BioLiP

>protein
KIMPEEEYSEFKELILQKELHVVYALSHVCGQDRTLLASILLRIFLHEKLESLLLCTLNDREISMEDEATTLFRATTLAS
TLMEQYMKATATQFVHHALKDSILKIMESKQSCELSPSKLEKNEDVNTNLTHLLNILSELVEKIFMASEILPPTLRYIYG
CLQKSVQHKWPTNTTMRTRVVSGFVFLRLICPAILNPRMFNIISDSPSPIAARTLILVAKSVQNLANLVEFGAKEPYMEG
VNPFIKSNKHRMIMFLDELGNVPELPTDLSRDLAALHEICVAHSDELRTLSNERGAQQHVLKKLLAITELLQQKQNQYTK

The query sequence (length=320) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8bos:G	320	320	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	1wq1:G
2	7r04:A	2326	239	0.2469	0.0340	0.3305	4.95e-26
3	7pgr:N	2423	255	0.2531	0.0334	0.3176	1.45e-24	2d4q:A, 2d4q:B, 2e2x:B, 3p7z:B, 3pg7:B, 7pgq:F, 7pgr:F, 7pgs:F, 7pgt:F, 7pgu:F, 7pgu:N
4	5cjp:E	372	140	0.1125	0.0968	0.2571	1.03e-07	5cjp:F
5	7dge:A	784	35	0.0406	0.0166	0.3714	0.58	1ewk:A, 1ewk:B, 1isr:A, 1iss:A, 1iss:B, 3ks9:A, 3ks9:B
6	2hke:A	377	143	0.1062	0.0902	0.2378	1.5	2hke:B
7	6bn5:B	448	78	0.0656	0.0469	0.2692	1.9
8	6qw6:S	126	120	0.0969	0.2460	0.2583	3.3	8h6e:4S, 8h6j:4S, 8qp8:S, 8qp9:S, 8qpk:S, 6qx9:S, 8qxd:S, 8r08:S
9	4lp7:D	230	57	0.0594	0.0826	0.3333	6.1	4lp7:A, 4lp7:B, 4lp7:C
10	8tao:B	771	45	0.0469	0.0195	0.3333	7.1	7fd8:A, 7fd8:B, 7fd9:A, 7fd9:B, 3lmk:A, 3lmk:B, 8t8m:A
11	7mhs:E	489	39	0.0375	0.0245	0.3077	7.3
12	6n51:B	793	45	0.0469	0.0189	0.3333	7.5	6n4x:B, 6n4y:C, 6n50:A, 6n50:B, 6n50:C, 6n51:A, 8t6j:B, 8t6j:A, 8t7h:A, 8t7h:B, 8t8m:B, 8tao:A
13	5xzr:A	519	86	0.0719	0.0443	0.2674	8.1	1aya:A, 1aya:B, 1ayb:A, 1ayc:A, 8b5y:A, 8b5y:B, 9blg:A, 9blg:B, 6bmr:A, 6cmr:A, 6cms:A, 5df6:A, 5ehp:A, 6md7:A, 6md7:B, 3mow:A, 3o5x:A, 7ppl:A, 7ppm:A, 7ppn:A, 4pvg:A, 4qsy:A, 6r5g:A, 7r75:A, 7r7d:A, 7r7d:B, 7r7i:A, 7rct:B, 7rct:A, 4rdd:A, 6roy:A, 6roy:B, 6roz:A, 6roz:C, 8rzw:A, 8rzw:B, 8rzy:A, 8rzy:B, 8s01:A, 8s01:B, 8s04:A, 8s04:B, 8s06:A, 8s06:B, 8s07:A, 8s07:B, 8s0h:A, 8s0h:B, 8s0i:A, 8s0i:B, 8s0j:A, 8s0j:B, 8s0k:A, 8s0k:B, 8s0o:A, 8s0o:B, 8s0p:A, 8s0p:B, 8s0q:A, 8s0q:B, 8s0s:A, 2shp:A, 2shp:B, 8t6d:A, 8t6d:B, 8t6g:A, 8t6g:B, 8t7q:A, 8t8q:A, 8t8q:B, 3tkz:A, 3tl0:A, 8u7w:A, 8u7w:B, 8u7x:A, 8u7x:B, 8wfy:A, 8wfy:B, 6wu8:A, 6wu8:B, 8wx7:B, 5x7b:A, 5x94:A, 5x94:B
14	6yeh:A	410	47	0.0563	0.0439	0.3830	9.9	6yeh:B, 6yeh:C, 6yeh:D, 6yeh:E, 6yeh:F, 6yei:A, 6yei:B, 6yei:C, 6yei:D, 6yei:E, 6yei:F

[Back]