5yr5:A, 5yr6:A, 5yr7:A
9	8p2k:MA	315	30	0.0338	0.0413	0.4333	5.0	2b3h:A, 2b3k:A, 9f1d:EA, 4fli:A, 4flj:A, 4flk:A, 4fll:A, 2g6p:A, 2gz5:A, 4hxx:A, 4ikr:A, 4iks:A, 4ikt:A, 4iku:A, 4iu6:A, 6lzb:A, 6lzc:A, 2nq6:A, 2nq7:A, 4u1b:A, 4u69:A, 4u6c:A, 4u6e:A, 4u6j:A, 4u6w:A, 4u6z:A, 4u70:A, 4u71:A, 4u73:A, 4u75:A, 4u76:A, 5ykp:A, 5yr4:A, 5yr5:A, 5yr6:A, 5yr7:A
10	4fuk:A	329	220	0.1273	0.1489	0.2227	0.006	4fuk:B
11	8khn:A	287	159	0.1221	0.1638	0.2956	0.010	8kho:A
12	4pv4:A	436	164	0.1039	0.0917	0.2439	0.049	4pv4:B
13	8bqd:x	367	211	0.1221	0.1281	0.2227	0.091	8bqx:x
14	3tav:A	264	82	0.0753	0.1098	0.3537	0.16	3tav:B
15	4v7f:l	380	141	0.0857	0.0868	0.2340	0.26	5jcs:u, 4v8t:t
16	5wze:B	449	117	0.0779	0.0668	0.2564	0.38	5wze:A, 5wze:C, 5wze:D
17	7oya:q1	118	22	0.0234	0.0763	0.4091	0.40
18	5xev:A	409	237	0.1481	0.1394	0.2405	0.52
19	3iu7:A	284	261	0.1610	0.2183	0.2375	1.1	4iec:A, 4if7:A, 3iu8:A, 3iu9:A, 4ook:A, 3pka:A, 3pkb:A, 3pkc:A, 3pkd:A, 3pke:A, 3ror:A, 1yj3:A, 5yoh:A, 5yoi:A, 5ypd:A, 5ypj:A, 5yxf:A
20	1kc7:A	872	96	0.0701	0.0310	0.2812	1.3
21	3na8:A	291	71	0.0545	0.0722	0.2958	2.1	3na8:B, 3na8:C, 3na8:D
22	4n6d:A	319	25	0.0312	0.0376	0.4800	3.6
23	5aju:A	217	26	0.0390	0.0691	0.5769	4.3
24	3nvl:A	549	66	0.0468	0.0328	0.2727	4.9	3nvl:B
25	4jbm:A	190	64	0.0545	0.1105	0.3281	4.9	4jbm:B
26	6jt5:A	409	189	0.1117	0.1051	0.2275	5.0	6jwf:A, 6jwf:B
27	6sym:A	135	43	0.0390	0.1111	0.3488	5.6	6sym:B
28	3q6d:A	355	156	0.0987	0.1070	0.2436	6.8	3q6d:B, 3q6d:C, 3q6d:D
29	7o5l:A	417	42	0.0468	0.0432	0.4286	7.6	7o5l:C, 7o5m:A, 7o5m:C, 7zd7:A, 7zd7:C, 7zd8:A, 7zd8:C, 7zd9:A, 7zd9:C
30	6ogz:A	1082	72	0.0494	0.0176	0.2639	7.6	6ogy:A, 6oj6:P, 2r7r:A, 2r7s:A, 2r7t:A, 2r7u:A, 2r7v:A, 2r7w:A, 2r7x:A, 2r7x:B
31	4bed:B	1734	86	0.0545	0.0121	0.2442	7.9	4bed:D, 3qjo:A, 3qjo:B
32	2cjp:B	319	56	0.0390	0.0470	0.2679	9.1
33	7cpx:A	2262	59	0.0390	0.0066	0.2542	9.5	7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B

[Back]